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Luisa AchaerandioFrancis VillatoroHéctor SocasBorja TosarGastón Giribetmejora de genes existentestriada catalítica serina histidina aspartatono confundir con aspartamo edulcoranteluisa achaerandio triada catalíticaLuisa AchaerandioCRISPR-CasEscherichia coliADNARNGen RewireTomás VilaPremio Nobel de QuímicaMOFFrancis VillatoroGastón GiribetCO2
Luisa Achaerandio triada catalítica
Con
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Luisa Achaerandio aclara que el proceso que están llevando a cabo no es una edición genética como CRISPR-Cas, sino más bien una mejora de genes existentes para añadir una triada catalítica.
…con superhéroes y tal Es que pega muchísimo, sobre todo en esta, justamente en este diseño que hacen, porque tú es como, lo que haces es mejorar, no estás cambiando, no estás cortando, no es el CRISPR -Cas, la tecnología de CRISPR-Cas con guía tradicional No es edición genética, ¿no? Efectivamente Genes que están ahí Exactamente, es una zona concreta que está ahí, que me puede servir para añadir lo que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no confundir con aspartamo, que es un edulcorante, ¿vale? Es importante decir todo. y básicamente esta triada catalítica tú la identificas en otras Enzimas de otras bacterias que suelen que ya de manera natural pueden degradar plástico pero se la incorporas a esta bacteria en estos lugares. Con lo cual la dotas de una nueva capacidad sin que pierda sus capacidades anteriores, es decir, esta bacteria…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio explica que los investigadores están avanzando en su investigación sobre la degradación de plásticos utilizando Escherichia coli, aprovechando el conocimiento existente y herramientas disponibles.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #3 · Palabras #4triada catalítica investigaciónmodelar degradación plástica escherichia coliutilizando conocimiento entorno investigadores…se puede utilizar AlfaFol. Tú puedes predecir una estructura, eso es predecir, pero en el momento en el que haces esto que han hecho estos autores, todos estos autores, que es añadirle en un lugar concreto una cosa muy concreta que te voy a contar, ¿vale? Que se llama triada catalítica. Esto significa ya modelar, es decir, ya estamos pasándonos el juego un poquito; estamos utilizando todas las posibilidades de nuestro entorno que todavía no te las he contado todas porque todavía te faltan datos para entender cómo se llega a esto, pero estamos utilizando todo lo que se sabe para ir un poquito más allá. De hecho, una de las cosas que dice una de las autoras, dice que si las proteínas nativas pueden ser rediseñadas computacionalmente para hacer algo nuevo, no necesitamos alterar el equilibrio genético de la célula con elementos externos, sino que dotamos a…
Luisa Achaerandio aclara que el proceso que están llevando a cabo no es una edición genética como CRISPR-Cas, sino más bien una mejora de genes existentes para añadir una triada catalítica.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1mejora de genes existentestriada catalítica serina histidina aspartatono confundir con aspartamo edulcoranteluisa achaerandio triada catalítica…con superhéroes y tal Es que pega muchísimo, sobre todo en esta, justamente en este diseño que hacen, porque tú es como, lo que haces es mejorar, no estás cambiando, no estás cortando, no es el CRISPR -Cas, la tecnología de CRISPR-Cas con guía tradicional No es edición genética, ¿no? Efectivamente Genes que están ahí Exactamente, es una zona concreta que está ahí, que me puede servir para añadir lo que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no confundir con aspartamo, que es un edulcorante, ¿vale? Es importante decir todo. y básicamente esta triada catalítica tú la identificas en otras Enzimas de otras bacterias que suelen que ya de manera natural pueden degradar plástico pero se la incorporas a esta bacteria en estos lugares. Con lo cual la dotas de una nueva capacidad sin que pierda sus capacidades anteriores, es decir, esta bacteria…
Luisa Achaerandio plantea una duda sobre cómo introducir una triada catalítica en un binding pocket, reconociendo que podría ser una pregunta que otros también se hagan.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #2 · Palabras #2triada catalítica binding pocketduda luisa achaerandiobinding pocket preguntaplásmido de adn circulartriada catalítica en plásmidoplantilla genética para decodificaciónluisa achaerandio modifica gen…como que se acuden a la fiesta, por así decirlo. ¿Qué es lo que pasa? Que esas bacterias tienen en comparación, como que se aprovechan un poco de la degradación que hace esta bacteria modificada y entonces pues está también simpático esta parte del artículo. ¿Cómo? Porque ya simplemente me quedaría que se supiera, porque tú te lo estarás preguntando. ¿Pero cómo meto yo esa triada catalítica en ese binding pocket? A lo mejor se lo pregunta alguien, ¿vale? No sé si se lo pregunta alguien, pero es una cosa que todavía quedaría por saber. Yo me lo estoy preguntando: ¿Cómo es la pregunta? ¿Cómo se modifica el gen? Exactamente, ¿cómo llega allí? Exactamente, pues básicamente volvemos a necesitar nuestro plásmido. Nuestro plásmido de ADN circular, que ya os lo he comentado, y este plásmido no va solo, que no me falte nada, que os cuento qué es lo que tenía. Este plásmido tiene, le metemos la triada, es decir, la plantilla genética para que posteriormente se pueda decodificar y codificar y decodificar. Pues esta triada, en este plasmido metemos la plantilla, metemos Una guía de ARN que hace de GPS molecular que va junto a la técnica de CRISPR-Cas, es decir, ese gen. Todo eso se lo metemos por electroporación a la célula, que básicamente es una de las maneras de introducir esos plasmidos. Básicamente, las bacterias están…
Luisa Achaerandio explica cómo una tecnología CRISPR-Cas y una guía de ARN se integran en el genético de las bacterias modificadas para degradar plástico, permitiendo a estas producir proteínas con una triada lista para la degradación.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #5crpr-cas guía arn bacteriasproteínas triada degradación plásticabacteria modifica genético plásticogen tecnología degradación bacteria…poco la temperatura, que por su porosidad va a entrar; quiero decir, es muy fácil que entre, sobre todo los que están modificados en el laboratorio y entonces básicamente al entrar eso ya en el citoplasma celular, pasa a través de su membrana, pues gracias a. Esa tecnología de CRISPR-Cas y la guía de ARN va a ese lugar concreto de esas proteínas, bueno, en este caso iría a nivel genético, digamos se integraría y ya después de que la célula pueda utilizar esa parte que ya está introducido como una adición a esa codificación genética, pues ya sí que esas proteínas tienen a la hora de crearse en la bacteria esa triada lista para poder degradar esos pequeños trocitos de plástico que les estamos poniendo a degustar a nuestra bacteria. Pues ya os digo, eso sería a grandes rasgos toda la técnica y lo que ellos han propuesto de Gen. Rewire y lo que ya para terminar simplemente, pues me gustaría decir que en este caso digamos que es una prueba de concepto. Es verdad que tú no puedes ya utilizar estas bacterias; no se trata de que tú cojas estas bacterias y ya las pongas en el medio y nos…
Luisa Achaerandio responde a una pregunta de Tomás Vila sobre la posibilidad de reprogramar bacterias o plantas para secuestrar CO2 de manera ultraeficiente.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #14reprogramar bacterias escherichia colisecuestrar co2 plantas reprogramadasinvestigadora tecnología secuestro co2supercomputación desarrollo tecnológico…acá estamos en la situación en que está el agujero negro estático frente a nosotros, entonces eso, cuando uno pasa adentro, le da una dirección no compacta ahora al espacio, ya no al tiempo, y claro, cuando uno integra una cosa no compacta, está infinito. Bueno, más preguntas de las que tenemos hoy. Pregunta Tomás Vila si se podrían entonces reprogramar bacterias o plantas de manera que puedan secuestrar CO2 de manera ultraeficiente. ¿Qué opinas, Luisa? Pues ya te digo, si se supiera, si se utilizara precisamente esta tecnología que ha desarrollado pues esta investigadora y demás, y a lo mejor utilizando la supercomputación que antes no lo he mencionado, pero tiene un nombre que es lo de PL, Protein Energy Landscape Exploration, ¿vale? y se sabe la afinidad energética que puedas utilizar para que haya realmente algún binding pocket, como hemos dicho antes, que captara más eficientemente…
Luisa Achaerandio responde a una pregunta de Tomás Vila y menciona el premio Nobel de Química del año en curso, relacionándolo con el pensamiento de este último.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #11premio nobel química este añomateriales mof confinar gases tóxicospensamiento de luisa achaerandio…todos lados, entonces podría pasar que hubiese uno en la ciudad. En Guayú, en Guayú, en Guayú. Hay que buscar un sitio que se llame En Guayú. ¿Cómo? En Guayú. Hay que buscar un sitio que se llama En Guayú y proponerle a tu universidad que haga una sede allí. Totalmente. Bueno. Bueno, y solamente me gustaría decir por la pregunta de Tomás Vila que el premio Nobel de Química de este año precisamente está relacionado un poco con su pensamiento, aunque no sé si se puede extrapolar a bacterias, pero que sí están los materiales MOF, lo de confinar, por ejemplo, gases tóxicos, ¿vale? que no olvidemos que hace poquito fue, pues listo. Muy bien, pues gracias Luisa, Francis, Gastón, Borja, ha sido un placer como siempre, hasta la semana que viene. Un placer, chao, chao. Hasta la semana, un abrazo. Muy bien chicos, pues nada, oyente. Madre mía, se nos ha ido un poco el tiempo. Yo creo que como, al carajo. Por culpa mía, íbamos súper bien, empezamos las preguntas a las 20 o algo así Las cismas, las cismas, las cismas ¿A qué hora? ¿A las cuyas y 20? A las…