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Silvana TapiaJuan Carlos GilFrancis VillatoroHéctor SocasBorja Tosardieta aumenta expresión cdgmpsistema secreción tipo 6 y bacteriasproteína soja inhibe secreción tipo 6enzimas para destruir bacteria competidorasistema de secreción tipo 6 silvana tapiamicrobiota intestinal y competición bacterianadieta influye movilidad vibrio choleraeanalogía tumores árboles agrobacterium tumefacienssecreción tipo cuatro agrobacterium tumefaciensbacteria agrobacterium tumefaciens y células vegetalesadn vuelve loca al sistema molecular vegetalárboles con deformaciones por bacteria agrobacteriumbacterias transferencia entre célulasagrobacterium tumefacium y tumoraciones arbóreascomplejo proteico agrobacterium tumefaciumAgrobacterium tumefaciensSilvana Tapia*Vibrio cholerae*CdGMPGooglesistemas de secreción de tipo 6Vibrio cholerae*Agrobacterium tumefaciens*sistemas de secreción tipo 6SPCSPCETIP 4P 2005AbascalVegaCebraADNJuan Carlos Gil
Secreción tipo cuatro Agrobacterium tumefaciens
Con
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Silvana Tapia señala que la dieta también influye en otros mecanismos de *Vibrio cholerae*, como su movilidad y síntesis de factores de virulencia, encontrando una curiosa analogía con tumores causados por bacterias en árboles.
…los autores ya lo que hacen es un poco pues desentrañar a ver qué es lo que ha podido hacer esa proteína o la caseína o la de gluten para modificar ese comportamiento y bueno es que hay unos mecanismos moleculares entre medias que lo bueno pues lo que hacen. Es por ejemplo una dieta, lo que hace es aumentar la expresión de una molécula que se llama CdGMP. Ve que eso aumenta la expresión de otro gen, que por lo visto está implicado en una menor síntesis de unas moléculas que las quiero nombrar porque cuando yo las descubrí en el ámbito de la microbiología son alucinantes: que son los sistemas de secreción de tipo 6. Estos sistemas de secreción, que si alguien tiene curiosidad puede poner el nombre en internet y buscarlos en Google, son Unos complejos de proteínas que tienen las bacterias ancladas a su membrana plasmática y a su pared celular, y que vistas al microscopio electrónico son como auténticas jeringuillas. Tienen una parte más ancha y luego un tubo hueco a través del cual la bacteria le pasa a otra célula cosas, sin entrar en contacto con el medio ambiente. De hecho, de forma coloquial se llaman jeringas moleculares. Bueno pues este sistema de secreción de tipo 6 tiene esa forma de jeringa, y lo que hace es cuando contacta con otra bacteria, en este caso competidora, le inyecta esa jeringa y le empieza a pasar enzimas a la otra bacteria para destruirla; es decir, le da el pinchazo y le mete a través de esa jeringa moléculas para matar a la bacteria competidora. Bueno pues resulta que la dieta con proteína de soja lo que hace es que vibre o cólera disminuya la síntesis de esos sistemas de secreción. Tipo 6, al tener menos jeringuillas en su superficie no interacciona, o no pincha por decirlo así, a sus competidoras y, por tanto, bueno pues menos competición, o digamos menos impacto sobre la microbiota. Al no poder competir con las bacterias que ya están en el intestino, pues eso también dificulta su colonización. Ese es como un mecanismo que me ha resultado más Curioso. Luego, por lo visto, también esa dieta influye en otros mecanismos de la bacteria como la movilidad, la síntesis de otros factores de virulencia, etc. Pero eso es el que me parece más curioso. También, como curiosidad, no sé si alguien ha ido por la calle, por un jardín y ha visto muchos árboles que aparecen como una especie de tumores o de bultos en el tronco. Son tumores y precisamente están causados por una bacteria, bueno, por muchos tipos, pero la más típica es Agrobacterium tumefaciens que precisamente tiene también estos sistemas de secreción, en este caso de tipo creo que 4 si no. me equivoco Bueno pues esa bacteria interacciona con células vegetales, a través de esas jeringas le mete un trocito de ADN a esa célula vegetal, ese ADN vuelve loca al sistema molecular de esa célula vegetal y empieza a dividirse de forma descontrolada y esa bacteria produce tumores también en vegetales Entonces si alguien va al parque y ve árboles cuyo tronco está deformado, tiene una serie de protuberancias, pues está producido por una bacteria que también tiene esas jeringas moleculares y las utiliza para inyectar a esas células vegetales ese trocito de ADN que vuelve loca a las células y produce tumores, pues igual que en los humanos se producen tumores por crecimiento descontrolado y eso nada, simplemente como curiosidad y bueno pues estos transportadores pues son bueno pues unos mecanismos increíbles porque es producto de la evolución y ¿De qué forma las bacterias son capaces de pasar de una célula a otra? Cosas sin contactar con el medio ambiente, porque liberarlas al medio ambiente lo que provocaría es la degradación; sería pues mucho esfuerzo. Sintetizando cosas que tú liberas al medio se pueden degradar o no pueden llegar a la otra bacteria si lo que quieres es matar. Pues estos sistemas tienen muchísimas funciones, casi todas, la mayoría de ellas es meterle cosas a otra célula para matarla y bueno pues si alguien tiene curiosidad como digo y las quiere ver en internet hay unas fotografías espectaculares; y bueno eso ha sido un poquito lo de Agrobacterium tumefacium era simplemente por curiosidad porque es algo bueno porque se ven en la calle esos árboles con esas tumoraciones que son producidas precisamente por un complejo proteico como este. Y volviendo al artículo, bueno pues la verdad es que las conclusiones que sacan los autores son importantes. Primera de ellas, quitando que se abrió cólera o no, dicen que la dieta quizá también tendría que estar contemplada en todos los estudios de…
Significado #1 · Palabras #1
Silvana Tapia describe un experimento realizado con ratones para analizar cómo diferentes dietas (ricas en proteínas, lípidos o carbohidratos) afectan la susceptibilidad a la colonización por *Vibrio cholerae*. Los ratones fueron alimentados durante un tiempo y posteriormente tratados con streptomicina.
Habla: Silvana TapiaSignificado #19proteína soja caseína y vibrio cólerastreptomicina resistencia vibrio cóleratracto digestivo susceptibilidad patógenosilvana tapia experimento ratones…y en cada una de ellas que haya un determinado ingrediente de forma mayoritaria; es decir, a un grupo de ratones le han dado una dieta enriquecida en proteínas, otro en lípidos y otro en carbohidratos y además los que recibían proteínas se ha distinguido. entre el tipo de proteína que iban a ingerir entre proteínas de soja, gluten de trigo y caseína de la leche Esos ratones son alimentados durante un tiempo y se tratan con antibióticos, precisamente una mezcla de streptomicina que es un antibiótico al que es resistente el vibrio cólera Posteriormente se le introduce por una sonda el patógeno a los ratones y se evalúa a ver si la dieta ha modificado algo en ese tracto digestivo para que esos ratones sean más o menos susceptibles a la colonización por el patógeno Luna, Silvana, lo de darle antibióticos a los ratones que Es para eliminar la flora intestinal preexistente o cómo. Claro, y sí, además ellos también han utilizado unos que eran tratados con antibióticos y otros libres de microorganismos para luego también introducirle una microbiota que sea humanizada, que contenga…
Silvana Tapia señala que la dieta también influye en otros mecanismos de *Vibrio cholerae*, como su movilidad y síntesis de factores de virulencia, encontrando una curiosa analogía con tumores causados por bacterias en árboles.
Habla: Silvana TapiaSignificado #1 · Palabras #1dieta aumenta expresión cdgmpsistema secreción tipo 6 y bacteriasproteína soja inhibe secreción tipo 6enzimas para destruir bacteria competidorasistema de secreción tipo 6 silvana tapiamicrobiota intestinal y competición bacterianadieta influye movilidad vibrio choleraeanalogía tumores árboles agrobacterium tumefacienssecreción tipo cuatro agrobacterium tumefaciensbacteria agrobacterium tumefaciens y células vegetalesadn vuelve loca al sistema molecular vegetalárboles con deformaciones por bacteria agrobacteriumbacterias transferencia entre célulasagrobacterium tumefacium y tumoraciones arbóreascomplejo proteico agrobacterium tumefacium…los autores ya lo que hacen es un poco pues desentrañar a ver qué es lo que ha podido hacer esa proteína o la caseína o la de gluten para modificar ese comportamiento y bueno es que hay unos mecanismos moleculares entre medias que lo bueno pues lo que hacen. Es por ejemplo una dieta, lo que hace es aumentar la expresión de una molécula que se llama CdGMP. Ve que eso aumenta la expresión de otro gen, que por lo visto está implicado en una menor síntesis de unas moléculas que las quiero nombrar porque cuando yo las descubrí en el ámbito de la microbiología son alucinantes: que son los sistemas de secreción de tipo 6. Estos sistemas de secreción, que si alguien tiene curiosidad puede poner el nombre en internet y buscarlos en Google, son Unos complejos de proteínas que tienen las bacterias ancladas a su membrana plasmática y a su pared celular, y que vistas al microscopio electrónico son como auténticas jeringuillas. Tienen una parte más ancha y luego un tubo hueco a través del cual la bacteria le pasa a otra célula cosas, sin entrar en contacto con el medio ambiente. De hecho, de forma coloquial se llaman jeringas moleculares. Bueno pues este sistema de secreción de tipo 6 tiene esa forma de jeringa, y lo que hace es cuando contacta con otra bacteria, en este caso competidora, le inyecta esa jeringa y le empieza a pasar enzimas a la otra bacteria para destruirla; es decir, le da el pinchazo y le mete a través de esa jeringa moléculas para matar a la bacteria competidora. Bueno pues resulta que la dieta con proteína de soja lo que hace es que vibre o cólera disminuya la síntesis de esos sistemas de secreción. Tipo 6, al tener menos jeringuillas en su superficie no interacciona, o no pincha por decirlo así, a sus competidoras y, por tanto, bueno pues menos competición, o digamos menos impacto sobre la microbiota. Al no poder competir con las bacterias que ya están en el intestino, pues eso también dificulta su colonización. Ese es como un mecanismo que me ha resultado más Curioso. Luego, por lo visto, también esa dieta influye en otros mecanismos de la bacteria como la movilidad, la síntesis de otros factores de virulencia, etc. Pero eso es el que me parece más curioso. También, como curiosidad, no sé si alguien ha ido por la calle, por un jardín y ha visto muchos árboles que aparecen como una especie de tumores o de bultos en el tronco. Son tumores y precisamente están causados por una bacteria, bueno, por muchos tipos, pero la más típica es Agrobacterium tumefaciens que precisamente tiene también estos sistemas de secreción, en este caso de tipo creo que 4 si no. me equivoco Bueno pues esa bacteria interacciona con células vegetales, a través de esas jeringas le mete un trocito de ADN a esa célula vegetal, ese ADN vuelve loca al sistema molecular de esa célula vegetal y empieza a dividirse de forma descontrolada y esa bacteria produce tumores también en vegetales Entonces si alguien va al parque y ve árboles cuyo tronco está deformado, tiene una serie de protuberancias, pues está producido por una bacteria que también tiene esas jeringas moleculares y las utiliza para inyectar a esas células vegetales ese trocito de ADN que vuelve loca a las células y produce tumores, pues igual que en los humanos se producen tumores por crecimiento descontrolado y eso nada, simplemente como curiosidad y bueno pues estos transportadores pues son bueno pues unos mecanismos increíbles porque es producto de la evolución y ¿De qué forma las bacterias son capaces de pasar de una célula a otra? Cosas sin contactar con el medio ambiente, porque liberarlas al medio ambiente lo que provocaría es la degradación; sería pues mucho esfuerzo. Sintetizando cosas que tú liberas al medio se pueden degradar o no pueden llegar a la otra bacteria si lo que quieres es matar. Pues estos sistemas tienen muchísimas funciones, casi todas, la mayoría de ellas es meterle cosas a otra célula para matarla y bueno pues si alguien tiene curiosidad como digo y las quiere ver en internet hay unas fotografías espectaculares; y bueno eso ha sido un poquito lo de Agrobacterium tumefacium era simplemente por curiosidad porque es algo bueno porque se ven en la calle esos árboles con esas tumoraciones que son producidas precisamente por un complejo proteico como este. Y volviendo al artículo, bueno pues la verdad es que las conclusiones que sacan los autores son importantes. Primera de ellas, quitando que se abrió cólera o no, dicen que la dieta quizá también tendría que estar contemplada en todos los estudios de…
Silvana Tapia explica cómo dietas proteicas, como aquellas ricas en caseína y gluten, pueden aumentar la resistencia de los ratones infectados con *Vibrio cholerae*.
Habla: Silvana TapiaPalabras #19caseína y gluten aumentan resistencia vibrio cólerametabolismo lento vibrio cólera dietas proteicassistema de secreción elimina bacterias intestinalesmicrobiota intestinal compite con vibrio cólera…pues en esta bacteria de estudio, y bueno, pues que también se ha visto que incluso estas dietas lo que hacen es que no solamente como hemos dicho, afectan a la movilidad a la competición con otras bacterias porque como hemos dicho, que el biocólera tiene que llegar al intestino y tiene que quedarse y ese intestino no está vacío ya tiene una microbiota entonces tiene que competir con ella lo hace gracias a que tiene esos sistemas de secreción que puede pincharle cosas a esas bacterias y eliminarlas pero también por lo visto las dietas proteicas pueden hacer que el metabolismo sea más lento en vibrio cólera y que todo ese conjunto de factores pues hacen que una dieta como la que ellos han probado rica en caseína y en gluten pueda hacer más resistentes a las personas pues que o bueno en este caso a los ratones que ellos habían infectado con vibrio cólera Y bueno, pues es un trabajo muy interesante, muy curioso. Se han analizado muchos factores y bueno, pues espero eso, que como he dicho, que no tengamos que entrar en contacto con esta bacteria, pero bueno, que da pie a estudios y a seguir avanzando en el…
Juan Carlos Gil y Silvana Tapia continúan la conversación sobre estudios bacterianos, haciendo referencia a un comentario en el chat sobre tumores en árboles y comparándolo con las agallas que protegen larvas de avispas.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #15agallas protegen larvas de avispastumor benigno en plantas y ataquesbacteria mete adn a células vegetalescrecimiento descontrolado por fragmento de adn…se estudian de dos en dos, no en forma de comunidades complejas. Y otro comentario... Para simplificar las interacciones y estudiar en detalle cada interacción y no tener ese factor de confusión que puede ser el tener muchas interacciones. Efectivamente. Y otro comentario que lo ha mencionado Cebra en el chat, en colación a los tumores que decías en árboles, a ella y a mí también nos ha recordado las agallas que tienen los, ¿verdad? Es algo semejante; es una especie de tumor benigno que excreta la planta cuando hay algún tipo de ataque, a menudo huevecillos de avispillas, que la propia avispa se lo sabe; la evolución es así de sabia. Entonces planta un huevito y la propia tumor, la galla del quejigo o de la encina o de lo que sea, protege a la larva hasta que se desarrolle; es alucinante. Sí, en este caso el tumor está formado por un crecimiento descontrolado de las células vegetales, pero ese crecimiento descontrolado es debido a ese fragmentito de ADN que le ha metido la bacteria a través de esos túneles o esas jeringas moleculares. Yo diría, Juan Carlos, que esa frase hecha, ese refrán que has dicho de que la evolución es sabia o la naturaleza es sabia, yo creo que deberíamos irlo cambiando por es paciente, o sea, la evolución y la naturaleza hacen lo que hacen porque lo que tienen es…
Juan Carlos Gil continúa explicando la evolución de los modelos utilizados para simular el agua, mencionando el modelo SPC y sus variantes.
Habla: Juan Carlos GilPalabras #9modelo spc para macromoléculastip 4p modelo abascal vegasimulación de agua e hielo rígido…para la simulación? Pues el primer modelo moderno se llama ST2 de 1974, una molécula de agua rígida con un centro Leonard Jones y cuatro cargas en disposición tetraédrica; es bastante natural para reproducir la tendencia tetraédrica de las moléculas de agua. En los años 80 llega el modelo SPC, Simple Point Charge, y su variante SPCE, que son muy sencillos, muy simples, muy robustos y todavía a día de hoy se siguen utilizando sobre todo para la envolvente acuosa de macromoléculas, en biología molecular y demás. En 1983 aparece un nuevo modelo llamado TIP 4P; el 4P viene de cuatro points, de cuatro centros de interacción que dio lugar a toda una familia de variantes con cuatro centros, cuyo campeón absoluto es el TIP 4P 2005, publicado por Abascal y Vega en 2005 y que sigue siendo a día de hoy el estándar de oro para simular agua y hielo con modelos rígidos. Pero todos estos modelos tienen una limitación grave y es que obviamente los enlaces, cada oxígeno tiene sus dos hidrógenos apareados de por vida, son sus hidrógenos y esos enlaces no se rompen, no capturan los fenómenos que ocurren en el agua natural como la…