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Luisa AchaerandioJosé EdelsteinAlberto ApariciBorja TosarIgnacio CrespoJuan Carlos GilFrancis VillatoroHéctor Socasrelojes horvath y edad celulargrupos metilos en sitios cpgorganoides cultivo y tiempo desarrollomodelo matemático de horvathHorvathCPGLuisa AchaerandioWhole Genome Bisulfite SequencingWGBS
Relojes horvath y edad celular
Con
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Luisa Achaerandio explica cómo los investigadores utilizan los 'relojes de Horvath', o relojes epigenéticos, para determinar la edad de desarrollo de las células.
…este de desarrollo. Volvamos a la persona que está encerrada, pero ¿cómo detecta dónde están esas marcas en la célula que te dice: ahora es el momento en el que tengo que diferenciarme o no? Por una parte, los hitos del desarrollo están investigados o se pueden visualizar a través de lo que se llaman los relojes de Horvath, que son relojes epigenéticos. Lo que detectan en las células son grupos metilos en determinados sitios, en los sitios que se llaman CP, donde hay una citosina, un fosforo y la guanina. Hay unos sitios que se repiten y si hay una contabilización, se puede calcular estadísticamente un tiempo de desarrollo y puede coincidir o coincide con justamente el tiempo que tienen estos organoides en cultivo Por lo tanto, por resumir, ese modelo de Horvath es el modelo matemático que utiliza ese patrón de meteliación en esos sitios CPG porque necesitamos eso, objetivar si ha pasado ese tiempo o no. Pero claro, ya os digo que esto no es el mecanismo en sí entero, sino básicamente que es nuestro lector de marcas en la pared. Ahora ha pasado un día, ¿no? Ahora voy a diferenciar la célula en…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio destaca la importancia de un artículo sobre organoides publicado en Nature, señalando que las células conservan una memoria de su tiempo de desarrollo.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #7células conservan memoria desarrollopreguntas triviales transcripción celularpersona celda sin referencias externas…hacer ya comparaciones a más tiempo. No es lo mismo mirar cómo a nivel metabólico ocurren determinados procesos cuando unas células están más inmaduras que cuando ya llevan más tiempo, digamos que evolucionan de una manera determinada y luego pues casi. Lo más impresionante diría yo de este artículo es que demuestran que las células conservan una memoria de su tiempo de desarrollo y me paro porque realmente a mí me ha resultado impresionante. Parece que es una pregunta trivial, ¿no? Pero a veces las preguntas triviales son a menudo las más difíciles de responder. Por ejemplo, ¿cómo sabe una célula cuánto tiempo ha pasado para segregar o comenzar un proceso metabólico, otro, poder hacer una transcripción, otra y demás? Para ello, como sabéis, a mí me gusta imaginar circunstancias concretas para hacer más asequible el entendimiento. Os animo a imaginar a una persona encerrada, por ejemplo, en una celda sin ventanas, sin reloj, sin teléfono y sin ninguna referencia externa ¿Cómo podría saber a esta persona que ha pasado aproximadamente un día? ¿Se os ocurre? Por el hambre, tengo hambre y sed. Sí, voy a decir que el sueño, por ejemplo, los ciclos circadianos y.…
Luisa Achaerandio explica cómo los investigadores utilizan los 'relojes de Horvath', o relojes epigenéticos, para determinar la edad de desarrollo de las células.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1relojes horvath y edad celulargrupos metilos en sitios cpgorganoides cultivo y tiempo desarrollomodelo matemático de horvath…este de desarrollo. Volvamos a la persona que está encerrada, pero ¿cómo detecta dónde están esas marcas en la célula que te dice: ahora es el momento en el que tengo que diferenciarme o no? Por una parte, los hitos del desarrollo están investigados o se pueden visualizar a través de lo que se llaman los relojes de Horvath, que son relojes epigenéticos. Lo que detectan en las células son grupos metilos en determinados sitios, en los sitios que se llaman CP, donde hay una citosina, un fosforo y la guanina. Hay unos sitios que se repiten y si hay una contabilización, se puede calcular estadísticamente un tiempo de desarrollo y puede coincidir o coincide con justamente el tiempo que tienen estos organoides en cultivo Por lo tanto, por resumir, ese modelo de Horvath es el modelo matemático que utiliza ese patrón de meteliación en esos sitios CPG porque necesitamos eso, objetivar si ha pasado ese tiempo o no. Pero claro, ya os digo que esto no es el mecanismo en sí entero, sino básicamente que es nuestro lector de marcas en la pared. Ahora ha pasado un día, ¿no? Ahora voy a diferenciar la célula en…
Luisa Achaerandio explica la importancia de distinguir entre diferentes marcadores celulares, como el número de mitosis, y los relojes epigenéticos para determinar el progreso del desarrollo celular.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5 · Palabras #4marcadores celulares y mitosisrelojes epigenéticos desarrollo celularwgbs whole genome bisulfite sequencingcambio molecular diferenciación celular…ha pasado ese tiempo o no. Pero claro, ya os digo que esto no es el mecanismo en sí entero, sino básicamente que es nuestro lector de marcas en la pared. Ahora ha pasado un día, ¿no? Ahora voy a diferenciar la célula en tal, ¿no? O voy a arrancar esta señal. Luego tenemos que es importante también hacer esta distinción porque tú dices, vale, yo necesito saber cuánto camino molecular ha recorrido esta célula y que no se me confunda con otros marcadores, por ejemplo, con simplemente cuántas mitosis se han producido y para ello también hay otros contadores, por ejemplo, mediante una cosa que se llama WGBS, que es Whole Genome Bisulfite Sequencing. Tú puedes saber si realmente se ha producido una cantidad de mitosis o realmente hay ese reloj epigenético que me está marcando un momento determinado en el que se produce un cambio molecular de ese recorrido de diferenciación. Otra cosa súper interesante de este artículo es cómo se han mantenido las neuronas durante cinco años; es que realmente esto era difícil de conseguir. Utilizan su propio protocolo, ya os he dicho que es muy interesante y luego digamos que para poder mejorar…