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Sara RobiscoJuan Carlos GilHéctor SocasGastón Giribetlaberintos sin minotauroquimiotaxia microorganismos movilidadagujero negro gran nube magallanesciclo solar heliosismologíaMinotauroGran Nube de MagallanesCiclo SolarHeliosismologíaHéctor SocasSara RobiscoBactaibMarteSaraFrontiers in Astronomy and Space SciencesJuan Carlos GilUniversidad de BerlínUniversidad de LisboaPortugalUniversidad de LeibnizAlloplanctisB. subtilisPealoplantis
Quimiotaxia microorganismos movilidad
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Héctor Socas introduce una serie de temas a tratar en el episodio 'Coffee Break: Señal y Ruido', incluyendo laberintos, quimiotaxia, agujeros negros y el ciclo solar.
…aranceles a la exportación de señales de radio, así que seguimos emitiendo y precisamente en este Día Mundial de la Radio agradecemos su compañía en Coffee Break, Señal y Ruido, la tertulia que hacemos cada semana sobre la actualidad de la ciencia. Hoy. Hablaremos de resolver laberintos, sin minotauro, claro que es más fácil; de la quimiotaxia, que es la movilidad de los microorganismos; de un agujero negro escupiendo estrellas desde la gran nube de Magallanes, y del ciclo solar y su relación con la heliosismología. Ya Saben que tenemos una página web en la que pueden encontrar toda la información relevante, todos los episodios anteriores, todos los 499 episodios que hemos publicado hasta la fecha, más los extras, todos los bonus y todas las cuestiones. Además, en esa…
Significado #1 · Palabras #1
Héctor Socas introduce una serie de temas a tratar en el episodio 'Coffee Break: Señal y Ruido', incluyendo laberintos, quimiotaxia, agujeros negros y el ciclo solar.
Habla: Héctor SocasSignificado #1 · Palabras #1laberintos sin minotauroquimiotaxia microorganismos movilidadagujero negro gran nube magallanesciclo solar heliosismología…aranceles a la exportación de señales de radio, así que seguimos emitiendo y precisamente en este Día Mundial de la Radio agradecemos su compañía en Coffee Break, Señal y Ruido, la tertulia que hacemos cada semana sobre la actualidad de la ciencia. Hoy. Hablaremos de resolver laberintos, sin minotauro, claro que es más fácil; de la quimiotaxia, que es la movilidad de los microorganismos; de un agujero negro escupiendo estrellas desde la gran nube de Magallanes, y del ciclo solar y su relación con la heliosismología. Ya Saben que tenemos una página web en la que pueden encontrar toda la información relevante, todos los episodios anteriores, todos los 499 episodios que hemos publicado hasta la fecha, más los extras, todos los bonus y todas las cuestiones. Además, en esa…
Héctor Socas reflexiona sobre un modelo de publicación científica abierto y público, introduciendo el tema de un artículo sobre quimiotaxis que Sara explicará.
Habla: Héctor SocasSignificado #5modelo publicación científica abiertoartículo quimiotaxis sara explicamicrobios se mueven como taxisestudio universidades berlín lisboabúsqueda vida en martebiomarcadores contorno geológicomicrobios posible vida marciana…abierto, o sea, con nombre y apellidos y se publicaba todo; nos habían, creo que éramos, no recuerdo si dos o tres referís y todo era, o sea, la identidad del referí, todos los comentarios, la respuesta con los autores, toda la correspondencia era pública. Lo cual es un concepto interesante, tiene sus defensores y sus detractores como todo; hay argumentos que me parecen razonables para defender una cosa y la otra, no me voy a mojar en ese sentido pero bueno, es interesante. Y en esta revista ha salido este artículo que nos va a contar Sara sobre una cosa que se llama la quimiotaxis, que es la capacidad de los microbios de moverse. Claro, tienen que ir en taxi porque son muy vagos. Muy vagos, exacto. Me autosaco la tarjeta ya. Exacto. Bueno, realmente estos alemanes es un estudio de varias universidades: Universidad de Berlín, la Universidad de Lisboa también en Portugal también participa, Universidad de Leibniz, he visto por aquí. Hay bastantes personas participando y es interesante porque dice a ver, nosotros cuando vamos a otros planetas, bueno, a otro planeta en nuestro caso, a Marte, ¿qué buscamos? Pues eso, las huellas de posible vida o posibles restos de vida; estamos buscando en un contorno geológico, ¿no? Revisamos la geología de la zona buscando biomarcadores y dice allí: ¿y por qué no buscamos microbios? Entonces a uno de ellos se le ocurrió: ¿y si buscamos microbios? Y dijeron: vale, ¿y los microbios qué característica tienen? Dice: pues yo cuando miras un microbio al microscopio, aquí quiero que todos los oyentes cierren un poco los ojos y se acuerden;…
Sara Robisco continúa explicando cómo observar microorganismos en muestras de agua, describiendo la apariencia de las partículas y los microbios que se ven a través de una placa.
Habla: Sara RobiscoSignificado #14microorganismos en muestras de aguapartículas en suspensión placamovimiento rápido microbios agua…tenéis un microscopio en casa y si no estáis tardando. Cuando coges una gota de agua de dudosa procedencia, cualquiera para investigar, ¿qué podemos hacer una cosa, un juego con los oyentes? Podéis contarnos en redes sociales de dónde habéis cogido muestras. ¿Y qué habéis visto? Bueno, pues cuando cogemos esas gotas de agua, las ponemos en la placa y observamos los microbios, pues tenemos varias cosas: partículas en suspensión y los microbios, ¿no? ¿Y qué pasa con los microbios? Que todos vemos que cruzan como súper rápido, y luego otro por ahí, van como locos, ¿no? Entonces claro se les ocurrió porque esto tiene un problema. Esa velocidad y es que si tú tomas una muestra en el espacio para estar detectando estos seres vivos a esa velocidad que se mueven, necesitarías una capturadora de imagen muy, muy rápida que sea capaz de pillarlos en ese momento. Un detector de imágenes por…
Sara Robisco explica un invento para capturar microorganismos, consistente en dos cámaras separadas por micromembranas que atraen a los microbios mediante un 'quimiofector'.
Habla: Sara RobiscoSignificado #3 · Palabras #5micromembranas atraen microorganismosquimiofector atrae bacterias robiscomovimiento hacia el quimiofactorbacterias con movilidad atraviesan membrana…Un detector de imágenes por Machine Learning muy potente que consumiría muchos recursos, entonces tendrías que tener un equipo muy pesado, muy potente y eso no es viable, entonces dice esta gente: vale, tenemos que crear algo para pillarlos, dice: oye, ¿Y si los pillamos quietecitos una vez que los atrapamos? ¿Cómo los atrapas? Pues esta es la cuestión: se les ha ocurrido un invento que consiste en dos cámaras separadas por unas micromembranas de tal forma de que tú pones tu trozo de sedimento en una parte de la cámara, en un lado de la membrana y en otro pones un elemento que lo vamos a llamar el quimiofector, que lo que provoca es que haya un movimiento hacia él. Las bacterias se sienten atraídos, los microbios se sienten atraídos hacia él de una forma salvaje. Entonces es fácil, ¿por qué? Porque solo aquellos seres que están vivos y tienen movilidad pueden atravesar la membrana y acabar en el quimiofactor. Es una aproximación barata y sobre todo es una idea. muy buena. Entonces, ¿qué necesitas para detectar esas bacterias? Un sistema de machine learning muy sencillo, un detector de gota, un detector de hay, no hay, además binario, un clasificador; entonces te reconoce los microbios, tenga la forma que tengan,…
Héctor Socas comenta sobre la dificultad de diseñar experimentos para buscar vida en Marte debido a la falta de conocimiento sobre qué se está buscando, y destaca una propuesta interesante de otros autores.
Habla: Héctor SocasSignificado #8 · Palabras #3movilidad células microorganismostelescopio microscopio muestra motilidadportaobjetos detección movimiento celular…ciertas garantías y se van muy paulativamente, pasito a pasito pues primero buscar agua, luego entender el terreno, luego entender la geología. Ahora estamos empezando a buscar evidencia geológica de vida pasada entonces estamos dando los pasitos poco a poco. Como no sabemos qué es lo que estamos buscando, es difícil diseñar un experimento. Entonces, lo que proponen estos autores me parece interesante. Sara, tú has leído el artículo en más detalle; yo solo lo he ojeado un poquito por encima. Pero es una propuesta de decir: bueno, algo bastante genérico que tiene la vida es su movilidad, esa motilidad de las células de los microorganismos. Entonces, a lo mejor basta con tener un telescopio, un microscopio, poner ahí una muestrita, una gotita en un porta ¿Cómo se llama esto? En un portaobjetos y ver si hay cositas que se mueven ahí. La verdad es que no parece mala idea y seguramente es algo muy sencillo de hacer. Decías que no hemos llevado grandes experimentos astrobiológicos a Marte, pero los tenemos. Están en un hangar, se llama Rosalind Franklin, y está esperando que algún día huele.…
Sara Robisco explica la incertidumbre existente sobre el porcentaje de bacterias con movilidad, basándose en datos de una base de datos llamada Bactaib.
Habla: Sara RobiscoSignificado #2bacterias movilidad porcentaje bactaibprokaryotas motilidad rango incertidumbrebiomarcadores estudio bacterias motilidad…que tienen las bacterias para moverse. Pero claro, dices, oye, un 80% es la mayor parte. Pues no, amigos. Usando bancos de cepas de datos de bacterias, hay una base de datos llamada Bactaib, muy interesante, que tiene 14.309 cepas diferentes de bacterias. Se ha descubierto que solo un 40% de estas bacterias tienen movilidad. De todas formas se sigue estudiando. Para que os hagáis una idea de la incertidumbre que hay de esto, se cree que hay un rango de bacterias con motilidad, vamos, prokaryotas con motilidad, perdón, entre un 5 y un 80%. Es ese rango enorme con el que jugamos, porque claro, hay tanto por conocer. De todas formas, para esta historia de los biomarcadores, de buscar biomarcadores, en este caso solemos hablar de biomarcadores en atmósferas de exoplanetas y tal pero también biomarcadores también es buscar microorganismos en Marte, por supuesto En este contexto realmente es que te da un poco igual porque tú vas a…
Sara Robisco explica cómo Pealoplantis, utilizada como control en un experimento para detectar vida en Marte, reacciona al quimiofector al atravesar la membrana.
Habla: Sara RobiscoSignificado #17pealoplantis detecta vida en martequimiofector reacción membrana pealoplantisalloplanctis cinco seis horasb subtilis muchas horas…Pealoplantis, se empezó poniendo en el estudio como control porque no se siente atraída por este quimiofector. al contrario, los estudios hasta ahora demostraban que le repelía, entonces dijeron vamos a ponerla porque le arrepele, vamos a ver qué pasa Bueno, pues ¿qué pasa? Que cuando atraviesan la membrana y se van al quimiofector se quedan quietas. Dicen: esto es para mí, esto es para mí; pues ya me quedo quietecita, ya no me muevo más, y ese es el momento de hacer una única foto que puede ser una a la hora y otras tres horas porque se ha estudiado que estas bacterias a partir de cinco o seis horas en el caso de Alloplanctis y me parece que muchas más horas en B. subtilis empiezan ya a crear. Colonias y no les interesa esas colonias y les quieren ver el microorganismo que ha llegado. Entonces, según se posan a la hora, hay una primera foto a cabo de una hora y otra a las tres horas y detectas las bacterias, los elementos que hay y los cuentas.…
Juan Carlos Gil continúa hablando sobre los métodos para resolver laberintos, mencionando una clasificación en tres tipos diferentes y ejemplificando con el comportamiento de las bacterias.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #10bacterias sara y quimiotaxisgradiente de presión partículas difundenlaberinto bacterias gradiente temperaturabacterias huyendo de sustancia tóxicapropagación de ondas en laberintointerferencia de ondas en encrucijadaonda recorriendo caminos sin salida…Que soy un poquito friki de los laberintos y que atesoro artículos, referencias, menciones, charlas, cosas sobre laberintos, formas de resolverlo, tanto algorítmicas como analógicas porque hay formas raritas, analógicas, tipo, de resolver estos laberintos. Se pueden clasificar en tres formas. Primero, las que siguen algún tipo de gradiente; por ejemplo, partículas que se difunden siguiendo un gradiente de presión o de temperatura. O nuestras amigas, las bacterias, Sara, que gracias a su quimiotaxis pueden navegar un laberinto; era parecido a lo que explicaba, parecido. Siguiendo gradientes de nutrientes o huyendo, también lo comentabas del estudio anterior: huyendo de una sustancia tóxica o lo que sea. Otra forma analógica es mediante algún tipo de propagación de ondas que recorren el laberinto y van chocando con los caminos sin salida; pueden interferir al irse por dos caminos y volver a confluir en una encrucijada, pueden interferir con otras ondas que se han ido por otros caminos y bueno, pues así acaban encontrando la salida con ondas. Un ejemplo muy chulo que he encontrado preparando este programa es un paper de 1995 en el que usan ondas químicas producidas por la famosa reacción oscilante de Beulosev-Zabotinsky, menos trabalenguamente conocida como la reacción BZ; así alguno es mejor la…