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Juan Carlos GilGastón GiribetFrancis VillatoroHéctor Socasmodos vibracionales dimetilsulfurotorsión grupo metil espectroscopiaseñal artículo científico 7 micrasespectroscopía infrarroja molécula dmsespectros del dimetilsulfuro artículofricción metilo azufre metilo infrarrojometilos respecto azufre micrasJuan Carlos GilDMSespectroscopía RamanCH3grupo de simetría C2VFrancis VillatoroCoffee BreakHéctor SocasK2-18bsimetría AC2dimetilsulfuro (DMS)Gastón GiribetH2O2CO2TierraJuan CarlosRaman
Espectros del dimetilsulfuro Artículo
Con
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Juan Carlos Gil continúa explicando las propiedades del dimetilsulfuro (DMS), detallando cómo los metilos se mueven respecto al azufre y comparando sus espectros en tierra con los datos del artículo científico.
…de eventualmente hacer raman en contra exoplanetas Y me dijo que vete tú a saber si con un blazar o con un maser, con algo que concentrase, bueno, también yo le forcé un poquito Pero claro, absolutamente, quiero decir, un poquito más exótico todavía de Lo que estamos pensando. Bueno, ¿qué modos en la molécula de DMS son activos entonces en infrarrojo? Pues el primero, la torsión del grupo metil, ¿vale? Esta torsión así, voy a hacer movimientos con las manos porque en espectroscopia si eres doble manco no tienes futuro. Aparece en tierra a 7,3 micras, con lo cual podría corresponder a la señal que aparece en el artículo que se adivina a 7 micras. Luego tenemos el bamboleo de uno de Los dos metilos respecto del azufre, de uno solo, ¿vale? Este en tierra, con nuestras condiciones aquí, aparece a 9,8 micras, que también es compatible con el ruidaco del espectro del artículo. Luego tenemos la fricción metilo-azufre-metilo, el ángulo de la moleculita abriéndose, que es semejante al anterior; también aparece en infrarrojo, aparece más o menos a la misma frecuencia, además de forma mucho menos intensa, con lo cual no es de esperar que aquí se vea. Y finalmente tenemos la deformación simétrica, ahora me fijo en los hidrógenos; la deformación simétrica de los hidrógenos del metilo. Esto es el carbono, mi mano, y si vibran de forma simétrica los tres de un único lado, eso afecta al momento dipolar de la…
Significado #1 · Palabras #1
Tras comentar un artículo sobre el exoplaneta K2-18b y la detección de dimetilsulfuro (DMS), Héctor Socas pregunta a Francis Villatoro sobre una detección previa de esa molécula.
Habla: Héctor SocasSignificado #14 · Palabras #3dimetilsulfuro exoplaneta k2-18bdetección de dimetilsulfuro una sigmabiomarcador exoplanetas amplificación mediática…detección de esa molécula que es el dimetilsulfuro, DMS Aunque con bastantes, bueno, hay muchas cosas, habría muchas cosas que comentar sobre esto Pero la cuestión es que esto, bueno, pues ha despertado mucho interés y mucha polémica Mucho interés por el... ¿Sí, Di Francis? Si no es que decir que en el artículo anterior, del que ya hablamos en Coffee Break hace tiempo, la molécula dimetilsulfuro se había detectado con del orden de una sigma. Una sigma no es nada, o sea, no se había detectado. No, por eso digo, no lo daban como detección, sino como un indicio y que había que seguir. Yo creo que en ese sentido, en aquel momento lo dije, que me parecía que lo habían hecho bien. Lo que pasa es que es verdad que estas cosas se amplifican en cuanto dices biomarcador o tal, se amplifica mucho. aquí dicen que hay más evidencia y tal, bueno, vamos a un poquito de introducción, vamos a contar un poco lo que es mundos iseánicos este planeta K2-18b, el K2 quiere decir que es de la misión 2 de Kepler, me parece interesante recordar esto Kepler era un…
Juan Carlos Gil, tras la crítica de Francis Villatoro sobre la metodología científica y el eco mediático generado por algunos artículos, plantea una hipótesis humorística sobre la validez de los modelos utilizados en investigación.
Habla: Juan Carlos GilPalabras #9dimetilsulfuro exoplaneta nidespecsigmas en resultados espectraleserrores enormes curvas de errorespectros químicos aparato terrestre…metodología que va a utilizar en su área, ¿qué expertos son? A mí ese tipo de cosas me mosquea mucho porque ya os digo, se está generando una bomba mediática enorme por una cosa que probablemente dentro de un año sepamos que todo es mentira, que no hay DMS. Me pregunto, Francis, si en vez de haber elegido ese modelo porque ellos lo valen, que combinaba metano CO2, dimetilsulfuro y dimetildisulfuro, hubiesen elegido una atmósfera con whisky ¿Verdad? ¿Os acordáis? Vete tú a saber si mejor las significancias, vamos, sí, las sigmas. Los resultados, si tú miras las curvas, tienen unos errores tan enormes, unas cosas tan tremendas; las barras de error son enormes. O sea, cuando uno ve la línea en azul, bonita, subiendo y bajando, ¡y qué maravilla! Unos puntitos amarillos, ¡qué maravilla! Hay unas bandas de error que son diez veces más grandes y se pregunta... Estoy acostumbrado a ver espectros químicos en tierra en un aparato, claro, con unos picos, en fin, cien veces por encima del ruido. Yo de aquí es que ni me atrevería, pero bueno, ni me atrevería ni a empezar. Esto tampoco son espectros típicos de astrofísica, ¿no? Estos son espectros de los que yo digo, de los que estamos empezando a observar. Claro, estamos empezando a ver. Entonces.…
Héctor Socas introduce la 'cara B' del episodio número 509 y retoma el debate sobre un planeta, mencionando que necesitan ayuda de Juan Carlos para aclarar detalles sobre una molécula.
Habla: Héctor SocasSignificado #13 · Palabras #16dimetilsulfuro exoplaneta nidespecespectros degeneración dimetildisulfuromolécula juan carlos aclaraciones…día es que ni sabemos si es Iceánico, no sabemos si es Reductor. Ese es el gran problema, o sea, el gran problema aquí es si es Iceánico. Ahora hablamos de todo eso, esperadame un segundito y ponemos esto. Justamente ahora, venga, vamos a debatir todo eso. Bien, gracias por seguirnos acompañando, comenzamos aquí la cara B de este episodio número 509 y nada, vamos a seguir con el debate entonces sobre este planeta. No lo hemos dicho, la molécula en cuestión, y aquí espero que Juan Carlos nos pueda echar un cable, es el dimetilsulfuro, aunque en estos espectros hay una cierta degeneración, que ya explicamos que el otro día significa que no puedes distinguir bien si es una cosa o la otra, o una combinación de, también puede ser, dimetildisulfuro, que es lo mismo, pero con el doble, disulfuro es el doble. Es lo mismo, luego lo comento, como el agua es al agua oxigenada, que no te viene bien para hacerte un café agua oxigenada. Correcto. Un átomo puede marcar la diferencia. Y ahora empezamos. Científicos dicen que hay criaturas tomando café en el mundo isiánico K2-18b. Bueno, esta molécula, Juan Carlos, puedes hablarnos un poco de ella porque es la clave de que esto haya tenido tanta repercusión, porque hay quien dice que es un…
Juan Carlos Gil, recordando sus orígenes como químico, explica las características espectroscópicas y la simetría del dimetilsulfuro (DMS).
Habla: Juan Carlos GilSignificado #2simetría del grupo c2v dimetilsulfuroespectroscopia infrarrojo grupos ch3características espectroscópicas juan carlos gil…tomando café en el mundo isiánico K2-18b. Bueno, esta molécula, Juan Carlos, puedes hablarnos un poco de ella porque es la clave de que esto haya tenido tanta repercusión, porque hay quien dice que es un biomarcador y que solo la generan los seres vivos. Pues te lo decía fuera de micrófono, me he puesto la camiseta de químico recordando mis orígenes y he aprovechado para mirar los grupos de simetría y qué cosas son activas en infrarrojo y demás. Bueno, el dimetilsulfuro DMS es dos metilos, grupos CH3, enlazados por un azufre en medio. Espectroscópicamente, de alguna forma, se puede tratar como si los metilos fuesen una bolita. Luego hago una puntualización, con lo cual tiene a todos los efectos simetría del grupo de simetría C2V, que significa que tiene un eje de rotación de 180 grados, es como un angulito, ¿no? Un eje de rotación de 180 grados y dos planos de simetría, uno del que forman parte los tres átomos y el perpendicular en el centro de la moleza. Has dicho 180 grados. Sí, el eje de rotación pasa de esta configuración a la contraria. Ah, vale. Hay un único…
Juan Carlos Gil continúa explicando las propiedades del dimetilsulfuro (DMS), comparándolo con el agua y detallando cómo sus modos vibracionales se manifiestan de manera diferente en espectroscopía infrarroja y Raman.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #15dimetilsulfuro propiedades como el aguaespectroscopía infrarroja modos rotavibracionalesraman polarizabilidad molecularvibraciones antisimétricas en infrarrojovibraciones simétricas en raman…del que forman parte los tres átomos y el perpendicular en el centro de la moleza. Has dicho 180 grados. Sí, el eje de rotación pasa de esta configuración a la contraria. Ah, vale. Hay un único eje aquí y es C2, no es C3, que sería un triángulo, etc. ¿Vale? Es decir, es semejante con esa puntualización al agua, por eso hacía la broma, ¿vale? Es como un grupo central y dos idénticos a los lados, grupo C2B. En el infrarrojo, recordemos, aparecen los modos rotavibracionales que hacen cambiar el momento dipolar de una molécula. En Raman, que alguna vez lo hemos mencionado aquí, los modos que aparecen son los que cambian su polarizabilidad. Si queréis el campo eléctrico inducido así en el infrarrojo, la mayor parte de las vibraciones de los movimientos de la molécula que aparecen son antisimétricas; en infrarrojo mediante que en Raman tienden a ser simétricas, por eso. son buenas técnicas complementarias Pero desafortunadamente no podemos hacer Raman AK-218B porque eso supondría iluminarle con un láser monocromático potentísimo y observar la pequeñísima fracción de luz que sale de forma inelástica, no Reilig y además a 90 o…
Juan Carlos Gil continúa explicando las propiedades del dimetilsulfuro (DMS), detallando cómo los metilos se mueven respecto al azufre y comparando sus espectros en tierra con los datos del artículo científico.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #1 · Palabras #1modos vibracionales dimetilsulfurotorsión grupo metil espectroscopiaseñal artículo científico 7 micrasespectroscopía infrarroja molécula dmsespectros del dimetilsulfuro artículofricción metilo azufre metilo infrarrojometilos respecto azufre micras…de eventualmente hacer raman en contra exoplanetas Y me dijo que vete tú a saber si con un blazar o con un maser, con algo que concentrase, bueno, también yo le forcé un poquito Pero claro, absolutamente, quiero decir, un poquito más exótico todavía de Lo que estamos pensando. Bueno, ¿qué modos en la molécula de DMS son activos entonces en infrarrojo? Pues el primero, la torsión del grupo metil, ¿vale? Esta torsión así, voy a hacer movimientos con las manos porque en espectroscopia si eres doble manco no tienes futuro. Aparece en tierra a 7,3 micras, con lo cual podría corresponder a la señal que aparece en el artículo que se adivina a 7 micras. Luego tenemos el bamboleo de uno de Los dos metilos respecto del azufre, de uno solo, ¿vale? Este en tierra, con nuestras condiciones aquí, aparece a 9,8 micras, que también es compatible con el ruidaco del espectro del artículo. Luego tenemos la fricción metilo-azufre-metilo, el ángulo de la moleculita abriéndose, que es semejante al anterior; también aparece en infrarrojo, aparece más o menos a la misma frecuencia, además de forma mucho menos intensa, con lo cual no es de esperar que aquí se vea. Y finalmente tenemos la deformación simétrica, ahora me fijo en los hidrógenos; la deformación simétrica de los hidrógenos del metilo. Esto es el carbono, mi mano, y si vibran de forma simétrica los tres de un único lado, eso afecta al momento dipolar de la…
Juan Carlos Gil explica los modos vibracionales activos y no activos en el dimetildisulfuro (DMDS), comparándolos con el dimetilsulfuro (DMS) y haciendo referencia a un artículo científico.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #3dimetilsulfuro comparación agua oxigenadaazufre metilo dimetilsulfuromolécula dimetilsulfuro grupos azufredimetilsulfuro estructura tridimensionalángulo dmds entre noventa y cien gradosmoléculas dmds único eje de rotaciónmodos vibracionales dimetildisulfurotorsión grupos metiloquios simetría ac2flexión enlace azufre metilo dmsdeformación dos azufres infrarrojo 105 micrasajuste modelo fitting banda 105 dimetildisulfuro…este también es fundamental, ese no aparece en infrarrojo Bueno, los que he dicho que aparecían estaban en torno a 7 y a 10 micras, se ven, se adivinan si miras con mucha intensidad o si quieres verlo de esa forma en el espectro ¿Qué es el dimetil disulfuro? Tú lo decías Héctor, en vez de un azufre, en medio de los dos metilos tienes dos azufres, por lo tanto si quieres cuatro grupos y por eso forzaba la comparación de antes del dimetil disulfuro con el agua, porque así me permite hacer la analogía que esto sería como el agua oxigenada H2O2, tenemos cuatro grupos, dos azufres y dos metilos en este caso. De hecho hay un mayor perecido porque tanto esta molécula dimetildisulfuro como el agua oxigenada en contra de lo que a priori podría parecer no son planas. Los dos laditos se molestan y la conformación más estable tiene un angulito, o sea que son moléculas que están un poquito abiertas, como un libro semiabierto En el agua oxigenada este ángulo es de 111 grados y en el DMDS de nuevo en tierra entre 90 o 100, es parecida Por eso las moléculas estas, el DMDS en particular, tiene un único eje de rotación, es la única simetría que tiene, en el ángulo central así, no tiene otras aunque lo parezca, ¿Vale? Y por tanto son solo de simetría AC2. Los modos activos en simetría AC2 son la torsión de los grupos metiloquios y la flexión del enlace azufre metilo que os comentaba antes, igual que en el DMS y aparece uno nuevo muy característico del dimetildisulfuro que es la deformación de los dos azufres. Tenemos dos azufres en medio y esta deformación es muy intensa en infrarrojo y aparece a 10,5 micras, que es así que yo la veo bien en el artículo. Es muy ancha, pero si me trato de olvidar de los azules, los azules es su modelo, del fitting, del ajuste a su modelo, esta banda en 10,5 del dimetildisulfuro a mí me parece razonable. Bueno, hay otros modos no activos del dimetildisulfuro. Como la torsión interna de la molécula, como si coges una toalla y la intentas secar, esa te deja siempre el momento dipular sin cambio, por tanto no es activo, y el estiramiento simétrico del doble enlace es ese. En la Tierra, decíamos, y voy a apuntar un…
Juan Carlos Gil explica cómo el dimetilsulfuro (DMS), generado por el fitoplancton, llega a la atmósfera terrestre donde es oxidado.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #16dimetilsulfuro océano atmósferaoxidación atmosférica dimetilsulfurodióxido de azufre lluvia ácidafitoplancton ácido sulfúrico atmósfera…Lo he buscado en la literatura, que usan estos bichitos para la regulación osmótica y como antioxidante De tal forma que cuando estos pequeños organismos se mueren, este DMSP se degrada Hay dos vías distintas, una va a una cosa que no nos interesa, la otra va al dimetilsulfuro Pasa al océano, del océano sale a la atmósfera, donde es oxidado en nuestro planeta pero de forma muy eficiente porque nuestra atmósfera es muy oxidante. Tenemos oxígeno, ozono y radicales hidroxilos sueltos y esto por tanto genera dióxido de azufre, entre otras cosas, dióxido de azufre que eventualmente degenera en ácido sulfúrico, la famosa lluvia ácida que antes teníamos mucha por los óxidos de azufre de los motores de combustión que ahora están muy reguladas. pero el fitoplacton también acaba echando ácido sulfúrico a la atmósfera y otras guarradas. Pero sí existen vías abióticas posibles para generar DMS aunque no en cantidades significativas. Una posible fuente, dime. No, nada; iba a decir que justamente todo esto que estás contando ahora es lo que lleva a todo este entusiasmo sobre la presencia de…
Tras explicar las propiedades del dimetilsulfuro y dimetildisulfuro, Juan Carlos Gil comenta sobre los resultados de un estudio en el exoplaneta K2-18b, donde la mejor explicación para los datos observados es una alta concentración de dimetildisulfuro.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #5dimetilsulfuro exoplaneta k2-18bdimetildisulfuro molécula ultra raraconcentración dimetildisulfuro estudio k2-18bmolécula dimetildisulfuro banda 105dimetilsulfuro exoplaneta nidespecdiadimetril sulfuro química analíticaratio dimetril sulfuro diadimetril sulfuro…por la tardanza, pero acaba de ser abducido por una serie de estudiantes que tienen examen mañana y no me dejaban salir de la clase. Le pido disculpas, pero... Se habla mucho de las abducciones alienígenas, pero las abducciones de estudiantes son las peores. Gastón es doctor en Ciencias Físicas y profesor en la Universidad de Nueva York. Pues nada, que nos estaba contando Juan Carlos todas las interioridades de la molécula del dimetilsulfuro y el dimetildisulfuro que según estos autores se habría encontrado en ese exoplaneta K2 -18b No lo hemos dicho, pero otra cosa que me llama mucho la atención es que cuando ellos seleccionan el modelo y ajustan posibles cantidades de dimetilsulfuro y de dimetildisulfuro El que mejor ajusta es el que tiene casi todo dimetildisulfuro, que es la molécula ya ultra rara por excelencia Claro, como le dejan parámetro libre, pues la banda esa de 10,5 que parece bastante sonada para el dimetildisulfuro pues toma peso y resulta que de dimetildisulfuro sale poquito, sale más dimetildisulfuro Mientras que en la Tierra el dimetildisulfuro prácticamente no existe, se puede estar en milésimas de partes por billón Decía que el dimetildisulfuro... No, iba a decir que me gustaría hacer una puntualización Sobre cómo hay que contextualizar cuando hablamos de moléculas como biomarcadores, pero no sé si es el momento ahora... Un poco más adelante, estamos intentando saber si hay. Una pregunta que tenía yo sobre esto justamente, sobre esta concentración anomala del ratio de los dos, del ratio del dimetril sulfuro y diadimetril sulfuro, que quería votar hablando con una amiga química pero no pude, no tuve tiempo, es si los procesos que dan lugar al diadimetril tienen que pasar necesariamente por el diametril sulfuro o no, o cuántos procesos hay. ¿Por qué digo esto? Porque si no sería mucho más rara esa proporción anómala entre los dos, no solamente que es muy distinta a la que hay en la Tierra, sino que si uno ve que la manera más eficiente de generar uno es pasando a través del otro, porque algún proceso complejo hace…
Juan Carlos Gil aclara que el dimetilsulfuro (DMS) y el dimetildisulfuro (DMDS) no están directamente relacionados, respondiendo a una observación anterior de Gastón Giribet.
Habla: Juan Carlos GilPalabras #10dimetilsulfuro exoplaneta k2-18babundancia de dms en k2-18batmósfera reductora k2-18bdescomposición del dms en la tierradimetilsulfuro dmds relación gastón giribetoxidación azufre dimetilsulfuro laboratoriofitoplacto producción dimetilsulfuro…que soñamos con encontrar biomarcadores con encontrar vida extraterrestre durante nuestra vida, pues estas cosas nos ilusionan, nos emocionan, nos generan optimismo. Estamos viendo que se, no sé, se suele decir que cuando el río suena es que agua lleva, ¿no? Pues que si empieza a haber este tipo de conversación, hace 20 años no se hablaba de esto, entonces es que estamos avanzando y yo creo que ese avance es la parte de señal que yo veo en todo esto. Perdón que me he alargado mucho, pero... Una cosita: según el truño ajuste, en mi opinión, del artículo, hay mil veces más dimetilsulfuro en K2-18b que en la Tierra, mil veces más. O sea, o está aquello con dinosaurios subidos encima de elefantes, subidos encima de tortugas; bueno, es una atmósfera reductora, con lo cual eso va a favor de que sea más estable la molécula. En la Tierra se descompone en horas, el DMS se descompone en horas, con lo cual hay presencia mil veces inferior a la. Posible de este planeta, pues por la bomba del fitoplacto en que está todo el rato echando. Quería contestar a Gastón: no, no están relacionados directamente ambas moléculas. Hay una posibilidad de, iba a decir de oxidar, de incorporar azufre al dimetilsulfuro para dar dimetilsulfuro, pero eso es en laboratorio controlado y con muy poca eficacia en la Tierra se. Generan de forma independiente, el dimetil disulfuro se generan pantanos en fermentaciones; lo hay en los quesos curados, lo hay en la cerveza, lo hay en el vino y es parte del olor del ajo. Dicen que el dimetil disulfuro. Me gusta esto del queso marcador y…
Juan Carlos Gil comenta la ausencia de sulfuro de hidrógeno en atmósferas reductoras con azufre, lo que le parece un problema significativo y cuestiona los métodos de análisis utilizados.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #20sulfuro de hidrógeno atmósferas reductorasdimetilsulfuro precursor en condicionesmétodos de análisis juan carlos gil…lo hay en los quesos curados, lo hay en la cerveza, lo hay en el vino y es parte del olor del ajo. Dicen que el dimetil disulfuro. Me gusta esto del queso marcador y el ajo, el queso marcador. Gracias porque tenía esa duda. Sí, no, no está muy. Relacionado, y una cosa que a mí también enseguida me llamó la atención es la falta de sulfuro de hidrógeno. En una atmósfera reductora, en la que tienes azufre por ahí volando por la atmósfera, no se explica que no haya disulfuro de hidrógeno, porque es un precursor en esas condiciones del dimetilsulfuro. Y lo han buscado y no lo han encontrado; eso es, o sea, eso para mí es bastante bajona, vamos, aparte de la mierdez, perdón, del desastre de ajuste y de tratamiento de los que hacen. A mí el ácido sulfídrico, perdón, el sulfuro de hidrógeno, sí, tengo una coña sobre esto. ¿Lo puedo contar, Héctor? Es un minuto. Claro, claro. Bueno, que a mí eso me lo deja. Sí, no, es que tengo una relación yo con el sulfuro de hidrógeno y el ácido sulfídrico porque en COU, y estaba en un colegio extraordinario, y el mejor profesor de química…