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Luisa AchaerandioIgnacio CrespoJuan Carlos GilJosé EdelsteinFrancis VillatoroHéctor SocasGastón Giribetvirus antiguos en restos óseosanálisis de ovejas en europamuestras de virus prehistoriarestos de dientes asiáticosHéctor SocasEuropaIgnacio Cresposiglo XXADNEspañaVirus de la viruela ovinaColágenoEurasiaIgnacioEdad de Bronce asiáticavirus ARNvirus ADNVirus de la viruela caprinaDermatosis nodular contagiosaVacasOvejasPoxviridaeCapri-Pox virusInteligencia Artificial
Muestras de virus prehistoria
Con
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Ignacio Crespo explica cómo se buscan muestras de virus antiguos en restos óseos, especialmente de ovejas, para analizar su historia y evolución.
…que sabemos que está relacionado con la posibilidad de pasar alguna infección a humanos. El planteamiento yo creo que es bastante necesario; es un paper que en principio está muy justificada la pregunta y que para mí lo más bonito es cómo intentan resolverla. Porque lo que hacen es, lo que decías Héctor: vamos a encontrar muestras, muestras de estos virus en otros momentos de la historia, incluso de la prehistoria. ¿Y dónde puedes encontrarlos? Porque lo que te dice el cuerpo es vamos a ver si hay restos de ovejas y vamos a analizarlos. Y efectivamente lo hacen; y cogen dos restos de dientes, además de ovejas, que encuentran... todos son análisis del continente asiático, pero sobre todo Europa. Salvo estos dos. Estos dos dientes sí que son del continente asiático y tienen la mayor antigüedad de todos los restos que han estado analizando, que son unos 1800 años de antigüedad para uno, 1300 para otro. Es bastante. Perdón, de antigüedad no, antes de…
Significado #1 · Palabras #1
Ignacio Crespo plantea una pregunta sobre cuándo prescribe la genética, tras mencionar la obtención de muestras de ADN con gran antigüedad.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #3adn de restos edad bronce asiáticainvasión privacidad genómica antiguamuestras viruela edad broncemuestras adn con gran antigüedadviruela ovina microorganismo persistentehistoria de la viruela ovina desconocidaviruela terrible para los humanos…directo. Eso es una de las grandes ventajas de los reproductores de podcast, que los puedes poner a velocidad triple y pasas así toda la parte que no te interesa y llegas a la parte que te interesa Estamos en el siglo XXI, señores, a ver, un poquito por favor Estamos en el siglo XXI, no como estas muestras de la viruela que son de hace 3000 años, de la edad de bronce asiática. Ignacio, esto ya es una… Es preocupante la invasión de privacidad que supone; todo el mundo está pensando en la invasión de privacidad de los móviles, pero el hecho de que ahora mismo la genómica llega hasta el punto de poder sacar muestras de ADN de restos de hace 3.000 años, me parece casi que más preocupante; o sea, esa gente está descansando en paz un montón de tiempo pensando que todo lo que hicieron ya ha quedado… ¿Cuándo prescribe, no? Es la pregunta. Exacto, ¿cuándo prescribe la genética? Pues a ver, la cosa es que no es sorprendente que hayan obtenido muestras con esta antigüedad; se han obtenido con muchísima más. Aquí lo que es guay es ver lo que nos cuenta sobre un microorganismo que sigue haciendo de las suyas todavía ahora y cuya historia no conocemos todo lo bien que nos gustaría: que es la viruela ovina. Nosotros pensamos en la viruela y nos viene a la mente lo terrible que ha sido para los seres humanos, por supuesto, y nos alegramos de que ahora mismo no haya casos en Europa y que no haya casos en el mundo en principio, ¿no? De hecho, se sigue hablando de la virulencia de un virus, ¿no? Claro, y de ahí viene el asunto, pero pensamos de manera muy antropocéntrica en ese aspecto. Poxviridae, que sería el grupo al que pertenecen, tiene otros virus que también generan viruela en…
Ignacio Crespo reflexiona sobre cómo rastrear el origen y evolución de un virus, planteando preguntas sobre su mutación y separación genética entre diferentes cepas.
Habla: Ignacio CrespoPalabras #20mutación y separación genéticarastreo del origen de un viruscambios en cepas de virus…hay un 97% de similitud. Es relativamente alto para estos casos donde el material genético no es como el nuestro, que es larguísimo y hace falta muchos cambios para obtener ese 3% de diferencia. Aquí tenemos 150 kilobases, entonces es muchísimo más asequible. ¿Cómo respondemos a esta pregunta? ¿Cómo podemos rastrear el origen de este virus que nos ha traído hasta aquí? ¿Cuánto ha mutado? Que eso es una cosa importante, ¿no? Si tenemos tres representantes emparentados, ¿cuándo se separaron? ¿Cómo de rápido han ido cambiando hasta tener el actual? ¿El virus que se describe históricamente como virus de la viruela ovina es el mismo que estamos teniendo ahora? ¿Podríamos esperar cambios? Porque aquí pasa otra cosa chula, y es que si vemos qué partes del genoma de este virus se relacionan con su capacidad para infectar unas especies u otras, parece que están localizados en los extremos, los extremos de su material genético, que son además los…
Ignacio Crespo explica cómo se buscan muestras de virus antiguos en restos óseos, especialmente de ovejas, para analizar su historia y evolución.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #1 · Palabras #1virus antiguos en restos óseosanálisis de ovejas en europamuestras de virus prehistoriarestos de dientes asiáticos…que sabemos que está relacionado con la posibilidad de pasar alguna infección a humanos. El planteamiento yo creo que es bastante necesario; es un paper que en principio está muy justificada la pregunta y que para mí lo más bonito es cómo intentan resolverla. Porque lo que hacen es, lo que decías Héctor: vamos a encontrar muestras, muestras de estos virus en otros momentos de la historia, incluso de la prehistoria. ¿Y dónde puedes encontrarlos? Porque lo que te dice el cuerpo es vamos a ver si hay restos de ovejas y vamos a analizarlos. Y efectivamente lo hacen; y cogen dos restos de dientes, además de ovejas, que encuentran... todos son análisis del continente asiático, pero sobre todo Europa. Salvo estos dos. Estos dos dientes sí que son del continente asiático y tienen la mayor antigüedad de todos los restos que han estado analizando, que son unos 1800 años de antigüedad para uno, 1300 para otro. Es bastante. Perdón, de antigüedad no, antes de…
Ignacio Crespo explica que tras analizar varias muestras, los investigadores obtuvieron 41 resultados positivos para el virus de la viruela ovina.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #4 · Palabras #2colágeno extraído de ovejasmuestras virales de tejido conectivoanálisis de gelatina en pergaminos754 muestras de eurasia antiguaanálisis genético del colágenoseparación virus parientes genéticosárbol filogenético virus ovinamuestras positivas virusreconstrucciones completas genomagenomas únicos investigadoresgenomas únicos del virus viruela ovinamaterial genético según ignacio crespovirus antiguos fragmentos faltantesrepresentatividad del virus ignacio crespogenomas comparados ignacio crespo…ocurrido, pero sobre todo se apoyan en otra cosa que es la llamativa, la que a mí me parece bonita, y es códices, pergaminos, que saben que están producidos lógicamente con o bien piel de ganadería, en algunos casos de oveja, o con gelatina, como pegamento. Gelatina que viene del colágeno, que viene de las articulaciones, del tejido conectivo, básicamente de la ganadería, en parte de las ovejas. Así que se ponen a analizar esto y ahí tienen bastantes más muestras. De hecho, consiguen 754 muestras de Eurasia, de unos 14.000 años de antigüedad algunas de ellas. No hablamos de estos pergaminos, lógicamente, pero recogiendo ya todo, no solamente los dientes, tenemos todo esto. Y a partir de ahí empiezan a hacer criba, empiezan a analizar genéticamente y ver cuánto es utilizable, porque por mucho que tú encuentres efectivamente en el material genético que hay en este colágeno o en este cuero, por supuesto, material genético del ganado, pero también del virus, habrá que encontrar el virus que nos interesa, el virus de la viruela ovina y separarlo de otros, de esos otros dos parientes que sabemos que habrá que reconstruir el árbol, de cuándo se ramificaron, cuándo se encuentra esa división. De todo ello se quedan con 41 muestras positivas para el virus. 41 muestras genéticas que parece que sí que tienen información del virus, pero de nuevo no valen todas. Necesitan que sean reconstrucciones suficientemente completas del genoma de cada uno de ellos y además suficientemente distintas, que son esos genomas únicos. Consiguen 22 genomas únicos de este virus concreto y aún así hay que tener en cuenta qué le llamamos único. Único no es que tengan todo el material genético que tenía ese virus, es suficiente. Entonces aquí hablamos de que tenga una cobertura de más de 0,1 por, que viene a ser que va A haber bastantes fragmentos que estén desaparecidos, fácilmente 9 de cada 10 en algunos casos, pues no vamos a tener esa información, pero es suficiente como para hacernos una idea de la representatividad de ese virus concreto en ese momento. Lo analizan y lo comparan con genomas que tenemos de. los otros dos, del de las cabras y del de las vacas. Y ven qué diferencias encuentran. De esta forma reconstruyen un árbol que ha sido bastante polémico porque en muchos otros textos, partiendo de otro tipo de estudios, tenían todas las combinaciones…
Ignacio Crespo explica cómo los investigadores han llegado a la conclusión de que el virus de la viruela ovina se separó primero, seguido por los virus de la viruela caprina y la dermatosis nodular contagiosa en las vacas.
Habla: Ignacio CrespoPalabras #14dermatosis nodular contagiosa en vacasseparación virus ovejas…posibles. Primero se ramificó de este grupo de virus, de Capripox virus, se ramificó el de las ovejas y los otros dos, cabras y vacas, fueron por su lado; por otro lado la combinación de ovejas y cabras y vacas por el otro, entonces tenían todas las opciones. y aquí parece que concluyen que es más parsimonioso asumir que se separó en primer lugar el virus de las ovejas en sí y los otros dos fueron por su camino, tanto el virus de la virula caprina como, que no hemos puesto nombre hasta ahora porque no nos va a quedar, pero bueno, el virus de la dermatosis nodular contagiosa, que es el de las vacas, el de las vacas y punto. La cuestión es poner fechas, y aquí ya es cuando hay también un poquito más de discusión; lo que comentan es que en principio podríamos sospechar que lógicamente fue antes de estos 3.500 años de antigüedad, cuando se separaron, hacen una horquilla bastante…
Ignacio Crespo comenta una conclusión interesante sobre los restos más antiguos encontrados del virus de la viruela ovina.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #2restos más antiguos virus viruela ovinadistintos virus viruela ovina siglo xxanálisis restos viruela ovina ignacio crespovelocidad mutación viral pandemiavirus arn mutan menosignacio crespo estudio virus…lo que comentan es que en principio podríamos sospechar que lógicamente fue antes de estos 3.500 años de antigüedad, cuando se separaron, hacen una horquilla bastante grande, de hasta esos 14.000 en algunos casos, y en algún momento ahí debieron separarse. Pero llegan a otra conclusión que también me parece interesante y es que incluso estos restos que estamos encontrando, los más antiguos de los que se han analizado, del virus de la viruela ovina, son suficientemente distintos a los del virus de la viruela ovina que tenemos ahora o incluso de los restos más antiguos estudiados, de un caso que hubo a principios del siglo XX, que también habían incluido En este estudio. Eso significa que sí es el mismo, pero cambia y se puede esperar que cambie. La velocidad no parece muy grande comparado con otros virus; además, es un virus ADN, sabemos. Yo creo que nos quedó grabado por la pandemia, que los virus ARN en principio, porque es reduccionista pensar solamente que es la única característica importante, pero en principio mutan menos. Así que con esto han ido reconstruyendo un poco la historia y han sacado estas conclusiones que a mí me parecen bonitas, sobre todo, aunque ya lo haya dicho muchas veces, por cómo consiguen convertir lo que son unas fuentes. Que podrían ser simplemente históricas, que efectivamente también existen, redacciones de cómo había afectado el virus, ha ganado de tal época y habían aparecido todos los problemas que son parecidos a los que tiene la viruela en nuestro caso: fiebre alta de…
Ignacio Crespo explica las razones por las cuales los resultados obtenidos al comparar ADN viral deben ser interpretados con precaución, señalando una divergencia en la presencia de inactivaciones genómicas entre el virus de la viruela ovina y otros relacionados.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #12inactivaciones genómicas virus viruela ovinavirus viruela caprina comparte inactivacionescomparación adn viral requiere precauciónramificación virus viruela ovina…Ignacio, me ha recordado el hecho de que hay muchos libros antiguos que se encuadernaban con piel, típicamente de cerdo. Y se me ha ocurrido que podría ser una fuente, vete tú a saber, de ADN antiguo. Aquí hay un problema, bueno hay muchos problemas que no He nombrado, de por qué estos resultados hay que cogerlos con cuidado. Por un lado, cuando comparaban el ADN de dos de estos tres virus, veían que a pesar de que parece que de esa familia se ramificó primero el del virus de la viruela ovina, este comparte con el virus de la viruela caprina ocho inactivaciones en su genoma que están presentes en ambos casos pero no están presentes en el. bovino y esto es un poco extraño para reconstruir el árbol. Ellos sospechan que siendo solo ocho puede que haya sido una convergencia evolutiva adaptándose a la presión del medio pero que haya sido independiente. entonces esto yo aprovecho para decir que…
Ignacio Crespo explica que la clasificación de los virus se basa en la identificación y el uso de analogías, comparando la situación con la denominación en inteligencia artificial.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #14poxviridae y sus géneroscapri pox virus como ejemploanalogías en clasificación de virusinteligencia artificial y denominación…virus, ¿no? Sin mencionar familia o género, porque no están dentro del árbol taxonómico habitual. Aunque tienen su propia clasificación que yo desconozco completamente. Sí, es verdad que es conflictivo y es una cosa en la que nunca me he adentrado mucho. Sí que se suele hablar del grupo, la familia Poxviridae y dentro de ellos están géneros, aunque es análogo. Porque, claro, hablar de que es lo mismo como si fuera algo esencial. El género de un virus es con el que se identifique, no vamos a estar aquí poniendo etiquetas. Ahí tendríamos en principio géneros dentro de los cuales encontramos el Capri-Pox virus y dentro de ese los tres de los que hemos estado hablando hoy. Se han usado las mismas palabras, quizás no sea buena idea; pero lo hacemos todo el rato, si es que pensamos con analogías, vamos a hablar luego de la inteligencia artificial, pues dime tú si no estamos ahí haciendo licencias de cómo llamarle a las cosas. Bueno, pues vamos a ir pasando de tema y Juan Carlos, llevamos ya varias semanas posponiendo el tema que nos habías propuesto que te parecía muy interesante sobre el transporte de protones en el ácido fosfórico tengo mucha curiosidad realmente por qué es lo…