Francis Villatoro explica que, siguiendo lo expuesto por Luisa Achaerandio, las bacterias modificadas genéticamente deben tener propiedades especiales para permitir la alteración de su funcionamiento y la adición de nuevas funciones a sus proteínas.
…una forma de más que no sabemos luego qué efectos tendrá en tu futuro de llevar esas gafas toda tu vida? ¿Cómo alterará eso? Bueno, al final, bueno, eso. Esos antitrangénicos tan radicales deben de ser un porcentaje muy bajo en los antitrangénicos mundiales. En cualquier caso, la idea de Manuel Ferrer es desarrollar una nueva tecnología de edición genética que evita la transgénesis. Entonces, lo que tú haces es decir: ¿cómo evito la transgénesis? Pues cojo una proteína que ya tenga el organismo, en este caso la bacteria, y le añado una nueva función. No puedo sustituir la función que ya tiene, porque si sustituyo la función que ya tiene, puede que esté alterando el funcionamiento biológico de la propia bacteria y no se reproduzca bien, pierda propiedades y características. En ciertas circunstancias, deje de ser y me critiquen porque la he modificado. Lo que hago es coger una proteína que, como ha Contado Luisa, pues tiene que tener una serie de propiedades especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que…
Luisa Achaerandio explica cómo una proteína específica, por su ubicación y estructura tridimensional, es útil para su investigación sobre la degradación de plásticos.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5proteína específica degradación plásticosestructura proteica ligando binding pocketcompuestos de azufre hacia la célulaaminoácidos formación con azufre…química, como me gusta a mí decirlo mucho: no tienen ojos, no tienen boca, es la comunicación que nosotros entendemos, pero sí que es una comunicación química que tiene un nombre muy bonito que se llama Quorum Sensi, muy chulo; es muy bonito ese concepto. Pues resulta que una de esas proteínas nos sirve para nuestro cometido, por el lugar en el que está, por la estructura que tiene y además porque en la parte central de esta estructura proteica a nivel tridimensional tiene lo que se llama un ligando, por así decirlo, que se llama un sitio de unión es un binding pocket que creo que se llama también, se puede decir perfectamente. Entonces justamente por ser así, esta proteína y la siguiente que sirve para transportar determinados alimentos, en concreto determinados compuestos de azufre hacia la célula, ¿para qué queremos el azufre? El azufre lo necesitamos para formar aminoácidos. También las bacterias necesitan aminoácidos, precisamente por el lugar en el que están, por la forma en la que tienen y por el tipo de sitio de unión que tienen. Gracias a la bioinformática, partiendo de esa idea de que tiene que tener algo parecido, se…
Luisa Achaerandio explica cómo se pueden rediseñar proteínas nativamente mediante métodos computacionales para obtener nuevas funcionalidades en Escherichia coli.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #13 · Palabras #14rediseño proteínas nativas escherichia colisuperpoder en escherichia colimétodos computacionales luisa achaerandio…juego un poquito; estamos utilizando todas las posibilidades de nuestro entorno que todavía no te las he contado todas porque todavía te faltan datos para entender cómo se llega a esto, pero estamos utilizando todo lo que se sabe para ir un poquito más allá. De hecho, una de las cosas que dice una de las autoras, dice que si las proteínas nativas pueden ser rediseñadas computacionalmente para hacer algo nuevo, no necesitamos alterar el equilibrio genético de la célula con elementos externos, sino que dotamos a nuestra querida E. coli de un nuevo superpoder. es así un poquito como pensar en, lo ves, no como ser humano, pero con el adamantium. O sea, no solo puedo ser un ser humano, o en este caso una bacteria, sino tener como algo adicional, ¿no? Que efectivamente me puede alterar un poquito... Perdón, dime,…
Luisa Achaerandio aclara que el proceso que están llevando a cabo no es una edición genética como CRISPR-Cas, sino más bien una mejora de genes existentes para añadir una triada catalítica.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #16mejora de genes existentestriada catalítica serina histidina aspartatono confundir con aspartamo edulcoranteluisa achaerandio triada catalítica…con superhéroes y tal Es que pega muchísimo, sobre todo en esta, justamente en este diseño que hacen, porque tú es como, lo que haces es mejorar, no estás cambiando, no estás cortando, no es el CRISPR -Cas, la tecnología de CRISPR-Cas con guía tradicional No es edición genética, ¿no? Efectivamente Genes que están ahí Exactamente, es una zona concreta que está ahí, que me puede servir para añadir lo que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no confundir con aspartamo, que es un edulcorante, ¿vale? Es importante decir todo. y básicamente esta triada catalítica tú la identificas en otras Enzimas de otras bacterias que suelen que ya de manera natural pueden degradar plástico pero se la incorporas a esta bacteria en estos lugares. Con lo cual la dotas de una nueva capacidad sin que pierda sus capacidades anteriores, es decir, esta bacteria…
Luisa Achaerandio explica cómo se introduce una triada catalítica en un plásmido de ADN circular para modificar el gen.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #9plásmido de adn circulartriada catalítica en plásmidoplantilla genética para decodificaciónluisa achaerandio modifica gen…estarás preguntando. ¿Pero cómo meto yo esa triada catalítica en ese binding pocket? A lo mejor se lo pregunta alguien, ¿vale? No sé si se lo pregunta alguien, pero es una cosa que todavía quedaría por saber. Yo me lo estoy preguntando: ¿Cómo es la pregunta? ¿Cómo se modifica el gen? Exactamente, ¿cómo llega allí? Exactamente, pues básicamente volvemos a necesitar nuestro plásmido. Nuestro plásmido de ADN circular, que ya os lo he comentado, y este plásmido no va solo, que no me falte nada, que os cuento qué es lo que tenía. Este plásmido tiene, le metemos la triada, es decir, la plantilla genética para que posteriormente se pueda decodificar y codificar y decodificar. Pues esta triada, en este plasmido metemos la plantilla, metemos Una guía de ARN que hace de GPS molecular que va junto a la técnica de CRISPR-Cas, es decir, ese gen. Todo eso se lo metemos por electroporación a la célula, que básicamente es una de las maneras de introducir esos plasmidos. Básicamente, las bacterias están…
Luisa Achaerandio explica cómo una tecnología CRISPR-Cas y una guía de ARN se integran en el genético de las bacterias modificadas para degradar plástico, permitiendo a estas producir proteínas con una triada lista para la degradación.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #2crpr-cas guía arn bacteriasproteínas triada degradación plásticabacteria modifica genético plásticogen tecnología degradación bacteria…poco la temperatura, que por su porosidad va a entrar; quiero decir, es muy fácil que entre, sobre todo los que están modificados en el laboratorio y entonces básicamente al entrar eso ya en el citoplasma celular, pasa a través de su membrana, pues gracias a. Esa tecnología de CRISPR-Cas y la guía de ARN va a ese lugar concreto de esas proteínas, bueno, en este caso iría a nivel genético, digamos se integraría y ya después de que la célula pueda utilizar esa parte que ya está introducido como una adición a esa codificación genética, pues ya sí que esas proteínas tienen a la hora de crearse en la bacteria esa triada lista para poder degradar esos pequeños trocitos de plástico que les estamos poniendo a degustar a nuestra bacteria. Pues ya os digo, eso sería a grandes rasgos toda la técnica y lo que ellos han propuesto de Gen. Rewire y lo que ya para terminar simplemente, pues me gustaría decir que en este caso digamos que es una prueba de concepto. Es verdad que tú no puedes ya utilizar estas bacterias; no se trata de que tú cojas estas bacterias y ya las pongas en el medio y nos…
Francis Villatoro explica que, siguiendo lo expuesto por Luisa Achaerandio, las bacterias modificadas genéticamente deben tener propiedades especiales para permitir la alteración de su funcionamiento y la adición de nuevas funciones a sus proteínas.
Habla: Francis VillatoroSignificado #1 · Palabras #1proteína bacteria nueva funciónevitar transgénesis tecnología edición genéticaalteración funcionamiento biológico bacteriamanuel ferrer propuesta transgénesisproteínas modificadas genéticamente luisaalteración funcionamiento proteínas bacteriascatálisis función bioquímica básicasitio activo proteína modificación…una forma de más que no sabemos luego qué efectos tendrá en tu futuro de llevar esas gafas toda tu vida? ¿Cómo alterará eso? Bueno, al final, bueno, eso. Esos antitrangénicos tan radicales deben de ser un porcentaje muy bajo en los antitrangénicos mundiales. En cualquier caso, la idea de Manuel Ferrer es desarrollar una nueva tecnología de edición genética que evita la transgénesis. Entonces, lo que tú haces es decir: ¿cómo evito la transgénesis? Pues cojo una proteína que ya tenga el organismo, en este caso la bacteria, y le añado una nueva función. No puedo sustituir la función que ya tiene, porque si sustituyo la función que ya tiene, puede que esté alterando el funcionamiento biológico de la propia bacteria y no se reproduzca bien, pierda propiedades y características. En ciertas circunstancias, deje de ser y me critiquen porque la he modificado. Lo que hago es coger una proteína que, como ha Contado Luisa, pues tiene que tener una serie de propiedades especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que…