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Silvana TapiaJuan Carlos GilFrancis VillatoroHéctor SocasBorja Tosarmodelo tip 4p 2005 estudio aguaestándar de oro modelos clásicos aguatrabajo abascal y vega modelo aguajl fernández abascal y el aguapolielectrolitos tesis juan carlos gilmodelo tip4p 2005 josé luis fernándezpotenciales profundos artículo científico mayoinvestigación tip4p 2005 juan carlos gilartículo científico modelos de aguareunión jl y sus doctoresinformación nueva artículo científicoJosé Luis Fernández AbascalJuan Carlos GilTIP 4P 2005AbascalVegaSPCSPCETIP4P 2005ST2Leonard Jones
Modelo tip4p 2005 José Luis Fernández
Con
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Juan Carlos Gil habla sobre José Luis Fernández Abascal, su antiguo director de tesis, y cómo este desarrolló el modelo TIP4P en 2005 para la modelización del agua.
…L, es especialmente prometedor para su identificación; aparece entre menos y más 20 grados a temperaturas muy decentes humanas y pocas miles de atmósferas de presión, perfectamente accesibles a cualquier laboratorio. Y por último, y esto me pasa a menudo, por Eso elijo los artículos, pues una cuestión personal. El modelo TIP 4P 2005, os he dicho que es el campeón entre los modelos clásicos del agua, el estándar de oro, incluso a día de hoy, o al menos hasta ayer, hasta que se hizo este trabajo, era de Abascal y Vega, os mencioné. Pues bien, Abascal es mi director de tesis, José Luis Fernández Abascal, cuando yo acabé la tesis en el año 97, donde hice los polielectrolitos que os he comentado antes, pues JL, como le llamamos, se empecé a interesar por el agua, por su modelización, lo que desembocó en este gran hito en 2005, que es posiblemente el más relevante de su carrera Yo no estuve involucrado directamente, aunque lo seguí muy de cerca, así que de alguna forma me considero una especie de tío segundo del modelo, si queréis, o algo así El caso es que leí este artículo; os lo he dicho antes, salió en mayo, o sea que ya lleva unos meses, y me voló la cabeza, porque yo no conocía este asunto de los potenciales profundos; me voló la cabeza que nuestro querido TIP 4P 2005 podría haberse sido superado. Así que espero hasta ahora para contároslo porque al final de cada año solemos reunirnos JL y sus doctores, entre ellos yo, y así hemos hecho hace poco, y entonces hemos hablado sobre todo esto. Me lo han contado en detalle y me lo han empollado para contároslo a vosotros, y desde mayo hasta ahora en el interim os decía. ¿Que se ha descubierto el hielo 22, el hielo 21? Se ha descubierto en octubre; es el primer polimorfo que se descubre en décadas. Ya ha sido justo ahora cuando estaba yo empollándome todo eso. Así que, ya picado por la curiosidad, me he entretenido a ver si…
Significado #3 · Palabras #1
Juan Carlos Gil continúa explicando la evolución de los modelos utilizados para simular el agua, mencionando el modelo SPC y sus variantes.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #4 · Palabras #8modelos de agua st2 simulaciónmolécula de agua rígida jonescargas tetraédricas en modelos aguamodelo spc para macromoléculastip 4p modelo abascal vegasimulación de agua e hielo rígido…las configuraciones que le van saliendo en la simulación pues puede calcular esas configuraciones por un DFT chulo, FETEN, e incorporar esos nuevos valores al reentrenar la red e incorporarlo para seguir haciendo la simulación con un potencial refinado. Vale, os he hablado de agua por un poquito y también de simulación, pero todavía necesito introducir otra cosita antes de pasar al artículo, mezclando agua y simulación. ¿Qué modelos de agua se han utilizado para la simulación? Pues el primer modelo moderno se llama ST2 de 1974, una molécula de agua rígida con un centro Leonard Jones y cuatro cargas en disposición tetraédrica; es bastante natural para reproducir la tendencia tetraédrica de las moléculas de agua. En los años 80 llega el modelo SPC, Simple Point Charge, y su variante SPCE, que son muy sencillos, muy simples, muy robustos y todavía a día de hoy se siguen utilizando sobre todo para la envolvente acuosa de macromoléculas, en biología molecular y demás. En 1983 aparece un nuevo modelo llamado TIP 4P; el 4P viene de cuatro points, de cuatro centros de interacción que dio lugar a toda una familia de variantes con cuatro centros, cuyo campeón absoluto es el TIP 4P 2005, publicado por Abascal y Vega en 2005 y que sigue siendo a día de hoy el estándar de oro para simular agua y hielo con modelos rígidos. Pero todos estos modelos tienen una limitación grave y es que obviamente los enlaces, cada oxígeno tiene sus dos hidrógenos apareados de por vida, son sus hidrógenos y esos enlaces no se rompen, no capturan los fenómenos que ocurren en el agua natural como la…
Juan Carlos Gil habla sobre José Luis Fernández Abascal, su antiguo director de tesis, y cómo este desarrolló el modelo TIP4P en 2005 para la modelización del agua.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #3 · Palabras #1modelo tip 4p 2005 estudio aguaestándar de oro modelos clásicos aguatrabajo abascal y vega modelo aguajl fernández abascal y el aguapolielectrolitos tesis juan carlos gilmodelo tip4p 2005 josé luis fernándezpotenciales profundos artículo científico mayoinvestigación tip4p 2005 juan carlos gilartículo científico modelos de aguareunión jl y sus doctoresinformación nueva artículo científico…L, es especialmente prometedor para su identificación; aparece entre menos y más 20 grados a temperaturas muy decentes humanas y pocas miles de atmósferas de presión, perfectamente accesibles a cualquier laboratorio. Y por último, y esto me pasa a menudo, por Eso elijo los artículos, pues una cuestión personal. El modelo TIP 4P 2005, os he dicho que es el campeón entre los modelos clásicos del agua, el estándar de oro, incluso a día de hoy, o al menos hasta ayer, hasta que se hizo este trabajo, era de Abascal y Vega, os mencioné. Pues bien, Abascal es mi director de tesis, José Luis Fernández Abascal, cuando yo acabé la tesis en el año 97, donde hice los polielectrolitos que os he comentado antes, pues JL, como le llamamos, se empecé a interesar por el agua, por su modelización, lo que desembocó en este gran hito en 2005, que es posiblemente el más relevante de su carrera Yo no estuve involucrado directamente, aunque lo seguí muy de cerca, así que de alguna forma me considero una especie de tío segundo del modelo, si queréis, o algo así El caso es que leí este artículo; os lo he dicho antes, salió en mayo, o sea que ya lleva unos meses, y me voló la cabeza, porque yo no conocía este asunto de los potenciales profundos; me voló la cabeza que nuestro querido TIP 4P 2005 podría haberse sido superado. Así que espero hasta ahora para contároslo porque al final de cada año solemos reunirnos JL y sus doctores, entre ellos yo, y así hemos hecho hace poco, y entonces hemos hablado sobre todo esto. Me lo han contado en detalle y me lo han empollado para contároslo a vosotros, y desde mayo hasta ahora en el interim os decía. ¿Que se ha descubierto el hielo 22, el hielo 21? Se ha descubierto en octubre; es el primer polimorfo que se descubre en décadas. Ya ha sido justo ahora cuando estaba yo empollándome todo eso. Así que, ya picado por la curiosidad, me he entretenido a ver si…