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Juan Carlos GilGastón GiribetFrancis VillatoroHéctor Socasdimetilsulfuro estructura tridimensionalángulo dmds entre noventa y cien gradosmoléculas dmds único eje de rotaciónmodos vibracionales dimetildisulfurotorsión grupos metiloquios simetría ac2flexión enlace azufre metilo dmsdeformación dos azufres infrarrojo 105 micrasajuste modelo fitting banda 105 dimetildisulfurotorsión interna molécula momento dipolarestiramiento simétrico doble enlacedimetilsulfuro formación biogénica tierraJuan Carlos Gildimetilsulfuro (DMS)C2VK2-18bDMDSHéctor SocasDMSCH3grupo de simetría C2VTierradimetildisulfuro (DMDS)7 micrasRamanGastón Giribetsimetría AC2
Moléculas DMDS único eje de rotación
Con
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Juan Carlos Gil continúa explicando las propiedades del dimetilsulfuro (DMS), comparándolo con el agua oxigenada para facilitar la analogía y detallando su estructura tridimensional.
…de antes del dimetil disulfuro con el agua, porque así me permite hacer la analogía que esto sería como el agua oxigenada H2O2, tenemos cuatro grupos, dos azufres y dos metilos en este caso. De hecho hay un mayor perecido porque tanto esta molécula dimetildisulfuro como el agua oxigenada en contra de lo que a priori podría parecer no son planas. Los dos laditos se molestan y la conformación más estable tiene un angulito, o sea que son moléculas que están un poquito abiertas, como un libro semiabierto En el agua oxigenada este ángulo es de 111 grados y en el DMDS de nuevo en tierra entre 90 o 100, es parecida Por eso las moléculas estas, el DMDS en particular, tiene un único eje de rotación, es la única simetría que tiene, en el ángulo central así, no tiene otras aunque lo parezca, ¿Vale? Y por tanto son solo de simetría AC2. Los modos activos en simetría AC2 son la torsión de los grupos metiloquios y la flexión del enlace azufre metilo que os comentaba antes, igual que en el DMS y aparece uno nuevo muy característico del dimetildisulfuro que es la deformación de los dos azufres. Tenemos dos azufres en medio y esta deformación es muy intensa en infrarrojo y aparece a 10,5 micras, que es así que yo la veo bien en el artículo. Es muy ancha, pero si me trato de olvidar de los azules, los azules es su modelo, del fitting, del ajuste a su modelo, esta banda en 10,5 del dimetildisulfuro a mí me parece razonable. Bueno, hay otros modos no activos del dimetildisulfuro. Como la torsión interna de la molécula, como si coges una toalla y la intentas secar, esa te deja siempre el momento dipular sin cambio, por tanto no es activo, y el estiramiento simétrico del doble enlace es ese. En la Tierra, decíamos, y voy a apuntar un poquito más, el dimetilsulfuro solo se forma en condiciones biogénicas, es decir. lo genera el fitoplacton, es un precursor de una molécula que se llama dimetilsulfonio propionato Lo he buscado en la literatura, que usan estos bichitos para la regulación osmótica y como antioxidante De tal forma que cuando estos pequeños organismos se…
Significado #1 · Palabras #1
Juan Carlos Gil continúa explicando las características espectroscópicas del dimetilsulfuro (DMS), detallando la simetría de sus átomos y su eje de rotación.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #2 · Palabras #2simetría del grupo c2v dimetilsulfuroespectroscopia infrarrojo grupos ch3características espectroscópicas juan carlos gildimetilsulfuro simetría átomoseje de rotación configuración contrariaeje c2 dimetilsulfurodimetilsulfuro propiedades como el aguaespectroscopía infrarroja modos rotavibracionalesraman polarizabilidad molecularvibraciones antisimétricas en infrarrojovibraciones simétricas en raman…tomando café en el mundo isiánico K2-18b. Bueno, esta molécula, Juan Carlos, puedes hablarnos un poco de ella porque es la clave de que esto haya tenido tanta repercusión, porque hay quien dice que es un biomarcador y que solo la generan los seres vivos. Pues te lo decía fuera de micrófono, me he puesto la camiseta de químico recordando mis orígenes y he aprovechado para mirar los grupos de simetría y qué cosas son activas en infrarrojo y demás. Bueno, el dimetilsulfuro DMS es dos metilos, grupos CH3, enlazados por un azufre en medio. Espectroscópicamente, de alguna forma, se puede tratar como si los metilos fuesen una bolita. Luego hago una puntualización, con lo cual tiene a todos los efectos simetría del grupo de simetría C2V, que significa que tiene un eje de rotación de 180 grados, es como un angulito, ¿no? Un eje de rotación de 180 grados y dos planos de simetría, uno del que forman parte los tres átomos y el perpendicular en el centro de la moleza. Has dicho 180 grados. Sí, el eje de rotación pasa de esta configuración a la contraria. Ah, vale. Hay un único eje aquí y es C2, no es C3, que sería un triángulo, etc. ¿Vale? Es decir, es semejante con esa puntualización al agua, por eso hacía la broma, ¿vale? Es como un grupo central y dos idénticos a los lados, grupo C2B. En el infrarrojo, recordemos, aparecen los modos rotavibracionales que hacen cambiar el momento dipolar de una molécula. En Raman, que alguna vez lo hemos mencionado aquí, los modos que aparecen son los que cambian su polarizabilidad. Si queréis el campo eléctrico inducido así en el infrarrojo, la mayor parte de las vibraciones de los movimientos de la molécula que aparecen son antisimétricas; en infrarrojo mediante que en Raman tienden a ser simétricas, por eso. son buenas técnicas complementarias Pero desafortunadamente no podemos hacer Raman AK-218B porque eso supondría iluminarle con un láser monocromático potentísimo y observar la pequeñísima fracción de luz que sale de forma inelástica, no Reilig y además a 90 o…
Juan Carlos Gil explica los modos vibracionales activos en espectroscopía infrarroja para la molécula de dimetilsulfuro (DMS), haciendo referencia a un artículo científico que sugiere una señal a 7 micras.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #3modos vibracionales dimetilsulfurotorsión grupo metil espectroscopiaseñal artículo científico 7 micrasespectroscopía infrarroja molécula dms…de eventualmente hacer raman en contra exoplanetas Y me dijo que vete tú a saber si con un blazar o con un maser, con algo que concentrase, bueno, también yo le forcé un poquito Pero claro, absolutamente, quiero decir, un poquito más exótico todavía de Lo que estamos pensando. Bueno, ¿qué modos en la molécula de DMS son activos entonces en infrarrojo? Pues el primero, la torsión del grupo metil, ¿vale? Esta torsión así, voy a hacer movimientos con las manos porque en espectroscopia si eres doble manco no tienes futuro. Aparece en tierra a 7,3 micras, con lo cual podría corresponder a la señal que aparece en el artículo que se adivina a 7 micras. Luego tenemos el bamboleo de uno de Los dos metilos respecto del azufre, de uno solo, ¿vale? Este en tierra, con nuestras condiciones aquí, aparece a 9,8 micras, que también es compatible con el ruidaco del espectro del artículo. Luego tenemos la fricción metilo-azufre-metilo, el ángulo de la…
Juan Carlos Gil explica qué modos vibracionales no son activos en espectroscopía infrarroja, detallando que se trata de la torsión antisimétrica de los dos metilos y el estiramiento simétrico de los enlaces carbono-azógenos.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #7deformación simétrica hidrógenos metilomomento dipolar molécula dimetilsulfurovibraciones infrarrojo moléculamolécula como paraguas taburetetorsión antisimétrica dos metilosestiramiento simétrico carbono azógenosespectroscopía infrarroja aumento dipolarmodo propio molécula momento dipolar…la fricción metilo-azufre-metilo, el ángulo de la moleculita abriéndose, que es semejante al anterior; también aparece en infrarrojo, aparece más o menos a la misma frecuencia, además de forma mucho menos intensa, con lo cual no es de esperar que aquí se vea. Y finalmente tenemos la deformación simétrica, ahora me fijo en los hidrógenos; la deformación simétrica de los hidrógenos del metilo. Esto es el carbono, mi mano, y si vibran de forma simétrica los tres de un único lado, eso afecta al momento dipolar de la molécula y es activo en infrarrojo. Es como un paraguas o como un tridente, como un taburete de tres patas, si quieres que se abre y se cierran. Y este, de nuevo en tierra, aparece a 7 micras. ¿Qué modos no son, por tanto, activos en infrarrojo? Los que te dejan la molécula con el mismo aumento dipolar, es decir, que son muy asimétricos, que serían la torsión antisimétrica de los dos metilos. Este modo de aquí es un modo propio de la molécula y deja en el momento en que tú le mires el momento dipolar es el mismo y el estiramiento simétrico de los dos enlaces carbono-azógenos, este también es fundamental, ese no aparece en infrarrojo Bueno, los que he dicho que aparecían estaban en torno a 7 y a 10 micras, se ven, se adivinan si miras con mucha intensidad o si quieres verlo de esa forma en el espectro ¿Qué es el dimetil disulfuro? Tú lo decías Héctor, en vez de un azufre, en medio de los dos metilos tienes dos azufres, por lo tanto si quieres cuatro grupos y por eso forzaba la comparación de antes del dimetil disulfuro con el agua, porque así me permite hacer la analogía que esto sería…
Juan Carlos Gil continúa explicando las propiedades del dimetilsulfuro (DMS), comparándolo con el agua oxigenada para facilitar la analogía y detallando su estructura tridimensional.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #1 · Palabras #1dimetilsulfuro estructura tridimensionalángulo dmds entre noventa y cien gradosmoléculas dmds único eje de rotaciónmodos vibracionales dimetildisulfurotorsión grupos metiloquios simetría ac2flexión enlace azufre metilo dmsdeformación dos azufres infrarrojo 105 micrasajuste modelo fitting banda 105 dimetildisulfurotorsión interna molécula momento dipolarestiramiento simétrico doble enlacedimetilsulfuro formación biogénica tierra…de antes del dimetil disulfuro con el agua, porque así me permite hacer la analogía que esto sería como el agua oxigenada H2O2, tenemos cuatro grupos, dos azufres y dos metilos en este caso. De hecho hay un mayor perecido porque tanto esta molécula dimetildisulfuro como el agua oxigenada en contra de lo que a priori podría parecer no son planas. Los dos laditos se molestan y la conformación más estable tiene un angulito, o sea que son moléculas que están un poquito abiertas, como un libro semiabierto En el agua oxigenada este ángulo es de 111 grados y en el DMDS de nuevo en tierra entre 90 o 100, es parecida Por eso las moléculas estas, el DMDS en particular, tiene un único eje de rotación, es la única simetría que tiene, en el ángulo central así, no tiene otras aunque lo parezca, ¿Vale? Y por tanto son solo de simetría AC2. Los modos activos en simetría AC2 son la torsión de los grupos metiloquios y la flexión del enlace azufre metilo que os comentaba antes, igual que en el DMS y aparece uno nuevo muy característico del dimetildisulfuro que es la deformación de los dos azufres. Tenemos dos azufres en medio y esta deformación es muy intensa en infrarrojo y aparece a 10,5 micras, que es así que yo la veo bien en el artículo. Es muy ancha, pero si me trato de olvidar de los azules, los azules es su modelo, del fitting, del ajuste a su modelo, esta banda en 10,5 del dimetildisulfuro a mí me parece razonable. Bueno, hay otros modos no activos del dimetildisulfuro. Como la torsión interna de la molécula, como si coges una toalla y la intentas secar, esa te deja siempre el momento dipular sin cambio, por tanto no es activo, y el estiramiento simétrico del doble enlace es ese. En la Tierra, decíamos, y voy a apuntar un poquito más, el dimetilsulfuro solo se forma en condiciones biogénicas, es decir. lo genera el fitoplacton, es un precursor de una molécula que se llama dimetilsulfonio propionato Lo he buscado en la literatura, que usan estos bichitos para la regulación osmótica y como antioxidante De tal forma que cuando estos pequeños organismos se…
Héctor Socas continúa la discusión sobre la posible presencia de dimetilsulfuro (DMS) y dimetildisulfuro (DMDS) en un exoplaneta, planteando que incluso si se detectaran estas moléculas, no necesariamente serían biomarcadores.
Habla: Héctor SocasSignificado #18 · Palabras #3detección dmds planeta hipótesistelescopio permite albergar esperanzamolécula interesante estudio futuro…para decidir si algo es un biomarcador o no? Es que me parece que estamos estirando mucho el chicle. ¿Qué es bonito plantear que quizás esa posibilidad existe? Sí, yo creo que al final todo depende del relato con el que uno revista, supongamos que hay DMS o DMDS en ese planeta, que es mucho suponer, ahora hemos estado discutiendo si nos creemos o no, pero supongamos que lo hay; es una primera hipótesis. Supongamos que lo hay, ¿y qué? ¿Podemos concluir de ahí que es un biomarcador? No, tenemos que ser la navaja del tedio y decir: bueno, esto no; hay que entusiasmarse, hay que decir: oye, pues la primera vez que ahora tenemos un telescopio que nos permite tener cierta albergar cierta esperanza de que podamos decir que ahí hay esta molécula y que es una molécula muy interesante, que habrá que seguir, no sé, estudiando y tal; es entusiasmante. O sea, dependiendo de cómo lo cuentes, lo puedes vender como señal o como ruido, ¿no? entonces Francis decía antes que para él es ruido, claro, si le dices a la gente que hay un biomarcador y que se puede haber encontrado vida en otro planeta que hemos encontrado, como he visto en algunos artículos, el indicio más fuerte de vida en otro…
Juan Carlos Gil aclara que el dimetilsulfuro (DMS) y el dimetildisulfuro (DMDS) no están directamente relacionados, respondiendo a una observación anterior de Gastón Giribet.
Habla: Juan Carlos GilPalabras #12dimetilsulfuro dmds relación gastón giribetoxidación azufre dimetilsulfuro laboratoriofitoplacto producción dimetilsulfuro…de elefantes, subidos encima de tortugas; bueno, es una atmósfera reductora, con lo cual eso va a favor de que sea más estable la molécula. En la Tierra se descompone en horas, el DMS se descompone en horas, con lo cual hay presencia mil veces inferior a la. Posible de este planeta, pues por la bomba del fitoplacto en que está todo el rato echando. Quería contestar a Gastón: no, no están relacionados directamente ambas moléculas. Hay una posibilidad de, iba a decir de oxidar, de incorporar azufre al dimetilsulfuro para dar dimetilsulfuro, pero eso es en laboratorio controlado y con muy poca eficacia en la Tierra se. Generan de forma independiente, el dimetil disulfuro se generan pantanos en fermentaciones; lo hay en los quesos curados, lo hay en la cerveza, lo hay en el vino y es parte del olor del ajo. Dicen que el dimetil disulfuro. Me gusta esto del queso marcador y…