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Silvana TapiaLuisa AchaerandioJuan Carlos GilFrancis VillatoroBorja TosarHéctor Socasidentificación de bacterias laboratoriotaxonomía bacteriana está cambiandocaracterísticas propiedades observablesfenotipo bacteriano como criteriotaxonomía bacteriana dando vuelcocriterios moleculares en bacteriasgenomas distintos con fenotipos similarescomparación de genomas bacterianosespecie nueva con diferencia del 3subespecies y cepas concretasbacterias aisladas de diferentes nichosdiferenciación de cepas bacterianasfenotipos de cepas diferentesgenes del 3 en especiesgenoma bacteriano 3 diferenteclasificación bacteriana no transitivaespecies bacterianas y porcentajes de similitudclasificación bacteriana evolucionagenomas comparados cuestionan especiee coli y salmonella como mezclasconcepto de especie se desdibujaSilvana TapiaJuan Carlos GilO157H7E. coli Nisle 1917Alfred NislePrimera Guerra Mundial*E. coli*ProteusEspañaE. coliHéctor SocasSalmonellaEscherichia coliPlaca de PetriBacteriasNutrientesLuisa AchaerandioClorofilaZepa XAgencia Europea del Medicamento
Diferenciación de cepas bacterianas
Con
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Silvana Tapia explica cómo se distinguen cepas diferentes de bacterias, incluso cuando pertenecen a la misma especie, basándose en sus características y propiedades.
…las tecnologías, sobre todo de secuenciación masiva, pues hoy en día prácticamente identificamos a las bacterias cogiendo su genoma y secuenciándolo y comparándolo con otros que han subido otros investigadores antes a ciertas bases de datos, pero antes. Y estoy diciendo hace muy poquitos años se hacía simplemente pues viendo cómo se comportaba esa bacteria. Si tú aislabas una bacteria en el laboratorio y tenía una serie de características o de propiedades, luego aislabas otra en otro entorno y tenía las mismas características que la primera, decías bueno pues es la misma especie. Y hoy en día por eso digo que la taxonomía bacteriana está cambiando totalmente porque ahora qué criterio utilizamos para decir que una bacteria es de la misma especie que la otra y hemos visto que por esas características que llamamos el fenotipo no nos sirve porque hay dos bacterias que pueden hacer lo mismo en una circunstancia pero luego tener genomas totalmente diferentes entonces ese criterio se está abandonando y la taxonomía bacteriana que es la que pone nombres a cada grupo bacteriano pues está dando pues un vuelco tremendo y no está cambiando toda la taxonomía y hoy en día pues se siguen criterios moleculares. Cuando una bacteria se comparan los genomas y son diferentes en un 3% de ese genoma, ya podemos considerar que estamos ante una especie nueva. Luego hay pequeñas particularidades dentro de ese porcentaje; bueno pues luego dependiendo de otros criterios se dice si es una subespecie o si es una cepa concreta. Cepas son pequeñas características, por ejemplo nosotros hemos aislado una misma bacteria pero de nichos o de entornos diferentes el simple hecho que una bacteria aguante en un nicho por ejemplo una temperatura y ahora yo la encuentro a otra temperatura totalmente diferente aunque yo sepa que es la misma especie digo que son dos cepas diferentes porque bueno pues tienen características particulares dentro de ese pequeño 3% que hace que un aguante por ejemplo a 4 grados y la otra 40 grados entonces bueno hoy en día se utilizan sobre todo criterios moleculares aunque todavía pese a ese 30% que nos dan de margen decir bueno pues si hay diferencia en ese 3% de genes ya estamos hablando de una especie diferente y luego todavía seguimos teniendo en cuenta pues algunas características fenotípicas pero como digo eso está en constante cambio y más ahora pues con las técnicas moleculares que tenemos que son capaces de afinar muchísimo más. Bueno, pues total que es cuestión de sepas, para que lo sepa Iba a complicar un poco la situación, me ha recordado Los dados no transitivos. ¿Es posible que una bacteria tenga un genoma 3% diferente a otra? La primera con una tercera y la B y la C, que por casualidad no, quiero decir: ¿es no transitivo el hecho de pertenecer a distintas especies? De hecho, había un autor que dice que en el futuro seguramente no podamos asignar un solo nombre a una bacteria, sino que sea por distinto porcentaje debido al parecido que tenga con otras bacterias. Es decir, que a lo mejor no podemos decir en el futuro que tengamos una E. coli, sino una bacteria 50% E. coli, 50% Salmonella, por decir dos nombres así al azar. Hay autores que proponen eso, que no hay una especie como tal, sino que pueden ser mezclas; el genoma puede tener bastante porcentaje de similitud a otros grupos básicos. O sea, eso, el concepto de especie en biología real pues se desdibuja, claro. Claro, totalmente; en microbiología el concepto de especie real es bastante diferente. Bueno, Vamos con la siguiente pregunta, no está mal para empezar. Nos pregunta Víctor: ¿qué son los priones? ¿Se pueden considerar la forma de vida más simple, incluso más que los virus? Luisa, por ejemplo, ¿quieres decirnos algo? Sí, yo lo primero dar las gracias a…
Significado #1
Héctor Socas retoma una pregunta del programa anterior sobre *E. coli* y su papel en la microbiota beneficiosa, continuando con una lista de preguntas relacionadas con biología y ciencias de la vida.
Habla: Héctor SocasSignificado #10e coli en microbiota beneficiosasilvana y poblaciones de e colicepas peligrosas de e coli…la había organizado un poco, empezando primero por la parte más relacionada con biología y ciencias de la vida Pues más que nada por si luego Luisa y Silvana quieren hacer mutis, pues que no tengan que estar aquí todo el resto del programa, pero como quieran Y podríamos empezar por una pregunta de Cebra; esta es del programa anterior, que preguntaba: Silvana tenía entendido que la E. coli en pequeñas poblaciones formaba parte de la microbiota beneficiosa, pero ahora no sé si siempre es perjudicial. No, efectivamente, forma parte de la microbiota; lo único que hay unas cepas que son particularmente peligrosas o que están asociadas a ciertas enfermedades, pero que E. Coli es una especie que está habitualmente formando parte de la microbiota sin ningún tipo de problema. Hay que explicar y bueno, el tema de la taxonomía microbiana es un poquito compleja porque no funciona igual que con el resto de organismos. Una bacteria…
Silvana Tapia explica cómo los errores en la división celular bacteriana pueden generar variaciones genéticas y alterar el comportamiento de las bacterias.
Habla: Silvana TapiaSignificado #13bacterias escherichia coli divisiones celularesmeiosis diferenciación humana nombres apellidosreproducción bacteriana células hijas fotocopiasespecies bacterias mismo nombrevariaciones genéticas en bacteriaserrores división celular bacterianafotocopia imperfecta de bacteriasdivisión celular bacteriana y propiedadescomportamiento alterado de célulase coli subespecie zepa xmultiplicación de e coli y evoluciónerrores en división celular e coli…multiplicación más rápida, con una multiplicación rápida puedo decir que cada 20 minutos se produce una célula hija; es decir, donde hay dos a los 20 minutos, 4, 8, 16 de forma exponencial. Esto hace que, bueno, pues como todas proceden de una misma célula. Por divisiones, como si se hicieran fotocopias, se le pone un nombre, *Escherichia coli* en este caso. En el caso de los seres humanos, nosotros, bueno, pues nuestras generaciones son muy diferentes a nosotros por los procesos de división celular, de meiosis, bueno, el mecanismo de la reproducción y nuestros hijos son diferentes a nosotros, y a nuestros hijos le ponemos pues unos nombres y unos apellidos para distinguirlos del resto. En el mundo bacteriano va un poquito diferente porque al final todos proceden de una misma célula hija porque son fotocopias; las células se van dividiendo por un proceso de división celular que es como hacer fotocopias de sí mismo, como son fotocopias pues van recibiendo el mismo nombre, son todas de la misma especie, *Escherichia coli*. Como se siguen multiplicando, se siguen dispersando, empiezan a colonizar nuevos nichos. Bueno, pues siempre y cuando nosotros tomemos esa bacteria y sea similar a la que como era antes sigue recibiendo ese nombre, pero como en la naturaleza no todo es perfecto, a lo mejor en un ciclo de división celular resulta que esa fotocopia no es perfecta mete un fallo; imaginemos una fotocopia, pues se borra un párrafo, se estropea y ya no es exactamente igual. Eso hablando. En términos de lo que sería el cromosoma el genoma y esto puede hacer que esa bacteria tenga una propiedad diferente que no tenía las anteriores, si esa propiedad hace que esa bacteria se comporte o esa célula se comporte diferente a las células de las cuales procedía, pues se. Habla ya de subespecie, E. coli subespecie, tal cosa, o Zepa X, y eso es lo que ha pasado con E. coli: que a lo largo de las numerosas multiplicaciones que ha podido sufrir a lo largo de la evolución, pues ha ido adquiriendo nuevas características, que le han dado propiedades nuevas. Hay algunas, por ejemplo, no sé si nos suena, por ejemplo, una E. coli que puede ser entero hemorrágica, que es aquella que produce la toxina chiga, que es una de las más peligrosas de las E. coli más peligrosas que existen ahora mismo; que una persona se…
Silvana Tapia continúa describiendo diferentes tipos de *E. coli*, mencionando una cepa letal llamada O157H7 y otra probiótica, la E. coli Nisle 1917, nombrada en honor a su descubridor Alfred Nisle.
Habla: Silvana TapiaPalabras #9cepa letal o157h7e coli nisle 1917 probióticaalfred nisle descubridor de e colibacteria e coli nisle en 1917tratamiento con e coli nisle soldados…las más peligrosas de las E. coli más peligrosas que existen ahora mismo; que una persona se puede morir en cuestión de días por deshidratación porque produce unas diarreas, unos vómitos muy intensos y la persona puede morir por deshidratación en pocos días. Esta sería una E. coli, una cepa concreta que es la O157H7 y es una de las E. coli más letales que existen pero tenemos también la otra versión y tenemos una E. coli que es probiótica que es la E. coli Nisle 1917 y se llama así, bueno, Nisle por su descubridor Alfred Nisle y 1917 porque fue aislada durante la guerra mundial Resulta que hubo una epidemia de una diarrea muy intensa entre los soldados, menos uno de ellos que resulta que estaba rodeado de soldados que estaban enfermos y esa persona pues no llegó a tener ni un solo síntoma de los que tenían el resto. Entonces este médico, Alfred Nisle, aisló de las heces a ver qué bacteria o qué es lo que había en las heces de esta persona que le estaba protegiendo frente a la enfermedad; aisló esta bacteria que la llamó E. coli Nisle en 1917 y se la empezó a administrar al resto de soldados y se curaron de la diarrea. Hoy en día es la única cepa, bueno en España, de decir que no se considera ningún probiótico como medicamento. La Agencia Europea del Medicamento, los probióticos no los consideran. Medicamentos, simplemente suplementos alimenticios o complementos. No están descritos como medicamentos. Entonces, en España o en Europa, esto es extrapolable a otros países. Cuando alguien va a una farmacia a comprar un probiótico, está comprando un…
Silvana Tapia explica cómo las cepas de *E. coli* pueden causar infecciones urinarias en España y cómo algunas han adquirido genes de virulencia o resistencia a antibióticos, mientras que otras se han convertido en bacterias beneficiosas.
Habla: Silvana TapiaSignificado #9 · Palabras #13infecciones urinarias proteus en españagenes virulencia e coli españaresistencia antibioticos bacterias beneficiosastratamiento diarrea bacterias ecoli…cocinados o que toman agua que no estaba con el tratamiento debido, pues puede tener una E. coli enterotoxigénica que también produce diarrea bastante intensa. Intensa otra muy conocida son las E. coli uropatógena; no sé si alguien ha tenido una infección. De orina en España: El 96% de las infecciones de orina están causadas por dos microorganismos, por Proteus o por E. coli, porque en este caso si llega a colonizar o llega a alcanzar el tracto urogenital, pues puede producir también infecciones de orina. Entonces bueno, es una bacteria, pues como hemos dicho, que puede estar normalmente en nuestro organismo sin causar ningún tipo de problema. Hay algunas que se han diferenciado un poquito del resto y han adquirido genes de virulencia, incluso genes de resistencia antibiótico, y hay otras que no han tenido nunca esas características o las han perdido a lo largo de la evolución y se han convertido incluso en bacterias beneficiosas capaces de protegernos frente a otras infecciones o incluso como tratamiento frente a la diarrea. Así que bueno, pues calma porque E. coli está con nosotros pero de forma controlada. Héctor, ¿no se te oye? No se te oye, Héctor, supongo estaría hablando de la diarrea del viajero, que todos los que han viajado mucho por Latinoamérica hemos padecido alguna que otra ocasión. No, no, no, simplemente le hacía el comentario de que, bueno, que…
Silvana Tapia explica cómo se distinguen cepas diferentes de bacterias, incluso cuando pertenecen a la misma especie, basándose en sus características y propiedades.
Habla: Silvana TapiaSignificado #1identificación de bacterias laboratoriotaxonomía bacteriana está cambiandocaracterísticas propiedades observablesfenotipo bacteriano como criteriotaxonomía bacteriana dando vuelcocriterios moleculares en bacteriasgenomas distintos con fenotipos similarescomparación de genomas bacterianosespecie nueva con diferencia del 3subespecies y cepas concretasbacterias aisladas de diferentes nichosdiferenciación de cepas bacterianasfenotipos de cepas diferentesgenes del 3 en especiesgenoma bacteriano 3 diferenteclasificación bacteriana no transitivaespecies bacterianas y porcentajes de similitudclasificación bacteriana evolucionagenomas comparados cuestionan especiee coli y salmonella como mezclasconcepto de especie se desdibuja…las tecnologías, sobre todo de secuenciación masiva, pues hoy en día prácticamente identificamos a las bacterias cogiendo su genoma y secuenciándolo y comparándolo con otros que han subido otros investigadores antes a ciertas bases de datos, pero antes. Y estoy diciendo hace muy poquitos años se hacía simplemente pues viendo cómo se comportaba esa bacteria. Si tú aislabas una bacteria en el laboratorio y tenía una serie de características o de propiedades, luego aislabas otra en otro entorno y tenía las mismas características que la primera, decías bueno pues es la misma especie. Y hoy en día por eso digo que la taxonomía bacteriana está cambiando totalmente porque ahora qué criterio utilizamos para decir que una bacteria es de la misma especie que la otra y hemos visto que por esas características que llamamos el fenotipo no nos sirve porque hay dos bacterias que pueden hacer lo mismo en una circunstancia pero luego tener genomas totalmente diferentes entonces ese criterio se está abandonando y la taxonomía bacteriana que es la que pone nombres a cada grupo bacteriano pues está dando pues un vuelco tremendo y no está cambiando toda la taxonomía y hoy en día pues se siguen criterios moleculares. Cuando una bacteria se comparan los genomas y son diferentes en un 3% de ese genoma, ya podemos considerar que estamos ante una especie nueva. Luego hay pequeñas particularidades dentro de ese porcentaje; bueno pues luego dependiendo de otros criterios se dice si es una subespecie o si es una cepa concreta. Cepas son pequeñas características, por ejemplo nosotros hemos aislado una misma bacteria pero de nichos o de entornos diferentes el simple hecho que una bacteria aguante en un nicho por ejemplo una temperatura y ahora yo la encuentro a otra temperatura totalmente diferente aunque yo sepa que es la misma especie digo que son dos cepas diferentes porque bueno pues tienen características particulares dentro de ese pequeño 3% que hace que un aguante por ejemplo a 4 grados y la otra 40 grados entonces bueno hoy en día se utilizan sobre todo criterios moleculares aunque todavía pese a ese 30% que nos dan de margen decir bueno pues si hay diferencia en ese 3% de genes ya estamos hablando de una especie diferente y luego todavía seguimos teniendo en cuenta pues algunas características fenotípicas pero como digo eso está en constante cambio y más ahora pues con las técnicas moleculares que tenemos que son capaces de afinar muchísimo más. Bueno, pues total que es cuestión de sepas, para que lo sepa Iba a complicar un poco la situación, me ha recordado Los dados no transitivos. ¿Es posible que una bacteria tenga un genoma 3% diferente a otra? La primera con una tercera y la B y la C, que por casualidad no, quiero decir: ¿es no transitivo el hecho de pertenecer a distintas especies? De hecho, había un autor que dice que en el futuro seguramente no podamos asignar un solo nombre a una bacteria, sino que sea por distinto porcentaje debido al parecido que tenga con otras bacterias. Es decir, que a lo mejor no podemos decir en el futuro que tengamos una E. coli, sino una bacteria 50% E. coli, 50% Salmonella, por decir dos nombres así al azar. Hay autores que proponen eso, que no hay una especie como tal, sino que pueden ser mezclas; el genoma puede tener bastante porcentaje de similitud a otros grupos básicos. O sea, eso, el concepto de especie en biología real pues se desdibuja, claro. Claro, totalmente; en microbiología el concepto de especie real es bastante diferente. Bueno, Vamos con la siguiente pregunta, no está mal para empezar. Nos pregunta Víctor: ¿qué son los priones? ¿Se pueden considerar la forma de vida más simple, incluso más que los virus? Luisa, por ejemplo, ¿quieres decirnos algo? Sí, yo lo primero dar las gracias a…
Silvana Tapia describe una imagen navideña creada con cultivos bacterianos en una placa de Petri, explicando cómo se realizó utilizando la fluorescencia de actividad bacteriana.
Habla: Héctor SocasPalabras #14imagen navideña cultivos petrifluorescencia actividad bacteriana silvana tapiacultivo bacterias emitiendo fluorescencia…constancia, no sé si existe realmente este color con ultravioleta, ¿no? Si se puede, bueno, no sé si, ah sí, sí, sí, con la clorofila, con la clorofila de Luisa. Espera, déjame primero para los oyentes describir a qué se está refiriendo Luisa ahora mismo. porque tiene puesto en su fondo una especie de imagen navideña que está hecha con cultivos en una placa de Petri y nos está explicando ahora cómo lo ha hecho pero que se ve pues la estrella de Navidad, un árbol de Navidad y como unos copos de nieve todo muy navideño pero hecho al parecer según nos está diciendo con la fluorescencia de actividad bacteriana ahí en ese cultivo Con bacterias que emiten fluorescencia cuando tienen nutrientes, es una platita con nutrientes y ella simplemente ha extendido una bacteria que cuando ha empezado a consumir esos nutrientes da fluorescencia Nosotros en el laboratorio tenemos a Vibrio Fischeri, que es una bacteria marina que también produce bioluminescencia de color azul en oscuridad más que para darle luz y luego hay en la naturaleza un montón de bacterias con pigmentos de todos los colores,…