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Luisa AchaerandioBorja TosarFrancis VillatoroHéctor SocasMaría Ribesviroides sin open framemarco de lectura abierto viroidesluisa achaerandio y viroidesbioinformática para biomoléculastrabajo de laboratorio con francis villatoromuestras para identificar biomoléculasextracción adn arn microbioma humanotécnicas northern plot microbiomaluisa achaerandio extracción heces salivabioinformática para secuencias de arnsecuencia de aminoácidos en base de datoshomologías entre proteínas y viroidesartículo cel del 2024molécula de arn circular obeliscomuestras y análisis bioinformático obeliscoforma bastoncillo o varilla obeliscoluisa achaerandio nombra entidad biológicaFrancis VillatoroLuisa AchaerandioViroidesOpen frame*Heces sanguinis*MarteARN circularCELADNARNNorthern Plot
Muestras para identificar biomoléculas
Con
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Luisa Achaerandio explica que identificar biomoléculas requiere herramientas como la bioinformática y el trabajo de laboratorio, reconociendo la mayor experiencia de Francis Villatoro en el tema.
…en forma de martillo que se le llama, ¿vale? Harbor Ribocimas, ¿vale? Son básicamente unas enzimas que en el momento en el que este agente infeccioso se introduce en su huésped utiliza esa maquinaria celular para crear estas ribocimas y poder replicarse. Entonces se diferencia precisamente en eso, en que si hablamos de viroides no estamos hablando de una biomolécula que tenga ese open frame, ese marco de lectura abierto. No tiene esa capacidad de identificarse con unas proteínas concretas y pues eso básicamente es como una diferencia como muy fundamental, pero ¿por qué digo yo que hay que ir al ajuste fino? Porque esto no es posible identificarlo con nuestros ojos, no es lo mismo diferenciar un perro de un pollo, por así decirlo, si estamos hablando de seres, que una biomolécula de otra y para eso, pues que me corrija evidentemente Francis, que es el que sabe del tema muchísimo mejor que yo. Necesitamos la bioinformática y necesitamos el trabajo de laboratorio y evidentemente necesitamos una cantidad de muestras pues bastante. importantes que se pueden ver perfectamente en el artículo para poder extraer tanto el ADN, por así decirlo, en este caso estaríamos extrayendo ADN y tenemos que extraer, estaríamos extrayendo ARN, ¿vale?, ácido ribonucleico de ese microbioma humano en concreto de las heces y de la saliva. Y para ello necesitan muchas técnicas de laboratorio, entre las que se encuentran pues Northern Plot y técnicas muy concretas, ¿vale? entonces una vez que ya lo tienes digamos estas técnicas de laboratorio se tienen que complementar con técnicas de bioinformática que básicamente es trasladar esa secuencia de aminoácidos partimos de la ARN o de las proteínas que encontremos en una muestra y esa secuencia de aminoácidos hay que pasarla a una base de datos y compararla pues con secuencias anteriores que tenemos tanto de nucleótidos como de proteínas y en ese proceso de comparación se pueden establecer lo que se llaman homologías por ejemplo con las proteínas o secuencias parecidas y se puede digamos que sacar un parecido o una diferencia entre este viroide que te digo y lo que se ha descubierto nuevo y se establece como nuevo. De hecho, en el artículo del CEL del 2024, Es el artículo en el que se le llama por primera vez obelisco. Y tiene que ser muy emocionante, realmente, ponerle el proceso ahora mismo en vivo de ponerle el nombre a una entidad biológica que realmente es nueva, pero que necesita todo este proceso tan grande de utilizar las muestras, de obtener las muestras, de hacer un proceso de laboratorio, de utilizar la bioinformática; es un grupo muy grande y de luego obtener unos resultados que nos llevan a esta conclusión. Entonces, es importante decir que se le llama obelisco simplemente esto por la forma que tiene en sí esta molécula de ARN circular que si la pudierais ver en el artículo, lo mismo la podía haber llamado obelisco que se podía haber llamado bastoncillo o varilla porque realmente esa es la forma que puede evocar esta biomolécula orgánica. Con un poquito de imaginación, parece un telescopio. Sí, también es verdad. Algunos dirán que es un símbolo fálico, no sé qué Te iba a preguntar, Luisa, porque para mí me lo has explicado de forma muy básica para la gente que no sabe y me gustaría trasladar eso también a nuestros oyentes porque habrá algunos también que también…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio explica que identificar biomoléculas requiere herramientas como la bioinformática y el trabajo de laboratorio, reconociendo la mayor experiencia de Francis Villatoro en el tema.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1viroides sin open framemarco de lectura abierto viroidesluisa achaerandio y viroidesbioinformática para biomoléculastrabajo de laboratorio con francis villatoromuestras para identificar biomoléculasextracción adn arn microbioma humanotécnicas northern plot microbiomaluisa achaerandio extracción heces salivabioinformática para secuencias de arnsecuencia de aminoácidos en base de datoshomologías entre proteínas y viroidesartículo cel del 2024molécula de arn circular obeliscomuestras y análisis bioinformático obeliscoforma bastoncillo o varilla obeliscoluisa achaerandio nombra entidad biológica…en forma de martillo que se le llama, ¿vale? Harbor Ribocimas, ¿vale? Son básicamente unas enzimas que en el momento en el que este agente infeccioso se introduce en su huésped utiliza esa maquinaria celular para crear estas ribocimas y poder replicarse. Entonces se diferencia precisamente en eso, en que si hablamos de viroides no estamos hablando de una biomolécula que tenga ese open frame, ese marco de lectura abierto. No tiene esa capacidad de identificarse con unas proteínas concretas y pues eso básicamente es como una diferencia como muy fundamental, pero ¿por qué digo yo que hay que ir al ajuste fino? Porque esto no es posible identificarlo con nuestros ojos, no es lo mismo diferenciar un perro de un pollo, por así decirlo, si estamos hablando de seres, que una biomolécula de otra y para eso, pues que me corrija evidentemente Francis, que es el que sabe del tema muchísimo mejor que yo. Necesitamos la bioinformática y necesitamos el trabajo de laboratorio y evidentemente necesitamos una cantidad de muestras pues bastante. importantes que se pueden ver perfectamente en el artículo para poder extraer tanto el ADN, por así decirlo, en este caso estaríamos extrayendo ADN y tenemos que extraer, estaríamos extrayendo ARN, ¿vale?, ácido ribonucleico de ese microbioma humano en concreto de las heces y de la saliva. Y para ello necesitan muchas técnicas de laboratorio, entre las que se encuentran pues Northern Plot y técnicas muy concretas, ¿vale? entonces una vez que ya lo tienes digamos estas técnicas de laboratorio se tienen que complementar con técnicas de bioinformática que básicamente es trasladar esa secuencia de aminoácidos partimos de la ARN o de las proteínas que encontremos en una muestra y esa secuencia de aminoácidos hay que pasarla a una base de datos y compararla pues con secuencias anteriores que tenemos tanto de nucleótidos como de proteínas y en ese proceso de comparación se pueden establecer lo que se llaman homologías por ejemplo con las proteínas o secuencias parecidas y se puede digamos que sacar un parecido o una diferencia entre este viroide que te digo y lo que se ha descubierto nuevo y se establece como nuevo. De hecho, en el artículo del CEL del 2024, Es el artículo en el que se le llama por primera vez obelisco. Y tiene que ser muy emocionante, realmente, ponerle el proceso ahora mismo en vivo de ponerle el nombre a una entidad biológica que realmente es nueva, pero que necesita todo este proceso tan grande de utilizar las muestras, de obtener las muestras, de hacer un proceso de laboratorio, de utilizar la bioinformática; es un grupo muy grande y de luego obtener unos resultados que nos llevan a esta conclusión. Entonces, es importante decir que se le llama obelisco simplemente esto por la forma que tiene en sí esta molécula de ARN circular que si la pudierais ver en el artículo, lo mismo la podía haber llamado obelisco que se podía haber llamado bastoncillo o varilla porque realmente esa es la forma que puede evocar esta biomolécula orgánica. Con un poquito de imaginación, parece un telescopio. Sí, también es verdad. Algunos dirán que es un símbolo fálico, no sé qué Te iba a preguntar, Luisa, porque para mí me lo has explicado de forma muy básica para la gente que no sabe y me gustaría trasladar eso también a nuestros oyentes porque habrá algunos también que también…
Luisa Achaerandio especifica que la identificación de biomoléculas se realiza a partir de muestras de heces o saliva y menciona una bacteria específica, *Heces sanguinis*, que ha sido identificada como su hospedador.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #2identificación biomoléculas heces salivabacteria heces sanguinis hospedadorartículo identificación heces sanguinis…tienen unas enzimas que una vez que entran en los hospedadores, que ya son diferentes a las plantas; ya no son plantas. Ya se han encontrado en microbiomas humanos y hemos dicho que hemos hablado de microbioma humano, entendiendo como microbioma humano, por ¿Concretar esto: heces o saliva? Y en concreto hay una bacteria concreta que sí se ha logrado discriminar, que ese sea su hospedador, que es el *Heces sanguinis*. Eso sí también lo pone en el artículo. Y luego me faltaría hablar del otro preprint, pero que digamos que parte de este. La idea fundamental yo creo que es interesante: es que podemos llegar a este nivel porque precisamente tenemos las herramientas para hacer lo que antes no teníamos. Resolver una estructura tridimensional o lineal a nivel molecular era imposible a partir del…
Francis Villatoro reflexiona sobre cómo identificar vida en un contexto limitado, como la búsqueda de vida en Marte, y enfatiza la importancia del concepto de evolución y heredabilidad para diferenciar entre entidades biológicas legítimas y química prebiótica.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #3búsqueda de vida en marteevolución y heredabilidad biológicaquímica prebiótica abiosisbiomoléculas agua azúcarproteínas y ácidos nucleicos biología molecularbiomoléculas clave herencia villatorodefinición descriptiva de la vida…de coger un viroide concreto y decir esto está vivo, porque cogemos un viroide concreto y lo que es un cristal, ¿vale? Es un cristal, no es nada más, es un cristal de ácidos nucleicos. Yo entiendo lo que dice Héctor; yo creo que Héctor un poco lo que dice es, ¿cómo sabes? Si es vida algo que encuentras, por ejemplo, en Marte, porque no tienes todo el contexto, solo encuentras unas moléculas entrelazadas Entonces, claro, si quieres detectar, por ejemplo, vida en Marte, necesitarías un contexto mucho mayor que simplemente encontrar unos átomos ahí Claro, pero la diferencia precisamente en que algo esté biológicamente o que sea una entidad biológicamente legítima parte de que tenga elementos heredables por eso está implícito el concepto de evolución y evolutivo y heredable eso justamente es lo que marca la diferencia y aunque haya una química prebiótica es abiosis justamente es acercarnos a ese punto de inflexión justo ahí por eso las moléculas simplemente quería decir que por eso las biomoléculas se dividen no en agua, azúcar, o sea azúcar no es una biomolécula ¿vale? O sea, realmente las biomoléculas que tú estudias en biología molecular, o sea, como biología molecular relacionadas con la herencia, son proteínas y ácidos nucleicos Ahí lo dejo ya Yo, en fin, es un tema desde luego controvertido porque seguramente se prestaría opiniones A mí me parece que es una definición descriptiva, ¿no? Es una descripción de qué es la vida que conocemos Porque uno podría hacer un experimento mental y concebir algo que podríamos estar de acuerdo en que es vida por ejemplo una especie sintética que nosotros podamos fabricar y que no se reproduce sino que simplemente la fabricamos en laboratorio y digo bueno estas cosas están vivas y también en Esa definición, lo de auto replicarse también hay que ver qué quiere decir porque auto implica que por ti mismo pero nosotros de hecho ni siquiera vivimos por nosotros mismos sin la microbiota, por ejemplo, que hablábamos, que necesitamos también todo un…