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Alberto ApariciBorja TosarGastón GiribetFrancis VillatoroHéctor SocasJuan Carlos Gilanálisis adn en revistas science celldebate generado por análisis adnatractivo del análisis adnanálisis de proteínas para clasificacióntécnicas diferentes llegan a conclusionesmucha gente en común análisis dnadudas sobre resultados análisis dnapaleoproteómica cráneo homo longimaterial limitado estudio paleogenómicaproteínas escasas análisis cellScienceCellADNAlberto ApariciFrancis VillatoroHomo longiADN nuclear
Análisis ADN en revistas Science Cell
Con
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Héctor Socas reflexiona sobre dos artículos científicos publicados en las revistas Science y Cell, destacando que la discusión se ha centrado principalmente en el análisis de ADN debido a su atractivo y potencial para generar debate.
…¿no? Sobre cuántos seguros estamos de esta afirmación. Francis también planteaba esta investigación en la cual se concluía que había un Denisovano de vacaciones en España o algo así, bueno, en fin, estas cosas pueden pasar, pero recordemos que estamos. Hablando de dos papers diferentes que se publicaron, uno en Science y otro en la revista Cell, hemos estado hablando aquí sobre todo de la parte del análisis de ADN porque es lo más emocionante y lo que da más juego, pero también no recuerdo cuál era cuál; creo que el de Cell era el que hablaba del análisis. De ADN y el de Science hablaba de análisis de proteínas, que también es otro análisis que se ha hecho, que también arroja las mismas conclusiones, o sea que hay dos análisis diferentes que llegan a la misma conclusión. Dos análisis diferentes con dos técnicas diferentes, porque podría ser otro grupo analizando también el ADN, pero no, no son dos técnicas distintas y de hecho hay mucha gente en común en los dos análisis y en ambas con serias dudas sobre los resultados. No solo hay dudas sobre la paleogenómica, sino también hay dudas sobre la paleoproteómica. Ah, claro, claro. Bueno, pero eso es por el poquísimo material que se ha sacado, ¿no? Por lo escasísimo que se ha sacado. Estamos hablando de muchas proteínas, estamos hablando de muy poquitas proteínas. Entre los autores, por lo menos del de Cell, que es el que yo tengo acceso, porque no tengo acceso a Science. Destacaría Kiao Mei Fu, que es una mujer, una experta en paleontología, una figura muy relevante en el tema de paleontología asiática. Estaba el pavo este también, que hablaban de... Ya que estamos hablando de China, vamos a aprender cosas de China; la Q en…
Significado #1 · Palabras #1
Francis Villatoro explica el proceso de análisis de ADN nuclear realizado sobre el sarro encontrado en un diente del cráneo conocido como 'Homo longi', y las dificultades para secuenciar fragmentos suficientemente largos.
Habla: Francis VillatoroSignificado #13adn nuclear homo longisecuenciación adn denisobanosvariabilidad humana moderno leandertalespuzzle adn referencia humano…pura emoción. Aquí los Men in Black empiezan a trabajar porque iba a decir algo importante como que es extraterrestre, que es lo que dice David Loeb. El próximo artículo. Bueno, en principio de este sarro, de esto que han encontrado en el diente han hecho un Análisis de ADN buscando ADN nuclear porque el ADN nuclear es el más claro. El ADN nuclear es muchísimo más largo y, por tanto, aunque encuentres muchos trozos, puedes acoplarlo, puedes ajustarlo a un ADN de referencia, un ADN de referencia humano y ver las diferencias; y esas diferencias de un único nucleótido, etcétera, son las que marcan si estás en una especie o en otra, si están dentro de la variabilidad propia del humano moderno o si corresponden a algo parecido a las variantes que se han observado en leandertales o las que se han observado en denisobanos. Y no se encontró, no se logró aislar adecuadamente, o sea, no se logró secuenciar, en la palabra técnica, trozos suficientemente largos porque lo que hace es coger los trozos e irlos poniendo como en un puzzle. Yo tengo varias. Copias de una pequeña región y tengo trozos un poquito más grandes que esa región y los voy colocando como en vertical y voy pegándolos como si fueran piecitas de Lego que voy colocando con los colores adecuados. Entonces no se logró reconstruir ADN nuclear,…
Alberto Aparici explica que el sarro encontrado en un diente del cráneo 'Homo longi' ha sido la única fuente para obtener ADN.
Habla: Alberto ApariciSignificado #18adn mitocondrial cráneo homo longimitocondrias como bacterias ancestralesrespiración celular y mitocondriasancestros unicelulares incorporaron bacterias…el ordenador en un momento dado. De hecho, yo me quedo escuchándoos a vosotros y vosotros decís: “Se ha quedado Alberto como congelado”, no sé cuántos, y yo no. Pero bueno, en fin. Tú seguís hablando ahí. Espero no haber metido la paz con lo que acabo. de comentar Seguro que no, te he convencido que no Bueno, la cosa que este sarro ha sido el único lugar donde se ha podido encontrar algo de ADN Y lógicamente cuando el ADN es muy escaso, lo que se ha encontrado es ADN mitocondrial Hay que pensar siempre, recordemos, las mitocondrias son esta parte de la célula donde ocurre la respiración y la mitocondria originalmente era una bacteria Es una bacteria que nuestros antepasados, nuestros tataratatarabuelos unicelulares, se incorporaron, digamos, esa bacteria al interior de las células Y en cada célula humana normalmente hay decenas, centenares, a Veces miles de mitocondrias. Entonces, copias del ADN de cada mitocondria hay muchísimas en cada célula. En cambio, copias del ADN de la célula, hay una en cada célula, con lo que cuando tienes escasez de ADN lo que encuentras primero siempre es el ADN…
Alberto Aparici explica cómo la degradación química de los nucleótidos puede alterar la composición del ADN antiguo, llevando a un exceso de citosinas como indicador de antigüedad.
Habla: Alberto ApariciSignificado #4adn antiguo sarro dentalcontaminación moderna adn dientesadenina citosina marcador adndegradación química nucleótidos altera adnexceso citosinas indicador antigüedad adnartículos cráneo proteómica y adn…tiene sentido con los estratos para hacer todo este análisis. Eso no lo he contado porque tampoco quiero extenderme yo aquí y pasarme dos horas hablando de los denisovanos para compensar, pero para hacer todo este análisis uno tiene que estar seguro de que el ADN que está utilizando es ADN antiguo, cuidado porque de todo el ADN que sacas de ese poquito de sarro que hay en el diente, el 90% es contaminación moderna solo una cantidad muy pequeñita es antiguo y para identificar que sea antiguo pues hay una serie de marcadores, por ejemplo en el ADN la adenina se convierte en citosina. si no recuerdo mal Hay una serie de cambios químicos que ocurren simplemente porque los nucleótidos se degradan químicamente y hacen que un nucleótido que debería ser de un tipo se convierta en un nucleótido de otro tipo Entonces si tú ves un exceso de citosinas en el ADN, tienes un cierto argumento en favor de que ese ADN es más antiguo y por lo tanto no es contaminación con este cráneo se han publicado dos artículos, uno es sobre ADN, que es de lo que estoy hablando todo el rato, y hay otro que es sobre proteómica se han sacado también proteínas antiguas de ese pedazo de sarro y se han analizado y en las proteínas ocurre lo mismo se producen una serie de desaminaciones, desaparecen ciertos grupos amina cuando las proteínas pasan mucho tiempo y se van degradando y eso te…
Alberto Aparici explica el proceso de análisis de ADN antiguo, detallando cómo los rigurosos tests aplicados reducen significativamente la cantidad de material genético utilizable.
Habla: Alberto ApariciSignificado #10tests severos reducen material genético2000 fragmentos adn analizados8000 posiciones nucleótidos adn…pasan mucho tiempo y se van degradando y eso te permite saber que las proteínas que estás sacando de ahí son proteínas antiguas o por lo menos tienen una alta probabilidad de ser proteínas antiguas en ese sentido. O sea que hay toda una serie de tests que Tú tienes que hacer para no estar analizando ADN, ¿qué pasaba por ahí simplemente? Y esos tests se hacen; son tests muy severos y te suelen dejar con muy poquito del ADN que tú sacabas. Tú sacas una gran cantidad de ADN y al final igual te quedas con, me parece que en este caso eran unos 2.000 fragmentos o algo por el estilo. Estoy hablando de memoria, no estoy seguro. No, estoy viendo aquí 8.000 posiciones de nucleótidos. Por lo tanto, 8 .000 pares de bases en total del ADN que tú vas a analizar. Es muy poquito, en realidad. Desde luego, además que no crean los oyentes que lo que estamos sacando de aquí es el ADN de una mitocondria como quien tira de una cuerda y lo saca entero. No, no, tú lo que tienes es muchos trocitos muy chiquitines. Me parece que la media de cada trocito…
Héctor Socas reflexiona sobre dos artículos científicos publicados en las revistas Science y Cell, destacando que la discusión se ha centrado principalmente en el análisis de ADN debido a su atractivo y potencial para generar debate.
Habla: Héctor SocasSignificado #1 · Palabras #1análisis adn en revistas science celldebate generado por análisis adnatractivo del análisis adnanálisis de proteínas para clasificacióntécnicas diferentes llegan a conclusionesmucha gente en común análisis dnadudas sobre resultados análisis dnapaleoproteómica cráneo homo longimaterial limitado estudio paleogenómicaproteínas escasas análisis cell…¿no? Sobre cuántos seguros estamos de esta afirmación. Francis también planteaba esta investigación en la cual se concluía que había un Denisovano de vacaciones en España o algo así, bueno, en fin, estas cosas pueden pasar, pero recordemos que estamos. Hablando de dos papers diferentes que se publicaron, uno en Science y otro en la revista Cell, hemos estado hablando aquí sobre todo de la parte del análisis de ADN porque es lo más emocionante y lo que da más juego, pero también no recuerdo cuál era cuál; creo que el de Cell era el que hablaba del análisis. De ADN y el de Science hablaba de análisis de proteínas, que también es otro análisis que se ha hecho, que también arroja las mismas conclusiones, o sea que hay dos análisis diferentes que llegan a la misma conclusión. Dos análisis diferentes con dos técnicas diferentes, porque podría ser otro grupo analizando también el ADN, pero no, no son dos técnicas distintas y de hecho hay mucha gente en común en los dos análisis y en ambas con serias dudas sobre los resultados. No solo hay dudas sobre la paleogenómica, sino también hay dudas sobre la paleoproteómica. Ah, claro, claro. Bueno, pero eso es por el poquísimo material que se ha sacado, ¿no? Por lo escasísimo que se ha sacado. Estamos hablando de muchas proteínas, estamos hablando de muy poquitas proteínas. Entre los autores, por lo menos del de Cell, que es el que yo tengo acceso, porque no tengo acceso a Science. Destacaría Kiao Mei Fu, que es una mujer, una experta en paleontología, una figura muy relevante en el tema de paleontología asiática. Estaba el pavo este también, que hablaban de... Ya que estamos hablando de China, vamos a aprender cosas de China; la Q en…