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Luisa AchaerandioBorja TosarFrancis VillatoroHéctor SocasMaría Ribesviroid-like colonies microbioma humanoelementos heredables de arn cel 2024muestras del microbioma humanoconcepto viroide agentes heredables arnestructura arn escalón pequeñoagente infeccioso plantas viroidemacromolécula biológica ajuste finoCELMicrobioma humanoARNLuisa AchaerandioMarcos de la PeñaUniversidad de Valencia (UPV)ViroidesPlantasObeliscosHéctor SocasOpen frameMicrobiomas humanosProteínasRibocimas
Historia de Viroides por Luisa Achaerandio
Con
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Luisa Achaerandio recomienda un artículo sobre colonias similares a viroides encontradas en el microbioma humano, explicando que se traducen como 'viroid-like colonies of human microbiomes'.
…estuvieron en La Revuelta, en Radio Televisión Española. Es verdad que viendo, por ejemplo, nada más que parándote con el nombre de Marcos de la Peña, aparece en X y creo que aparece justo como un pequeño clip de vídeo donde se ve en ese programa, ¿sabes? Hablando precisamente de la importancia de la ciencia, vale, pues nada más que el artículo, yo lo recomiendo que lo veáis porque es un artículo muy bonito. Es un artículo que claramente ya te dice con el título de qué estamos hablando, que supongo que lo aportaremos en las notas del episodio, pues como siempre, ya te lo está aclarando, te dice Viroid-like colonies of human microbiomes, o como se pronuncia. Pues básicamente se traduce como unos microbiomas, o sea, en el microbioma humano, es decir, dentro, en concreto, utilizando o extrayendo muestras del microbioma humano se han encontrado unos colonizadores que se parecen, B-Joid-like, se parecen a unas entidades, por así llamarlo, o como lo llaman en este artículo del CEL de 2024, lo llaman elementos heredables de ARN, agentes o elementos genéticos. ¿Esto qué significa? Pues a lo mejor hay que empezar por el concepto de viroide, que digamos es un escalón un poco más pequeño de estructura de ARN. Ya te digo, aquí me he encontrado yo que no sabía bien si empezar desde el principio a principio o simplemente pues centrarme en este punto de lo que era un viroide en sí. Un viroide básicamente es un agente infeccioso para plantas, como se puede entender generalmente ¿vale? Es como se le conoce de manera general y digamos que su forma y comportamiento se parece mucho a este nuevo agente heredable, pero no del todo. Esto digamos que es un ajuste fino a la hora de poder diferenciar un agente biológico de otro en realidad una macromolécula biológica o una biomolécula de otra ¿vale? Estamos hablando de un ajuste fino. ¿En qué se diferencian? Pues como os decía en el artículo del CEL se ve clarísimo. Es un ARN circular, básicamente, que yo tengo aquí un dibujito que se ve muy claro, donde la diferencia con un viroide es que tiene un Open Frame Read, que es básicamente un marco de lectura, es…
Significado #5 · Palabras #1
Luisa Achaerandio recomienda un artículo sobre colonias similares a viroides encontradas en el microbioma humano, explicando que se traducen como 'viroid-like colonies of human microbiomes'.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5 · Palabras #1viroid-like colonies microbioma humanoelementos heredables de arn cel 2024muestras del microbioma humanoconcepto viroide agentes heredables arnestructura arn escalón pequeñoagente infeccioso plantas viroidemacromolécula biológica ajuste fino…estuvieron en La Revuelta, en Radio Televisión Española. Es verdad que viendo, por ejemplo, nada más que parándote con el nombre de Marcos de la Peña, aparece en X y creo que aparece justo como un pequeño clip de vídeo donde se ve en ese programa, ¿sabes? Hablando precisamente de la importancia de la ciencia, vale, pues nada más que el artículo, yo lo recomiendo que lo veáis porque es un artículo muy bonito. Es un artículo que claramente ya te dice con el título de qué estamos hablando, que supongo que lo aportaremos en las notas del episodio, pues como siempre, ya te lo está aclarando, te dice Viroid-like colonies of human microbiomes, o como se pronuncia. Pues básicamente se traduce como unos microbiomas, o sea, en el microbioma humano, es decir, dentro, en concreto, utilizando o extrayendo muestras del microbioma humano se han encontrado unos colonizadores que se parecen, B-Joid-like, se parecen a unas entidades, por así llamarlo, o como lo llaman en este artículo del CEL de 2024, lo llaman elementos heredables de ARN, agentes o elementos genéticos. ¿Esto qué significa? Pues a lo mejor hay que empezar por el concepto de viroide, que digamos es un escalón un poco más pequeño de estructura de ARN. Ya te digo, aquí me he encontrado yo que no sabía bien si empezar desde el principio a principio o simplemente pues centrarme en este punto de lo que era un viroide en sí. Un viroide básicamente es un agente infeccioso para plantas, como se puede entender generalmente ¿vale? Es como se le conoce de manera general y digamos que su forma y comportamiento se parece mucho a este nuevo agente heredable, pero no del todo. Esto digamos que es un ajuste fino a la hora de poder diferenciar un agente biológico de otro en realidad una macromolécula biológica o una biomolécula de otra ¿vale? Estamos hablando de un ajuste fino. ¿En qué se diferencian? Pues como os decía en el artículo del CEL se ve clarísimo. Es un ARN circular, básicamente, que yo tengo aquí un dibujito que se ve muy claro, donde la diferencia con un viroide es que tiene un Open Frame Read, que es básicamente un marco de lectura, es…
Luisa Achaerandio explica la diferencia entre viroides y un nuevo tipo de ARN circular, destacando que los viroides carecen de un 'open frame' o marco de lectura abierto.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #2viroides sin open framemarco de lectura abierto viroidesluisa achaerandio y viroides…en forma de martillo que se le llama, ¿vale? Harbor Ribocimas, ¿vale? Son básicamente unas enzimas que en el momento en el que este agente infeccioso se introduce en su huésped utiliza esa maquinaria celular para crear estas ribocimas y poder replicarse. Entonces se diferencia precisamente en eso, en que si hablamos de viroides no estamos hablando de una biomolécula que tenga ese open frame, ese marco de lectura abierto. No tiene esa capacidad de identificarse con unas proteínas concretas y pues eso básicamente es como una diferencia como muy fundamental, pero ¿por qué digo yo que hay que ir al ajuste fino? Porque esto no es posible identificarlo con nuestros ojos, no es lo mismo diferenciar un perro de un pollo, por así decirlo, si estamos hablando de seres, que una biomolécula de otra y para eso, pues que me corrija evidentemente Francis, que es el que sabe…
Luisa Achaerandio explica cómo las técnicas de laboratorio para analizar biomoléculas deben complementarse con bioinformática para comparar secuencias de ARN o proteínas con bases de datos existentes.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #19bioinformática para secuencias de arnsecuencia de aminoácidos en base de datoshomologías entre proteínas y viroidesartículo cel del 2024…estaríamos extrayendo ARN, ¿vale?, ácido ribonucleico de ese microbioma humano en concreto de las heces y de la saliva. Y para ello necesitan muchas técnicas de laboratorio, entre las que se encuentran pues Northern Plot y técnicas muy concretas, ¿vale? entonces una vez que ya lo tienes digamos estas técnicas de laboratorio se tienen que complementar con técnicas de bioinformática que básicamente es trasladar esa secuencia de aminoácidos partimos de la ARN o de las proteínas que encontremos en una muestra y esa secuencia de aminoácidos hay que pasarla a una base de datos y compararla pues con secuencias anteriores que tenemos tanto de nucleótidos como de proteínas y en ese proceso de comparación se pueden establecer lo que se llaman homologías por ejemplo con las proteínas o secuencias parecidas y se puede digamos que sacar un parecido o una diferencia entre este viroide que te digo y lo que se ha descubierto nuevo y se establece como nuevo. De hecho, en el artículo del CEL del 2024, Es el artículo en el que se le llama por primera vez obelisco. Y tiene que ser muy emocionante, realmente, ponerle el proceso ahora mismo en vivo de ponerle el nombre a una entidad biológica que realmente es nueva, pero que necesita todo este proceso tan…
Luisa Achaerandio continúa explicando las características de los viroides y su relación con los obeliscos, después de que Héctor Socas interviniera para aclarar la naturaleza de los viroides.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1viroides infectan plantasobeliscos evolución de la naturalezaluisa achaerandio explica viroidesobeliscos más grandes que viroidesproteínas propias en obeliscosribocimas en los obeliscosenzimas de obeliscos hospedadoresmicrobiomas humanos y obeliscos…cientos de nucleótidos, además en forma circular, que no tiene extremos porque está todo conectado y eso lo hace un poquito más estable y que infecta células de plantas y dentro de las células se puede No, no, perdona, perdona Héctor No, no, los viroides son Los que infectan Plantas. Digamos plantas, pero los obeliscos es como si fuera una especie de evolución de la naturaleza. Los obeliscos ya se ha demostrado. Sí, pero yo soy los viroides. Ah, vale, los viroides en sí, vale, vale, ok. Sí, los viroides sí infectan plantas. Vale, vale, y luego los obeliscos son como un paso un poco más, son más grandes, ¿no? Eso es. Y ahí, ¿sigue entonces con la explicación ahí? Eso, son un poquito más grandes y no solo es que sea un poquito más grande, sino que además añaden proteínas propias y ribocimas; es decir, que tienen unas enzimas que una vez que entran en los hospedadores, que ya son diferentes a las plantas; ya no son plantas. Ya se han encontrado en microbiomas humanos y hemos dicho que hemos hablado de microbioma humano, entendiendo como microbioma humano, por ¿Concretar esto: heces o saliva? Y en concreto hay una bacteria concreta que sí se ha logrado discriminar, que ese sea su hospedador, que es el *Heces sanguinis*. Eso sí también lo pone en el artículo. Y luego me faltaría hablar del otro preprint, pero que…
Luisa Achaerandio interrumpe la discusión sobre la definición de vida para señalar que una definición ya ha sido planteada y se encuentra disponible en el capítulo, que consta de 16 páginas.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #18definición de vida capítulo luisa achaerandiocapítulo de 16 páginas luisa achaerandiopágina 13 definición de vida…esa dualidad de la que estaba hablando yo justo en este momento y dice que hay un planteamiento antiindividualista de la asistencia al que hay que referirse y quería yo exactamente ir, porque claro aquí empieza ya a... Tal que no hay una definición entonces. Exactamente, pero no, pero él había planteado una; espera te haber sido, porque el capítulo son 16 páginas, si tú quieres introduce algo y te la doy en una frase. Vale, bueno, entonces lanzo otra pregunta diferente. Perdona, Luisa, en la página 13, al final, en el penúltimo párrafo, tienes la definición. Proponemos entender la vida como... Eso, tú ya lo has encontrado, ¿eh? Lo digo yo, si quieres. Espérate, espérate, espérate. Página 13 Ya estamos. Proponemos entender la vida como, exactamente, una red de interacciones e interdependencias que se establece…