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Silvana TapiaJuan Carlos GilFrancis VillatoroHéctor SocasBorja Tosaralgoritmo evolutivo opspexestructuras de hielo posiblesfitness según energía calculadapotencial neuronal profundo más rápidoOPSPEXDFTfigura 1Juan Carlos GilH barraFrancis VillatoroHéctor Socasteorema de indeterminación de HeisenbergJavier Benavides
Fitness según energía calculada
Con
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Juan Carlos Gil describe un ciclo iterativo utilizado para generar estructuras de hielo posibles, comenzando con un algoritmo evolutivo llamado OPSPEX.
…cristalinas que está descrito en la figura 1 del artículo y que es su principal aportación metodológica, y que os tengo que contar rápidamente: primero para que os fascinéis al menos una fracción de lo que lo he hecho yo y para que podáis entender. Lo que luego os cuento: Es un ciclo que en la figura va en el sentido de las agujas del reloj. Empieza arriba a la izquierda, en una caja que pone generación de estructuras, donde se usa un algoritmo evolutivo llamado OPSPEX para generar muchísimas estructuras de hielo posibles. Al principio del todo, completamente al azar, y luego, a lo largo de cuando se realimenta el ciclo, pues van combinando y mutando las mejores estructuras que se van encontrando, evaluando su aptitud, su fitness, que en este caso es cuán estables parecen según su energía calculada. En la primera iteración esto se calcula con un DFT completo, pero en iteraciones sucesivas ya se va utilizando el potencial neuronal profundo, lo cuento luego, pues que es muchísimo, muchísimo más rápido. El segundo paso a la derecha de este en la figura. Se llama evolución de estructuras. Estas estructuras crudas que ha generado la etapa anterior pasan por una dinámica molecular con este potencial profundo, de tal forma que las estructuras se relajan, los enlaces de hidrógeno se reorganizan, se escapan de…
Significado #1 · Palabras #1
Juan Carlos Gil describe un ciclo iterativo utilizado para generar estructuras de hielo posibles, comenzando con un algoritmo evolutivo llamado OPSPEX.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #1 · Palabras #1algoritmo evolutivo opspexestructuras de hielo posiblesfitness según energía calculadapotencial neuronal profundo más rápido…cristalinas que está descrito en la figura 1 del artículo y que es su principal aportación metodológica, y que os tengo que contar rápidamente: primero para que os fascinéis al menos una fracción de lo que lo he hecho yo y para que podáis entender. Lo que luego os cuento: Es un ciclo que en la figura va en el sentido de las agujas del reloj. Empieza arriba a la izquierda, en una caja que pone generación de estructuras, donde se usa un algoritmo evolutivo llamado OPSPEX para generar muchísimas estructuras de hielo posibles. Al principio del todo, completamente al azar, y luego, a lo largo de cuando se realimenta el ciclo, pues van combinando y mutando las mejores estructuras que se van encontrando, evaluando su aptitud, su fitness, que en este caso es cuán estables parecen según su energía calculada. En la primera iteración esto se calcula con un DFT completo, pero en iteraciones sucesivas ya se va utilizando el potencial neuronal profundo, lo cuento luego, pues que es muchísimo, muchísimo más rápido. El segundo paso a la derecha de este en la figura. Se llama evolución de estructuras. Estas estructuras crudas que ha generado la etapa anterior pasan por una dinámica molecular con este potencial profundo, de tal forma que las estructuras se relajan, los enlaces de hidrógeno se reorganizan, se escapan de…
Juan Carlos Gil describe el proceso final del ciclo iterativo para generar estructuras de hielo, explicando cómo se calcula la energía libre de las estructuras restantes después de múltiples refinamientos.
Habla: Juan Carlos GilPalabras #8cálculo energía libre estructuras supervivientesdft refinamiento geometrías exactasdinámica molecular potencial porcentajesimulaciones energía libre estructuras…mejorar el potencial profundo, valga la redundancia de tanto profundo; era lo que antes llamábamos aprendizaje activo. Tenemos entonces estructuras mejores, potencial refinado y seguimos con el ciclo hasta que, después de dar las vueltas que sean necesarias, Convergen los dos puntos de decisión que hay en el diagrama y cuando es así nos salimos en el bloque final, abajo a la derecha de la figura, que pone cálculo de la energía libre con las estructuras supervivientes a todas estas perrerías, pues se relajan por última vez con un DFT ahora muy, muy, muy fino para obtener las geometrías exactas, perfectas y se calcula su energía libre mediante nuevas simulaciones por dinámica molecular con potencial porcentaje. No sé si habéis, bueno, montón de palabras; a mí es una belleza que me sublime ya lo que hacen aquí, cosa que yo desconocía; yo me salí de esto hace ya algunas décadas y he flipado. Resultados exploran 131.481 estructuras, más de 130.000. La figura 3 es el mapa de energía-densidad, energía-densidad que os comentaba antes y han puesto todos los puntitos de todas las estructuras; cada puntito azul clarito es una estructura. La línea Cian…
Francis Villatoro y Héctor Socas discuten sobre los límites inferiores y superiores del tiempo necesario para que una excitación energética se produzca.
Habla: Francis VillatoroSignificado #3heisenberg y duración mínima excitaciónexcitación energética tamaño mínimo heisenbergcambio en energía cambio en tiempo heisenbergexcitación energética y cota superiortiempo máximo producción excitaciónh barra dividido delta de energíacambio en tiempo y cambio en energíatiempo propio y excitación energéticaregeneración neuronal según javier benavidesneuronas no se regeneraban en el pasado…reloj en reposo relativo a la excitación y en el de la expansión global. ¿Cuánto tiempo tarda en excitarse o desexcitarse un campo cuántico en tiempo propio? Supongo que es la creación de una partícula; ¿cuánto tarda en crearse una partícula o en destruirse? El teorema de indeterminación de Heisenberg aplicado al cambio en energía y al cambio en tiempo te dice que si tú generas una excitación de un cierto tamaño energético tiene una duración mínima porque el producto del cambio en tiempo y el cambio en energía es mayor que una cierta constancia constante, con lo que una cierta variación en energía tiene un tiempo máximo en el que puede producirse. Por debajo de ese tiempo se puede producir sin ningún problema, pero no tenemos cota inferior. Entonces, como no tenemos cota inferior, solo tenemos cota superior. Pero sí, esa excitación que tenga asociada una cierta energía implica un tiempo máximo en el que se ha producido. Nos tenemos cota inferior, ¿no? El tiempo tiene que ser mayor que H barra partido por el delta de energía, ¿no? Exactamente, o sea, el cambio en tiempo, la duración, tiene que ser mayor que H barra partido el cambio en energía. Vale, muy interesante. Eso nos da una cierta idea, eso por supuesto, esto siempre en tiempo propio, es decir, en el sistema de reposo local, ¿vale? O sea, ya cuando te pones a moverte, puedes dilatar el tiempo y ficticiamente interpretar eso como que ha ocurrido en un tiempo muy largo, pero tiempo propio es realmente el único tiempo que tiene sentido de hablar para la duración de una excitación. Pregunta Javier Benavides si las neuronas se regeneran o no lo hacen. Yo creo que esto viene porque hubo una época en la que se decía que no se regeneraban las neuronas, pero bueno, hoy en día se sabe que sí se regeneran, ¿no? Poco, pero se regeneran. Bueno, en el encéfalo humano lo que sí sabemos es que ciertas regiones, ciertas glándulas, por ejemplo el hipocampo, tienen generación activa de neuronas, no sé si os acordáis, fue famosísimo, hace ya muchos años, el tema de que estudiaron el tamaño del…