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Juan Carlos GilGastón GiribetFrancis VillatoroHéctor Socasdimetilsulfuro exoplaneta k2-18bdimetildisulfuro molécula ultra raraconcentración dimetildisulfuro estudio k2-18bmolécula dimetildisulfuro banda 105dimetilsulfuro exoplaneta nidespecdiadimetril sulfuro química analíticaratio dimetril sulfuro diadimetril sulfuroGastón GiribetJuan Carlos GilDMSespectroscopía RamanHéctor SocasJosé Luis Negro FernándezCOUH2O2EspañaPlata o PlomoTierraCH3grupo de simetría C2VK2-18bsimetría AC2
Diadimetril sulfuro Química analítica
Con
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Gastón Giribet plantea una pregunta sobre la formación del dimetildisulfuro y su relación con el dimetilsulfuro, que pretendía discutir con una colega química.
…por la tardanza, pero acaba de ser abducido por una serie de estudiantes que tienen examen mañana y no me dejaban salir de la clase. Le pido disculpas, pero... Se habla mucho de las abducciones alienígenas, pero las abducciones de estudiantes son las peores. Gastón es doctor en Ciencias Físicas y profesor en la Universidad de Nueva York. Pues nada, que nos estaba contando Juan Carlos todas las interioridades de la molécula del dimetilsulfuro y el dimetildisulfuro que según estos autores se habría encontrado en ese exoplaneta K2 -18b No lo hemos dicho, pero otra cosa que me llama mucho la atención es que cuando ellos seleccionan el modelo y ajustan posibles cantidades de dimetilsulfuro y de dimetildisulfuro El que mejor ajusta es el que tiene casi todo dimetildisulfuro, que es la molécula ya ultra rara por excelencia Claro, como le dejan parámetro libre, pues la banda esa de 10,5 que parece bastante sonada para el dimetildisulfuro pues toma peso y resulta que de dimetildisulfuro sale poquito, sale más dimetildisulfuro Mientras que en la Tierra el dimetildisulfuro prácticamente no existe, se puede estar en milésimas de partes por billón Decía que el dimetildisulfuro... No, iba a decir que me gustaría hacer una puntualización Sobre cómo hay que contextualizar cuando hablamos de moléculas como biomarcadores, pero no sé si es el momento ahora... Un poco más adelante, estamos intentando saber si hay. Una pregunta que tenía yo sobre esto justamente, sobre esta concentración anomala del ratio de los dos, del ratio del dimetril sulfuro y diadimetril sulfuro, que quería votar hablando con una amiga química pero no pude, no tuve tiempo, es si los procesos que dan lugar al diadimetril tienen que pasar necesariamente por el diametril sulfuro o no, o cuántos procesos hay. ¿Por qué digo esto? Porque si no sería mucho más rara esa proporción anómala entre los dos, no solamente que es muy distinta a la que hay en la Tierra, sino que si uno ve que la manera más eficiente de generar uno es pasando a través del otro, porque algún proceso complejo hace…
Significado #1 · Palabras #1
Juan Carlos Gil, recordando sus orígenes como químico, explica las características espectroscópicas y la simetría del dimetilsulfuro (DMS).
Habla: Juan Carlos GilSignificado #10simetría del grupo c2v dimetilsulfuroespectroscopia infrarrojo grupos ch3características espectroscópicas juan carlos gil…tomando café en el mundo isiánico K2-18b. Bueno, esta molécula, Juan Carlos, puedes hablarnos un poco de ella porque es la clave de que esto haya tenido tanta repercusión, porque hay quien dice que es un biomarcador y que solo la generan los seres vivos. Pues te lo decía fuera de micrófono, me he puesto la camiseta de químico recordando mis orígenes y he aprovechado para mirar los grupos de simetría y qué cosas son activas en infrarrojo y demás. Bueno, el dimetilsulfuro DMS es dos metilos, grupos CH3, enlazados por un azufre en medio. Espectroscópicamente, de alguna forma, se puede tratar como si los metilos fuesen una bolita. Luego hago una puntualización, con lo cual tiene a todos los efectos simetría del grupo de simetría C2V, que significa que tiene un eje de rotación de 180 grados, es como un angulito, ¿no? Un eje de rotación de 180 grados y dos planos de simetría, uno del que forman parte los tres átomos y el perpendicular en el centro de la moleza. Has dicho 180 grados. Sí, el eje de rotación pasa de esta configuración a la contraria. Ah, vale. Hay un único…
Juan Carlos Gil continúa explicando las propiedades del dimetilsulfuro (DMS), detallando cómo los metilos se mueven respecto al azufre y comparando sus espectros en tierra con los datos del artículo científico.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #2espectros del dimetilsulfuro artículofricción metilo azufre metilo infrarrojometilos respecto azufre micras…hacer movimientos con las manos porque en espectroscopia si eres doble manco no tienes futuro. Aparece en tierra a 7,3 micras, con lo cual podría corresponder a la señal que aparece en el artículo que se adivina a 7 micras. Luego tenemos el bamboleo de uno de Los dos metilos respecto del azufre, de uno solo, ¿vale? Este en tierra, con nuestras condiciones aquí, aparece a 9,8 micras, que también es compatible con el ruidaco del espectro del artículo. Luego tenemos la fricción metilo-azufre-metilo, el ángulo de la moleculita abriéndose, que es semejante al anterior; también aparece en infrarrojo, aparece más o menos a la misma frecuencia, además de forma mucho menos intensa, con lo cual no es de esperar que aquí se vea. Y finalmente tenemos la deformación simétrica, ahora me fijo en los hidrógenos; la deformación simétrica de los hidrógenos del metilo. Esto es el carbono, mi mano, y si vibran de forma simétrica los tres de un único lado, eso afecta al momento dipolar de la…
Juan Carlos Gil continúa explicando las propiedades del dimetilsulfuro (DMS), comparándolo con el agua oxigenada para facilitar la analogía.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #3dimetilsulfuro comparación agua oxigenadaazufre metilo dimetilsulfuromolécula dimetilsulfuro grupos azufredimetilsulfuro estructura tridimensionalángulo dmds entre noventa y cien gradosmoléculas dmds único eje de rotaciónmodos vibracionales dimetildisulfurotorsión grupos metiloquios simetría ac2flexión enlace azufre metilo dmsdeformación dos azufres infrarrojo 105 micrasajuste modelo fitting banda 105 dimetildisulfuro…este también es fundamental, ese no aparece en infrarrojo Bueno, los que he dicho que aparecían estaban en torno a 7 y a 10 micras, se ven, se adivinan si miras con mucha intensidad o si quieres verlo de esa forma en el espectro ¿Qué es el dimetil disulfuro? Tú lo decías Héctor, en vez de un azufre, en medio de los dos metilos tienes dos azufres, por lo tanto si quieres cuatro grupos y por eso forzaba la comparación de antes del dimetil disulfuro con el agua, porque así me permite hacer la analogía que esto sería como el agua oxigenada H2O2, tenemos cuatro grupos, dos azufres y dos metilos en este caso. De hecho hay un mayor perecido porque tanto esta molécula dimetildisulfuro como el agua oxigenada en contra de lo que a priori podría parecer no son planas. Los dos laditos se molestan y la conformación más estable tiene un angulito, o sea que son moléculas que están un poquito abiertas, como un libro semiabierto En el agua oxigenada este ángulo es de 111 grados y en el DMDS de nuevo en tierra entre 90 o 100, es parecida Por eso las moléculas estas, el DMDS en particular, tiene un único eje de rotación, es la única simetría que tiene, en el ángulo central así, no tiene otras aunque lo parezca, ¿Vale? Y por tanto son solo de simetría AC2. Los modos activos en simetría AC2 son la torsión de los grupos metiloquios y la flexión del enlace azufre metilo que os comentaba antes, igual que en el DMS y aparece uno nuevo muy característico del dimetildisulfuro que es la deformación de los dos azufres. Tenemos dos azufres en medio y esta deformación es muy intensa en infrarrojo y aparece a 10,5 micras, que es así que yo la veo bien en el artículo. Es muy ancha, pero si me trato de olvidar de los azules, los azules es su modelo, del fitting, del ajuste a su modelo, esta banda en 10,5 del dimetildisulfuro a mí me parece razonable. Bueno, hay otros modos no activos del dimetildisulfuro. Como la torsión interna de la molécula, como si coges una toalla y la intentas secar, esa te deja siempre el momento dipular sin cambio, por tanto no es activo, y el estiramiento simétrico del doble enlace es ese. En la Tierra, decíamos, y voy a apuntar un…
Juan Carlos Gil explica cómo el dimetilsulfuro (DMS), generado por el fitoplancton, llega a la atmósfera terrestre donde es oxidado.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #15 · Palabras #13dimetilsulfuro océano atmósferaoxidación atmosférica dimetilsulfurodióxido de azufre lluvia ácidafitoplancton ácido sulfúrico atmósfera…Lo he buscado en la literatura, que usan estos bichitos para la regulación osmótica y como antioxidante De tal forma que cuando estos pequeños organismos se mueren, este DMSP se degrada Hay dos vías distintas, una va a una cosa que no nos interesa, la otra va al dimetilsulfuro Pasa al océano, del océano sale a la atmósfera, donde es oxidado en nuestro planeta pero de forma muy eficiente porque nuestra atmósfera es muy oxidante. Tenemos oxígeno, ozono y radicales hidroxilos sueltos y esto por tanto genera dióxido de azufre, entre otras cosas, dióxido de azufre que eventualmente degenera en ácido sulfúrico, la famosa lluvia ácida que antes teníamos mucha por los óxidos de azufre de los motores de combustión que ahora están muy reguladas. pero el fitoplacton también acaba echando ácido sulfúrico a la atmósfera y otras guarradas. Pero sí existen vías abióticas posibles para generar DMS aunque no en cantidades significativas. Una posible fuente, dime. No, nada; iba a decir que justamente todo esto que estás contando ahora es lo que lleva a todo este entusiasmo sobre la presencia de…
Gastón Giribet plantea una pregunta sobre la formación del dimetildisulfuro y su relación con el dimetilsulfuro, que pretendía discutir con una colega química.
Habla: Gastón GiribetSignificado #1 · Palabras #1dimetilsulfuro exoplaneta k2-18bdimetildisulfuro molécula ultra raraconcentración dimetildisulfuro estudio k2-18bmolécula dimetildisulfuro banda 105dimetilsulfuro exoplaneta nidespecdiadimetril sulfuro química analíticaratio dimetril sulfuro diadimetril sulfuro…por la tardanza, pero acaba de ser abducido por una serie de estudiantes que tienen examen mañana y no me dejaban salir de la clase. Le pido disculpas, pero... Se habla mucho de las abducciones alienígenas, pero las abducciones de estudiantes son las peores. Gastón es doctor en Ciencias Físicas y profesor en la Universidad de Nueva York. Pues nada, que nos estaba contando Juan Carlos todas las interioridades de la molécula del dimetilsulfuro y el dimetildisulfuro que según estos autores se habría encontrado en ese exoplaneta K2 -18b No lo hemos dicho, pero otra cosa que me llama mucho la atención es que cuando ellos seleccionan el modelo y ajustan posibles cantidades de dimetilsulfuro y de dimetildisulfuro El que mejor ajusta es el que tiene casi todo dimetildisulfuro, que es la molécula ya ultra rara por excelencia Claro, como le dejan parámetro libre, pues la banda esa de 10,5 que parece bastante sonada para el dimetildisulfuro pues toma peso y resulta que de dimetildisulfuro sale poquito, sale más dimetildisulfuro Mientras que en la Tierra el dimetildisulfuro prácticamente no existe, se puede estar en milésimas de partes por billón Decía que el dimetildisulfuro... No, iba a decir que me gustaría hacer una puntualización Sobre cómo hay que contextualizar cuando hablamos de moléculas como biomarcadores, pero no sé si es el momento ahora... Un poco más adelante, estamos intentando saber si hay. Una pregunta que tenía yo sobre esto justamente, sobre esta concentración anomala del ratio de los dos, del ratio del dimetril sulfuro y diadimetril sulfuro, que quería votar hablando con una amiga química pero no pude, no tuve tiempo, es si los procesos que dan lugar al diadimetril tienen que pasar necesariamente por el diametril sulfuro o no, o cuántos procesos hay. ¿Por qué digo esto? Porque si no sería mucho más rara esa proporción anómala entre los dos, no solamente que es muy distinta a la que hay en la Tierra, sino que si uno ve que la manera más eficiente de generar uno es pasando a través del otro, porque algún proceso complejo hace…
Juan Carlos Gil aclara que el dimetilsulfuro (DMS) y el dimetildisulfuro (DMDS) no están directamente relacionados, respondiendo a una observación anterior de Gastón Giribet.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #8dimetilsulfuro dmds relación gastón giribetoxidación azufre dimetilsulfuro laboratoriofitoplacto producción dimetilsulfuro…de elefantes, subidos encima de tortugas; bueno, es una atmósfera reductora, con lo cual eso va a favor de que sea más estable la molécula. En la Tierra se descompone en horas, el DMS se descompone en horas, con lo cual hay presencia mil veces inferior a la. Posible de este planeta, pues por la bomba del fitoplacto en que está todo el rato echando. Quería contestar a Gastón: no, no están relacionados directamente ambas moléculas. Hay una posibilidad de, iba a decir de oxidar, de incorporar azufre al dimetilsulfuro para dar dimetilsulfuro, pero eso es en laboratorio controlado y con muy poca eficacia en la Tierra se. Generan de forma independiente, el dimetil disulfuro se generan pantanos en fermentaciones; lo hay en los quesos curados, lo hay en la cerveza, lo hay en el vino y es parte del olor del ajo. Dicen que el dimetil disulfuro. Me gusta esto del queso marcador y…
Juan Carlos Gil relata una experiencia personal relacionada con el sulfuro de hidrógeno y el ácido sulfídrico, recordando a su antiguo profesor de química, José Luis Negro Fernández, quien falleció hace un año.
Habla: Juan Carlos GilPalabras #2sulfuro de hidrógeno atmósferas reductorasdimetilsulfuro precursor en condicionesmétodos de análisis juan carlos gilsulfuro de hidrógeno ácido sulfídricojose luis negro fernández química couexperiencia personal sulfuro de hidrógenomarcha del ácido sulfídrico cationeslaboratorio península aguas marinassulfuro de hidrógeno huevos podridosgrupo de los guarros laboratoriomarcha del sulfídrico aguas marinasmolécula sh2 sulfuro de hidrógenodisolución acuosa protones liberaciónmarcha del ácido sulfídricoquímica analítica cationes disoluciónchistes bombas fétidas españamarcha del sulfídrico química analíticacation plata precipitación clorhídricocation plomo precipitación disolución…lo hay en los quesos curados, lo hay en la cerveza, lo hay en el vino y es parte del olor del ajo. Dicen que el dimetil disulfuro. Me gusta esto del queso marcador y el ajo, el queso marcador. Gracias porque tenía esa duda. Sí, no, no está muy. Relacionado, y una cosa que a mí también enseguida me llamó la atención es la falta de sulfuro de hidrógeno. En una atmósfera reductora, en la que tienes azufre por ahí volando por la atmósfera, no se explica que no haya disulfuro de hidrógeno, porque es un precursor en esas condiciones del dimetilsulfuro. Y lo han buscado y no lo han encontrado; eso es, o sea, eso para mí es bastante bajona, vamos, aparte de la mierdez, perdón, del desastre de ajuste y de tratamiento de los que hacen. A mí el ácido sulfídrico, perdón, el sulfuro de hidrógeno, sí, tengo una coña sobre esto. ¿Lo puedo contar, Héctor? Es un minuto. Claro, claro. Bueno, que a mí eso me lo deja. Sí, no, es que tengo una relación yo con el sulfuro de hidrógeno y el ácido sulfídrico porque en COU, y estaba en un colegio extraordinario, y el mejor profesor de química que he tenido durante mi vida y que por quien estudié yo química, porque me iluminó, José Luis Negro Fernández, que murió justo ahora hace un año. Bueno, nos propuso a los que queríamos estar. Más tiempo en el laboratorio hacer una práctica que nos inventábamos nosotros. Y con dos amigas y otro amigo se nos ocurrió analizar la presencia de cationes metálicos en las aguas de los mares alrededor de la península mediante una cosa que se llama la marcha del ácido sulfídrico o marcha de los cationes. El ácido sulfídrico, el sulfuro de hidrógeno es gaseoso, es como huelen los huevos podridos debido a este compuesto, o sea, es horroroso, ¿vale? Y nuestro laboratorio estaba debajo de las aulas, con lo cual nos llamaban en el colegio, nos llamaban los guarros. Tuvimos durante un año que éramos el grupo de los guarros y más sin ri, la experiencia que habían hecho el año anterior era destilar los compuestos aromáticos de plantas como menta y como plantas aromáticas semejantes, con lo cual. Era todo lo contrario, así que éramos los guarros. Siempre me acordaré de eso. En gas, la molécula SH2 se debe llamar, si quieres, corrección química, sulfuro de hidrógeno y ácido sulfídrico es en disolución acuosa, cuando se disocia la molécula y libera protones, libera cationes hidrógeno que se rodean de moléculas de agua, ¿vale? O sea, no es exactamente la misma ¿Usa aplicación más útil en la humanidad ha sido esos chascos, esos chistes que uno tira? Bombas fétidas, lo llamamos en España. Bueno, en química analítica, hasta hace... no me atrevo a decirlo, porque posiblemente se esté usando hasta ahora, era fundamental para determinación cualitativa de cationes en disolución. Recomiendo mirarlo, si tenéis interés por la química básica, la marcha del sulfídrico Eso suena, no sé, a alguna obra de música clásica ¿El qué? ¿La marcha del sulfídrico? La marcha del sulfídrico, la marcha de los cationes La marcha del sulfídrico a mí me suena una droga divisa Es una marcha porque partimos de la disolución, la echamos, creo que recordar ácido clorhídrico Por tanto el cloruro hace precipitar tres cationes, me recuerdo algunos, el cation plata, el cation plomo 2 Eso precipita, por tanto si aparece más o menos blanco sabes si hay plata o plomo coges entonces la fracción líquida que queda por arriba y le echas otro compuesto que ya no me acuerdo Plata o plomo me encantó ¿Qué pasó? Plata o plomo suena película mexicana, plata o plomo ¡Qué buenísimo! Eso es excelente. Bueno, que por eso es una marcha, vas cogiendo la zona que no precipita y lo vas procesando un paso detrás de otro. Sí, en inglés diríamos un pipeline, ¿no? Pues no sé cómo se dice a esto precisamente, no me suena la palabra pipeline, ahora…