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Francis VillatoroHéctor SocasGastón Giribetproteínas quiralidad invertida prionesaminoácidos estrógidos priones tierrasilverine pregunta priones aminoácidosprion proteína mal plegadamutación aminoácidos clave plegamientoribosoma añade aminoácido a aminoácidoestructura proteína entorno aguaNéstor MartínezSilverine MaxilverFrancis VillatoroThomas VilaSabineradiación de HawkingHéctor SocasARN mensajeroARNGastón GiribetTierraBennuADN
Silverine pregunta priones Aminoácidos
Con
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Héctor Socas combina una pregunta de Néstor Martínez con otra de Silverine para aclarar si las proteínas con quiralidad invertida están relacionadas con los priones y discute la composición de aminoácidos en estos últimos.
…solamente una única quiralidad, depende de la técnica de síntesis que utilices. Hoy en día para temas de fármacos, etc., se usan ya técnicas de síntesis que directamente te dan una única quiralidad sin necesidad de tener que separar después quiralidades, ¿no? Hay una pregunta que voy a combinar dos en realidad: una de Néstor Martínez y otra de Silverine o Silverin. Aprovecho y le pregunto: ¿cómo lo diríamos?, ¿Silverine o Silverine Maxilver?. Preguntaba originariamente Néstor si las proteínas con quiralidad invertida son los temibles priones y añadía Maxilver que es difícil que los priones tengan aminoácidos de estrógidos cuando en la Tierra son levógidos, ¿no? Sí, no tiene nada que ver. El prion básicamente es una proteína que está mal plegada. Claro, son las mal plegadas. ¿Y por qué está mal plegada? Pues porque tiene una mutación. Hay ciertos aminoácidos que están cambiados. Hay una mutación que hace que un aminoácido que es clave en el plegamiento y que hace que muchas veces en el plegamiento el ribosoma va añadiendo aminoácido a aminoácido y hay un proceso en el que se va reestructurando la estructura conforme se va sintetizando la proteína. La proteína está como una cosa alargada y se va doblando y se conformando y depende pues del entorno, del agua, que lo envuelve todo, pero también de la propia estructura del ribosoma, de la propia estructura de la propia proteína. Entonces a veces cambiar un único aminoácido hace que una proteína se pliegue de una manera ligeramente distinta. Y un aplicamiento ligeramente distinto, pues normalmente no tiene ningún tipo de consecuencia; de hecho, hay muchas proteínas que tienen partes móviles, pero si afecta al sitio activo, al lugar donde está, digamos, radicada la función biológica de la…
Significado #1 · Palabras #1
Gastón Giribet explica la relación entre los aminoácidos y la vida en la Tierra, comparando la complejidad de las proteínas con la de estos compuestos orgánicos básicos.
Habla: Gastón GiribetSignificado #13 · Palabras #15aminoácidos como ladrillos fundamentalesproteína complejidad superior a aminoácidomoléculas orgánicas y vida en la tierradécada del 50 y conocimiento de aminoácidos…Recordemos que las proteínas son unas macromoléculas orgánicas que tienen cadenas de aminoácidos Los aminoácidos son moléculas más pequeñas, moléculas orgánicas también, y 14 de los 20 aminoácidos que existen en las proteínas conocidas están en Bennu En la Tierra los aminoácidos son elementos que tienen que ver con la vida en la Tierra. Estas moléculas orgánicas a ver, para que entendamos, la proteína es una cosa mucho más compleja que un aminoácido, muchísimo más compleja que un aminoácido, pero los aminoácidos son elementos, son ladrillos fundamentales para la vida que conocemos. Recordemos, ustedes recordarán por ejemplo allá por la década del 50, no porque ustedes se acuerden, ninguno de nosotros había. nacido, pero el experimento Stanley Miller, ¿no? de la década del 50, ese experimento pionero en el cual el tipo era una gran probeta, puso no solamente... ¿Cómo? Era Uri Miller, el experimento. Ah, puede ser ese Uri Miller. Uri, Stanley Miller. Stanley…
Gastón Giribet explica que los aminoácidos encontrados en la Tierra y en el asteroide Bennu, aunque sean imágenes especulares entre sí, provienen de fuentes diferentes.
Habla: Gastón GiribetSignificado #11aminoácidos encontrados en tierraasteroide bennu imágenes especularesfuentes distintas de aminoácidos…es química, la química es electromagnetismo y mecánica cuántica, y todas estas teorías son simétricas ante derecha e izquierda; si una molécula es posible, su versión especular también lo es. Así que a priori no hay ningún problema con que eso sea así. Pero lo que nos está diciendo es que sea cual fuere la fuente original de los aminoácidos que nosotros encontramos en la Tierra y de los aminoácidos que encontramos en Bennu, que son los mismos pero reflejados en el espejo, son fuentes distintas. ¿Está bien? Porque no hemos sido impregnados. Con el mismo material por la misma fuente, porque si no tendríamos los mismos aminoácidos girando para el mismo lado. Entonces, en ese sentido, hay un par de trabajos que salieron esta semana: hay un trabajo de McCoy y hay un trabajo de Daniel Glavin. Y…
Héctor Socas continúa la conversación sobre los aminoácidos encontrados en asteroides, matizando que su descubrimiento no implica necesariamente la existencia de vida.
Habla: Héctor SocasSignificado #15aminoácidos en asteroidesnubes moleculares y aminoácidosaminoácidos en nubes interestelaresbases de la vida en cualquier sitioproteínas y aminoácidos relacióncélula como base de proteínaproteína comparada con la vida…encontrado compuestos orgánicos, moléculas orgánicas, que se han encontrado aminoácidos, que son la base del ADN, la base de la vida, o sea, generamos una impresión como que hay una relación más directa o hay una distancia corta entre aminoácidos y la vida. O sea, que parece que ya aquello hay. Uno me dice aminoácidos y yo me imagino un conejo. Claro, y hay que recordar, yo tenía esa impresión también, y cuando empecé a ver, bueno, al poco de terminar la carrera, y empecé a ver noticias así de los últimos avances en astrofísica y tal, había esta explosión de encontrar aminoácidos por todas partes: se encontraban aminoácidos en asteroides, en nubes moleculares, en mitad del espacio interestelar. Aminoácidos, pues sí, se han encontrado aminoácidos en nubes interestelares. O sea que esto lo que nos dice es dos cosas: primero, que las bases de la vida se forman prácticamente en cualquier sitio, a poco que les dé lo mínimo indispensable. Pero que de ahí, como decía Gastón, a las proteínas hay un buen trecho; o sea, una proteína es algo, o sea, un aminoácido para una proteína puede ser, no sé, me lo estoy inventando, pero como una célula para nosotros, es una base, pero es algo muy pequeñito comparado con lo que es la proteína, que a su vez es algo muy pequeñito comparado con cualquier cosa que podamos pensar como vida. Entonces, llamar un poco la cautela en eso; creo que el resultado, no es que se haya descubierto Que los asteroides hay aminoácidos, eso no es tan sorprendente, pero bueno, si el tener, como siempre, la cuantificación, el detalle, es la primera vez que se ve esto en tanto detalle, por supuesto, o sea, una cosa es decir que hay aminoácidos y otra cosa es…
Francis Villatoro explica la diferencia en la quiralidad entre los aminoácidos y los nucleótidos, destacando que los primeros son levógiros mientras que estos últimos son dextrógiros.
Habla: Francis VillatoroSignificado #18 · Palabras #14aminoácidos levógiros en la vidanucleótidos dextrógiros de adn arnquiralidad de aminoácidos y nucleótidos gastón…en el espacio hay un equilibrio de quiralidades, ¿no? No de todos se han encontrado las dos versiones, pero de muchos se han encontrado las dos versiones y en proporción relativamente similar; pero pues serán pocas las moléculas que se han detectado. Gastón ha destacado los aminoácidos que están en la vida. Para los países se han encontrado claramente 33 aminoácidos, entre ellos 14 de los 20 que están en nuestras proteínas de manera normal, porque también la vida terrestre también tiene algunas excepciones con algún que otro aminoácido. Y se han encontrado 23 nucleótidos, entre ellos los 5 de ADN y ARN. No sé si quedó claro cuando lo contó Gastón, los aminoácidos tienen quiralidad levógira, pero en los nucleótidos tienes una núcleo base, que es un azúcar; ese azúcar es de quiralidad estrógira, ¿vale? Los aminoácidos son levogiro y los nucleótidos son destrógiro. Y también creo recordar que Bennu es un asteroide muy primitivo, que por eso fue un objetivo elegido para esta misión, con lo cual eso nos salva la pregunta de si puede haber ese material; puede haber llegado ahí en algún impacto o algo así. Eso, en…
Héctor Socas combina una pregunta de Néstor Martínez con otra de Silverine para aclarar si las proteínas con quiralidad invertida están relacionadas con los priones y discute la composición de aminoácidos en estos últimos.
Habla: Héctor SocasSignificado #1 · Palabras #1proteínas quiralidad invertida prionesaminoácidos estrógidos priones tierrasilverine pregunta priones aminoácidosprion proteína mal plegadamutación aminoácidos clave plegamientoribosoma añade aminoácido a aminoácidoestructura proteína entorno agua…solamente una única quiralidad, depende de la técnica de síntesis que utilices. Hoy en día para temas de fármacos, etc., se usan ya técnicas de síntesis que directamente te dan una única quiralidad sin necesidad de tener que separar después quiralidades, ¿no? Hay una pregunta que voy a combinar dos en realidad: una de Néstor Martínez y otra de Silverine o Silverin. Aprovecho y le pregunto: ¿cómo lo diríamos?, ¿Silverine o Silverine Maxilver?. Preguntaba originariamente Néstor si las proteínas con quiralidad invertida son los temibles priones y añadía Maxilver que es difícil que los priones tengan aminoácidos de estrógidos cuando en la Tierra son levógidos, ¿no? Sí, no tiene nada que ver. El prion básicamente es una proteína que está mal plegada. Claro, son las mal plegadas. ¿Y por qué está mal plegada? Pues porque tiene una mutación. Hay ciertos aminoácidos que están cambiados. Hay una mutación que hace que un aminoácido que es clave en el plegamiento y que hace que muchas veces en el plegamiento el ribosoma va añadiendo aminoácido a aminoácido y hay un proceso en el que se va reestructurando la estructura conforme se va sintetizando la proteína. La proteína está como una cosa alargada y se va doblando y se conformando y depende pues del entorno, del agua, que lo envuelve todo, pero también de la propia estructura del ribosoma, de la propia estructura de la propia proteína. Entonces a veces cambiar un único aminoácido hace que una proteína se pliegue de una manera ligeramente distinta. Y un aplicamiento ligeramente distinto, pues normalmente no tiene ningún tipo de consecuencia; de hecho, hay muchas proteínas que tienen partes móviles, pero si afecta al sitio activo, al lugar donde está, digamos, radicada la función biológica de la…
Francis Villatoro explica una característica de las proteínas, específicamente cómo los priones replican su estructura plegada mediante interacciones proteína-proteína.
Habla: Francis VillatoroSignificado #4 · Palabras #9priones proteínas mutadasenfermedades neurológicas prionesalteración sitio activo prionesfunción biológica modificada prionesaminoácidos de quiralidad incorrectaproteínas artificiales reciclaje celularmaquinaria humana aminoácidos utilizablespriones y proteínas plegadas francisplegado de proteínas y contagiopropensión al plegado de prionespriones replican estructura plegadainteracciones proteina-proteína en prionesproteína prion modificada célulaproteína priónica afecta síntesis proteicaribosoma pliega mal proteínas sintetizadasarn mensajero codifica proteína ribosomaprión altera función del ribosomapriones afectan síntesis proteicaproteínas priones alteran plegamientoviroides arn mal plegados…de hecho, hay muchas proteínas que tienen partes móviles, pero si afecta al sitio activo, al lugar donde está, digamos, radicada la función biológica de la proteína, pues hace que la proteína ya no funcione de manera adecuada, funcione de manera diferente. Priones: son proteínas en las que una mutación ha provocado que el sitio activo quede alterado y de tal forma que inducen una enfermedad. Hay muy poquitas proteínas que hagan eso; suelen ser enfermedades neurológicas porque es un sitio muy delicado ese tipo de cosas, y son proteínas que alteran ligeramente la función que tienen que hacer y entonces esa función alterada pues tiene una implicación, una función biológica modificada, una implicación patológica. Pero no tiene nada que ver; no es que en el organismo humano, si tú introduces aminoácidos de la quilaridad incorrecta, no son utilizables por la maquinaria. O sea, la maquinaria no es capaz de construir proteínas con esos aminoácidos. Y si tú introduces una proteína que tenga algunos de esos aminoácidos de la quilaridad opuesta, en principio podría funcionar, o sea, podría ser una proteína artificial, podría ser función si la parte funcional no se ve afectada, pero cuando las proteínas acaban siendo recicladas, acaban siendo, digamos, destruidas, cortadas, etc., acabaría cortándose y acabaría resultando que quedan ahí unos aminoácidos que después no se pueden aprovechar para hacer otras proteínas. O sea que en principio no tiene nada que ver. Gastón, creo que querías comentar algo. No, yo no sé nada de biología, la verdad; de química orgánica muy poco, pero los priones tienen esta cosa también de que ese plegado es una proteína plegada, como bien explicaba Francis; pero también tiene a veces cierta propensión a contagiar ese plegado, a hacer que se empiece a plegar otras. Sí, una de las cosas que tienen las proteínas es que hay interacciones proteína-proteína; entonces los priones tienen esa peculiaridad de que se replican, es decir, cuando en una célula tenemos esa proteína modificada que es el prion, cuando se va a sintetizar esa proteína a partir del código genético, si está, perdón, a partir del gen que Codifica la proteína, del ARN mensajero que le llega al ribosoma; si hay el prion, el ribosoma tiende a plegar mal lo que está sintetizando. Es decir, recibe un código que le dice qué aminoácidos tiene que poner, pero cuando está plegándose la proteína, si está cerca la proteína priónica, altera la función del ribosoma; muchas veces bloquea, porque esto es un proceso, ya os digo, está fabricando uno a uno. O sea, se están pegando yo recibo los aminoácidos y los voy pegando y se va plegando la proteína si. las pocas proteínas que son priones está cerca, altera ese plegamiento y hace que se pliegue mal entonces la proteína mal plegada altera la formación de la proteína buena con lo que eso hace que se replique el prion y actúa entre comillas con una especie como de virus o algo así eso también puede ocurrir con la ARN el ARN también hay el equivalente a, se llaman viroides, que son ARN mal plegados. Entonces esos ARN mal plegados, cuando se encuentran en el citoplasma, son replicables y si pasan a la herencia y provocan una enfermedad, etc., cuando alteran el plegamiento de otros ARN. Antes de sacar la siguiente pregunta, que ya muy rápidamente para ir…
Héctor Socas menciona que imparte una asignatura de bioinformática y necesita estar al tanto de temas bioquímicos para poder enseñar a sus alumnos. Relata una pregunta formulada por Thomas Vila y Silverine Maxilver sobre la radiación de Hawking.
Habla: Héctor SocasSignificado #8 · Palabras #4radiación de hawking thomas vilamodos vibracionales cuánticos horizontebioinformática asignatura héctor socassilverine maxilver pregunta bioquímica…etc., cuando alteran el plegamiento de otros ARN. Antes de sacar la siguiente pregunta, que ya muy rápidamente para ir terminando, pero he visto un comentario que no me resisto a sacar de N punto a punto: dice, en casa de Francis, ChatGPT le pregunta a él. Bueno, recordad que yo doy una asignatura de bioinformática y con bioquímico y tengo que enterarme de algo de las cosas estas bioquímicas; si no, ¿qué le cuento yo a mis chavales? Hay una pregunta graciosilla en la que se han compinchado Thomas Vila y Silverine Maxilver, que ya me ha dicho que es Silverine, como Sabine, se han compinchado aquí para hacer una gamberrada y preguntar: ¿cuánto es exacto decir que la radiación de Hawking es dada por el corte de los modos vibracionales cuánticos cerca, por los modos de vibraciones cuánticas cerca del horizonte y es independiente de las partículas que caen en el interior? Sospecho que esa es una puya, Gastón, porque ha hecho a veces el comentario de la forma de ver la radiación Hawking como que se puede ver con partículas Le recomiendo, hay una entrada en el blog de Francis que explica muy bien cuál es la preponderancia, la…