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José EdelsteinIgnacio CrespoFrancis VillatoroHéctor SocasBorja Tosarcrpr repeticiones tándem material genéticoespaciadores crpr reconocimiento infecciones viralesdni microorganismo patógeno crpralteración espaciadores crpr reproducción microorganismosespaciadores longitud superior artículovariabilidad inusual espaciadores crespofunción espaciadores paper científicoCRISPRIgnacio Crespofago SA1StaphylococcusAntropic
Espaciadores crpr reconocimiento infecciones virales
Con
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Ignacio Crespo explica cómo las repeticiones en tándem de CRISPR almacenan material genético para reconocer infecciones virales, comparándolo con un DNI para microorganismos.
…eso con que aquí de repente directamente ya puedes buscarlo. Puedes decir, mira, aquí tenemos esas repeticiones palindrómicas. No son igual ese aspecto de palindrómicas en este caso, pero lo dejamos en el aire. Pero las han encontrado. Esto es importante. En CRISPR, esas repeticiones que decimos en tándem, lo que permitían era almacenar dentro de lo que se llaman espaciadores, que están entre repetición y repetición, en esos espaciadores se almacenaba material genético que ayudaba a reconocer las infecciones de estos virus que atacaban a los microorganismos. Los lo almacenaban ahí, quedaba fijo, era como el DNI del microorganismo patógeno. Y se quedaba. Esto es importante porque si después, con la reproducción de microorganismos que tienen sistemas CRISTER, generación tras generación, alteramos estos espaciadores, ya no coinciden. Como si yo voy cambiando los números de tu DNI generación tras generación, pues no van a coincidir para reconocer al individuo cuando pasemos dos, tres generaciones. Así que en este caso tenían que quedarse fijos. Esto veremos luego por qué es importante. Pero hay una diferencia que se subraya, y creo que la subrayan en el mismo paper; creo que incluso ahí ya lo decían, y es que son mucho más largas. Estos espaciadores que han encontrado son mucho más largos, lo cual no encaja del todo, y aquí viene la segunda parte: además son bastante más variables de lo que deberían. Deberían de quedarse estables si tienen realmente esa función; y nos interesa que tengan función porque si no, ¿de qué estamos hablando? No es la herramienta, no es la llave inglesa, el taladro que estábamos buscando. Es algo que vete tú a saber qué es. También podríamos plantear cómo utiliza un bacteriófago, un bacteriófago jumbo especialmente grande, un virus muy grande, este tipo de sistema…
Significado #1 · Palabras #1
Ignacio Crespo comenta sobre un laboratorio de Antropic y su nivel de bioseguridad, explicando que este permite trabajar con microorganismos de bajo riesgo debido a la disponibilidad de tratamientos.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #12laboratorio antropic nivel bioseguridad 2microorganismos bajo riesgo tratamientos disponiblesinfecciones menores laboratorio antropic…para sintetizar ahí el virus? Que a mí ya he dicho que no me preocupa ese futuro, me preocupa el presente sociopolítico que hay al respecto y la falta de legislación, pero que no es tan raro; que precisamente estamos yendo en la dirección de automatizar los laboratorios y ponerlos en sus manos. Habría que ver cómo funciona. De todos modos, este laboratorio de Antropic tiene un nivel de bioseguridad 2, que significa que no hay nada, ningún microorganismo con el que puedan trabajar que sea realmente peligroso, porque son infecciones menores para las cuales tenemos tratamiento. No vamos a ver nada raro. Y por poner un caso para hacernos una idea, simplemente de lo que estamos hablando, pues no pueden trabajar con tuberculosis, no pueden trabajar con COVID; es bastante, por ahora. Cabal eso sí que están buscando, estamos buscando edición genética, que igual…
Ignacio Crespo explica cómo las repeticiones en tándem de CRISPR almacenan material genético para reconocer infecciones virales, comparándolo con un DNI para microorganismos.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #1 · Palabras #1crpr repeticiones tándem material genéticoespaciadores crpr reconocimiento infecciones viralesdni microorganismo patógeno crpralteración espaciadores crpr reproducción microorganismosespaciadores longitud superior artículovariabilidad inusual espaciadores crespofunción espaciadores paper científico…eso con que aquí de repente directamente ya puedes buscarlo. Puedes decir, mira, aquí tenemos esas repeticiones palindrómicas. No son igual ese aspecto de palindrómicas en este caso, pero lo dejamos en el aire. Pero las han encontrado. Esto es importante. En CRISPR, esas repeticiones que decimos en tándem, lo que permitían era almacenar dentro de lo que se llaman espaciadores, que están entre repetición y repetición, en esos espaciadores se almacenaba material genético que ayudaba a reconocer las infecciones de estos virus que atacaban a los microorganismos. Los lo almacenaban ahí, quedaba fijo, era como el DNI del microorganismo patógeno. Y se quedaba. Esto es importante porque si después, con la reproducción de microorganismos que tienen sistemas CRISTER, generación tras generación, alteramos estos espaciadores, ya no coinciden. Como si yo voy cambiando los números de tu DNI generación tras generación, pues no van a coincidir para reconocer al individuo cuando pasemos dos, tres generaciones. Así que en este caso tenían que quedarse fijos. Esto veremos luego por qué es importante. Pero hay una diferencia que se subraya, y creo que la subrayan en el mismo paper; creo que incluso ahí ya lo decían, y es que son mucho más largas. Estos espaciadores que han encontrado son mucho más largos, lo cual no encaja del todo, y aquí viene la segunda parte: además son bastante más variables de lo que deberían. Deberían de quedarse estables si tienen realmente esa función; y nos interesa que tengan función porque si no, ¿de qué estamos hablando? No es la herramienta, no es la llave inglesa, el taladro que estábamos buscando. Es algo que vete tú a saber qué es. También podríamos plantear cómo utiliza un bacteriófago, un bacteriófago jumbo especialmente grande, un virus muy grande, este tipo de sistema…
Ignacio Crespo describe cómo Antropic observó que la retrotranscriptasa se activaba durante infecciones bacterianas específicas, concretamente cuando un fago SA1 infectaba Staphylococcus.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #10retrotranscriptasa activada por fago sa1infección de staphylococcus por fagosestructura conocida en infecciones bacterianasinvestigación retrotranscriptasa antropic…Y luego que no hemos visto la función. Hemos visto una estructura que más o menos remeda. Y que sabemos que estadísticamente esa proteína, ese gen acompañante va junto con la retrotranscriptasa, pero no está claro cómo actúa en la urgencia una con la otra. Y además luego sí que vieron en húmedo, investigando ya con las manos en la masa, que la retrotranscriptasa se activaba. Se activaba cuando había infecciones; bueno, en concreto, cuando un fago SA1 infectaba Staphylococcus, bacterias en este caso. Entonces, sí, había una reacción aparentemente llamativa, pero estamos todavía muy en el inicio. Quedan muchas cosas abiertas al respecto porque, como digo, no encuentran la función; no pueden confirmarla, ellos mismos insisten; solamente hemos encontrado esta estructura que más o menos se parece, y esto también es importante; no es algo único, es algo que conocemos. Estas retrotranscriptasas se comportan como retrones, que precisamente tienen esta actividad: convertir ARN, bueno, retrotranscribir ARN en ADN, asociarlo a una enzima, una proteína, mantenerlo inactivo y que ante determinados estímulos del entorno se active,…