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Luisa AchaerandioBorja TosarFrancis VillatoroHéctor SocasMaría Ribesviroides sin encapsulado arnvirus con cápside proteicadiferencia viroides virus arnviroides cadenas pequeñas de arnnucleótidos en forma circularluisa achaerandio aclara viroidesARNADNHéctor SocasLuisa AchaerandioCELViroideOpen Frame ReadHarbor RibocimasMicrobioma humanoMarcos de la PeñaUniversidad de Valencia (UPV)ARN mensajeroViroidesOpen frameCristinaVirusFrancis Villatoro
Viroides sin encapsulado ARN
Con
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Héctor Socas agradece a Luisa Achaerandio la explicación sobre biomoléculas para facilitar su comprensión por parte de los oyentes y aclara la diferencia entre viroides y virus.
…me lo has explicado de forma muy básica para la gente que no sabe y me gustaría trasladar eso también a nuestros oyentes porque habrá algunos también que también tengan tan poco conocimiento de estos temas como yo O sea, si yo lo he entendido bien, el asunto Es que estos viroides, la diferencia con los virus, por ejemplo, es que simplemente, o sea, es lo más sencillo que puede haber autorreplicante: que es una pequeña cadena de ARN sin encapsulado. O sea, el virus viene con una cápside proteica, ¿no? O sea, el virus es un virus tiene dos partes: tiene el ARN, que es lo que se replica, o el ADN, y una envoltura proteica que lo protege, ¿no? Una cápsula, digamos, dentro de una cápsula. Nada, a lo loco, al aire, es solamente una cadenita muy pequeña de ARN que pueden ser cientos de nucleótidos, además en forma circular, que no tiene extremos porque está todo conectado y eso lo hace un poquito más estable y que infecta células de plantas y dentro de las células se puede No, no, perdona, perdona Héctor No, no, los viroides son Los que infectan Plantas. Digamos plantas, pero los obeliscos es como si fuera una especie de evolución de la naturaleza. Los obeliscos ya se ha demostrado. Sí, pero yo soy los viroides. Ah, vale, los viroides en sí, vale, vale, ok. Sí, los viroides sí…
Significado #4 · Palabras #1
Luisa Achaerandio explica la necesidad de comprender el concepto de viroide para entender los nuevos agentes heredables de ARN recientemente descubiertos.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #6 · Palabras #3viroid-like colonies microbioma humanoelementos heredables de arn cel 2024muestras del microbioma humanoconcepto viroide agentes heredables arnestructura arn escalón pequeñoagente infeccioso plantas viroidemacromolécula biológica ajuste finoarn circular celmarco de lectura proteínaribocimas martillo harborenzimas ribocimas replicaciónviroides sin open framemarco de lectura abierto viroidesluisa achaerandio y viroides…estuvieron en La Revuelta, en Radio Televisión Española. Es verdad que viendo, por ejemplo, nada más que parándote con el nombre de Marcos de la Peña, aparece en X y creo que aparece justo como un pequeño clip de vídeo donde se ve en ese programa, ¿sabes? Hablando precisamente de la importancia de la ciencia, vale, pues nada más que el artículo, yo lo recomiendo que lo veáis porque es un artículo muy bonito. Es un artículo que claramente ya te dice con el título de qué estamos hablando, que supongo que lo aportaremos en las notas del episodio, pues como siempre, ya te lo está aclarando, te dice Viroid-like colonies of human microbiomes, o como se pronuncia. Pues básicamente se traduce como unos microbiomas, o sea, en el microbioma humano, es decir, dentro, en concreto, utilizando o extrayendo muestras del microbioma humano se han encontrado unos colonizadores que se parecen, B-Joid-like, se parecen a unas entidades, por así llamarlo, o como lo llaman en este artículo del CEL de 2024, lo llaman elementos heredables de ARN, agentes o elementos genéticos. ¿Esto qué significa? Pues a lo mejor hay que empezar por el concepto de viroide, que digamos es un escalón un poco más pequeño de estructura de ARN. Ya te digo, aquí me he encontrado yo que no sabía bien si empezar desde el principio a principio o simplemente pues centrarme en este punto de lo que era un viroide en sí. Un viroide básicamente es un agente infeccioso para plantas, como se puede entender generalmente ¿vale? Es como se le conoce de manera general y digamos que su forma y comportamiento se parece mucho a este nuevo agente heredable, pero no del todo. Esto digamos que es un ajuste fino a la hora de poder diferenciar un agente biológico de otro en realidad una macromolécula biológica o una biomolécula de otra ¿vale? Estamos hablando de un ajuste fino. ¿En qué se diferencian? Pues como os decía en el artículo del CEL se ve clarísimo. Es un ARN circular, básicamente, que yo tengo aquí un dibujito que se ve muy claro, donde la diferencia con un viroide es que tiene un Open Frame Read, que es básicamente un marco de lectura, es decir, que se tiene en su interior la información para traducir una proteína muy concreta con la que se le pueda identificar y también porta ribocimas, ribocimas en forma de martillo que se le llama, ¿vale? Harbor Ribocimas, ¿vale? Son básicamente unas enzimas que en el momento en el que este agente infeccioso se introduce en su huésped utiliza esa maquinaria celular para crear estas ribocimas y poder replicarse. Entonces se diferencia precisamente en eso, en que si hablamos de viroides no estamos hablando de una biomolécula que tenga ese open frame, ese marco de lectura abierto. No tiene esa capacidad de identificarse con unas proteínas concretas y pues eso básicamente es como una diferencia como muy fundamental, pero ¿por qué digo yo que hay que ir al ajuste fino? Porque esto no es posible identificarlo con nuestros ojos, no es lo mismo diferenciar un perro de un pollo, por así decirlo, si estamos hablando de seres, que una biomolécula de otra y para eso, pues que me corrija evidentemente Francis, que es el que sabe…
Luisa Achaerandio explica cómo las técnicas de laboratorio para analizar biomoléculas deben complementarse con bioinformática para comparar secuencias de ARN o proteínas con bases de datos existentes.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #7bioinformática para secuencias de arnsecuencia de aminoácidos en base de datoshomologías entre proteínas y viroidesartículo cel del 2024…estaríamos extrayendo ARN, ¿vale?, ácido ribonucleico de ese microbioma humano en concreto de las heces y de la saliva. Y para ello necesitan muchas técnicas de laboratorio, entre las que se encuentran pues Northern Plot y técnicas muy concretas, ¿vale? entonces una vez que ya lo tienes digamos estas técnicas de laboratorio se tienen que complementar con técnicas de bioinformática que básicamente es trasladar esa secuencia de aminoácidos partimos de la ARN o de las proteínas que encontremos en una muestra y esa secuencia de aminoácidos hay que pasarla a una base de datos y compararla pues con secuencias anteriores que tenemos tanto de nucleótidos como de proteínas y en ese proceso de comparación se pueden establecer lo que se llaman homologías por ejemplo con las proteínas o secuencias parecidas y se puede digamos que sacar un parecido o una diferencia entre este viroide que te digo y lo que se ha descubierto nuevo y se establece como nuevo. De hecho, en el artículo del CEL del 2024, Es el artículo en el que se le llama por primera vez obelisco. Y tiene que ser muy emocionante, realmente, ponerle el proceso ahora mismo en vivo de ponerle el nombre a una entidad biológica que realmente es nueva, pero que necesita todo este proceso tan…
Héctor Socas agradece a Luisa Achaerandio la explicación sobre biomoléculas para facilitar su comprensión por parte de los oyentes y aclara la diferencia entre viroides y virus.
Habla: Héctor SocasSignificado #4 · Palabras #1viroides sin encapsulado arnvirus con cápside proteicadiferencia viroides virus arnviroides cadenas pequeñas de arnnucleótidos en forma circularluisa achaerandio aclara viroides…me lo has explicado de forma muy básica para la gente que no sabe y me gustaría trasladar eso también a nuestros oyentes porque habrá algunos también que también tengan tan poco conocimiento de estos temas como yo O sea, si yo lo he entendido bien, el asunto Es que estos viroides, la diferencia con los virus, por ejemplo, es que simplemente, o sea, es lo más sencillo que puede haber autorreplicante: que es una pequeña cadena de ARN sin encapsulado. O sea, el virus viene con una cápside proteica, ¿no? O sea, el virus es un virus tiene dos partes: tiene el ARN, que es lo que se replica, o el ADN, y una envoltura proteica que lo protege, ¿no? Una cápsula, digamos, dentro de una cápsula. Nada, a lo loco, al aire, es solamente una cadenita muy pequeña de ARN que pueden ser cientos de nucleótidos, además en forma circular, que no tiene extremos porque está todo conectado y eso lo hace un poquito más estable y que infecta células de plantas y dentro de las células se puede No, no, perdona, perdona Héctor No, no, los viroides son Los que infectan Plantas. Digamos plantas, pero los obeliscos es como si fuera una especie de evolución de la naturaleza. Los obeliscos ya se ha demostrado. Sí, pero yo soy los viroides. Ah, vale, los viroides en sí, vale, vale, ok. Sí, los viroides sí…
Luisa Achaerandio reflexiona sobre la existencia de entidades biológicas aún más simples que los virus, denominadas 'obeliscos', y recuerda cómo el descubrimiento de estas entidades amplió nuestra comprensión del mundo molecular.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #15 · Palabras #6obeliscos más simples que los virusentidades biológicas cadena de arndescubrimiento obeliscos mundo molecular…de la vida, o sea, que podamos llegar a extender un poquito más de lo que se puede interpretar como autonomía, ¿no? Como biomolécula, ¿no? Un poquito más, mucho más abajo del ADN. La vida más simple, ¿no?, que nos habían dicho que eran los virus cuando yo Iba al colegio, nos resulta que todavía hay cosas más simples, más básicas que los virus: que es una simple cadena que se replica de ARN, ¿no? Impresionante. Y fíjate cómo se ha abierto el espacio, que entre los virus y los viroides hemos encontrado precisamente esta entidad que se ha llamado obelisco, así es como lo Han denominado, Obelisque, así es como lo han denominado Obelisk, como SK, que si hubiera sido el revés, Obelix, como KS, podríamos preguntarnos por Asterix, que seguro está también por ahí. Bueno, vamos a hacer la pausita; ahora nos sigues contando cosas…
Luisa Achaerandio explica la naturaleza y características de los 'obeliscos', entidades biológicas descubiertas recientemente en bioquímica, destacando su estabilidad debido a su estructura circular de ARN.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #10 · Palabras #11árn circular cerrado covalentementeexonucleasas afectan al arn mensajeroestabilidad de los obeliscos luisa achaerandioácido ribonucleico estructura circular…y Luisa nos estaba contando esta fascinante historia de los viroides y los obeliscos, que es un descubrimiento reciente de la bioquímica y al contrario que los viroides, estos obeliscos sí que están además dentro del cuerpo humano, en nuestra microbiota. Exactamente, por ahí van los tiros entonces me gustaría recordar que un obelisco es un ARN es decir un ácido ribonucleico circular cerrado covalentemente es decir que al estar cerrado no le afectan unas enzimas que se llaman exonucleasas con lo cual lo hacen estable porque eso es uno de los problemas que tiene el ARN que por ejemplo el ARN mensajero determinados tipos de ARN que hay muchísimos Las vacunas de la COVID, ¿no? El RNA mensajero de las vacunas Exactamente, hay muchísimos, sí, y uno de los problemas que tenían era eso, que al ser moléculas abiertas y lineales, enseguida se degradaban y se veían afectadas por determinadas enzimas, por…
Francis Villatoro responde a una pregunta de Cristina sobre si los viroides, entidades biológicas aún más simples que los virus, pueden considerarse vivos, aclarando que su definición depende del contexto y la perspectiva.
Habla: Francis VillatoroSignificado #12definición de vida viroidescristal de ácidos nucleicos viroideperspectiva sobre la vida viroides…serie de estructuras bioquímicas muy sencillas. No estaba hablando de un ejemplo concreto, cuando hablamos de un individuo concreto, tú estás vivo porque perteneces a una especie que evoluciona. ¿Y llamar vida a un viroide entonces? Claro, está la idea de... Cristina preguntaba: ¿los viroides, que son menos que los virus, que no es nada, una cosa de ridícula, se pueden considerar vivos? ¿Un ser vivo? De hecho, es eso. Hablando, partiendo del concepto de vida. No estamos hablando de coger un viroide concreto y decir esto está vivo, porque cogemos un viroide concreto y lo que es un cristal, ¿vale? Es un cristal, no es nada más, es un cristal de ácidos nucleicos. Yo entiendo lo que dice Héctor; yo creo que Héctor un poco lo que dice es, ¿cómo sabes? Si es vida algo que encuentras, por ejemplo, en Marte, porque no tienes todo el contexto, solo encuentras unas moléculas entrelazadas Entonces, claro, si quieres detectar, por ejemplo, vida en Marte, necesitarías un contexto mucho mayor que…