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Luisa AchaerandioIgnacio CrespoJuan Carlos GilJosé EdelsteinFrancis VillatoroHéctor SocasGastón Giribetinactivaciones genómicas virus viruela ovinavirus viruela caprina comparte inactivacionescomparación adn viral requiere precauciónramificación virus viruela ovinaárbol evolutivo del virus viruela ovinaconvergencia evolutiva adaptándose al mediolimitación encuadernaciones antiguas contaminación cruzadaIgnacio Crespovirus ARNvirus ADNJuan Carlos GilPoxviridaeCapri-Pox virusInteligencia Artificial
Comparación ADN viral requiere precaución
Con
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Ignacio Crespo explica las razones por las cuales los resultados obtenidos al comparar ADN viral deben ser interpretados con precaución, señalando una divergencia en la presencia de inactivaciones genómicas entre el virus de la viruela ovina y otros relacionados.
…Ignacio, me ha recordado el hecho de que hay muchos libros antiguos que se encuadernaban con piel, típicamente de cerdo. Y se me ha ocurrido que podría ser una fuente, vete tú a saber, de ADN antiguo. Aquí hay un problema, bueno hay muchos problemas que no He nombrado, de por qué estos resultados hay que cogerlos con cuidado. Por un lado, cuando comparaban el ADN de dos de estos tres virus, veían que a pesar de que parece que de esa familia se ramificó primero el del virus de la viruela ovina, este comparte con el virus de la viruela caprina ocho inactivaciones en su genoma que están presentes en ambos casos pero no están presentes en el. bovino y esto es un poco extraño para reconstruir el árbol. Ellos sospechan que siendo solo ocho puede que haya sido una convergencia evolutiva adaptándose a la presión del medio pero que haya sido independiente. entonces esto yo aprovecho para decir que cuidado habrá que ver y sobre lo que decías Juan Carlos que por eso me he acordado la otra limitación es que el encuadernado por supuesto pues puede haber sido de cuero y también se ha analizado pero es que sabemos que como esto era una industria y una industria tan importante por mucho que ahora la hayamos olvidado y el encolado sea con polímeros y la tapa también puede haber una contaminación cruzada que haya afectado los resultados porque han visto que Incluso en piel que podía provenir de ganado bovino, de vacas y de búfalos, aunque creo que en este caso solamente han analizado las vacas, había presencia del virus de la viruela caprina, algo que en principio no debería ocurrir porque es bastante específico…
Significado #1 · Palabras #1
Ignacio Crespo explica que los investigadores lograron obtener 22 genomas únicos del virus de la viruela ovina, aunque define el término 'único' en un contexto específico relacionado con la cobertura genética.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #12genomas únicos del virus viruela ovinamaterial genético según ignacio crespovirus antiguos fragmentos faltantesrepresentatividad del virus ignacio crespogenomas comparados ignacio crespo…muestras genéticas que parece que sí que tienen información del virus, pero de nuevo no valen todas. Necesitan que sean reconstrucciones suficientemente completas del genoma de cada uno de ellos y además suficientemente distintas, que son esos genomas únicos. Consiguen 22 genomas únicos de este virus concreto y aún así hay que tener en cuenta qué le llamamos único. Único no es que tengan todo el material genético que tenía ese virus, es suficiente. Entonces aquí hablamos de que tenga una cobertura de más de 0,1 por, que viene a ser que va A haber bastantes fragmentos que estén desaparecidos, fácilmente 9 de cada 10 en algunos casos, pues no vamos a tener esa información, pero es suficiente como para hacernos una idea de la representatividad de ese virus concreto en ese momento. Lo analizan y lo comparan con genomas que tenemos de. los otros dos, del de las cabras y del de las vacas. Y ven qué diferencias encuentran. De esta forma reconstruyen un árbol que ha sido bastante polémico porque en muchos otros textos, partiendo de otro tipo de estudios, tenían todas las combinaciones…
Ignacio Crespo reflexiona sobre un estudio reciente que analiza el virus de la viruela ovina y compara su velocidad de mutación con la de otros virus, destacando la influencia de la pandemia en la percepción de la tasa de mutación viral.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #4 · Palabras #10velocidad mutación viral pandemiavirus arn mutan menosignacio crespo estudio virus…se han analizado, del virus de la viruela ovina, son suficientemente distintos a los del virus de la viruela ovina que tenemos ahora o incluso de los restos más antiguos estudiados, de un caso que hubo a principios del siglo XX, que también habían incluido En este estudio. Eso significa que sí es el mismo, pero cambia y se puede esperar que cambie. La velocidad no parece muy grande comparado con otros virus; además, es un virus ADN, sabemos. Yo creo que nos quedó grabado por la pandemia, que los virus ARN en principio, porque es reduccionista pensar solamente que es la única característica importante, pero en principio mutan menos. Así que con esto han ido reconstruyendo un poco la historia y han sacado estas conclusiones que a mí me parecen bonitas, sobre todo, aunque ya lo haya dicho muchas veces, por cómo consiguen convertir lo que son unas fuentes. Que podrían ser simplemente históricas, que efectivamente también existen, redacciones de cómo había afectado el virus, ha ganado de tal época y habían aparecido todos los problemas que son parecidos a los que tiene la viruela en nuestro caso: fiebre alta de…
Ignacio Crespo explica las razones por las cuales los resultados obtenidos al comparar ADN viral deben ser interpretados con precaución, señalando una divergencia en la presencia de inactivaciones genómicas entre el virus de la viruela ovina y otros relacionados.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #1 · Palabras #1inactivaciones genómicas virus viruela ovinavirus viruela caprina comparte inactivacionescomparación adn viral requiere precauciónramificación virus viruela ovinaárbol evolutivo del virus viruela ovinaconvergencia evolutiva adaptándose al mediolimitación encuadernaciones antiguas contaminación cruzada…Ignacio, me ha recordado el hecho de que hay muchos libros antiguos que se encuadernaban con piel, típicamente de cerdo. Y se me ha ocurrido que podría ser una fuente, vete tú a saber, de ADN antiguo. Aquí hay un problema, bueno hay muchos problemas que no He nombrado, de por qué estos resultados hay que cogerlos con cuidado. Por un lado, cuando comparaban el ADN de dos de estos tres virus, veían que a pesar de que parece que de esa familia se ramificó primero el del virus de la viruela ovina, este comparte con el virus de la viruela caprina ocho inactivaciones en su genoma que están presentes en ambos casos pero no están presentes en el. bovino y esto es un poco extraño para reconstruir el árbol. Ellos sospechan que siendo solo ocho puede que haya sido una convergencia evolutiva adaptándose a la presión del medio pero que haya sido independiente. entonces esto yo aprovecho para decir que cuidado habrá que ver y sobre lo que decías Juan Carlos que por eso me he acordado la otra limitación es que el encuadernado por supuesto pues puede haber sido de cuero y también se ha analizado pero es que sabemos que como esto era una industria y una industria tan importante por mucho que ahora la hayamos olvidado y el encolado sea con polímeros y la tapa también puede haber una contaminación cruzada que haya afectado los resultados porque han visto que Incluso en piel que podía provenir de ganado bovino, de vacas y de búfalos, aunque creo que en este caso solamente han analizado las vacas, había presencia del virus de la viruela caprina, algo que en principio no debería ocurrir porque es bastante específico…
Ignacio Crespo explica que la clasificación de los virus se basa en la identificación y el uso de analogías, comparando la situación con la denominación en inteligencia artificial.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #11poxviridae y sus géneroscapri pox virus como ejemploanalogías en clasificación de virusinteligencia artificial y denominación…virus, ¿no? Sin mencionar familia o género, porque no están dentro del árbol taxonómico habitual. Aunque tienen su propia clasificación que yo desconozco completamente. Sí, es verdad que es conflictivo y es una cosa en la que nunca me he adentrado mucho. Sí que se suele hablar del grupo, la familia Poxviridae y dentro de ellos están géneros, aunque es análogo. Porque, claro, hablar de que es lo mismo como si fuera algo esencial. El género de un virus es con el que se identifique, no vamos a estar aquí poniendo etiquetas. Ahí tendríamos en principio géneros dentro de los cuales encontramos el Capri-Pox virus y dentro de ese los tres de los que hemos estado hablando hoy. Se han usado las mismas palabras, quizás no sea buena idea; pero lo hacemos todo el rato, si es que pensamos con analogías, vamos a hablar luego de la inteligencia artificial, pues dime tú si no estamos ahí haciendo licencias de cómo llamarle a las cosas. Bueno, pues vamos a ir pasando de tema y Juan Carlos, llevamos ya varias semanas posponiendo el tema que nos habías propuesto que te parecía muy interesante sobre el transporte de protones en el ácido fosfórico tengo mucha curiosidad realmente por qué es lo…