Sara Robisco explica la razón por la cual Pealoplantis fue incluida en un estudio como control, debido a su repulsión hacia el quimiofector.
…ahí sería que fuera el 0%, o sea, que realmente la vida en Marte hubiera sido tal que toda ella absolutamente se queda quieta para la foto O que esté extinta, que hubiese estado y que ya está Claro, que eso también, este experimento ayudaría un poco, ¿no? Pero vamos al experimento porque parece que da un poquito de margen de confusión, ¿no? Porque realmente ellos no fotografían imágenes en movimiento esta semimembrana semiperneable que ponen en medio tienen varias han probado con distintos tipos de grosores porque claro no conocemos es muy divertido no conocemos las bacterias que puede haber en Marte no conocemos sus medidas entonces claro ponen los dos medios a tierra el suelo lo sacuden mucho lo menean centrifugan y oponen las bacterias toman muestras de lo que flota y lo van depositando en una membrana de las cámaras y aquello que se pasa a través de la membrana al quimiofector se queda quieto. ¿Por qué? Porque ya tiene comidita. Y una cosa que no he dicho, la segunda bacteria que he descrito, Pealoplantis, se empezó poniendo en el estudio como control porque no se siente atraída por este quimiofector. al contrario, los estudios hasta ahora demostraban que le repelía, entonces dijeron vamos a ponerla porque le arrepele, vamos a ver qué pasa Bueno, pues ¿qué pasa? Que cuando atraviesan la membrana y se van al quimiofector se quedan quietas. Dicen: esto es para mí, esto es para mí; pues ya me quedo quietecita, ya no me muevo más, y ese es el momento de hacer una única foto que puede ser una a la hora y otras tres horas porque se ha estudiado que estas bacterias a partir de cinco o seis horas en el caso de Alloplanctis y me parece que muchas más horas en B. subtilis empiezan ya a crear. Colonias y no les interesa esas colonias y les quieren ver el microorganismo que ha llegado. Entonces, según se posan a la hora, hay una primera foto a cabo de una hora y otra a las tres horas y detectas las bacterias, los elementos que hay y los cuentas.…
Héctor Socas reflexiona sobre un modelo de publicación científica abierto y público, introduciendo el tema de un artículo sobre quimiotaxis que Sara explicará.
Habla: Héctor SocasSignificado #7modelo publicación científica abiertoartículo quimiotaxis sara explicamicrobios se mueven como taxis…abierto, o sea, con nombre y apellidos y se publicaba todo; nos habían, creo que éramos, no recuerdo si dos o tres referís y todo era, o sea, la identidad del referí, todos los comentarios, la respuesta con los autores, toda la correspondencia era pública. Lo cual es un concepto interesante, tiene sus defensores y sus detractores como todo; hay argumentos que me parecen razonables para defender una cosa y la otra, no me voy a mojar en ese sentido pero bueno, es interesante. Y en esta revista ha salido este artículo que nos va a contar Sara sobre una cosa que se llama la quimiotaxis, que es la capacidad de los microbios de moverse. Claro, tienen que ir en taxi porque son muy vagos. Muy vagos, exacto. Me autosaco la tarjeta ya. Exacto. Bueno, realmente estos alemanes es un estudio de varias universidades: Universidad de Berlín, la Universidad de Lisboa también en Portugal también participa, Universidad de Leibniz, he visto por aquí. Hay…
Sara Robisco explica un invento para capturar microorganismos, consistente en dos cámaras separadas por micromembranas que atraen a los microbios mediante un 'quimiofector'.
Habla: Sara RobiscoSignificado #3 · Palabras #4micromembranas atraen microorganismosquimiofector atrae bacterias robiscomovimiento hacia el quimiofactorbacterias con movilidad atraviesan membrana…Un detector de imágenes por Machine Learning muy potente que consumiría muchos recursos, entonces tendrías que tener un equipo muy pesado, muy potente y eso no es viable, entonces dice esta gente: vale, tenemos que crear algo para pillarlos, dice: oye, ¿Y si los pillamos quietecitos una vez que los atrapamos? ¿Cómo los atrapas? Pues esta es la cuestión: se les ha ocurrido un invento que consiste en dos cámaras separadas por unas micromembranas de tal forma de que tú pones tu trozo de sedimento en una parte de la cámara, en un lado de la membrana y en otro pones un elemento que lo vamos a llamar el quimiofector, que lo que provoca es que haya un movimiento hacia él. Las bacterias se sienten atraídos, los microbios se sienten atraídos hacia él de una forma salvaje. Entonces es fácil, ¿por qué? Porque solo aquellos seres que están vivos y tienen movilidad pueden atravesar la membrana y acabar en el quimiofactor. Es una aproximación barata y sobre todo es una idea. muy buena. Entonces, ¿qué necesitas para detectar esas bacterias? Un sistema de machine learning muy sencillo, un detector de gota, un detector de hay, no hay, además binario, un clasificador; entonces te reconoce los microbios, tenga la forma que tengan,…
Sara Robisco explica la elección de L-serina como atrayente para las bacterias *Aloferax volcani*, destacando su presencia en muestras de Ryugu y su potencial existencia en Marte.
Habla: Sara RobiscoPalabras #6l-serina atrayente bacterias aloferaxeserina en muestras ryugucondrita carbonácea sistema solarposible presencia eserina marte…en sus fases primarias es muy móvil, ella se transporta y tal y luego llega un momento en su crecimiento que se queda quieta y ya no se mueve, entonces tiene sus cosas que le hacen interesante para este estudio. La verdad es que las tres son muy buenas. ¿Y qué usan para atraerlas? ¿Qué quimiofectores estamos usando? Pues se usa la L-serina. ¿Por qué han escogido la L-serina? Porque la L-serina, aparte de ser un quimiofector que atrae a muchísimos microorganismos de la Tierra, es uno de, es un, a ver como lo digo, se ha encontrado el eserina en Ryugu, en las muestras de Ryugu había el eserina entonces es muy interesante por esto, porque al estar en una condreta carbonácea muy prístina se cree que este aminoácido pudo estar presente incluso antes de que nuestro sistema solar se generase. Entonces es interesante que respondan a esto porque ya tienes algo que puede estar presente en Marte ya que las condritas carbonáceas impactaron contra la Tierra, impactaron contra Marte. Entonces, es posible que aquí tenemos el eserina, pero que allí en Marte o en otros cuerpos del Sistema Solar haya el eserina. Entonces, no han hecho, como diríamos nosotros, no han dado puntada sin hilo. Hay que recordar que cuando buscamos microorganismos en Marte, o sea, todavía no hemos llevado un buen laboratorio de análisis que nos dé una buena, una respuesta definitiva y hubo bastante polémica con las ondas Viking que creo que fueron las últimas en…
Sara Robisco explica la razón por la cual Pealoplantis fue incluida en un estudio como control, debido a su repulsión hacia el quimiofector.
Habla: Sara RobiscoSignificado #1 · Palabras #1bacterias marcianas medidas desconocidasmembrana semiperneable grosores distintossuelo marciano centrifugado muestras flotantesquimiofector comidita para bacteriaspealoplantis control en estudioquimiofector repulsión pealoplantisestudios previos repelencia pealoplantispealoplantis detecta vida en martequimiofector reacción membrana pealoplantisalloplanctis cinco seis horasb subtilis muchas horas…ahí sería que fuera el 0%, o sea, que realmente la vida en Marte hubiera sido tal que toda ella absolutamente se queda quieta para la foto O que esté extinta, que hubiese estado y que ya está Claro, que eso también, este experimento ayudaría un poco, ¿no? Pero vamos al experimento porque parece que da un poquito de margen de confusión, ¿no? Porque realmente ellos no fotografían imágenes en movimiento esta semimembrana semiperneable que ponen en medio tienen varias han probado con distintos tipos de grosores porque claro no conocemos es muy divertido no conocemos las bacterias que puede haber en Marte no conocemos sus medidas entonces claro ponen los dos medios a tierra el suelo lo sacuden mucho lo menean centrifugan y oponen las bacterias toman muestras de lo que flota y lo van depositando en una membrana de las cámaras y aquello que se pasa a través de la membrana al quimiofector se queda quieto. ¿Por qué? Porque ya tiene comidita. Y una cosa que no he dicho, la segunda bacteria que he descrito, Pealoplantis, se empezó poniendo en el estudio como control porque no se siente atraída por este quimiofector. al contrario, los estudios hasta ahora demostraban que le repelía, entonces dijeron vamos a ponerla porque le arrepele, vamos a ver qué pasa Bueno, pues ¿qué pasa? Que cuando atraviesan la membrana y se van al quimiofector se quedan quietas. Dicen: esto es para mí, esto es para mí; pues ya me quedo quietecita, ya no me muevo más, y ese es el momento de hacer una única foto que puede ser una a la hora y otras tres horas porque se ha estudiado que estas bacterias a partir de cinco o seis horas en el caso de Alloplanctis y me parece que muchas más horas en B. subtilis empiezan ya a crear. Colonias y no les interesa esas colonias y les quieren ver el microorganismo que ha llegado. Entonces, según se posan a la hora, hay una primera foto a cabo de una hora y otra a las tres horas y detectas las bacterias, los elementos que hay y los cuentas.…
Sara Robisco explica cómo se ha probado un sistema de Machine Learning para detectar vida en Marte, comparando resultados obtenidos con quimiofector y un medio de cultivo estándar utilizado para algas.
Habla: Sara RobiscoSignificado #4 · Palabras #3machine learning detección vida martequimiofector comparado con algasmedio cultivo estándar bacteriascultivo de agar como control…muy bien porque el tiempo de computación y el tiempo de entrenamiento este sistema de Machine Learning es muy sencillito, necesitas muy poquitos recursos y muy poquito tiempo. En un ordenador normal de casa se podría incluso entrenar. Hasta aquí todo bien. Pero, ¿qué pasa? Hemos dicho que han encontrado. Pues mira, han probado con concentraciones de quimiofector y con un medio normal, el típico de la placa del alga. ¿Cómo se llama el alga que ponemos en las placas redondas? Bueno, el típico medio que ponemos en las placas de cultivo de bacterias. El cultivo de agar es el medio que han cogido como medio control y luego los medios con el eserina. Bueno, pues han hecho el experimento y efectivamente con las concentraciones que ellos ponen, tanto las dos bacterias como la arquea colonizan, vamos, colonizan, se posan y aumentan entre un 300-400% la población que hay. Claro, de no tener nada a tener un…