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Métodos computacionales Luisa Achaerandio
Con
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Luisa Achaerandio explica cómo se pueden rediseñar proteínas nativamente mediante métodos computacionales para obtener nuevas funcionalidades en Escherichia coli.
…juego un poquito; estamos utilizando todas las posibilidades de nuestro entorno que todavía no te las he contado todas porque todavía te faltan datos para entender cómo se llega a esto, pero estamos utilizando todo lo que se sabe para ir un poquito más allá. De hecho, una de las cosas que dice una de las autoras, dice que si las proteínas nativas pueden ser rediseñadas computacionalmente para hacer algo nuevo, no necesitamos alterar el equilibrio genético de la célula con elementos externos, sino que dotamos a nuestra querida E. coli de un nuevo superpoder. es así un poquito como pensar en, lo ves, no como ser humano, pero con el adamantium. O sea, no solo puedo ser un ser humano, o en este caso una bacteria, sino tener como algo adicional, ¿no? Que efectivamente me puede alterar un poquito... Perdón, dime,…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio explica la importancia de la colaboración entre investigadores y centros de computación de alto rendimiento, como el Barcelona Supercomputing Center, para llevar a cabo estudios científicos complejos.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #8colaboración investigadores barcelona supercomputing centercomputación grande para resolver estructuras molecularesestructuras moleculares según artículo científico…Supercomputing Center, 314.000 billones de cálculos por segundo. 314.000 billones de cálculos por segundo. Lo vuelvo a decir porque es impresionante. O sea, de hecho ellos se ponen, digamos, la etiqueta de que van acelerando la ciencia, ¿no? Básicamente. Entonces, esto es fundamental que haya esta colaboración porque este estudio requiere no solo de las pruebas de laboratorio sino que también necesita una computación muy grande para poder llegar a resolver tanto determinadas estructuras que nos hace falta reconocer como dónde colocar otras estructuras moleculares para que realmente lo que nos está contando el artículo pueda llegar a funcionar. Entonces, volviendo a nuestra querida E. coli, se puede decir Escherichia coli y Escherichia coli; ambas dos se puede decir, pero por acortar es mejor decir E. coli. Es una conocida del laboratorio, mi alumnado, vamos, lo hemos utilizado muchísimo en clase;…
Luisa Achaerandio explica cómo se pueden rediseñar proteínas nativamente mediante métodos computacionales para obtener nuevas funcionalidades en Escherichia coli.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1rediseño proteínas nativas escherichia colisuperpoder en escherichia colimétodos computacionales luisa achaerandio…juego un poquito; estamos utilizando todas las posibilidades de nuestro entorno que todavía no te las he contado todas porque todavía te faltan datos para entender cómo se llega a esto, pero estamos utilizando todo lo que se sabe para ir un poquito más allá. De hecho, una de las cosas que dice una de las autoras, dice que si las proteínas nativas pueden ser rediseñadas computacionalmente para hacer algo nuevo, no necesitamos alterar el equilibrio genético de la célula con elementos externos, sino que dotamos a nuestra querida E. coli de un nuevo superpoder. es así un poquito como pensar en, lo ves, no como ser humano, pero con el adamantium. O sea, no solo puedo ser un ser humano, o en este caso una bacteria, sino tener como algo adicional, ¿no? Que efectivamente me puede alterar un poquito... Perdón, dime,…
Luisa Achaerandio responde a una pregunta de Tomás Vila sobre la posibilidad de reprogramar bacterias o plantas para secuestrar CO2 de manera ultraeficiente.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #17 · Palabras #18reprogramar bacterias escherichia colisecuestrar co2 plantas reprogramadasinvestigadora tecnología secuestro co2supercomputación desarrollo tecnológico…acá estamos en la situación en que está el agujero negro estático frente a nosotros, entonces eso, cuando uno pasa adentro, le da una dirección no compacta ahora al espacio, ya no al tiempo, y claro, cuando uno integra una cosa no compacta, está infinito. Bueno, más preguntas de las que tenemos hoy. Pregunta Tomás Vila si se podrían entonces reprogramar bacterias o plantas de manera que puedan secuestrar CO2 de manera ultraeficiente. ¿Qué opinas, Luisa? Pues ya te digo, si se supiera, si se utilizara precisamente esta tecnología que ha desarrollado pues esta investigadora y demás, y a lo mejor utilizando la supercomputación que antes no lo he mencionado, pero tiene un nombre que es lo de PL, Protein Energy Landscape Exploration, ¿vale? y se sabe la afinidad energética que puedas utilizar para que haya realmente algún binding pocket, como hemos dicho antes, que captara más eficientemente…