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Microbioma del hombre de hielo
Con
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Silvana Tapia describe un artículo reciente publicado en la revista Microbiom sobre el microbioma del hombre del hielo, destacando que el autor principal es Sarham, afiliado al Instituto de Biomedicina y al Instituto de Estudios de las Momias de Bolzano.
…uy, pues es que han sido muchos casos y muy curiosos. De todas formas yo no he sido en estos 45 años supersticiosa; no voy a hacerme ahora ni voy a coger ninguna cosa rara. Bueno, pues nada, he traído este artículo que me ha parecido muy curioso, salió. También hace muy poquito, hace una semana. Está publicado en la revista Microbiom y el principal autor, el primer autor es Sarham, del Instituto de Biomedicina y el Instituto de Estudios de las Momias de Bolzano, traducido literalmente como pone ahí en el artículo. Y el título traducido es El microbioma del hombre de hielo, desvelando milenios de diversidad microbiana y su continua evolución. Para poner un poquito en antecedentes, el hombre del hielo es la momia humana más antigua encontrada en Europa. Se presupone pues que se quedó ahí y que tiene hoy en día una edad de 5.300 años, por ahí de la edad de cobre. Hoy en día se han hecho muchísimos análisis y es Increíble la cantidad de cosas que sabemos de esta momia. Sabemos datos fisiológicos, por ejemplo, la edad que tiene: 46 o tenía 46 años cuando murió, que medía 1 metro 60, que tenía los ojos marrones, la piel ligeramente oscura, que tenía caries, la enfermedad de Lyme, parásitos intestinales, artritis, que el grupo sanguíneo era O positivo, que tenía 63 tatuajes y heridas que intentó curarse en último momento, porque bueno, también sabemos cuál fue la causa de la muerte: y es que fue asesinado. O sea, fijaros cuando se descubrió en el 1991 que lo encontraron unos montañeros en la frontera entre Austria e Italia y bueno pues durante todos estos años se han estado haciendo una serie de análisis y pruebas que han determinado pues toda esta información que a mí es que me parece alucinante, pero algo que no se había descubierto no se había estudiado en profundidad hasta el momento era su microbiota. Entonces, bueno, pues en este artículo los autores intentan pues responder a esta pregunta. Luego tiene un sentido porque bueno, aparte de lo que es lo que hacemos siempre, caracterizar la microbiota, los microorganismos que hay en un lugar, por qué están ahí, qué mecanismos tienen para estar ahí. Luego también hay otras cuestiones que son importantes responder y es que los que están ahí ¿qué pueden estar haciendo? y en el tema de conservar algo tan absolutamente valioso. La presencia de microorganismos puede ser muy relevante, sobre todo en temas de biodeterioro. Bueno, esta momia está actualmente en el Museo Arqueológico del Tirol del Sur, allí en Italia, y está en una cámara conservada a menos 6 grados y con un porcentaje de humedad del 99%, un poco recreando las condiciones del lugar donde se encontró y por supuesto condiciones que no fomenten el crecimiento bacteriano que harían pues que se deteriorara. Pero bueno, estos investigadores se han planteado dos preguntas. Primero, una muy importante: ¿conservar esa momia microbiota del momento en el que falleció? Es decir, microbiota presente hace 5.300 años, y la segunda pregunta, bueno puede que no, que en el momento de fallecer ese cuerpo o esa microbiota fue desplazada por microorganismos ambientales. Siguiente pregunta, ¿de qué ambiente? ¿De allí donde se encontró la momia o el ambiente que hoy en día tienen en esa cámara de conservación? Bueno pues esta es la primera pregunta que se hacen los investigadores y que intentan resolverlas. ¿Cómo abordan este problema? Pues primero tomando muestras, algo bastante complicado porque estamos hablando de algo muy valioso en el que no se puede toquetear mucho y por supuesto no se puede coger muestras siempre que se quiera, entonces bueno lo hicieron con mucho cuidado y sabiendo que posiblemente este experimento o este trabajo no se podía replicar en el futuro, aunque se hicieron dos muestreos años atrás, en el 2010 me parece que se menciona y también en el 1992 o algo así, pero claro, en ese momento no había la tecnología que hay hoy en día para poder identificar microorganismos. Bueno, los investigadores ponen que toman muestras de la piel externa, de algunos tejidos internos, cogen muestras también del agua procedente del deshielo, del hielo superficial, del sitio, de la tierra, del lugar donde se encontró en 1991 que tenían guardada, el agua incluso que se utiliza para humedecer la cámara de conservación y el aire de los museos y de los laboratorios. Conocer también la microbiota que hay alrededor es muy importante para saber la que esté presente en la momia; si es igual a la que hay en el ambiente, pues es contaminación y si es diferente, pues sí podemos sospechar que sea una microbiota propia de la momia. Bueno, ¿qué es lo primero que descubren? Pues que el interior y el exterior son ecosistemas distintos; que el ambiente, por supuesto, tiene su ecosistema y la piel de la momia tiene un ecosistema muy parecido al exterior. Por lo tanto, bueno, pues ahí se puede decir que ha sido contaminación;…
Significado #1 · Palabras #1
Héctor Socas anuncia que, además de discutir temas relacionados con la inteligencia artificial y la opinión del Vaticano, abordarán temas más prácticos como la relación entre inteligencia artificial y medicina, el microbioma del Hombre de Hielo (Iceman) y otros descubrimientos científicos.
Habla: Héctor SocasSignificado #3 · Palabras #3inteligencia artificial y medicinamicrobioma del hombre de hielo icemanespectro del antihidrógeno…interesante y tengo mucho interés en conocer la opinión del Vaticano. Digamos que me quiero empapar del tema, así que sí, será uno de los asuntos que trataremos hoy aquí, en Coffee Break. Ya saben, la tertulia de cada semana sobre la actualidad de la ciencia. Pero hablaremos también de temas más terrenales, de la relación entre inteligencia artificial y medicina. Del microbioma de Iceman, el hombre de hielo. Y no, no me estoy refiriendo al amigo de Maverick. Hablaremos también del fin de las colisiones en el LHC, del espectro del antihidrógeno, de quarks y de la tacoclina solar. Como Siempre, de todo esto y lo que surja. Pero todo eso en un minuto, antes les quiero recordar que tenemos una página web que es señalirruido.com. Y ahí pueden encontrar toda la información sobre este programa, todos los papers, todas las referencias de los…
Héctor Socas da la bienvenida a Gastón Giribet a la tertulia y le agradece su participación. Se comenta sobre la necesidad de avanzar rápidamente para cubrir todos los temas pendientes.
Habla: Héctor SocasPalabras #2gastón giribet universidad nueva yorkmicrobioma del hombre de hielotertulia avanza rápido temas pendientesleyenda urbana hombre del hieloarqueólogo y muerte misteriosaturista halló la momia…Papa. Bueno pues, muchas gracias Ignacio; yo creo que con esto vamos a ir llegando al final del primer bloque y hacemos la pausita y volvemos a vuelta de la pausa con más contenidos; no se vayan todavía. Una y más, eso era súper ratón, ¿no? Chao, chao. Bueno, Gracias por seguirnos acompañando. Se nos une ahora Gastón Giribet, que es doctor en Ciencias Físicas y profesor en la Universidad de Nueva York. Hola Gastón, ¿qué tal? ¿Cómo estás? Hola amigos, un gusto verlos. ¿Cómo están? Dependo que te unas a la tertulia. Me gusta mi rol dual de oyente la primera hora y participante. Vas tomando notas y tal. Vamos a seguir pasando al siguiente tema porque tenemos que ir un poquito rápido; sé que te hubiera gustado aportar tu punto de vista sobre todo lo que estábamos hablando, pero vamos a avanzar porque quizás luego haya más tiempo de retomarlo. Silvana, esto del microbioma del hombre de hielo, cuéntanos un poco y como hacía yo la broma al principio: no estamos hablando del personaje de Top Gun sino de... quizás hombre en el hielo, más que del hielo, ¿no? Sí, bueno, de todas formas, Héctor, fíjate que esta mañana, claro, estaba leyendo acerca del hombre del hielo: curiosidades. Una curiosidad te lleva a otra, empiezas a buscar y acabo en la Wikipedia y de repente pues se me han quitado un poco las ganas de comentar este artículo porque en la Wikipedia cuando habla de esta momia al final, que lo tengo aquí abierto la página, te pone leyenda urbana sobre una presunta maldición y por lo visto ocho personas que han estado trabajando muy cercanas a esto desde, por ejemplo, pone aquí el turista que halló la momia, el arqueólogo que desveló secretos del cuerpo, etcétera, pues todos ellos han muerto en circunstancias muy extrañas. Entonces bueno, si la semana que viene no estoy, pues sospechen. Bueno, no te preocupes, no te va a pasar nada. A ver qué has traído aquí y ya tendremos que ver qué nos pasa. Nada, nada, pero ha sido bueno, la guinda porque ya estaba leyendo todo y me he quedado: uy, pues es que han sido muchos casos y muy curiosos. De…
Silvana Tapia describe un artículo reciente publicado en la revista Microbiom sobre el microbioma del hombre del hielo, destacando que el autor principal es Sarham, afiliado al Instituto de Biomedicina y al Instituto de Estudios de las Momias de Bolzano.
Habla: Silvana TapiaSignificado #1 · Palabras #1microbioma del hombre de hielosarham instituto biomedicina bolzanomomia humana más antigua europaedad de cobre 5300 añosojos marrones del hombre del hielohombre del hielo frontera austria italiaanálisis y pruebas hombre del hielomicrobiota hombre del hielo descubiertamicrobiota del hombre del hielocaracterizar microbiota en lugaresmecanismos para estar microbiotabiodeterioro en museo tirol surhombre del hielo cámara conservadacondiciones humedad 99 museomomia microbiota hace 5300 añosmicroorganismos ambientales desplazaron microbiotamicrobiota del hombre hielomuestreos de 2010 y 1992tecnología identificación microorganismosmicrobioma del hombre del hielomuestras agua deshielo hombre del hielocontaminación microbiota momiaaire de museos y laboratorios…uy, pues es que han sido muchos casos y muy curiosos. De todas formas yo no he sido en estos 45 años supersticiosa; no voy a hacerme ahora ni voy a coger ninguna cosa rara. Bueno, pues nada, he traído este artículo que me ha parecido muy curioso, salió. También hace muy poquito, hace una semana. Está publicado en la revista Microbiom y el principal autor, el primer autor es Sarham, del Instituto de Biomedicina y el Instituto de Estudios de las Momias de Bolzano, traducido literalmente como pone ahí en el artículo. Y el título traducido es El microbioma del hombre de hielo, desvelando milenios de diversidad microbiana y su continua evolución. Para poner un poquito en antecedentes, el hombre del hielo es la momia humana más antigua encontrada en Europa. Se presupone pues que se quedó ahí y que tiene hoy en día una edad de 5.300 años, por ahí de la edad de cobre. Hoy en día se han hecho muchísimos análisis y es Increíble la cantidad de cosas que sabemos de esta momia. Sabemos datos fisiológicos, por ejemplo, la edad que tiene: 46 o tenía 46 años cuando murió, que medía 1 metro 60, que tenía los ojos marrones, la piel ligeramente oscura, que tenía caries, la enfermedad de Lyme, parásitos intestinales, artritis, que el grupo sanguíneo era O positivo, que tenía 63 tatuajes y heridas que intentó curarse en último momento, porque bueno, también sabemos cuál fue la causa de la muerte: y es que fue asesinado. O sea, fijaros cuando se descubrió en el 1991 que lo encontraron unos montañeros en la frontera entre Austria e Italia y bueno pues durante todos estos años se han estado haciendo una serie de análisis y pruebas que han determinado pues toda esta información que a mí es que me parece alucinante, pero algo que no se había descubierto no se había estudiado en profundidad hasta el momento era su microbiota. Entonces, bueno, pues en este artículo los autores intentan pues responder a esta pregunta. Luego tiene un sentido porque bueno, aparte de lo que es lo que hacemos siempre, caracterizar la microbiota, los microorganismos que hay en un lugar, por qué están ahí, qué mecanismos tienen para estar ahí. Luego también hay otras cuestiones que son importantes responder y es que los que están ahí ¿qué pueden estar haciendo? y en el tema de conservar algo tan absolutamente valioso. La presencia de microorganismos puede ser muy relevante, sobre todo en temas de biodeterioro. Bueno, esta momia está actualmente en el Museo Arqueológico del Tirol del Sur, allí en Italia, y está en una cámara conservada a menos 6 grados y con un porcentaje de humedad del 99%, un poco recreando las condiciones del lugar donde se encontró y por supuesto condiciones que no fomenten el crecimiento bacteriano que harían pues que se deteriorara. Pero bueno, estos investigadores se han planteado dos preguntas. Primero, una muy importante: ¿conservar esa momia microbiota del momento en el que falleció? Es decir, microbiota presente hace 5.300 años, y la segunda pregunta, bueno puede que no, que en el momento de fallecer ese cuerpo o esa microbiota fue desplazada por microorganismos ambientales. Siguiente pregunta, ¿de qué ambiente? ¿De allí donde se encontró la momia o el ambiente que hoy en día tienen en esa cámara de conservación? Bueno pues esta es la primera pregunta que se hacen los investigadores y que intentan resolverlas. ¿Cómo abordan este problema? Pues primero tomando muestras, algo bastante complicado porque estamos hablando de algo muy valioso en el que no se puede toquetear mucho y por supuesto no se puede coger muestras siempre que se quiera, entonces bueno lo hicieron con mucho cuidado y sabiendo que posiblemente este experimento o este trabajo no se podía replicar en el futuro, aunque se hicieron dos muestreos años atrás, en el 2010 me parece que se menciona y también en el 1992 o algo así, pero claro, en ese momento no había la tecnología que hay hoy en día para poder identificar microorganismos. Bueno, los investigadores ponen que toman muestras de la piel externa, de algunos tejidos internos, cogen muestras también del agua procedente del deshielo, del hielo superficial, del sitio, de la tierra, del lugar donde se encontró en 1991 que tenían guardada, el agua incluso que se utiliza para humedecer la cámara de conservación y el aire de los museos y de los laboratorios. Conocer también la microbiota que hay alrededor es muy importante para saber la que esté presente en la momia; si es igual a la que hay en el ambiente, pues es contaminación y si es diferente, pues sí podemos sospechar que sea una microbiota propia de la momia. Bueno, ¿qué es lo primero que descubren? Pues que el interior y el exterior son ecosistemas distintos; que el ambiente, por supuesto, tiene su ecosistema y la piel de la momia tiene un ecosistema muy parecido al exterior. Por lo tanto, bueno, pues ahí se puede decir que ha sido contaminación;…
Silvana Tapia explica cómo los investigadores distinguen entre contaminación actual y microorganismos presentes en el hombre del hielo al analizar su ADN, y plantea la posibilidad de que queden organismos vivos.
Habla: Silvana TapiaSignificado #4 · Palabras #12contaminación ambiental hombre del hielomicrobiota superficie vs ambienteimposibilidad cámaras estériles silvana tapiatreponema succinefaciens microbiota industrializadamicrobiota intestinal hombre del hielopoblaciones cazadores recolectores treponemadieta occidentalizada y treponemamicroorganismo marcador microbiota ancestralhombre del hielo dieta análisis estómagoanálisis moleculares adn hombre del hielobacterias típicas intestino microbiota antiguadegradación del adn en microbiomacitoisinas convertidas en uracilsecuenciación de adn silvana tapiamicrobiota ancestral hombre del hieloadn degradado hombre hielomicrobiota intestinal hombre hielobacterias adaptadas temperaturas bajasclostridium temperaturas muy bajassilvana tapia análisis de adnculturómica de muestras del hombre hielolevaduras creciendo en laboratoriosilvana tapia analiza culturómicalevaduras cicrófilas adaptadas al fríomuestras del hombre del hielomicroorganismos vivos en la momiaambiente polar y regiones alpinaspseudomonas en momia post-mortemdegradación de estructuras por levadurasgenomas de levaduras y bacterias…distintos; que el ambiente, por supuesto, tiene su ecosistema y la piel de la momia tiene un ecosistema muy parecido al exterior. Por lo tanto, bueno, pues ahí se puede decir que ha sido contaminación; además, bueno, supongo que por muy, aunque se traten. Las cosas con mucho cuidado, al final tampoco se están en cámaras estériles y es imposible controlar tantas cosas, entonces, bueno, pues lo que ellos suponían que podía haber contaminación ambiental queda confirmado con esa similitud entre la microbiota de la superficie y la microbiota del ambiente, pero hacen un descubrimiento muy importante y es que hay restos del microbioma. intestinal original ¿Y cómo descubren eso? Bueno, porque en la muestra que ellos han tomado resulta que hay especies que son típicas del intestino; de hecho, hay una de ellas que es Treponema succinefaciens que ha desaparecido en la microbiota de las poblaciones industrializadas. Es decir, que nosotros hoy en día nuestra microbiota intestinal no contiene este microorganismo; lo hemos perdido. Sin embargo, parece que sigue presente en algunas tribus o en algunas poblaciones que todavía son cazadores-recolectores mayoritariamente o agricultores tradicionales, pero en personas con dietas ya occidentalizadas no es típico. entonces los autores consideran que la aparición o digamos la detección de este microorganismo sería un marcador de microbiota ancestral y por supuesto pues encaja con todo lo que bueno pues toda la dieta que por cierto también no lo he dicho antes también se sabe lo que comió el hombre de hielo 8 horas antes de morir que se hizo pues un análisis del contenido del estómago se han hecho también análisis de polen de la superficie bueno pues yo he empezado a buscar por eso Empiezo a leer y voy tirando de una cosa a otra porque me parece todo absolutamente alucinante. Bueno, el tema es que encuentran bacterias, todo eso sí, con análisis moleculares del ADN, que son típicas del intestino y además dan con una que no es típica de la microbiota intestinal actual, sino, bueno, pues más antigua. ¿Cómo corroboran que de verdad estén ante una microbiota ancestral? Bueno pues midiendo la calidad del ADN, el ADN cuando está expuesto empieza a sufrir daños, en concreto hay una forma de medirlo, la tasa, no la tasa, sino el índice de degradación o el grado de degradación que es viendo cuántas citosinas se han convertido en uracil, porque la citosina va perdiendo grupos amino conforme va pasando el tiempo y se van convirtiendo en uracil. entonces ellos hacen esa secuenciación de ADN y la comparan con ADN de esas especies que hay en la base de datos y si ven que hay mayor cantidad de uracilo quiere decir que ese ADN ha estado expuesto a esas condiciones durante más tiempo por tanto es ADN más antiguo y efectivamente en esa microbiota hay especies que hoy en día pues no tenemos habitualmente en la microbiota y otras especies que sí existen pero se ha visto que ese ADN estaba mucho más degradado por tanto no es contaminación actual sino es microorganismos que estaban con el hombre de hielo en el momento de morir. También dicen que no todo es microbiota intestinal, ellos han escogido una serie de resultados muy llamativos pero son conscientes que ha habido mucha contaminación y encuentran muchas bacterias que estaban presentes en el medio pues donde se encontró la momia, muchas bacterias sobre todo adaptadas a temperaturas muy bajas. Algunas especies de Clostridium que son capaces de desarrollarse o de sobrevivir a temperaturas muy bajas. Y otra pregunta que se hicieron porque hasta ese momento eran todos análisis moleculares, es decir, detección de ADN bacteriano y en un momento del trabajo se preguntan si puede quedar algo vivo. Entonces empiezan a lo que nosotros llamamos actualmente la culturómica, que es coger muestras y sembrarlas en distintas placas de cultivo a ver si vemos crecimiento bacteriano y se llevan la sorpresa de que sí, que hay en concreto, no son bacterias, cuatro levaduras que son capaces de crecer en condiciones de laboratorio Ahí la pregunta es, bueno, hemos conseguido dentro de esas muestras, además algunas de ellas son tejidos del interior que no estaban expuestos Están vivas y dicen, vale, pero es contaminación o son Levaduras que al igual que pasaba con la microbiota que son antiguas. Bueno, pues aquí en este caso parece que son modernas porque son levaduras cicrófilas adaptadas al frío y son típicas también del medio ambiente. Se han detectado especies relacionadas en ambientes polares, en las regiones alpinas frías, etc. Entonces ahí dicen: vale, hay algo; hay microorganismos vivos en el interior de la momia pero son contaminación ambiental pero esto le lleva a otra y a otra pregunta o a otra reflexión muy importante vale da igual que esas levaduras o bacterias que también han detectado pseudomonas sean contaminación ambiental o la haya adquirido la momia pues post-mortem porque tiene una relevancia muy importante y es esas levaduras ¿esas bacterias tienen capacidad de degradar a la estructura? Pues parece ser que sí, porque han cogido los genomas De esas bacterias que han logrado crecer en el laboratorio y de esas levaduras han secuenciado los genomas completos y han detectado que su genoma está enriquecido en enzimas como las colagenasas, las proteasas, las lipasas y precisamente la momia que es lo…
Silvana Tapia expresa su entusiasmo por el trabajo realizado sobre el hombre del hielo y su microbioma, mencionando un comentario gracioso del chat que relaciona a las personas con sus propios microorganismos.
Habla: Silvana TapiaSignificado #6 · Palabras #4microbioma del hombre del hielocarcasas de nuestro microbiomabacterias en el cuerpo humanomeme sobre microorganismos…la concentración de oxígeno es algo que no han podido controlar bien, pero que lo mismo tienen que replanteárselo para evitar que esos microorganismos que están en el interior y están metabólicamente activos puedan perjudicar a la conservación del amor. Así que, bueno, a mí me ha gustado muchísimo el trabajo; me ha parecido muy curioso y lo que he dicho me ha dado pie a ir buscando, investigando más cosas y he dado pues con datos y con información que, bueno, pues súper interesante, la verdad. ¿Qué bueno? Acabo de ver un comentario en el chat que me ha hecho mucha gracia: dice Expo de Mita; al final solo somos carcasas de nuestro microbioma. Bueno, hay un meme por ahí que dice: cuando te sientas solo, que sepas que tienes bacterias por todo tu cuerpo y eres un mundo para ellas. Bueno, yo tengo alumnos que son muy creativos y hace unos años un chico que estaba acabando bioquímica me propuso un tema de trabajo de fin de grado y fue el estudio del tanatomicrobioma, es decir, cómo evoluciona la microbiota cuando fallecemos, está el…