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Luisa AchaerandioBorja TosarFrancis VillatoroHéctor SocasMaría Ribesbioinformática para biomoléculastrabajo de laboratorio con francis villatoromuestras para identificar biomoléculasextracción adn arn microbioma humanotécnicas northern plot microbiomaluisa achaerandio extracción heces salivabioinformática para secuencias de arnsecuencia de aminoácidos en base de datoshomologías entre proteínas y viroidesartículo cel del 2024molécula de arn circular obeliscomuestras y análisis bioinformático obeliscoforma bastoncillo o varilla obeliscoluisa achaerandio nombra entidad biológicaARN circularCELLuisa AchaerandioFrancis Villatoro3 de septiembre de 2025StanfordUPVMaría José López GaleanoMarcos de la PeñaARNCSICViroidesPlantasObeliscosHéctor SocasMaríaCleopatraMinisterio de Antigüedades de EgiptoARN mensajeroCEDMaría RibesGastón GiribetMicrobiota humanaCoffee Break: Señal y RuidoLuisa*Heces sanguinis*Gabriel OsorioHot SpringsADNNorthern Plot
Muestras y análisis bioinformático obelisco
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Luisa Achaerandio describe el proceso de nombrar una nueva entidad biológica, 'obelisco', destacando la complejidad del trabajo que implica desde la obtención de muestras hasta el análisis bioinformático.
…biomolécula que tenga ese open frame, ese marco de lectura abierto. No tiene esa capacidad de identificarse con unas proteínas concretas y pues eso básicamente es como una diferencia como muy fundamental, pero ¿por qué digo yo que hay que ir al ajuste fino? Porque esto no es posible identificarlo con nuestros ojos, no es lo mismo diferenciar un perro de un pollo, por así decirlo, si estamos hablando de seres, que una biomolécula de otra y para eso, pues que me corrija evidentemente Francis, que es el que sabe del tema muchísimo mejor que yo. Necesitamos la bioinformática y necesitamos el trabajo de laboratorio y evidentemente necesitamos una cantidad de muestras pues bastante. importantes que se pueden ver perfectamente en el artículo para poder extraer tanto el ADN, por así decirlo, en este caso estaríamos extrayendo ADN y tenemos que extraer, estaríamos extrayendo ARN, ¿vale?, ácido ribonucleico de ese microbioma humano en concreto de las heces y de la saliva. Y para ello necesitan muchas técnicas de laboratorio, entre las que se encuentran pues Northern Plot y técnicas muy concretas, ¿vale? entonces una vez que ya lo tienes digamos estas técnicas de laboratorio se tienen que complementar con técnicas de bioinformática que básicamente es trasladar esa secuencia de aminoácidos partimos de la ARN o de las proteínas que encontremos en una muestra y esa secuencia de aminoácidos hay que pasarla a una base de datos y compararla pues con secuencias anteriores que tenemos tanto de nucleótidos como de proteínas y en ese proceso de comparación se pueden establecer lo que se llaman homologías por ejemplo con las proteínas o secuencias parecidas y se puede digamos que sacar un parecido o una diferencia entre este viroide que te digo y lo que se ha descubierto nuevo y se establece como nuevo. De hecho, en el artículo del CEL del 2024, Es el artículo en el que se le llama por primera vez obelisco. Y tiene que ser muy emocionante, realmente, ponerle el proceso ahora mismo en vivo de ponerle el nombre a una entidad biológica que realmente es nueva, pero que necesita todo este proceso tan grande de utilizar las muestras, de obtener las muestras, de hacer un proceso de laboratorio, de utilizar la bioinformática; es un grupo muy grande y de luego obtener unos resultados que nos llevan a esta conclusión. Entonces, es importante decir que se le llama obelisco simplemente esto por la forma que tiene en sí esta molécula de ARN circular que si la pudierais ver en el artículo, lo mismo la podía haber llamado obelisco que se podía haber llamado bastoncillo o varilla porque realmente esa es la forma que puede evocar esta biomolécula orgánica. Con un poquito de imaginación, parece un telescopio. Sí, también es verdad. Algunos dirán que es un símbolo fálico, no sé qué Te iba a preguntar, Luisa, porque para mí me lo has explicado de forma muy básica para la gente que no sabe y me gustaría trasladar eso también a nuestros oyentes porque habrá algunos también que también…
Significado #1 · Palabras #1
Héctor Socas presenta a Luisa Achaerandio, una invitada al programa 'Coffee Break: Señal y Ruido', destacando su formación en fisioterapia, tecnología de la comunicación, bioestadística y bioinformática.
Habla: Héctor SocasPalabras #15fisioterapia luisa achaerandiotecnología de la comunicación achaerandiobioestadística bioinformática achaerandio…y también tenemos ahí iniciativas de micromecenazgo por si quieren apoyarnos en Patreon, Paypal o en iVoox; como digo, son iniciativas de micromecenazgo que van de un euro al mes a diez euros al mes. Vamos a empezar ya con la tertulia; empiezo con las Presentaciones y me hace mucha ilusión empezar con nuestra invitada de hoy que es Luisa Achaerandio, que estudió fisioterapia. También ha hecho máster en tecnología de la comunicación, ahora en bioestadística y bioinformática y nada, pues bienvenida a la tertulia, Luisa ¿cómo estás? Muchas gracias Héctor, un placer estar aquí. Bueno, por su apellido puede parecer que podría ser de Bilbao, pero ya se sabe que la gente de Bilbao nace y vive donde le da la gana y pues Luisa es un ser de Bilbao que decidió nacir en Málaga y vivir en Tenerife, o sea que ha hecho aquí el sota caballo y…
Luisa Achaerandio se muestra dispuesta a explicar conceptos complejos de bioquímica como replicones, viroides y obeliscos, aunque reconoce que no es su especialidad y busca ofrecer una explicación lo más precisa posible. Menciona un descubrimiento reciente de una nueva entidad biológica por parte del CSIC.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #8luisa explica replicones y viroidesobeliscos descubrimientos bioquímica recientebioquímica conceptos complejos luisadescubrimiento entidad biológica csicnueva entidad biológica cuerpo humanoobeliscos descubrimiento reciente…mete miedo, es en plan, ahí huele a... Yo creo que esa es la de Breakthrough en general, la de las iniciativas de Breakthrough. Sí, es impresionante la foto, dices, mi madre, qué pasada. En todo caso una pena porque hubiera molado muchísimo ver eso volar. Bueno, vamos entonces a pasar el tema y vamos ya con las cosas de más enjundia porque Luisa, me habías contado unas historias que yo como no entiendo de biología ni de bioquímica ni nada de esto me vuela la cabeza. Me hablabas de replicones y de viroides y de obeliscos, que son descubrimientos relativamente nuevos de la bioquímica y que me gustaría que nos explicaras. Un poco. Ha habido avances recientes además con el descubrimiento de estos obeliscos y tal. Pues sí, tengo la responsabilidad de contarlo lo mejor posible, que tampoco es mi especialidad, pero sí me gustaría hacerlo lo más aproximado posible. Entonces, lo primero que quería decir es que hace casi un año, desde ahora, un miércoles 30 de octubre en el 2024 sale una nota de prensa del CSIC donde dicen que descubren una nueva entidad biológica que habita en el cuerpo humano ni más ni menos. Entonces, ¿cómo te quedas con esto? Yo me acuerdo que estaba... Exorcista, porque... Claro, te parece que, bueno, se generó un gran revuelo porque realmente me acuerdo que estaba en clase, yo normalmente soy docente de formación profesional sanitaria y, bueno, pues soy conocida porque me gusta,…
Luisa Achaerandio describe el proceso de nombrar una nueva entidad biológica, 'obelisco', destacando la complejidad del trabajo que implica desde la obtención de muestras hasta el análisis bioinformático.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1bioinformática para biomoléculastrabajo de laboratorio con francis villatoromuestras para identificar biomoléculasextracción adn arn microbioma humanotécnicas northern plot microbiomaluisa achaerandio extracción heces salivabioinformática para secuencias de arnsecuencia de aminoácidos en base de datoshomologías entre proteínas y viroidesartículo cel del 2024molécula de arn circular obeliscomuestras y análisis bioinformático obeliscoforma bastoncillo o varilla obeliscoluisa achaerandio nombra entidad biológica…biomolécula que tenga ese open frame, ese marco de lectura abierto. No tiene esa capacidad de identificarse con unas proteínas concretas y pues eso básicamente es como una diferencia como muy fundamental, pero ¿por qué digo yo que hay que ir al ajuste fino? Porque esto no es posible identificarlo con nuestros ojos, no es lo mismo diferenciar un perro de un pollo, por así decirlo, si estamos hablando de seres, que una biomolécula de otra y para eso, pues que me corrija evidentemente Francis, que es el que sabe del tema muchísimo mejor que yo. Necesitamos la bioinformática y necesitamos el trabajo de laboratorio y evidentemente necesitamos una cantidad de muestras pues bastante. importantes que se pueden ver perfectamente en el artículo para poder extraer tanto el ADN, por así decirlo, en este caso estaríamos extrayendo ADN y tenemos que extraer, estaríamos extrayendo ARN, ¿vale?, ácido ribonucleico de ese microbioma humano en concreto de las heces y de la saliva. Y para ello necesitan muchas técnicas de laboratorio, entre las que se encuentran pues Northern Plot y técnicas muy concretas, ¿vale? entonces una vez que ya lo tienes digamos estas técnicas de laboratorio se tienen que complementar con técnicas de bioinformática que básicamente es trasladar esa secuencia de aminoácidos partimos de la ARN o de las proteínas que encontremos en una muestra y esa secuencia de aminoácidos hay que pasarla a una base de datos y compararla pues con secuencias anteriores que tenemos tanto de nucleótidos como de proteínas y en ese proceso de comparación se pueden establecer lo que se llaman homologías por ejemplo con las proteínas o secuencias parecidas y se puede digamos que sacar un parecido o una diferencia entre este viroide que te digo y lo que se ha descubierto nuevo y se establece como nuevo. De hecho, en el artículo del CEL del 2024, Es el artículo en el que se le llama por primera vez obelisco. Y tiene que ser muy emocionante, realmente, ponerle el proceso ahora mismo en vivo de ponerle el nombre a una entidad biológica que realmente es nueva, pero que necesita todo este proceso tan grande de utilizar las muestras, de obtener las muestras, de hacer un proceso de laboratorio, de utilizar la bioinformática; es un grupo muy grande y de luego obtener unos resultados que nos llevan a esta conclusión. Entonces, es importante decir que se le llama obelisco simplemente esto por la forma que tiene en sí esta molécula de ARN circular que si la pudierais ver en el artículo, lo mismo la podía haber llamado obelisco que se podía haber llamado bastoncillo o varilla porque realmente esa es la forma que puede evocar esta biomolécula orgánica. Con un poquito de imaginación, parece un telescopio. Sí, también es verdad. Algunos dirán que es un símbolo fálico, no sé qué Te iba a preguntar, Luisa, porque para mí me lo has explicado de forma muy básica para la gente que no sabe y me gustaría trasladar eso también a nuestros oyentes porque habrá algunos también que también…
Luisa Achaerandio continúa explicando las características de los viroides y su relación con los obeliscos, después de que Héctor Socas interviniera para aclarar la naturaleza de los viroides.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #9viroides infectan plantasobeliscos evolución de la naturalezaluisa achaerandio explica viroides…cientos de nucleótidos, además en forma circular, que no tiene extremos porque está todo conectado y eso lo hace un poquito más estable y que infecta células de plantas y dentro de las células se puede No, no, perdona, perdona Héctor No, no, los viroides son Los que infectan Plantas. Digamos plantas, pero los obeliscos es como si fuera una especie de evolución de la naturaleza. Los obeliscos ya se ha demostrado. Sí, pero yo soy los viroides. Ah, vale, los viroides en sí, vale, vale, ok. Sí, los viroides sí infectan plantas. Vale, vale, y luego los obeliscos son como un paso un poco más, son más grandes, ¿no? Eso es. Y ahí, ¿sigue entonces con la explicación ahí? Eso, son un poquito más grandes y no solo es que sea un poquito más grande, sino que además añaden proteínas propias y ribocimas; es decir, que tienen unas enzimas que una vez que entran en los hospedadores, que ya son diferentes a las plantas; ya no son…
Luisa Achaerandio especifica que la identificación de biomoléculas se realiza a partir de muestras de heces o saliva y menciona una bacteria específica, *Heces sanguinis*, que ha sido identificada como su hospedador.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #19identificación biomoléculas heces salivabacteria heces sanguinis hospedadorartículo identificación heces sanguinis…tienen unas enzimas que una vez que entran en los hospedadores, que ya son diferentes a las plantas; ya no son plantas. Ya se han encontrado en microbiomas humanos y hemos dicho que hemos hablado de microbioma humano, entendiendo como microbioma humano, por ¿Concretar esto: heces o saliva? Y en concreto hay una bacteria concreta que sí se ha logrado discriminar, que ese sea su hospedador, que es el *Heces sanguinis*. Eso sí también lo pone en el artículo. Y luego me faltaría hablar del otro preprint, pero que digamos que parte de este. La idea fundamental yo creo que es interesante: es que podemos llegar a este nivel porque precisamente tenemos las herramientas para hacer lo que antes no teníamos. Resolver una estructura tridimensional o lineal a nivel molecular era imposible a partir del…
Luisa Achaerandio reflexiona sobre la existencia de entidades biológicas aún más simples que los virus, denominadas 'obeliscos', y recuerda cómo el descubrimiento de estas entidades amplió nuestra comprensión del mundo molecular.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #8 · Palabras #18obeliscos más simples que los virusentidades biológicas cadena de arndescubrimiento obeliscos mundo molecular…de la vida, o sea, que podamos llegar a extender un poquito más de lo que se puede interpretar como autonomía, ¿no? Como biomolécula, ¿no? Un poquito más, mucho más abajo del ADN. La vida más simple, ¿no?, que nos habían dicho que eran los virus cuando yo Iba al colegio, nos resulta que todavía hay cosas más simples, más básicas que los virus: que es una simple cadena que se replica de ARN, ¿no? Impresionante. Y fíjate cómo se ha abierto el espacio, que entre los virus y los viroides hemos encontrado precisamente esta entidad que se ha llamado obelisco, así es como lo Han denominado, Obelisque, así es como lo han denominado Obelisk, como SK, que si hubiera sido el revés, Obelix, como KS, podríamos preguntarnos por Asterix, que seguro está también por ahí. Bueno, vamos a hacer la pausita; ahora nos sigues contando cosas…
Luisa Achaerandio explica la naturaleza y características de los 'obeliscos', entidades biológicas descubiertas recientemente en bioquímica, destacando su estabilidad debido a su estructura circular de ARN.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #11viroides y obeliscos en bioquímicadescubrimiento reciente de la bioquímicamicrobiota humana con obeliscoshistoria de viroides por luisa achaerandioárn circular cerrado covalentementeexonucleasas afectan al arn mensajeroestabilidad de los obeliscos luisa achaerandioácido ribonucleico estructura circular…un toque, tenemos eso. Mira María también; la pasta es el plástico este, le dicen pasta, podría ser el dinero también. Yo lo había dejado ahí como una metáfora de la sociedad actual, el capitalismo, yo qué sé, todas estas cosas que se pone la gente a, bueno. A ver, vamos a centrarnos: que nos estamos dispersando. Tenemos a María, tenemos a Gastón y Luisa nos estaba contando esta fascinante historia de los viroides y los obeliscos, que es un descubrimiento reciente de la bioquímica y al contrario que los viroides, estos obeliscos sí que están además dentro del cuerpo humano, en nuestra microbiota. Exactamente, por ahí van los tiros entonces me gustaría recordar que un obelisco es un ARN es decir un ácido ribonucleico circular cerrado covalentemente es decir que al estar cerrado no le afectan unas enzimas que se llaman exonucleasas con lo cual lo hacen estable porque eso es uno de los problemas que tiene el ARN que por ejemplo el ARN mensajero determinados tipos de ARN que hay muchísimos Las vacunas de la COVID, ¿no? El RNA mensajero de las vacunas Exactamente, hay muchísimos, sí, y uno de los problemas que tenían era eso, que al ser moléculas abiertas y lineales, enseguida se degradaban y se veían afectadas por determinadas enzimas, por…
Luisa Achaerandio explica cómo la investigación sobre los 'obeliscos' quedó interrumpida hasta septiembre de 2025, momento en que se retomó el trabajo con una base de datos para analizar muestras y determinar su función.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #3 · Palabras #5investigación obeliscos hasta septiembre 2025base datos para analizar muestras obeliscosfunción desconocida agente infeccioso obeliscosluisa achaerandio análisis muestras obeliscos…del 2014 y quería decir eso, que era una... 2024 era, ¿no? Perdón, del 2024, el 14 de noviembre del 2024, que era una colaboración entre Stanford y UPV, donde también intervenían dos científicos españoles: Uno, María José López Galeano y Marcos de la Peña. Entonces, a partir de ahí todo como que se paró, porque yo es verdad que no he vuelto a escuchar el tema de los obeliscos hasta posteriormente el 3 de septiembre del 2025. El primer pasado, exactamente, prácticamente ayer, donde siguiendo con el trabajo de estos primeros autores, pues ya teníamos esa base de datos para rápidamente comprobar en otras muestras si este agente infeccioso, infectivo o simplemente que estaba por allí porque es verdad que una cosa importante es que no se sabe cuál es su función; esto es el inicio precisamente de poder llegar a descubrirlo. Partiendo de ahí, rápidamente. Ya hay otro grupo de investigadores, en este caso relacionados con, en general son japoneses; pone Shiyunichi Urayama, del Departamento de las Ciencias del Entorno y de la Vida, del Laboratorio de la Molécula Extrema, de la Biología para la Molécula Extrema…
Héctor Socas menciona una broma interna sobre el nombre 'obelisco' en comparación con 'asterisco', y luego introduce la conversación sobre un descubrimiento reciente relacionado con obeliscos egipcios y un puerto sumergido.
Habla: Héctor SocasPalabras #10forma de arn mensajero obeliscoobelisco egipcio forma varillaentidad arn mensajero covalenteobelisco asterisco broma internapuerto sumergido ministerio antigüedadesdescubrimiento obeliscos egipcios matarile…hacer una pregunta muy tonta: ¿Por qué el nombre? Me encanta que me lo digas porque realmente es algo que yo creo que es la pregunta como más rápida, pero también tiene su relevancia y básicamente si te vas al artículo del CED del 2024 es cuando los autores. Por la forma de ARN mensajero que está cerrado covalentemente y que tiene esa forma de varilla, hombre, podían haberle puesto “varilla” pero quedaba como mucho menos atractivo. Entonces decidieron ellos de manera personal decir: bueno pues tengo la oportunidad de decir que esta es una nueva entidad y la vamos a llamar así porque nos recuerda a un obelisco, como los obeliscos egipcios, ¿no? Ok, yo preguntaba porque cuando presentábamos los temas estábamos haciendo chistes entre nosotros: si obelisco o asterisco. Y hablando de obeliscos egipcios, María, yo no sé si habría obeliscos en este puerto que han descubierto sumergido en el fondo del mar; matarile, erile, erile, con las llaves, se habrían caído las llaves de Cleopatra por ahí, pero bueno, cuéntanos un poco este descubrimiento que ha salido en muchos medios de comunicación y que, del que parece que sabemos bastante poco, salvo que hay un anuncio oficial del Ministerio de Antigüedades de Egipto, ¿no? Así es, no hay un paper como tal, es un anuncio, como dices, del Ministerio de Antigüedades con el Consejo Supremo de Antigüedades, que me parece un nombre épico: el Consejo Supremo de Antigüedades de Egipto, que lo presidió Hawass. Ahí te pueden dar asiento…
Tras una pregunta de Gabriel Osorio sobre qubits, este plantea si los obeliscos podrían ser virus de bacterias, a lo que Francis Villatoro responde negativamente y explica que son bacteriófagos.
Habla: Francis VillatoroPalabras #19obeliscos como virus de bacteriasbacteriófagos exclusivos de bacteriasmicrobión humano y bacteriófagoshot springs y bacteriófagos…muy rápidas de Gabriel Osorio: pregunta, ¿Se han planteado métodos de representación de números usando niveles cuánticos? Eso se llaman qubits y qubits, pues por supuesto, obviamente sí, se han planteado y se usan y están implementados en experimentos. Gabriel Osorio también pregunta: ¿los obeliscos serían virus de las bacterias? No, los virus de las bacterias son los bacteriófagos. ¿Son exclusivos de las bacterias? No, como le ha dicho Luisa, se encuentran en el microbión humano, se encuentran en... Y en la Hot Springs, eso, de momento y así he contestado rápidamente dos preguntas. Perfecto, pues sí, así aumentamos la productividad de preguntas respondidas. Bueno, pues nada, en fin, que nos vemos la semana que viene, o no, yo que sé, ya se verá, pero en principio habrá Coffee Break si no pasa nada demasiado. La semana que viene se anuncian los premios Nobel, lunes, martes, miércoles y el jueves tendremos que…