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Luisa AchaerandioJuan Carlos GilGastón GiribetIgnacio CrespoFrancis VillatoroHéctor Socasshotgun para secuenciación de adntroceado de adn con shotgunbioinformática y ordenadores en shotguncraig venter y tecnología shotgunsecuenciación hemophilus influenzae 1995primer genoma completo craig venterhitos secuenciación organismo sencillitoCraig VenterFrancis VillatoroPCRCOVID-19Héctor SocasLuisa AchaerandioWaxonCollinsProyecto Genoma HumanoAemófilos InfluenzalesIgnacioNIH (Institutos Nacionales de la Salud)hospitales Carlos IIICraig Venter InstituteCelera Genomicssiglo XXIADN
Secuenciar hemophilus influenzae
Con
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Francis Villatoro explica que la tecnología desarrollada por Craig Venter permitió secuenciar el primer genoma completo de un organismo en 1995, específicamente *hemophilus influenzae*.
…revolucionaria porque permitió, aunque no se conocían todos los genes humanos, estamos hablando de los 80, permitió acelerar muchísimo la identificación de genes involucrados en ciertas enfermedades de base genética y ya a principio de la década de los 1990. pues realizó un avance muy importante a nivel biotecnológico, que fue el desarrollo de la tecnología de shotgun de secuenciación. Shotgun se suele traducir como perdigonazo. En lugar de hacer un disparo con una bala, lo haces un disparo con muchos perdigones. Entonces lo que haces es trocear un trozo de ADN en muchos trozos; son trozos muy pequeños, y después utilizas herramientas bioinformáticas, ordenadores, para ir pegando los trozos viendo los solapes. Vas poniendo todos los trozos y vas intentando ver qué zonas se solapan, y con eso vas construyendo una secuencia más larga a partir de esos solapes. Esta técnica de shotgun le permitió un enorme éxito en 1995, que fue el primer genoma completo de un organismo. Fue de hemophilius influenzae y la verdad es que fue todo un hito en 1995 lograr secuenciar de manera completa un organismo, aunque es un organismo obviamente muy sencillito. El influencer hemofílico es la... Básicamente, influenza viene de gripe. Aemophilus influenzae. La influenza se conoce. La gripe. Entonces, este hito fue un hito que, digamos, entre comillas, lo coloca en la historia de la genómica; pero realmente lo que le hizo muy, muy famoso fue desarrollar con una empresa privada, que era básicamente el... Craig Venter Institute, el instituto de…
Significado #1 · Palabras #1
Francis Villatoro explica que la tecnología desarrollada por Craig Venter permitió secuenciar el primer genoma completo de un organismo en 1995, específicamente *hemophilus influenzae*.
Habla: Francis VillatoroSignificado #1 · Palabras #1shotgun para secuenciación de adntroceado de adn con shotgunbioinformática y ordenadores en shotguncraig venter y tecnología shotgunsecuenciación hemophilus influenzae 1995primer genoma completo craig venterhitos secuenciación organismo sencillito…revolucionaria porque permitió, aunque no se conocían todos los genes humanos, estamos hablando de los 80, permitió acelerar muchísimo la identificación de genes involucrados en ciertas enfermedades de base genética y ya a principio de la década de los 1990. pues realizó un avance muy importante a nivel biotecnológico, que fue el desarrollo de la tecnología de shotgun de secuenciación. Shotgun se suele traducir como perdigonazo. En lugar de hacer un disparo con una bala, lo haces un disparo con muchos perdigones. Entonces lo que haces es trocear un trozo de ADN en muchos trozos; son trozos muy pequeños, y después utilizas herramientas bioinformáticas, ordenadores, para ir pegando los trozos viendo los solapes. Vas poniendo todos los trozos y vas intentando ver qué zonas se solapan, y con eso vas construyendo una secuencia más larga a partir de esos solapes. Esta técnica de shotgun le permitió un enorme éxito en 1995, que fue el primer genoma completo de un organismo. Fue de hemophilius influenzae y la verdad es que fue todo un hito en 1995 lograr secuenciar de manera completa un organismo, aunque es un organismo obviamente muy sencillito. El influencer hemofílico es la... Básicamente, influenza viene de gripe. Aemophilus influenzae. La influenza se conoce. La gripe. Entonces, este hito fue un hito que, digamos, entre comillas, lo coloca en la historia de la genómica; pero realmente lo que le hizo muy, muy famoso fue desarrollar con una empresa privada, que era básicamente el... Craig Venter Institute, el instituto de…
Luisa Achaerandio interviene para aclarar que se está discutiendo sobre una bacteria, *hemophilus influenzae*, y no sobre un virus de la gripe.
Significado #4 · Palabras #2proyecto genoma humano públicosecuenciación con técnica estándarsecuenciar hemophilus influenzaevirus de la influenza como errorbacteria hemophilus influenzae en discusiónbacterias respiratorias identificadas por luisa achaerandiobacteria hemophilus influenzaeneumonía por hemophilus influenzaesinusitis con síntomas respiratoriosproblema de salud de ignaciosecuenciación de hemophilus influenzaeproyecto genoma humano waxon collinstécnicas lentas proyecto genoma humanogarantías secuenciación orden adecuadoshotgun de venter y celera genomicssecuenciación del genoma humano por celerajcvi y técnica shotgun de ventercelera genomics frente al proyecto genoma…decidió, digamos, poder empezar a, entre comillas, comercializar el secuenciar cosas. Pero claro, en los 90 había una gran iniciativa, que es una iniciativa de principios de los 90, que era el Proyecto Genoma Humano, que desde la gran institución, el NIH, los Institutos Nacionales de Salud en Estados Unidos, que es la gran institución que financia la investigación biomédica, en España serían el Instituto, ¿cómo se llama? Los hospitales Carlos III, bueno, Carlos III, no me acuerdo de las siglas exactas, me acabo de olvidar. Este proyecto genoma humano proponía a nivel público secuenciar todo el genoma humano pero utilizando una técnica estándar, que es una técnica mucho más conservadora en la que secuencias grandes trozos primero; intentas localizar muy bien un trozo en un cromosoma, saber muy bien dónde está ese trozo, un trozo relativamente grande y ahora intentas secuenciar el trozo grande, lo que requiere una enorme cantidad, me aclara Ignacio, que son los institutos de salud Carlos III y si me permites hago otra aclaración porque cuando estabais hablando de hemófilos influenzae no quería interrumpir en ese. Momento, pero Héctor ha dicho el de la gripe; ojo, eso es el virus de la influenza. Estamos hablando aquí, aquí estamos hablando de una bacteria: bacterias respiratorias, sí. Sí, sí, sí, pero bueno, que también causa otros problemas: neumonía, sinusitis con síntomas respiratorios y también se conoce como gripe, pero bacterial. Y ya está, solo aquí porque estoy estrenándome con interrupciones en el programa. Muchas gracias por la aclaración y los oyentes que perdonen la voz que tiene Ignacio, pero está un poco tocado. Luisa, ¿tú querías decir algo más? No, eso, lo mismo, lo mismo, que básicamente era eso, que era una gripe bacteriana. O sea, un tipo de infección respiratoria bacteriana de un microorganismo, microorganismo gran negativo que se llama Aemófilos Influenzales. El proyecto Genoma Humano era un proyecto garantizado; era un proyecto riguroso que inició el premio Nobel, Waxon, y que continuó Collins, su sucesor como director del proyecto Genoma Humano, y era saber muy bien dónde se encuentra un trozo que yo voy a secuenciar y después con técnicas extremadamente lentas y extremadamente bioquímicas, demasiado húmedas, demasiado de laboratorio, ir secuenciando poco a poco ese gran trozo. Partirlo en trozos grandes y secuenciar esos trozos y tener garantías siempre de que lo estás haciendo en el orden adecuado y que tienes una muy buena localización de ese trozo. Eso, bueno, era un proyecto que en principio era lento, fue avanzándose en las tecnologías de secuenciación y fue acelerándose y ya alrededor del año 2000 ya estaba a buen ritmo e incluso llegó a utilizar las técnicas de shotgun de perdigonazos de Venter y Venter vio que podía, en paralelo a lo que estaba haciendo con su empresa, su instituto JCVI, podía crear una empresa bien financiada, la creo muy tarde, Celera Genomics, es del 98, con muy buena financiación para utilizar su técnica de secuenciación, de shock gun, para secuenciar el genoma humano. y hacer una iniciativa privada en paralelo a la iniciativa pública y que quizás pudiera vencer a la iniciativa pública. ¿Qué problema tenía la técnica shotgun? Pues la técnica shotgun tiene el problema de que realmente no sabe lo que está secuenciando ni dónde está, ¿vale? Hay una enorme cantidad, por ejemplo, las zonas repetitivas. Tú como una zona repetitiva AT, AT, AT, AT,…
Francis Villatoro explica la estrategia de utilizar bacterias muy sencillas para fines de biología sintética, destacando la necesidad de controlarlas para evitar problemas sanitarios y éticos.
Habla: Francis VillatoroSignificado #10bacterias sencillas para biología sintéticacontrol de bacterias evita problemas sanitariosgenes esenciales en bacterias muy sencillassecuenciación de bacterias más sencillas…que viva para fabricar penicilina, que viva, que sobreviva, que no se me muera, que se reproduzca para que los que se mueran sean sustituidas; que tenga lo mínimo imprescindible para estar viva, pero que solamente se dedique a fabricar lo que yo quiero. entonces la idea es, pues coge una bacteria muy sencilla, una bacteria tan sencilla que solo en un entorno muy controlado Eso sí, hay que evitar que se te escape, o se me escapa, problema sanitario, ética, científica, aquí vamos a matar a la gente, no, no, esto tiene que ser una cosa tan sencilla que vive en un entorno en el que si yo la saco de ese entorno, automáticamente muere O sea, usar una bacteria muy sencilla era clave, entonces se dedicó a secuenciar las bacterias más sencillas y empezó a trabajar con esas bacterias y una vez que tenía controlado más o menos Esto también se pensaba que era muy fácil, ¿vale? Que iba a ser muy fácil determinar los genes esenciales. Básicamente se utilizaba la técnica que se utilizaba de toda la vida desde poco después del ADN, que es ir apagando y encendiendo genes. Claro, pensaban que una bacteria mínima tendría 200 genes. Resulta que no, que tiene del orden de 500; y apagar y…
Francis Villatoro afirma que la secuenciación del genoma humano fue un hito fundamental en biología al inicio del siglo XXI y considera que sentó las bases para la medicina personalizada.
Significado #17secuenciación del genoma humanomedicina personalizada siglo xxitratamiento de cánceres con secuenciaciónexpresión génica en células cancerosas…digo eso, para los que saben, ya saben por dónde van los tiros. Yo creo que puede ser un buen candidato a premio Nobel el año que viene y quizás el año siguiente. Ya si no se lo dan el año que viene y el siguiente, ya probablemente no se lo den nunca, ¿no? Algo absolutamente fue el inicio del siglo XXI en biología, o sea, el gran hito del siglo XXI en biología fue el protógeno humano, eso fuera de toda duda Y yo añadiría que además construimos la forma que entendemos el mundo sobre narrativas y esta es la narrativa fundacional de toda la medicina personalizada que con suerte se seguirá desarrollando durante este siglo y que será el gran avance de la medicina de este siglo, ya no como promesa lejana, sino como que estamos poco a poco aproximándonos ya en el presente, sobre todo en el tratamiento de algunos cánceres, que se puede hacer una secuenciación bastante interesante para ver cómo se expresan los genes en esas células, qué terapia específica, por ejemplo, cómo desensibles son a determinadas hormonas o a determinado fármaco, ahí se está avanzando muy bien. y sobre lo que decías hay dos cosas que quería apuntar, una la de Collins que por supuesto pasaré por encima y muy muy rápido pero sí quería apuntarlo y la otra sobre el malo que preguntaba Héctor de las opciones que has dado Francis yo estaba pensando…