Héctor Socas propone retomar una pregunta anterior sobre la relación entre la biología estructural y la genómica computacional, sugiriendo que Luisa Achaerandio tiene algo que decir al respecto.
…con el de Francis, que ya estaba pendiente, de hecho, de la semana pasada y está, bueno, no tan lejos del tema porque también vamos a ir hablando de cerebros, que seguimos pensando que es el sustrato físico de toda esta inteligencia de la que hablamos, en Este caso biológico, y de estos experimentos, Francis, de criogenización. No sé si Luisa está levantando la mano. Sí, no, solamente que si hay tiempo y tú lo ves, me gustaría retomar la pregunta de lo que nos lleva, o sea, aterrizar un poco lo que nos lleva a la estructura de la biología, es decir, la biología estructural con la genómica computacional, es decir, el cómo llegas ahí, ¿vale? ¿Cómo es realmente que se pliega esa proteína? Con tres frases lo digo cuando tú quieras. Venga, porque lo diga ya. Ah, vale, pues ahora, claro. Claro, sí, sí. Pues básicamente, si tú quieres conectar biología molecular con la estructura de esas proteínas, con realmente pasarlas a un ordenador, hay una regla básica. Una regla básica de estructura, es decir, de ángulos, en este caso son los ángulos…
Héctor Socas anuncia los temas principales del episodio, incluyendo el estudio del asteroide Ryugu y su relación con el ADN.
Habla: Héctor SocasPalabras #4asteroide ryugu y bases del adngravitondas de ligo virgo kagraexperimentos criogenización tejido cerebral murinoteorías de la conciencia y debate…hasta que él mismo lo confirme. Es día Juliano 2.461.126,12. Pasen y pónganse cómodas: que aquí empieza su tertulia de cada semana sobre la actualidad de la ciencia. Están ustedes escuchando, espero que por voluntad propia, Coffee Break, Señal y Ruido. Hoy Hablaremos del asteroide Ryugu, porque se han encontrado todas las bases del ADN en las muestras recogidas en ese asteroide. También hablaremos del nuevo catálogo de ondas gravitacionales, las gravitondas de LIGO, Virgo y KAGRA. Y también retomaremos la conversación de la semana pasada sobre DeepMind. Y comentaremos esos experimentos sobre la criogenización de tejido cerebral murino. Y hablando de tejido cerebral, seguiremos el debate sobre las teorías de la conciencia. Eso de astrofísica y de bastantes más cosas, lo que nos dé tiempo. Antes de empezar les recuerdo que tenemos una página web que es señalirruido.com repito, señalirruido, todo junto y con ñ, señalirruido.com y ahí pueden encontrar toda la información sobre este programa todas las referencias y los papers que comentamos en…
Héctor Socas propone retomar una pregunta anterior sobre la relación entre la biología estructural y la genómica computacional, sugiriendo que Luisa Achaerandio tiene algo que decir al respecto.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #3biología estructural y genómica computacionalproteína se pliega luisa achaerandioexperimentos de criogenización francis…con el de Francis, que ya estaba pendiente, de hecho, de la semana pasada y está, bueno, no tan lejos del tema porque también vamos a ir hablando de cerebros, que seguimos pensando que es el sustrato físico de toda esta inteligencia de la que hablamos, en Este caso biológico, y de estos experimentos, Francis, de criogenización. No sé si Luisa está levantando la mano. Sí, no, solamente que si hay tiempo y tú lo ves, me gustaría retomar la pregunta de lo que nos lleva, o sea, aterrizar un poco lo que nos lleva a la estructura de la biología, es decir, la biología estructural con la genómica computacional, es decir, el cómo llegas ahí, ¿vale? ¿Cómo es realmente que se pliega esa proteína? Con tres frases lo digo cuando tú quieras. Venga, porque lo diga ya. Ah, vale, pues ahora, claro. Claro, sí, sí. Pues básicamente, si tú quieres conectar biología molecular con la estructura de esas proteínas, con realmente pasarlas a un ordenador, hay una regla básica. Una regla básica de estructura, es decir, de ángulos, en este caso son los ángulos…
Francis Villatoro explica cómo la criopreservación mostrada en películas como Alien es ciencia ficción debido a los desafíos técnicos relacionados con la congelación del agua.
Habla: Francis VillatoroSignificado #14criopreservación como en aliencongelación del agua en organismos vivosdesafíos técnicos de la criopreservación…vez habíamos comentado, de diciembre lo comentamos en enero o febrero y en este caso no son académicos los que han publicado y han publicado un artículo titulado Recuperación funcional del hipocampo murino adulto tras una criopreservación por vitrificación. La criopreservación es lo que vemos en muchas películas, se meten ahí en una especie de cámara y quedan así como congelados, preservados en un viaje interestelar que son muchísimos años a muy alta velocidad y entonces pasan cientos de años cuando llegan y cuando llegan, entre comillas, los descrionizan, los vuelven a la temperatura estándar y salen tan tranquilos y funcionando de escándalo, eso lo hemos visto desde Alien a todas las películas. eso obviamente es ciencia ficción todavía, que da mucho trabajo, el gran problema que tiene el enfriamiento, la congelación de un organismo vivo es que el agua se congela y el agua es una sustancia cristalina, el hielo, el hielo Tiene muchos defectos y tiene muchos problemas, y esa estructura cristalina destruye y aumenta de tamaño; aumenta de tamaño, poco se habla, poco se habla, destruye las células y genera una cantidad de efectos increíbles de daños en el tejido, en todo.…
Francis Villatoro explica cómo se evita la destrucción celular causada por la formación de cristales de hielo durante la criopreservación.
Habla: Francis VillatoroSignificado #12criopreservación evita destrucción celularestructura vítrea como alternativa a cristalescristalización produce efectos puntuales lineales…destruye las células y genera una cantidad de efectos increíbles de daños en el tejido, en todo. Entonces, cuando tú después descongelas te encuentras un material extremadamente roto y perjudicado, con una enorme cantidad de efectos, dislocaciones, etc. Eso se evita desde hace muchos años con unos agentes, agentes de criopreservación que lo que hacen es ayudar a que se forme una estructura vítrea, no un cristal sino un vidrio en el agua; esa estructura amorfa es una estructura que produce muchísimos menos defectos que la cristalización porque la cristalización siempre lleva a efectos que pueden ser puntuales, lineales, paredes de dominio. Es decir, cuando vemos un cristal de hielo lo vemos que no es nada transparente y es porque está lleno de defectos. Entonces, utilizando agentes que te permiten que se vitifique el agua en los tejidos y en el interior de los vasos, se han conseguido recuperaciones muy buenas, en los que a nivel visual, en muchísimos órganos, el resultado del órgano, o sea, tú lo infrías a…
Francis Villatoro describe experimentos de recuperación de órganos tras criopreservación, mencionando el trabajo del profesor Ramón Risco y su investigación con el nemátodo C-Elegans.
Habla: Francis VillatoroSignificado #6vitrificación de vasos sanguíneosrecuperación de tejido con neuronasexperimentos de recuperación de órganoscriopreservación de nemátodo c-elegansestudios neurona a neurona en c-eleganspropagación del impulso nervioso en criopreservaciónrecuperación neuronas tras criopreservaciónvitrificación técnica investigación básicaporcentajes recuperación criopreservación 80…del órgano, o sea, tú lo infrías a temperaturas muy bajas, yo que sé, 80 grados sobre el cielo absoluto y después lo vuelves a recuperar una temperatura ambiente, 20 y pocos grados, y obtienes órganos que aparentemente tienen muy, muy pocos defectos. Y se ha hecho esto con, por ejemplo, vasos sanguíneos y se ha visto que se puede recuperar a que con una bomba logras que fluya el líquido y aparentemente los vasos están muy bien. se ha hecho en tejido con neuronas, nuestra amiga y oyente Alicia, Alicia Hurtado, me destacaba el caso de Ramón Risco, que es un profesor de física aplicada, de departamento de física aplicada de la Universidad de Sevilla, que es un experto español en el tema este de criopreservación, por este tipo de técnicas, las técnicas de vitrificación, y que ha hecho cosas tan curiosas como congelar el nemátodo el Kenorhabitis elegans, el C-Elegans, congelarlo y después criopreservarlo, sería la palabra correcta, criopreservarlo, muy baja temperatura y después recuperarlo a temperatura ambiente y aparentemente el gusano parece que funciona muy bien, aparentemente tiene un funcionamiento muy similar a si no hubiera recibido un gran daño en este proceso. Incluso después de haber congelado, creo que uno de sus artículos ha hablado hasta tres años y medio; el gusano, es decir, que no es que sean cientos de años, pero bueno, es un tiempo bastante razonable. Y ha hecho también estudios con el tema del sistema neuronal de como son organismos que tienen muy poquitas neuronas, del orden de 300; se pueden hacer estudios neurona a neurona y comprobar si las neuronas permiten pues la propagación del impulso nervioso, permiten cierta sinapsis y se ha comprobado que aparentemente se recupera relativamente bien. Claro, esto hay que siempre ponerlos entre comillas. Estamos hablando de porcentajes de recuperación del orden del 80% y hay ciertas neuronas que no se recuperan y se pierden. Esto está todavía en una investigación relativamente básica. Entonces, lo que se utiliza, este tipo de técnica de criopreservación por vitrificación, pues lo que se ha utilizado en Este artículo que se ha publicado en PENAS y que depende del artículo de divulgación que leas, te dice que se ha recuperado el cerebro y el funcionamiento del cerebro del ratón, cuando en realidad solamente se ha estudiado el hipocampo; o te dicen que se ha…
Francis Villatoro describe un experimento en el que se analiza la funcionalidad de rodajas de hipocampo de ratón tras ser criopreservadas y recalentadas, comparándolas con experimentos donde se criopreserva todo el ratón.
Habla: Francis VillatoroSignificado #3criopreservación de ratoncitos con v3vitrificación con dimetilsulfóxido etilenglicolproceso lento para evitar daño criopreservaciónagente vitrificante vm3 en criopreservaciónhipocampo de ratón criopreservadoactividad eléctrica en rodajas de hipocampoelectrodos para análisis de hipocampocomportamiento similar a un ratón vivopotenciales de acción en hipocampoelectrodos para actividad neuronalcriopreservación del hipocampo de ratónsimilitud entre potenciales de acciónexperimentos con hipocampo preservadorodajas de hipocampo de ratóncriopreservación de rodajas vs ratónfuncionalidad en rodajas criopreservadashipocampo y criopreservación alphadevactividad electrofisiológica hipocampo ratonescortes del hipocampo criopreservacióntasas de respiración tejido slicescomparación actividad electrofisiológica no preservados…del cerebro del ratón, cuando en realidad solamente se ha estudiado el hipocampo; o te dicen que se ha recuperado el funcionamiento, porque claro, el artículo titula Functional Recovery. Funcional es la primera palabra que tiene el título del artículo. Entonces, para el periodista científico es: ¡uh! Funcionamiento, han comprobado que funciona. Ya ni que lees nada más. Lo pone el título. Bueno, tranquilidad, ¿vale? Tranquilidad. Se ha hecho criopreservación mediante un agente que vitrifica, que se llama V3, que es una variante de uno bastante famoso, que es el VM3, que bueno, son varias sustancias en ciertas proporciones: dimetilsulfóxido, etilenglicol, formamida y polivinilpirrolidona en ciertas proporciones. Y es un agente que se puede inyectar por perfusión en sangre a un organismo y se puede conseguir que el ratoncito lo podamos criopreservar. Eso sí, cuando volvemos a la temperatura ambiente, en un proceso que son procesos por etapas, que son procesos lentos, todo esto tiene que hacerse a un cierto ritmo adecuado para que quede con el menos daño. Por supuesto, el ratoncito no vuelve a la vida. Pero lo que sí se ha hecho es a ese ratoncito, ya recuperada su temperatura, quitarle el encéfalo; buscar el hipocampo y coger el hipocampo y convertirlo en rodajas, en pequeñas rodajas. Y ahora en esas rodajas, una pequeña, como un cristalito de estos que ponen los microscopios, ahí puedo poner electrodos y se ha visto con electrodos que hay cierta actividad similar en esas rodajitas de hipocampo, que ya os digo, ha sido criopreservado y vuelto y recalentado y vuelto a la temperatura ambiente; cierto comportamiento que es bastante semejante al que se obtiene cuando hago lo mismo con un ratón. Está Vivo, con un ratón al que no le he hecho nada, no lo he preservado, directamente le he quitado el encéfalo y he cogido su hipocampo y lo he puesto en rodajas; entonces hay ciertas semejanzas en los potenciales de acción. Aquí estamos hablando de poner electrodos, poner electrodos, es decir, no estamos hablando de coger una neurona y ver si esta neurona está bien, es funcional o no es funcional, sino que pongo electrodos que lo que hacen es un potencial de acción efectivo entre muchas neuronas y se ve que lo que yo veo, los picos que yo veo, esos spikes, esos picos que se ven de actividad neuronal son similares a los de lo que yo observo en el hipocampo del ratón que no ha sido criopreservado y el que ha sido criopreservado. Entonces se han hecho experimentos de dos tipos, si yo Hago rodajas del hipocampo, son rodajas que tienen un grosor de 350 micrómetros, es decir, del orden de 0,35 milímetros. Entonces yo cojo esas rodajas y las criopreservo y después las caliento y hago este estudio; en esas rodajas el porcentaje de funcionalidad es más alto que si yo hago la criopreservación de todo el ratón y después lo caliento y le saco las rodajas del hipocampo. El funcionamiento ahí empeora respecto a lo que es solo criopreservar las rodajas. Pero bueno, se han hecho varios test de actividad microtocondrial, de respiración, de tasas de respiración en ese tejido. Repito, slices, rodajitas muy delgaditas del tejido y ahí es donde hago todo este tipo de estudio. Cortes del hipocampo, exactamente, son cortes del hipocampo y entonces se ve que ciertas, digamos, caracterizaciones de la actividad electrofisiológica en esos cortes es muy similar a, no perfectamente similar, pero bastante similar a lo que obtengo cuando esos cortes lo hago en un individuo que no ha sido criopreservado, ¿no? Entonces podríamos estar en detalles de porcentajes, etcétera, pero ya os digo, no creo que sea muy relevante, ¿vale? O sea, lo importante es que se ha hecho solo. Con cortes y a pesar de lo que aparece escrito, lees alguna de las noticias en prensa o en medios, en blogs, etcétera, y te da la sensación de que es que han recuperado el hipocampo, ¿no? Y han cogido el hipocampo y están trabajando en el hipocampo entero. Y…
Tras mencionar la criopreservación de muestras biológicas y su relación con el debate sobre la conciencia, Francis Villatoro explica cómo algunos periodistas han informado erróneamente sobre la actividad neurofisiológica observada en un ratón congelado, confundiendo hipocampos cortados con animales completos.
Habla: Francis VillatoroSignificado #20hipocampo cortado en rocortesactividad neurofisiológica del ratón congeladoimágenes recuerdan a cajalinmunofluorescencia con microscopio de fluorescencia…la conciencia. En contra del tiempo universal, en contra del espacio-tiempo, ¿no? El tiempo se conserva también, la nueva ley de... El hecho de que no solo hayan criopreservado rodajitas, cortes del hipocampo, sino también animales completos, fue lo que más ha llamado la atención a muchos periodistas, que han dicho, han congelado un animal completo y ahora dicen que tiene actividad, su hipocampo tiene actividad neurofisiológica, y dicen, no, perdona, su hipocampo cortado en rocortes. Cuatro neuronas han vuelto a la actividad Las imágenes recuerdan a los dibujitos de Cajal, las imágenes de neuronas que se ven en el artículo y comparan las imágenes del ratón vivo, el ratón que he observado y el otro Y también la imagen de la inmunofluorescencia puede que haya por ahí una, parece que estaba hecha con microscopio de fluorescencia Sí, hay vídeos incluso en el artículo que están muy bien y bueno, supongo que hay que ser experto en tejidos. No hay que ser organógrafo para entender en detalle si el tejido es completamente correcto o no, pero a vista son tejidos que parecen perfectamente. Ves uno y ves otro y dicen pues yo no veo la…