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Ignacio CrespoJuan Carlos GilFrancis VillatoroJosé EdelsteinHéctor SocasSilvana TapiaIsabel CorderoLuisa AchaerandioGastón Giribetvacuna contra el vih variabilidadanticuerpos altamente neutralizantes linfocitos bregiones conservadas del virusvacunas frente a regiones no mutanproteínas neutralizan variantes viraleslinaje celular raro en repertorio humanoanticuerpos interesantes enmascarados por linfocitos blinfocitos BIsabel CorderoVIHVRP01VIH1SIDAIgnacio CrespoADNlinfocitos Torigami de ADNLuisa AchaerandioFrancis VillatoroJosé Edelstein
Proteínas neutralizan variantes virales
Ep545: 11F; Dinosaurios; Sag A*; Genes y Psiquiatría; AlphaGenome; ADN Origami
12 de febrero de 20269 momentos
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Isabel Cordero continúa la discusión sobre las aplicaciones del origami de ADN, explicando cómo el enfoque busca neutralizar variantes virales a través de proteínas que varían menos.
…pero a veces esa variación le da una capacidad nueva. Entonces por eso los virus de ARN son virus que hay que tenerlo siempre bajo la atención porque tienen mucha capacidad de producirse variantes nuevas, a veces más infectivas, a veces más letales, etc. Y en el caso del VIH es lo que ocurre, varía mucho y es muy difícil conseguir una vacuna que genere anticuerpos que realmente consigan neutralizar todas las posibles variantes que hay de esa población del virus. Pues estos anticuerpos altamente neutralizantes los produce un linaje concreto de linfocitos B de nuestro sistema inmunitario. Esos anticuerpos, como he dicho, reconocen regiones altamente conservadas del virus, que son las que nos interesan estudiar y hacer vacunas sobre las regiones que no mutan y que no varían. No podemos estar constantemente haciendo vacunas frente a regiones que sabemos que van a variar mucho más rápidamente; siempre intentamos que esas vacunas generen anticuerpos. Frente a los trocitos, a esas proteínas que varían menos en este tipo de virus, y esto le permite neutralizar a cualquier variante del virus. Sin embargo, como todo, hay un inconveniente: y es que este linaje celular, el que produce este tipo de anticuerpos, es muy raro en el repertorio humano. Además está en pequeña cantidad y muchas veces cuando está presente, su actividad se ve enmascarada por la de otros linajes de linfocitos B, que son muchos más activos y empiezan a generar otro tipo de anticuerpos. Por tanto, los anticuerpos interesantes se quedan un poquito relegados y enmascarados con respecto al resto. Por tanto, necesitamos mecanismos que nos permitan, digamos, multiplicar o magnificar estos anticuerpos que son tan interesantes, sobre todo cuando ocurre la primera vacunación, que es donde necesitamos que haya mayor cantidad de estos anticuerpos para…
Significado #1 · Palabras #1
Francis Villatoro explica que utiliza diversas técnicas para analizar el splicing de genes y determinar qué variantes proteicas se producen, así como para identificar posibles sitios de acoplamiento de factores de transcripción.
Habla: Francis VillatoroPalabras #8splicing de genes según francis villatorovariantes proteicas y transcriptos generadosfactores de transcripcion promotor identificados…a todas las demás herramientas, con lo que cuando un bioquímico normalmente tenía que usar dos o tres herramientas, pues quiero ver en este: tengo un gen o un par de genes y quiero ver el entorno entre ellos, qué zonas son relevantes, regulatorias o no. Pues uso una técnica para ver el tema del splicing, para ver cómo qué tipo de variante de ese gen producen diferentes proteínas, qué tipo de transcriptos genero. Tengo otra técnica para ver, pues, posibles lugares donde se acoplan factores de transcripción de tipo promotor. O sea, tengo diferentes herramientas. Ahora, todas esas herramientas están en una única herramienta, la herramienta de alfa-ginome. O sea, eso facilita mucho la labor al biólogo bioquímico; pero es que además, con una ventana de un millón de bases y con una resolución de base a base. Entonces, el…
Isabel Cordero continúa la discusión sobre las aplicaciones del origami de ADN, señalando que este método busca generar anticuerpos capaces de reconocer múltiples variantes de un virus.
Habla: Isabel CorderoPalabras #9origami de adn para anticuerposanticuerpos neutralizantes contra virusvacunología moderna y virus patógenosinvestigación sobre el virus vihvirus de la inmunodeficiencia humana 1981…con ADN y bueno, de forma controlada y por una serie de mecanismos se van abriendo y se va liberando el fármaco. Se utilizan también para hacer biosensores y para estudios de biología celular. La segunda pregunta es: ¿para qué queremos hacer origami de ADN? Ya sabemos para qué se está utilizando pero todavía podemos buscarle más aplicaciones. Por ejemplo en este artículo lo van a utilizar para avanzar en uno de los retos de la vacunología moderna como es la generación de anticuerpos ampliamente neutralizantes. Es decir, con los origamis de ADN queremos generar anticuerpos capaces de reconocer múltiples variantes de un mismo virus y esto es importantísimo porque hoy en día tenemos muchísimos virus muy patógenos que no tenemos ni un remedio, no tenemos un medicamento para curar la infección pero tampoco tenemos vacunas disponibles para protegernos frente a la infección y en concreto en este artículo quieren aplicarlo para el VIH que es un virus, el virus de la inmunodeficiencia humana que sabemos pues se describió en el 1981, ya llevamos pues casi 45 años investigando sobre él y bueno se va avanzando por supuesto pero sigue siendo pues una laguna en el conocimiento. Es un virus de ARN y bueno pues con una complejidad añadida. Como hemos dicho, los virus de ARN tienen unos sistemas de reparación; cuando ellos se van multiplicando, van haciendo copias de sí mismos, también de su material genético y ellos no tienen…
Isabel Cordero continúa la discusión sobre las aplicaciones del origami de ADN, explicando cómo el enfoque busca neutralizar variantes virales a través de proteínas que varían menos.
Habla: Isabel CorderoSignificado #1 · Palabras #1vacuna contra el vih variabilidadanticuerpos altamente neutralizantes linfocitos bregiones conservadas del virusvacunas frente a regiones no mutanproteínas neutralizan variantes viraleslinaje celular raro en repertorio humanoanticuerpos interesantes enmascarados por linfocitos b…pero a veces esa variación le da una capacidad nueva. Entonces por eso los virus de ARN son virus que hay que tenerlo siempre bajo la atención porque tienen mucha capacidad de producirse variantes nuevas, a veces más infectivas, a veces más letales, etc. Y en el caso del VIH es lo que ocurre, varía mucho y es muy difícil conseguir una vacuna que genere anticuerpos que realmente consigan neutralizar todas las posibles variantes que hay de esa población del virus. Pues estos anticuerpos altamente neutralizantes los produce un linaje concreto de linfocitos B de nuestro sistema inmunitario. Esos anticuerpos, como he dicho, reconocen regiones altamente conservadas del virus, que son las que nos interesan estudiar y hacer vacunas sobre las regiones que no mutan y que no varían. No podemos estar constantemente haciendo vacunas frente a regiones que sabemos que van a variar mucho más rápidamente; siempre intentamos que esas vacunas generen anticuerpos. Frente a los trocitos, a esas proteínas que varían menos en este tipo de virus, y esto le permite neutralizar a cualquier variante del virus. Sin embargo, como todo, hay un inconveniente: y es que este linaje celular, el que produce este tipo de anticuerpos, es muy raro en el repertorio humano. Además está en pequeña cantidad y muchas veces cuando está presente, su actividad se ve enmascarada por la de otros linajes de linfocitos B, que son muchos más activos y empiezan a generar otro tipo de anticuerpos. Por tanto, los anticuerpos interesantes se quedan un poquito relegados y enmascarados con respecto al resto. Por tanto, necesitamos mecanismos que nos permitan, digamos, multiplicar o magnificar estos anticuerpos que son tan interesantes, sobre todo cuando ocurre la primera vacunación, que es donde necesitamos que haya mayor cantidad de estos anticuerpos para…
Isabel Cordero continúa la discusión sobre el desarrollo de vacunas contra el VIH, explicando los objetivos de un grupo de autores en relación con la producción de anticuerpos neutralizantes.
Habla: Isabel CorderoPalabras #2anticuerpos ampliamente neutralizantes vihanticuerpo vrp01 contra vih1neutralización del 90 de cepas vih1autores estrategia producción anticuerpo vrp01…vacunas, sobre todo para aquellas pues como he dicho en las que el virus varía mucho y bueno pues no podemos estar construyendo vacunas constantemente y a la misma velocidad que puede mutar el virus. Por tanto, el objetivo de estos autores es conseguir que El sistema inmunitario produzca esos anticuerpos ampliamente neutralizantes en concreto contra el VIH. Y, en concreto, digamos anticuerpos ampliamente neutralizantes es el nombre genérico. En concreto quieren que se produzca un anticuerpo que se llama VRP01. Es un anticuerpo humano muy potente y capaz de neutralizar aproximadamente el 90% de las cepas de VIH1, que es la variante que domina, la más importante que ha generado la pandemia de SIDA. Luego hay otras variantes pero son minoritarias, entonces estamos hablando que queremos, bueno que quieren los autores que ese anticuerpo que es el capaz de neutralizar al 90% de las partículas víricas sea el que más se produzca y para eso pues tienen que tener una estrategia. ¿En qué se basa esta estrategia? Bueno, pues en este caso mejorar todos los sistemas que existen hoy en día para generar esa producción de anticuerpos. ¿Esto no se ha intentado antes? Sí, se ha hecho. ¿Con qué estrategia? Bueno, pues se han intentado metiendo…
Tras analizar problemas con nanopartículas proteicas como vehículos de antígenos en vacunas, Ignacio Crespo y Isabel Cordero comentan una alternativa propuesta por los autores: presentar un antígeno viral poco variable para generar una respuesta específica.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #11 · Palabras #16antígeno viral poco variableproteínas como vehículos de antígenosrespuesta específica contra antígenoignacio crespo e isabel cordero…de nuestro organismo donde pues ahí se desarrollan y se activan los linfocitos B y además bueno pues eso pues se veían los anticuerpos que nos interesaban se veían desplazados por esos anticuerpos que se habían generado frente a las proteínas de la partícula Por tanto, viendo esto, que tenemos un problema, que se ha intentado solucionar el problema, como hemos dicho, creando unos vehículos en forma de proteínas y que no funciona del todo bien, los autores plantean una alternativa. Ellos lo que quieren es presentar un antígeno, es decir, una molécula presente en el virus y que sea muy poquito variable, que genere una respuesta, pero no contra el vehículo, solamente frente al antígeno. que sea además la respuesta deseada, que sea mayor y que no quede enmascarada por ningún otro mecanismo y aquí es donde a los autores se le ocurre utilizar un Origami de ADN. ¿Por qué? Porque los origamis de ADN se ha visto que son mínimamente inmunostimulantes y no generan ningún tipo de respuesta por parte del sistema inmunitario pudiendo funcionar perfectamente como un andamio o un vehículo inerte. Además, visto…
Luisa Achaerandio explica cómo los autores buscan crear un origami de ADN para incluir un antígeno específico generado mediante ingeniería de proteínas.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #20 · Palabras #4origami de adn para antígenoingeniería de proteínas optimizadaantígenos neutralizantes contra virus…esto de hecho, bueno, es precioso. Los dibujos se ven ahí, la figura geométrica y es preciosa, pero no sé si serían capaces de hacer estructuras más grandes, en principio para lo que son los objetivos de este artículo y de otros anteriores, que es portar o Vehiculizar algo como una especie de nanocápsula, en principio parece que eso es sencillo; ya otras estructuras más grandes, ya eso pues claro, se aumenta en dificultad. Bueno, entonces uno de los primeros objetivos de los autores es conseguir eso, hacer un origami con el ADN y en el origami, en esa figura geométrica del ADN, pues incluirle ese antígeno concreto que también es algo que se ha generado, como he dicho, por ingeniería de proteínas y está optimizado para intentar estudiar el antígeno. Estimular al máximo nuestro sistema inmunitario y que se produzcan esos antígenos que son tan neutralizantes y que podrían pues como he dicho pues neutralizar al virus, valga la redundancia. Luego además dicen: bueno, nosotros hemos ideado este sistema pero queremos saber si es mejor a lo que ya existe, que es el sistema de proteínas. Entonces también compara y luego lo más importante quieren analizar cómo, o sea, no solamente conseguirlo,…
Luisa Achaerandio explica cómo los autores del estudio modificaron la estructura de los andamios de ADN añadiendo una pequeña proteína llamada 'padre' para activar los linfocitos T.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5proteína padre en andamios de adnlinfocitos t activados por péptidosorigami de adn y respuesta inmunitariareacción inmunitaria con proteínas pequeñas…de proteínas. Si no conseguimos activar a esos linfocitos T, el centro germinal no se expande bien y no se llevan a cabo el resto de reacciones que necesitamos. Por tanto, aquí ¿qué hacen los autores? Pues vuelven a hacer otra modificación sobre su andamio de ADN y esta vez le incluyen una pequeña proteína que la llaman padre, ahí ya no he averiguado, no he entrado a averiguar qué significa cada letra, pero bueno, como además me servía para la explicación, es un péstido muy chiquitito que se lo unen de forma complementaria a ese origami de ADN esa proteína parece ser que les va a ayudar a activar esos linfocitos T pero no va a producir esa reacción inmunitaria que si provocan las proteínas grandes de los vehículos de proteínas es decir, es el punto exacto, un poquito de proteína pero no lo suficiente como para dar una respuesta que no queremos y ahora con ese pequeño cambio si lo consiguen, ahora ven que perfectamente el origami entra, Llega donde tiene que llegar y activa a las células T cooperadoras foliculares, que era el punto clave en el que se había parado la versión anterior. Logran activar los linfocitos T, se activa el linaje que ellos querían de linfocitos B y bueno pues ya parece…
Luisa Achaerandio explica cómo la utilización de andamios de proteínas para transportar antígenos provocaba la producción de anticuerpos no deseados, enmascarando los anticuerpos esperados.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #8anticuerpos no deseados en andamios proteínasorigami de adn actuando correctamenteproblemas con antígenos transportados…B por cada millón y después de utilizar este sistema eso incrementa absolutamente y ahí sí tienen una ventaja muchísimo mayor que cuando se utilizaba el andamiaje de proteínas aquí es cuando consiguen origami de ADN, un punto, andamiaje de proteínas, cero. Aquí es donde está el mayor cambio en cuanto a los distintos sistemas, y es que el portar el antígeno en ese vehículo de proteínas no solamente estimulaba el sistema inmunitario, se producían anticuerpos que no queríamos y enmascaraban a los que sí querían. Ahora, después de solventar todos los problemas y que ya el origami de ADN llegue a actuar donde tiene que. Llegar. Ahora sí, ellos encuentran una explosión de este linaje de linfocitos B y además también recuentan una gran cantidad de anticuerpos frente a ese antígeno que ellos estaban portando en ese origami de ADN. Por tanto, y además se hace un resumen muy…
Luisa Achaerandio y José Edelstein continúan la discusión sobre la evaluación de artículos científicos, comparando enfoques basados en estructuras de proteína con modificaciones posteriores basadas en ADN.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #16estructura de proteína como basemodificaciones basadas en adnproteínas mejores que adnluisa achaerandio y jose edelstein…han hecho entre 17 personas, además con el mismo conocimiento, entonces bueno, eso ya puede chirriar. Claro, no, pero súper bonito y súper, lo que decían, ¿no? Como parecía que, ay, y me he encontrado la piedra, pero venga, vamos a levantarnos y a ver si... Además, ellos tenían como base la estructura de proteína; digamos que el vehículo de proteínas era como: esto es nuestra línea base y tenemos que ser mejor que eso. Entonces, cuando ellos hacían una modificación decían: no, las proteínas siguen siendo mejores, a ver qué es lo que pasa, qué puedo modificar para que sea mejor. Y vas leyendo el artículo y venga: punto para las proteínas, cero para el ADN. Otra vez, punto para las proteínas, cero para el ADN, hasta que ya consiguen sobrepasar las propiedades que da el vehículo proteico. Estaba pensando, creo que esto es la primera vez que pasa en Coffee Break, que hay un cambio de día durante la grabación. Yo…