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Isabel CorderoAlberto ApariciBorja TosarJuan Carlos GilFrancis VillatoroHéctor Socasagua pesada cern universidad autónomamicroscopía de fluorescencia en agua pesadatinción ribosomal de segmentos 16sarqueas en garrafas abandonadasprotocolo fish para ribosomas activosdetección de bacterias con fisharqueas no detectadas con fishviñeta xkcd científicos laboratorioARN ribosomalJuan Carlos GilCERNUniversidad Autónoma de Madridcromosoma 1717Q21Alberto ApariciKingFISHXKCDcitocromos CAlbertoADNfigura 1
Tinción ribosomal de segmentos 16s
Ep516: Premios Princesa de Asturias; El Enigma del He; Bacterias en Agua Pesada; Alones
13 de junio de 20254 momentos
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Juan Carlos Gil describe cómo garrafas de agua pesada donadas por el CERN a la Universidad Autónoma de Madrid en 1989 fueron almacenadas durante más de 30 años antes de ser examinadas.
…por el CERN al Departamento de Física de Materiales de entonces de la Facultad de Ciencias de la Universidad Autónoma de Madrid en 1989, 1989. No he encontrado; no existe referencia de qué demonios, para qué demonios se donó y qué hacía ahí, ¿no? Esperando. Bueno, pues estas garrafas de agua pesada purísima han estado selladas a oscuras, sin nutrientes, olvidadas y abandonadas ahí en un sótano durante más de 30 años, hasta que hace un par de años a alguien se le ocurrió mirar dentro. Supongo que sin mucha esperanza, ¿no? Bueno, pues se le ocurrió a ver si había algún bichito. Utilizaron microscopía de fluorescencia, utilizaron tinción específica para el ARN ribosomal de los segmentos 16S de bacterias y otra tinción específica para arqueas. El protocolo de esto se llama Hibridación Fluorescente In-Situ, FISH, como pescado en inglés. Bueno, el caso es que estas extinciones detectan ribosomas activos, es decir, actividad metabólica, vamos, bichitos vivos y coleando. Y vaya si detectaron montones y montones de bacterias; arqueas no apareció ninguna, ¿vale? Pero aparecieron montones y montones de arqueas. Recordaba cuando preparaba esto hace un par de semanas; había una tira de XKCD, que todos los frikis conoceremos, en una de sus viñetas se ve que están varios científicos en un laboratorio y dice uno: Es curioso cómo, pese a ser una De las ramas principales del árbol de la vida, no se conoce ninguna especie de arquea que cause enfermedades en humanos. Al que otro responde: mira, personalmente creo que es porque esos respiradores de metano, dicen, son demasiado raros e incompetentes como…
Significado #1 · Palabras #1
Juan Carlos Gil describe cómo garrafas de agua pesada donadas por el CERN a la Universidad Autónoma de Madrid en 1989 fueron almacenadas durante más de 30 años antes de ser examinadas.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #1 · Palabras #1agua pesada cern universidad autónomamicroscopía de fluorescencia en agua pesadatinción ribosomal de segmentos 16sarqueas en garrafas abandonadasprotocolo fish para ribosomas activosdetección de bacterias con fisharqueas no detectadas con fishviñeta xkcd científicos laboratorio…por el CERN al Departamento de Física de Materiales de entonces de la Facultad de Ciencias de la Universidad Autónoma de Madrid en 1989, 1989. No he encontrado; no existe referencia de qué demonios, para qué demonios se donó y qué hacía ahí, ¿no? Esperando. Bueno, pues estas garrafas de agua pesada purísima han estado selladas a oscuras, sin nutrientes, olvidadas y abandonadas ahí en un sótano durante más de 30 años, hasta que hace un par de años a alguien se le ocurrió mirar dentro. Supongo que sin mucha esperanza, ¿no? Bueno, pues se le ocurrió a ver si había algún bichito. Utilizaron microscopía de fluorescencia, utilizaron tinción específica para el ARN ribosomal de los segmentos 16S de bacterias y otra tinción específica para arqueas. El protocolo de esto se llama Hibridación Fluorescente In-Situ, FISH, como pescado en inglés. Bueno, el caso es que estas extinciones detectan ribosomas activos, es decir, actividad metabólica, vamos, bichitos vivos y coleando. Y vaya si detectaron montones y montones de bacterias; arqueas no apareció ninguna, ¿vale? Pero aparecieron montones y montones de arqueas. Recordaba cuando preparaba esto hace un par de semanas; había una tira de XKCD, que todos los frikis conoceremos, en una de sus viñetas se ve que están varios científicos en un laboratorio y dice uno: Es curioso cómo, pese a ser una De las ramas principales del árbol de la vida, no se conoce ninguna especie de arquea que cause enfermedades en humanos. Al que otro responde: mira, personalmente creo que es porque esos respiradores de metano, dicen, son demasiado raros e incompetentes como…
Juan Carlos Gil explica cómo Alberto mencionó que para caracterizar las comunidades bacterianas se realizó un análisis metagenómico, una técnica de biología molecular.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #16análisis metagenómico comunidades bacterianasextracción secuenciación adn total alobestia masivabioinformático del adn muestra complejagenes rutas metabólicas microorganismos…para la mayoría de cualquier otro ser vivo. Comentaba antes con Héctor que hace unos episodios hablaba de la famosa bacteria Conan que es capaz de resistir dosis de radiación miles de veces superiores a las que acabaría con cualquiera de nosotros. Bueno, pues para caracterizar las comunidades bacterianas, lo mencionó Alberto al principio, hicieron análisis metagenómico. Es una técnica de biología molecular que consiste en la extracción y secuenciación alobestia masiva y un análisis posterior bioinformático del ADN total contenido en una muestra que puede ser arbitrariamente compleja. Una paletada de arena del campo, el contenido del intestino de un bicho y en este caso pues un mogolloncito de agua pesada con bichitos dentro. Esta técnica permite de una sola vez identificar los microorganismos presentes sin necesidad de lo que se hace habitualmente que es aislarlos y cultivarlos de forma individual y también permite dar pistas de sus genes y de sus rutas metabólicas. Esto aparece en el panel B de la figura 1. para, por separado, con colorines para los tres contenedores. Bueno, pues ahí se aprecia como las firmas genéticas más abundantes de los bichitos son de dos filos, pseudomonadota y bacteriodota, filos que contienen, son familias que contienen bacterias que se…
Alberto Aparici explica cómo King identificó genes relacionados con enfermedades buscando marcadores genéticos en cromosomas específicos, y describe la ubicación de estos marcadores en el cromosoma 17.
Habla: Alberto ApariciSignificado #5marcadores genéticos cromosoma 17artículo 17q21 cromosomasbrazo largo cromosoma 17…si todos coinciden con el mismo cromosoma ¿vale? porque yo asumo que ese gen estropeado que yo no sé cuál es ni sé dónde está se habrá heredado junto con material que está dentro de ese cromosoma ¿vale? y resulta que terminó encontrando en toda la gente que estaba en esas familias marcadores genéticos del brazo largo del cromosoma 17. Por eso en el artículo lo que hablan es 17Q21. 17 es el cromosoma 17, Q es el brazo largo y 21 es el fragmento 21, que esas cosas se separan en diversas bandas, del brazo largo. ¿vale? Entonces, fijaos hasta qué punto sin tú poder identificar el gen concreto, si sabes dónde están tus marcadores genéticos y utilizando esta técnica de que cuando tú has hecho el ADN de esta persona, realmente lo que has hecho es cortar en trocitos el ADN del…
Alberto Aparici continúa explicando el proceso de comparación de proteínas para determinar cercanía genética, mencionando ejemplos concretos como fibrinopéptidos, citocromos C y hemoglobinas.
Habla: Alberto ApariciSignificado #12secuencia de aminoácidos fibrinopéptidoscitocromos c cercanía genéticacadenas de hemoglobina secuencia…de una proteína era difícil no es que fuera difícil secuenciar el ADN es que secuenciar los aminoácidos de una proteína también era complicado y de hecho lo dicen en su artículo el artículo a mi me pareció muy claro y muy transparente en él dicen teníamos 5 o 6 proteínas de las cuales se conocía la secuencia de aminoácidos a ver si las encuentro ahora sí, están aquí. Fibrinopéptidos, citocromos C y hemoglobinas. Bueno, las diversas cadenas de la hemoglobina que tiene varias, ¿no? Entonces esas proteínas no eran extremadamente grandes y eran suficientemente interesantes como para que la gente hubiera secuenciado la cadena. ¿No? Entonces esas, las pudieron comparar directamente. Esas pudieron decir: vale, ¿cómo son las de los humanos? ¿Cómo son las de los chimpancés? Vamos a mirarlo. Y entonces lo que encontraron fue que eran todas ellas idénticas salvo una de las cadenas de la…