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Ignacio CrespoJuan Carlos GilFrancis VillatoroJosé EdelsteinHéctor SocasSilvana TapiaIsabel CorderoLuisa AchaerandioGastón Giribetbioinformática y estadística genéticagwas en trastornos psiquiátricoscorrelación genética luis achaerandioGWASLuisa AchaerandioIsabel CorderoP-factorAndrew GrotzingerGenome-Wide Association StudiesNature
GWAS análisis estadístico correlación causalidad
Ep545: 11F; Dinosaurios; Sag A*; Genes y Psiquiatría; AlphaGenome; ADN Origami
12 de febrero de 20265 momentos
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Luisa Achaerandio describe la metodología utilizada en un estudio reciente publicado en Nature sobre trastornos psiquiátricos, explicando que se basa en bioinformática y estadística genética.
…un 0,4 sería normal y una cosa que me ha llamado la atención de este paper es que hay, por ejemplo, trastornos psiquiátricos que tienen una heredabilidad de 0,66. Por ejemplo se pueden mirar al final del artículo estos valores o sea que realmente bueno pues. Es curioso, tiene un peso; vale, la metodología, como ya decía, como ya había adelantado, está basada en el empleo de la bioinformática y la estadística genética basada en GWAS. No hay experimentos celulares ni cultivos; es un análisis genómico estadístico. Hay muchas herramientas; si queréis, las vemos en más profundidad después; pues si queréis preguntarme, pero básicamente utilizan correlación genética, solapomiento poligénico, correlación genética, quiero decir cosas que, y por supuesto análisis computacional, análisis funcional computacional. El hallazgo principal es que se identifican gracias a este análisis cinco factores genéticos, es decir, que todas estas enfermedades o desordenes psiquiátricos se pueden englobar en cinco tipos, ¿vale? Compulsivo, esquizofrenia bipolar, neurodesarrollo, es…
Significado #4 · Palabras #1
Luisa Achaerandio explica el significado de un estudio reciente publicado en Nature sobre las bases genéticas de alteraciones psiquiátricas, destacando la colaboración internacional y el uso de estudios GWAS.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #10 · Palabras #17estudio gwas sobre alteraciones psiquiátricasconsorcios internacionales para desórdenes genéticosgenome wide association studies andrew grotzingerredes internacionales datos genéticos clínicos…Genetic Landscape Across 14 Psychiatric Disorders", que se puede traducir como mapeando el paisaje genético alrededor o a través, basándose en 14 desórdenes psiquiátricos concretos, para ver si hay en efecto una base genética que los pueda relacionar o no. El autor es Andrew Grotzinger, espero haberlo pronunciado bien el apellido, y el trabajo está liderado por una cantidad de consorcios y de redes internacionales. Vaya, un consorcio a nivel genético; lo digo en general para los que a lo mejor no estáis tan familiarizados con el tema: son redes internacionales que integran datos genéticos y clínicos para estudiar enfermedades complejas como son este tipo de desórdenes, ¿vale? El trabajo es colaborativo enorme y se basa en estudios de GWAS; es decir, GWAS es un acrónimo que significa Genome-Wide Association Studies, ¿vale? Ok, entonces empezamos con la premisa inicial que me llama mucho la atención porque dice, y ojo al dato, aproximadamente la mitad de la población; no dice la población mundial pero sí que lo dice de palabras textuales: Aproximadamente la mitad de la población…
Luisa Achaerandio describe la metodología utilizada en un estudio reciente publicado en Nature sobre trastornos psiquiátricos, explicando que se basa en bioinformática y estadística genética.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #4 · Palabras #1bioinformática y estadística genéticagwas en trastornos psiquiátricoscorrelación genética luis achaerandio…un 0,4 sería normal y una cosa que me ha llamado la atención de este paper es que hay, por ejemplo, trastornos psiquiátricos que tienen una heredabilidad de 0,66. Por ejemplo se pueden mirar al final del artículo estos valores o sea que realmente bueno pues. Es curioso, tiene un peso; vale, la metodología, como ya decía, como ya había adelantado, está basada en el empleo de la bioinformática y la estadística genética basada en GWAS. No hay experimentos celulares ni cultivos; es un análisis genómico estadístico. Hay muchas herramientas; si queréis, las vemos en más profundidad después; pues si queréis preguntarme, pero básicamente utilizan correlación genética, solapomiento poligénico, correlación genética, quiero decir cosas que, y por supuesto análisis computacional, análisis funcional computacional. El hallazgo principal es que se identifican gracias a este análisis cinco factores genéticos, es decir, que todas estas enfermedades o desordenes psiquiátricos se pueden englobar en cinco tipos, ¿vale? Compulsivo, esquizofrenia bipolar, neurodesarrollo, es…
Luisa Achaerandio describe cómo la genética del P-factor se correlaciona con el neuroticismo, autolesiones e intentos de suicidio, destacando una clara división entre factores sociales y otros factores en la figura del artículo.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5genética del p-factor y neuroticismocorrelación genética autolesiones e intentos suicidiofactores sociales y punto de inflexión…5, a los que queréis mirar el artículo, hay una figura que me parece increíble porque nada más que de un vistazo me ha llamado muchísimo la atención. A ver también vosotros cómo la interpretáis porque no sé, a mí me ha parecido muy visual para lo siguiente. Muestra que la genética del P-factor se correlaciona con neuroticismo, autolesiones, intentos de suicidio y nada más que de un vistazo porque te aparece como una correlación genética te da la impresión porque te dice por arriba de un punto de inflexión están como los factores sociales y por debajo de ese punto de inflexión están estos factores, neuroticismo, intentos De suicidio. Entonces, como que a mí, lo puedo interpretar como que esta vulnerabilidad psiquiátrica se relaciona más con la regulación emocional y con el estrés que con rasgos cognitivos. Es decir, tú puedes ser una persona muy inteligente, pero oye, si tú…
Luisa Achaerandio señala limitaciones en el estudio genético sobre el P-factor, destacando la predominancia de población europea en los datos y posibles sesgos en los diagnósticos autoinformados.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #2sesgo diagnóstico autoinformado pacientepredominio población europea en datos pfactortamaños de muestras desiguales trastornosgwas análisis estadístico correlación causalidad…no sé, lo utilizas para la depresión, pero a lo mejor, oye, podemos abrir un poquito más el campo porque sabemos que en base afectan mucho los genes del clúster dopaminérgico. Ahora, no está exento de limitaciones, que también hay que ver una lectura crítica. La lectura crítica, y es una lectura bastante clara, eso creo que lo podemos deducir cualquiera; es que el predominio de la población es europea, en los datos, ¿vale? Eso se ve claramente. Aparte, que bueno, que los diagnósticos muchas veces están basados en un psiquiatra que te da el diagnóstico autoinformado del paciente. Entonces, bueno, a veces ahí puede haber también cierto sesgo, porque yo tengo la muestra pero a lo mejor lo que no tengo bien es el diagnóstico. A ver si nos entendemos, ¿no? Entonces, que hay tamaños de muestras desiguales entre los diferentes trastornos y que bueno, en definitivas cuentas, aunque sea un millón de muestras de pacientes, GWAS no deja de ser un análisis estadístico; entonces igual correlación no implica causalidad como todos sabemos, pero por eso hay que seguir investigando. De todas maneras me parece sorprendente que todo nos lleve. Como a ese lugar del cromosoma 11 del clúster dopaminérgico. Luego hay, en lo que es los conflictos de intereses, he mirado que bueno siempre va a estar incluida empresas como Biogen pero bueno eso es normal; eso es algo que suele ocurrir y que bueno es…
Isabel Cordero resume la presentación anterior sobre un estudio genético y expresa su interés en los hallazgos, destacando cómo las correlaciones pueden indicar posibles relaciones causales.
Habla: Isabel CorderoSignificado #2 · Palabras #10estrés como disparadorcorrelación indica causalidad potencialisabel cordero interés hallazgos…un trabajo que tiene bastante potencial para cambiar o para pensar sobre la nosología psiquiátrica, es decir, la descripción y diferenciación y clasificación de este tipo de enfermedades que, bueno, evidentemente están en gran parte muy poco comprendidas Muy Bien, muy bien, estupendo resumen. Yo, sí, súper bonito y súper interesante; o sea, y aunque correlación no implica causalidad, sí te dice por dónde intentar buscarla, ¿no? Entonces, te puede ayudar mucho a encontrar, muy interesante, y que me ha parecido muy interesante que el estrés afecta mucho a muchas cosas, ¿no? Es como el disparador, ¿no? Sí, efectivamente. ¿Quién lo iba a imaginar? Para sorpresa de nadie, pero bueno, ya no tenemos dudas. Tenemos hechos, ¿no? No, pero, o sea, corrobora que también lo que sale no parece una barbaridad, ¿no? O sea, lo vemos, pero sí, sí, muy muy interesante. Muy bien, Francis, yo me había saltado el orden y porque, no sé, leí mal. No se ha notado, si no se ha…