Búsqueda · 26 momentos en 13 episodios
Ignacio CrespoJuan Carlos GilFrancis VillatoroJosé EdelsteinHéctor SocasSilvana TapiaIsabel CorderoLuisa AchaerandioGastón Giribetbases genéticas alteraciones psiquiátricasartículo nature diciembrepaisaje genético 14 desórdenes psiquiátricosluisa achaerandio psicología genómicaestudio gwas sobre alteraciones psiquiátricasconsorcios internacionales para desórdenes genéticosgenome wide association studies andrew grotzingerredes internacionales datos genéticos clínicosLuisa AchaerandioFrancis VillatoroNature14 Psychiatric DisordersTDHAGWASBarbara McClintockPremio NobelTrasposonesADNAndrew GrotzingerGenome-Wide Association StudiesSNPSingle Nucleotid PolymorphinsDRD2NCAM1ANKKP-factor
Luisa Achaerandio Psicología genómica
Ep545: 11F; Dinosaurios; Sag A*; Genes y Psiquiatría; AlphaGenome; ADN Origami
12 de febrero de 20269 momentos
Con
0:000:301:001:302:002:303:003:38
Luisa Achaerandio se muestra agradecida por ser redirigida y anuncia que va a hablar sobre las bases genéticas de alteraciones psiquiátricas, basándose en un artículo reciente publicado en la revista Nature.
…el cero, ¿no? Eran los, eran, no estoy seguro: eran los babilonios los primeros que manejaban el cero o fueron los mayas. Sara, no, no me acuerdo. Por los árabes, ¿no fueron los árabes? Los árabes fueron, los trajeron. Los trajeron, sí, sí, Nefer, aclara. Invoquemos, invoquemos. Bueno, vayamos al grano: Luisa, cuéntanos tu tema de psicología genómica y cosas por el estilo. Pues me alegra que me haya reconducido, Francis. Muy chulo. Pues mira, vamos a hablar de bases genéticas de determinadas alteraciones psiquiátricas. Es un artículo de Nature del 10 de diciembre, hace poquito, del 25, y se titula, a ver, mi inglés no es el mejor del mundo, pero vaya, "Mapping the Genetic Landscape Across 14 Psychiatric Disorders", que se puede traducir como mapeando el paisaje genético alrededor o a través, basándose en 14 desórdenes psiquiátricos concretos, para ver si hay en efecto una base genética que los pueda relacionar o no. El autor es Andrew Grotzinger, espero haberlo pronunciado bien el apellido, y el trabajo está liderado por una cantidad de consorcios y de redes internacionales. Vaya, un consorcio a nivel genético; lo digo en general para los que a lo mejor no estáis tan familiarizados con el tema: son redes internacionales que integran datos genéticos y clínicos para estudiar enfermedades complejas como son este tipo de desórdenes, ¿vale? El trabajo es colaborativo enorme y se basa en estudios de GWAS; es decir, GWAS es un acrónimo que significa Genome-Wide Association Studies, ¿vale? Ok, entonces empezamos con la premisa inicial que me llama mucho la atención porque dice, y ojo al dato, aproximadamente la mitad de la población; no dice la población mundial pero sí que lo dice de palabras textuales: Aproximadamente la mitad de la población…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio se muestra agradecida por ser redirigida y anuncia que va a hablar sobre las bases genéticas de alteraciones psiquiátricas, basándose en un artículo reciente publicado en la revista Nature.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1bases genéticas alteraciones psiquiátricasartículo nature diciembrepaisaje genético 14 desórdenes psiquiátricosluisa achaerandio psicología genómicaestudio gwas sobre alteraciones psiquiátricasconsorcios internacionales para desórdenes genéticosgenome wide association studies andrew grotzingerredes internacionales datos genéticos clínicos…el cero, ¿no? Eran los, eran, no estoy seguro: eran los babilonios los primeros que manejaban el cero o fueron los mayas. Sara, no, no me acuerdo. Por los árabes, ¿no fueron los árabes? Los árabes fueron, los trajeron. Los trajeron, sí, sí, Nefer, aclara. Invoquemos, invoquemos. Bueno, vayamos al grano: Luisa, cuéntanos tu tema de psicología genómica y cosas por el estilo. Pues me alegra que me haya reconducido, Francis. Muy chulo. Pues mira, vamos a hablar de bases genéticas de determinadas alteraciones psiquiátricas. Es un artículo de Nature del 10 de diciembre, hace poquito, del 25, y se titula, a ver, mi inglés no es el mejor del mundo, pero vaya, "Mapping the Genetic Landscape Across 14 Psychiatric Disorders", que se puede traducir como mapeando el paisaje genético alrededor o a través, basándose en 14 desórdenes psiquiátricos concretos, para ver si hay en efecto una base genética que los pueda relacionar o no. El autor es Andrew Grotzinger, espero haberlo pronunciado bien el apellido, y el trabajo está liderado por una cantidad de consorcios y de redes internacionales. Vaya, un consorcio a nivel genético; lo digo en general para los que a lo mejor no estáis tan familiarizados con el tema: son redes internacionales que integran datos genéticos y clínicos para estudiar enfermedades complejas como son este tipo de desórdenes, ¿vale? El trabajo es colaborativo enorme y se basa en estudios de GWAS; es decir, GWAS es un acrónimo que significa Genome-Wide Association Studies, ¿vale? Ok, entonces empezamos con la premisa inicial que me llama mucho la atención porque dice, y ojo al dato, aproximadamente la mitad de la población; no dice la población mundial pero sí que lo dice de palabras textuales: Aproximadamente la mitad de la población…
Luisa Achaerandio explica el objetivo de un estudio reciente publicado en Nature sobre comorbilidad psiquiátrica y la necesidad de herramientas bioinformáticas para analizar los datos.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #11comorbilidad psiquiátrica y herramientas bioinformáticasbase genética común en patologíaslocus genético asociado a rasgosvariante snp single nucleotid polymorphinspleiotropía variante genética enfermedades…tienen otro añadido, que como las mujeres, voy a meter la cuña, a veces somos complejas y poco comprendidas. Por lo tanto, tienen menos como que se ocultan y a nivel social altera, afecta todo lo relativo con la enfermedad psiquiátrica o psicológica. Este paper responde a una pregunta central que es la siguiente: ¿existe una base genética común que explique esa comorbilidad psiquiátrica? ¿Hay algún nexo de unión entre estas enfermedades o patologías? Pues para ello se estudian datos de estos GWAS de más de un millón de pacientes; ojo al dato también, o sea, es que son datos realmente relevantes, un millón de pacientes, esto importantísimo también, imposible hacerlo sin las herramientas de bioinformática, ¿vale? Esto es posible porque tenemos estas herramientas que nos lo permiten, pues tenemos datos de GWAS de un millón de pacientes y de ese millón de pacientes digamos que aparecen estos 14 trastornos. Para poder entender un poquito cuáles son los resultados tengo que recordar algunas cositas genéticas, algunos datos genéticos. Algunos conceptos. El primero es el concepto de locus genético. Un locus es una localización muy concreta del genoma que está asociado a un rasgo. Se puede entender también como variante SNP, Single Nucleotid Polymorphins o simplemente SNP. Otro concepto importante para comprender bien el resultado que nos ofrece este estudio es el concepto de pleiotropía. Se entiende como pleiotropía como que es una variante genética que influye en varias enfermedades concretas. Es decir, tú tienes un SNIP, te pongo por ejemplo. El gen, o sea lo que es la variante del gen MC1R que a mí me encanta, ya sabéis, el receptor 1 de la melanocortina que puede ser, aparte de que es un SNIP, que está en un locus genético concreto, para los más curiosos se encuentra en la posición 89.920.138…
Luisa Achaerandio explica un nuevo concepto relacionado con trastornos psiquiátricos, diferenciando las enfermedades genéticas de las poligénicas y la importancia de entender la heredabilidad en genética cuantitativa.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #6trastornos psiquiátricos pleiotrópicosheredabilidad en genética cuantitativaenfermedades genéticas versus poligénicas…más sensibles a la anestesia e incluso tener más tendencia al melanoma. Entonces ahí está incluido el concepto tanto de locus en concreto como pleiotropía, como estas diferencias. Vale, pues el artículo identifica 283 loci, que es el plural de locus, ¿vale? Ok, pleiotrópicos, que están compartidos entre estos trastornos. Que en proporción a más de un millón, pues evidentemente 238, pues oye, no es tanto. Ya han encontrado un nexo de unión. Hay otro concepto que me gustaría poner sobre la mesa porque a veces no se entiende la diferencia entre enfermedades genéticas y enfermedades poligénicas. Entonces hay que comprender muy bien lo que es el concepto de heredabilidad en genética cuantitativa. Se refiere a la varianza fenotípica y lo digo así sin paños calientes porque a lo mejor ya hay mucha gente que a esto ya le suena. La heredabilidad se define como el porcentaje de variabilidad total que se debe en parte solo a la genética y el porcentaje de…
Luisa Achaerandio explica que un análisis genómico ha identificado cinco factores genéticos que engloban diversos desórdenes psiquiátricos.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #7bioinformática y estadística genéticagwas en trastornos psiquiátricoscorrelación genética luis achaerandiofactores genéticos y desordenes psiquiátricostrastorno estrés postraumático y depresiónvarianza genética en esquizofrenia bipolarfactor internalizante y adiccionesp factor vulnerabilidad genéticapredisposición genética psicopatologíafactor inteligencia en trastornos psiquiátricosvulnerabilidad psiquiátrica globalgenes drd2 implicadosgen ncam1 relacionadogen ankk en vulnerabilidad…un 0,4 sería normal y una cosa que me ha llamado la atención de este paper es que hay, por ejemplo, trastornos psiquiátricos que tienen una heredabilidad de 0,66. Por ejemplo se pueden mirar al final del artículo estos valores o sea que realmente bueno pues. Es curioso, tiene un peso; vale, la metodología, como ya decía, como ya había adelantado, está basada en el empleo de la bioinformática y la estadística genética basada en GWAS. No hay experimentos celulares ni cultivos; es un análisis genómico estadístico. Hay muchas herramientas; si queréis, las vemos en más profundidad después; pues si queréis preguntarme, pero básicamente utilizan correlación genética, solapomiento poligénico, correlación genética, quiero decir cosas que, y por supuesto análisis computacional, análisis funcional computacional. El hallazgo principal es que se identifican gracias a este análisis cinco factores genéticos, es decir, que todas estas enfermedades o desordenes psiquiátricos se pueden englobar en cinco tipos, ¿vale? Compulsivo, esquizofrenia bipolar, neurodesarrollo, es decir, TDHA, todo esto que conocemos, sobre todo en el ámbito educativo y factor internalizante, por ejemplo, el trastorno de estrés postraumático, depresión, ansiedad y las adicciones Es decir, que si tienes que ordenar los desórdenes psiquiátricos, en principio lo ordenas en estos cinco puntos ¿Y qué explican el 66% de la varianza genética? Esto está muy chulo ¿vale? O sea, realmente puedes englobar estos trastornos psiquiátricos en esta clasificación. Y lo que también me ha parecido muy chulo es que justo por encima se ha podido deducir o propone este artículo el P-factor, ¿no? Que es básicamente que por encima, a un nivel superior, aparece este concepto de P-factor, es decir, la vulnerabilidad genética general en psicopatología. Es decir, que no es que sea una enfermedad, sino que se establece un P-factor como si fuera el factor de inteligencia que te establece una predisposición genética general que aumenta la probabilidad de poder desarrollar distintos trastornos a lo largo de la vida, cosa que está muy chula. Es decir, tú puedes tener un P-factor de, yo qué sé, 3, yo de 4 y, bueno, pues ahí ya vamos viendo, ¿no? Entonces, es la idea de establecer como una cuantificación de la vulnerabilidad psiquiátrica global, ¿vale? Sobre la que luego fenotípicamente aparece el trastorno o se desarrollan trastornos concretos. A nivel del hotspot genético, es decir, ¿qué genes están implicados? Ojo, aquí tenemos algo que no nos sorprende a nadie porque son el DRD2, el NCAM1, el ANKK... Uy, perdón, esto es que no tiene muy buen oído, pero bueno, hay una serie de genes que están relacionados. Con la dopamina, ¿vale? En concreto y además que me parece increíble que sobre todo se encuentran en el cromosoma 11. Por lo tanto, cualquier alteración, tanto estructural como genética, como a nivel de ni en el cromosoma 11 relacionado con genes que están…
Luisa Achaerandio describe cómo la genética del P-factor se correlaciona con el neuroticismo, autolesiones e intentos de suicidio, destacando una clara división entre factores sociales y otros factores en la figura del artículo.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #14genética del p-factor y neuroticismocorrelación genética autolesiones e intentos suicidiofactores sociales y punto de inflexión…5, a los que queréis mirar el artículo, hay una figura que me parece increíble porque nada más que de un vistazo me ha llamado muchísimo la atención. A ver también vosotros cómo la interpretáis porque no sé, a mí me ha parecido muy visual para lo siguiente. Muestra que la genética del P-factor se correlaciona con neuroticismo, autolesiones, intentos de suicidio y nada más que de un vistazo porque te aparece como una correlación genética te da la impresión porque te dice por arriba de un punto de inflexión están como los factores sociales y por debajo de ese punto de inflexión están estos factores, neuroticismo, intentos De suicidio. Entonces, como que a mí, lo puedo interpretar como que esta vulnerabilidad psiquiátrica se relaciona más con la regulación emocional y con el estrés que con rasgos cognitivos. Es decir, tú puedes ser una persona muy inteligente, pero oye, si tú…
Luisa Achaerandio comenta un hallazgo relacionado con la expresión de receptores dopaminérgicos en diferentes tipos de células cerebrales, observando una correlación entre factores asociados a psicosis y neuronas excitadoras.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #10receptores dopaminérgicos y psicosisoligodendrocitos y estrés postraumáticoexpresión de receptores en células cerebralesdesarrollo temprano y cerebro fetalluisa achaerandio y receptores dopaminérgicos…no te dicen que controles tu insulina, por favor, a lo mejor tampoco puedes controlar tan fácilmente la forma en la que tienes de expresarte o de comportarte, ¿vale? Y por eso también me parece súper relevante esta figura a nivel visual, simplemente, ¿vale? Por ese twist que te hace justo en ese punto, por lo menos no me ha dado tiempo de profundizar al máximo, pero me ha llamado mucho la atención. Luego, pues claro, si tú también analizas en bases genéticas donde se expresan este tipo de receptores dopaminérgicos, pues ves que los factores que están asociados a psicosis están más relacionados con neuronas excitadoras; los factores que están relacionados más con trastornos de estrés postraumático y demás, pues se expresan más en oligodendrocitos, es decir, que hay más desajuste genético o más expresión de determinados receptores ya localizados en diferentes células, que eso también está muy interesante. Y que esto ocurre sobre todo, estas tendencias ocurren en el cerebro fetal y desarrollo temprano, también muy chulo; o sea, me parece realmente interesante. Básicamente, ya terminando, tiene una implicación terapéutica clara: que es que, bueno, pues a nivel terapéutico, a lo mejor el inhibidor selectivo de la recaptación de la serotonina te puede servir de manera transdiagnóstica para diferentes manifestaciones…
Luisa Achaerandio señala limitaciones en el estudio genético sobre el P-factor, destacando la predominancia de población europea en los datos y posibles sesgos en los diagnósticos autoinformados.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #19sesgo diagnóstico autoinformado pacientepredominio población europea en datos pfactortamaños de muestras desiguales trastornosgwas análisis estadístico correlación causalidad…no sé, lo utilizas para la depresión, pero a lo mejor, oye, podemos abrir un poquito más el campo porque sabemos que en base afectan mucho los genes del clúster dopaminérgico. Ahora, no está exento de limitaciones, que también hay que ver una lectura crítica. La lectura crítica, y es una lectura bastante clara, eso creo que lo podemos deducir cualquiera; es que el predominio de la población es europea, en los datos, ¿vale? Eso se ve claramente. Aparte, que bueno, que los diagnósticos muchas veces están basados en un psiquiatra que te da el diagnóstico autoinformado del paciente. Entonces, bueno, a veces ahí puede haber también cierto sesgo, porque yo tengo la muestra pero a lo mejor lo que no tengo bien es el diagnóstico. A ver si nos entendemos, ¿no? Entonces, que hay tamaños de muestras desiguales entre los diferentes trastornos y que bueno, en definitivas cuentas, aunque sea un millón de muestras de pacientes, GWAS no deja de ser un análisis estadístico; entonces igual correlación no implica causalidad como todos sabemos, pero por eso hay que seguir investigando. De todas maneras me parece sorprendente que todo nos lleve. Como a ese lugar del cromosoma 11 del clúster dopaminérgico. Luego hay, en lo que es los conflictos de intereses, he mirado que bueno siempre va a estar incluida empresas como Biogen pero bueno eso es normal; eso es algo que suele ocurrir y que bueno es…
Luisa Achaerandio plantea un problema con los diagnósticos actuales de trastornos mentales, sugiriendo que estos podrían no reflejar la organización biológica real de la psicopatología.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5diagnósticos trastornos mentalesorganización biológica psicopatologíanosología psiquiátrica luisa achaerandio…eso es algo que suele ocurrir y que bueno es evidente porque esto tiene tirón, o sea quiero decir, esto puede tener bastante repercusión por todo lo que estamos diciendo. Con lo cual termino diciendo que puede establecer ese cambio de paradigma, porque los diagnósticos actuales están basados en un manual de diagnóstico de trastornos mentales, uno u otro, tienen diferentes siglas, y podía, bueno, pues yo creo que es un problema puesto encima de la mesa, que puede no reflejar esta organización biológica real de esta psicopatología, ¿no? Por lo tanto, es un trabajo que tiene bastante potencial para cambiar o para pensar sobre la nosología psiquiátrica, es decir, la descripción y diferenciación y clasificación de este tipo de enfermedades que, bueno, evidentemente están en gran parte muy poco comprendidas Muy Bien, muy bien, estupendo resumen. Yo, sí, súper bonito y súper interesante; o sea, y aunque correlación no implica causalidad, sí te dice por dónde intentar buscarla, ¿no? Entonces, te puede ayudar mucho a encontrar, muy interesante, y que me ha parecido muy…
Luisa Achaerandio introduce el tema de Barbara McClintock, ganadora del Premio Nobel por los trasposones o genes saltarines, relacionándolo con la discusión previa sobre genoma y el Día Internacional de la Mujer y la Niña en la Ciencia.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #20 · Palabras #8barbara mcclinton premio nobel trasposonesgenes saltarines adn víricodía internacional mujer y niña ciencia…Alfagenome, creo que hay tanta gente, ¿no? Una barbaridad, a nivel de estudiantes, profesores, usándolo para cantidad de cenato. O sea, va a ser terrible, o sea, este tipo de cosas las usa mucha gente, que no pensemos que hay una cosa que la usan dos o tres. Bueno Yo solo quería decir, simplemente, como ya estamos hablando de genoma y demás Y estamos hablando también, hemos introducido lo de la niña y la mujer de la ciencia Quería hablar de, que, aprovechar para hablar de Barbara McClinton que es el Nobel de Trasposones de 1983, de esos genes saltarines tan monos porque me lo ha recordado con el tema del ADN vírico, esas zonas que no se conocen, esas zonas que se siguen investigando y bueno pues estaría bien, he visto que podía ser interesante también recordarlo. Perfecto. Muy bien. Bueno, Silvana, hay un artículo en Science que da lugar a la portada del episodio; de este episodio de esta semana que habla de vacunas origami de ADN. El concepto de origami de ADN me parece irresistible, maravilloso y muy evocador. No es algo nuevo, hay que decir…