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José EdelsteinIgnacio CrespoFrancis VillatoroHéctor SocasBorja Tosaranálisis genético antropic retrotranscriptasasfragmentos genoma cercano función proteínasgenoma relevante 3564 familias antropicAntropicIgnacio CrespoZangEmily CharpentierJennifer Doudna
Fragmentos genoma cercano función Proteínas
Con
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Ignacio Crespo continúa explicando el proceso de análisis genético realizado por Antropic, detallando cómo clasificaron las retrotranscriptasas y los fragmentos del genoma relacionados.
…hay algunos que se parecen lo suficiente en algunas partes como para considerar que el gen está emparentado, por decirlo de esa manera, muy muy brutamente. Así que los tratas como un todo, como un clúster. Pues aún así tenían 200.000 distintos. Los clasificaron en 9 clases, muestrearon unas 11.000 ubicaciones dentro de ese genoma que eran relevantes y los dividieron en 3.564 familias, que es una barbaridad, con posibles compañeras, lo que decíamos, ¿no? no solo la retrotranscriptasa sino algún otro fragmento de ese genoma cercano que parezca heredarse junto, que parezca estar correlacionado y que pueda tener una función que evidentemente pues se convierta en proteínas en principio. De esto lo dividieron en 17 familias, pasaron varios filtros. Y al final aquello se quedó prácticamente en unos poquitos casos, en menos de 10 casos posibles que investigaron. Unas 21 horas y media duró todo este proceso; proceso en el cual utilizaron muchas inteligencias artificiales, como decíamos, a través de lo que…
Significado #1 · Palabras #1
Ignacio Crespo explica cómo Emily Charpentier y Jennifer Doudna permitieron la aplicación práctica de herramientas biológicas similares a CRISPR, facilitando la edición genética al reconocer y modificar secuencias genómicas.
Habla: Ignacio CrespoPalabras #16edición genética charpentier doudnasecuencias genómicas cortes mutacionesbacterias arqueas edición sencillavariante zang edición genética…genético para que no pudiera continuar con la infección. Esto es muy interesante, pero se quedó ahí hasta que Emily Charpentier y Jennifer Doudna consiguieron llevarlo al mundo aplicado para poder editar genéticamente con estas herramientas, ya que eran. capaces de reconocer secuencias concretas genómicas y editar encima de ellas, cortar y por lo tanto no solamente retirar sino forzar mutaciones para que haya pequeños cambios o mezclarlo con otros fragmentos genéticos pues consiguieron aplicarlo a bacterias y arqueas, a una edición muy muy sencilla. Posteriormente Zang entró con una variante de lo que ellas Habían patentado que podía aplicarse a células como las nuestras, como las de las plantas, y esto fue una revolución porque las técnicas que había para edición genética previas cometían más errores, eran menos específicas. Esto se llevó un premio Nobel hace…
Ignacio Crespo explica cómo la combinación de ciertos sistemas podría ser útil para detectar y actuar sobre material genético, detallando el proceso de búsqueda de genes y su posterior transformación en proteínas.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #7retrotranscriptasa busca genesgenes transformados en proteínasmaterial genético con retrotranscriptasaproteínas a partir de genes…distintos microorganismos, virus, etc. Y vamos a intentar cribar esa grandísima cantidad de genes para encontrar una retrotranscriptasa que esté asociada a alguna proteína que pueda tener un efecto: que pueda cortar, que pueda empalmar, que pueda hacer algo. Esa combinación es interesante porque sabemos que está relacionada en algunos casos con sistemas que podrían ser útiles como herramientas para detectar y actuar, digamos, sobre otro material genético. Recordemos que retrotranscriptasa, en este caso, bueno, estaríamos buscando los genes, pero esos genes podemos volverlos proteínas, podemos traducirlos en proteínas. La retrotranscriptasa lo que hace es, por lo contrario, la transcriptasa. En vez de convertir el ADN en ARN como intermediario para luego traducirlo en proteínas, la retrotranscriptasa convierte el ARN en ADN. Hace el inverso. Entonces esto era un poco lo que tenían en mente. Vamos a buscar estas características en nuestra enorme…
Ignacio Crespo continúa explicando el proceso de análisis genético realizado por Antropic, detallando cómo clasificaron las retrotranscriptasas y los fragmentos del genoma relacionados.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #1 · Palabras #1análisis genético antropic retrotranscriptasasfragmentos genoma cercano función proteínasgenoma relevante 3564 familias antropic…hay algunos que se parecen lo suficiente en algunas partes como para considerar que el gen está emparentado, por decirlo de esa manera, muy muy brutamente. Así que los tratas como un todo, como un clúster. Pues aún así tenían 200.000 distintos. Los clasificaron en 9 clases, muestrearon unas 11.000 ubicaciones dentro de ese genoma que eran relevantes y los dividieron en 3.564 familias, que es una barbaridad, con posibles compañeras, lo que decíamos, ¿no? no solo la retrotranscriptasa sino algún otro fragmento de ese genoma cercano que parezca heredarse junto, que parezca estar correlacionado y que pueda tener una función que evidentemente pues se convierta en proteínas en principio. De esto lo dividieron en 17 familias, pasaron varios filtros. Y al final aquello se quedó prácticamente en unos poquitos casos, en menos de 10 casos posibles que investigaron. Unas 21 horas y media duró todo este proceso; proceso en el cual utilizaron muchas inteligencias artificiales, como decíamos, a través de lo que…