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Luisa AchaerandioFrancis VillatoroBorja TosarHéctor Socassecuenciación arnm mensajero célula únicaexpresión génica en células individualesimpacto moléculas regeneración cartílagoprostaglandinas y capacidad regenerativamoléculas que generan regeneraciónARN mensajeroLuisa AchaerandioFrancis VillatoroWGSADNNature
Secuenciación ARN célula única
Con
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Luisa Achaerandio explica cómo se están utilizando técnicas como la secuenciación de ARN mensajero de célula única para analizar la expresión génica en células individuales y determinar el impacto de ciertas moléculas en la regeneración del cartílago.
…de por sí el cartílago Recordemos que es un tejido avascular y sin ningún tipo de irrigación Avascular quiere decir que no le llega sangre, vamos, para entendernos, ¿no? Que no tiene ni irrigación ni nervación, ¿vale? Entonces, esto es lo fundamental, ¿no? Que también se ha descubierto porque se hacen pruebas tanto a nivel sistémico como a nivel de inyecciones locales, ¿vale? Entonces, ¿por dónde íbamos por las técnicas que se utilizan? Pues se utiliza de todo tipo: secuenciación de ARN mensajero de célula única, ¿vale?, para saber qué genes están activos en cada controcito, precisamente para ver si afecta o no esta molécula a nivel de expresión o no de estas prostaglandinas que estamos diciendo o de esta capacidad regenerativa, o sea, estas moléculas que generan esa regeneración. Luego también se utiliza histología clásica, ya os digo; os invito a visualizar la parte final del artículo donde se ven todas las pruebas, todos los resultados de las pruebas. Histología clásica, para quien haya hecho pruebas de laboratorio, pues se hacen…
Significado #1 · Palabras #1
Francis Villatoro explica cómo, en 1958, no existía conocimiento sobre cómo la información genética salía del núcleo celular.
Habla: Francis VillatoroPalabras #15arn mensajero descubrimiento 1960información genética núcleo celularmolécula arn mensajero berkeleyproteína codificada adn núcleo…podía pasar de alguna manera copiarse esa información, lo que hoy en día ya descubrió Brenner, la transcripción; hay una molécula intermedia. Si yo fabrico fuera del núcleo y tengo la información guardada dentro del núcleo, ¿cómo sale esa información? ¿Sale? En 1958 no sale, en 1958 no hay idea sobre qué salga esa información; esa información está oculta dentro del núcleo, entonces ¿cómo? ¿Cómo que hay magia, telepatía? ¿Cómo funciona eso? Eso hay que descubrirlo y ya más tarde, alrededor de 1960, se descubre el ARN mensajero y se descubre que es una molécula que se encuentra en el núcleo, que se encuentra fuera del núcleo y que por lo tanto tiene que haber un mecanismo de salida de ese ARN mensajero y ese ARN mensajero puede tener una información asociada a lo que codifica la proteína que se fabrica fuera dentro del núcleo en el ADN. Eso ya es muy posterior, entonces ya sobre 1962, cuando lleva muchos años muerta Rosalind Franklin, es cuando se ve claro que sí, sí, hicieron muy bien tomándose unas pintas y lanzando la palabra eureka y escribiendo allí en la pared que se conserva todavía,…
Luisa Achaerandio explica cómo se están utilizando técnicas como la secuenciación de ARN mensajero de célula única para analizar la expresión génica en células individuales y determinar el impacto de ciertas moléculas en la regeneración del cartílago.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1secuenciación arnm mensajero célula únicaexpresión génica en células individualesimpacto moléculas regeneración cartílagoprostaglandinas y capacidad regenerativamoléculas que generan regeneración…de por sí el cartílago Recordemos que es un tejido avascular y sin ningún tipo de irrigación Avascular quiere decir que no le llega sangre, vamos, para entendernos, ¿no? Que no tiene ni irrigación ni nervación, ¿vale? Entonces, esto es lo fundamental, ¿no? Que también se ha descubierto porque se hacen pruebas tanto a nivel sistémico como a nivel de inyecciones locales, ¿vale? Entonces, ¿por dónde íbamos por las técnicas que se utilizan? Pues se utiliza de todo tipo: secuenciación de ARN mensajero de célula única, ¿vale?, para saber qué genes están activos en cada controcito, precisamente para ver si afecta o no esta molécula a nivel de expresión o no de estas prostaglandinas que estamos diciendo o de esta capacidad regenerativa, o sea, estas moléculas que generan esa regeneración. Luego también se utiliza histología clásica, ya os digo; os invito a visualizar la parte final del artículo donde se ven todas las pruebas, todos los resultados de las pruebas. Histología clásica, para quien haya hecho pruebas de laboratorio, pues se hacen…
Francis Villatoro explica la hipótesis monoclonal para explicar la heterogeneidad de las mutaciones presentes en los tumores de cáncer colorrectal, argumentando que se originan a partir de una única célula mutada.
Habla: Francis VillatoroPalabras #19hipótesis monoclonal cáncer colorrectalcélula mutada proliferación celulartumor estructura heterogénea francis villatoromecanismos de corrección mutaciones tumorales…dos teorías, dos hipótesis sobre el origen de los tumores porque una de las cosas que se ha observado en los últimos 25-30 años es que los tumores no son homogéneos en cuanto a las mutaciones que tienen cada una de las células que se encuentran en el tumor. sino que hay una enorme heterogeneidad en las mutaciones que aparecen en el tumor. Entonces, claro, hay una hipótesis para explicar esta heterogeneidad, que es la hipótesis de que una célula, la hipótesis monoclonal, el origen monoclonal del tumor, Una célula por alguna razón muta y lo que muta es un gen asociado a los mecanismos de proliferación celular de tal manera de que se desregula el crecimiento de esas células y de repente esa célula se vuelve de alguna manera inmortal y empieza a producir otras células. y entonces como está, digamos, mutado un mecanismo clave en esa proliferación celular, la hipotesis monoclonal nos dice que el tumor se va produciendo a partir de una única célula mutada y las células que van apareciendo van teniendo diferentes mutaciones porque hay mecanismos de seguridad, de control, de corrección de mutaciones que no actúan correctamente en esas células y por eso el tumor tiene una estructura tan heterogénea. Esa estructura heterogénea es clave para proteger al tumor de los tratamientos. Nosotros nos gustaría que el tumor fuera muy homogéneo para que un tratamiento dirigido a una diana común a todas las células del tumor atacara todas las células del tumor y nos…
Francis Villatoro explica la diferencia entre secuenciación de genoma completo (WGS) y secuenciación de exoma completo, detallando cómo los genes eucariotas están divididos en exones y intrones.
Habla: Francis VillatoroSignificado #12 · Palabras #11genes eucariotas divididos en exones intronessecuenciación de exoma completo humanosexones transcriben montaje arn mensajerotranscriptoma como indicador proteomaarn mensajero sale fuera célulaproteoma traducción final genesrelación transcriptoma arn mensajerosecuenciación genoma completo póliposestudio exoma completo mucosaardenocarcinoma secuenciado individuos…las técnicas WGS, que son técnicas que buscan ver todas las, digamos, SNPs, todas las variantes que tiene ese genoma completo, ¿vale? No se secuencia realmente el genoma completo, sino solo se identifican esas variantes sobre un genoma de referencia. Y se ha aplicado también una secuenciación de exoma completo. Los genes eucariotas, en humanos, los humanos somos eucariotas, están divididos en unos trozos que son los exones que tienen en su interior, en el código, digamos, en el ADN, trocitos que no codifican, que se llaman intrones. Entonces los exones se transcriben y después se hace un montaje del ARN mensajero transcripto. Ese montaje puede ser completamente lineal o en algunas proteínas puede haber diferentes montajes posibles. Y ese es el transcriptoma; cuando se habla de transcriptoma, lo que se habla es ya de ARN mensajero que sale fuera de la célula. Es decir, se interpreta el transcriptoma como un proxy, un indicador de lo que se va a expresar, qué genes se van a expresar y por tanto qué proteínas acabarán siendo traducidas. Eso ya es el proteoma, lo que se lleva finalmente a traducir. En el exoma, dentro del núcleo, hablamos de esos trocitos, los exones por separado, los diferentes ARN mensajeros por separado. Aquí se ha estudiado genoma completo y exoma completo. No se ha estudiado transcriptoma, no se ha estudiado proteoma. Bien, y lo que se ha observado, se ha hecho este genoma completo y exoma completo de los pólipos y de otras regiones, parte de la mucosa, si se ha encontrado en alguno de los individuos un ardenocarcinoma, pues también se ha secuenciado, estos pueden ser benignos o malignos y lo que se Ha observado: el resultado fundamental del estudio es que del orden del 40% de los pólipos premalignos que son benignos son policlonales y del orden del 28% de los que son aparentemente van a ser malignos porque estamos en individuos jóvenes son también…