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Ignacio CrespoJuan Carlos GilFrancis VillatoroJosé EdelsteinHéctor SocasSilvana TapiaIsabel CorderoLuisa AchaerandioGastón Giribettrastornos psiquiátricos pleiotrópicosheredabilidad en genética cuantitativaenfermedades genéticas versus poligénicasvariabilidad fenotípica factores genéticos ambientalesenfermedades psiquiátricas heredabilidad 0 4trastornos psiquiátricos heredabilidad 0 66bioinformática y estadística genéticagwas en trastornos psiquiátricoscorrelación genética luis achaerandioGWASP-factorLuisa AchaerandioNatureFrancis Villatoro14 Psychiatric DisordersSNPSingle Nucleotid PolymorphinsIsabel Cordero
Correlación Genética Luis Achaerandio
Con
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Luisa Achaerandio describe la metodología utilizada en un estudio reciente publicado en Nature sobre trastornos psiquiátricos, explicando que se basa en bioinformática y estadística genética.
…más sensibles a la anestesia e incluso tener más tendencia al melanoma. Entonces ahí está incluido el concepto tanto de locus en concreto como pleiotropía, como estas diferencias. Vale, pues el artículo identifica 283 loci, que es el plural de locus, ¿vale? Ok, pleiotrópicos, que están compartidos entre estos trastornos. Que en proporción a más de un millón, pues evidentemente 238, pues oye, no es tanto. Ya han encontrado un nexo de unión. Hay otro concepto que me gustaría poner sobre la mesa porque a veces no se entiende la diferencia entre enfermedades genéticas y enfermedades poligénicas. Entonces hay que comprender muy bien lo que es el concepto de heredabilidad en genética cuantitativa. Se refiere a la varianza fenotípica y lo digo así sin paños calientes porque a lo mejor ya hay mucha gente que a esto ya le suena. La heredabilidad se define como el porcentaje de variabilidad total que se debe en parte solo a la genética y el porcentaje de variabilidad que se debe al ambiente, es decir, esa relación. Por lo tanto, si tenemos el valor 1, pues digamos que influye el 100% de la genética o nada puede influir, ¿no? Y por ejemplo, en enfermedades psiquiátricas un 0,4 sería normal y una cosa que me ha llamado la atención de este paper es que hay, por ejemplo, trastornos psiquiátricos que tienen una heredabilidad de 0,66. Por ejemplo se pueden mirar al final del artículo estos valores o sea que realmente bueno pues. Es curioso, tiene un peso; vale, la metodología, como ya decía, como ya había adelantado, está basada en el empleo de la bioinformática y la estadística genética basada en GWAS. No hay experimentos celulares ni cultivos; es un análisis genómico estadístico. Hay muchas herramientas; si queréis, las vemos en más profundidad después; pues si queréis preguntarme, pero básicamente utilizan correlación genética, solapomiento poligénico, correlación genética, quiero decir cosas que, y por supuesto análisis computacional, análisis funcional computacional. El hallazgo principal es que se identifican gracias a este análisis cinco factores genéticos, es decir, que todas estas enfermedades o desordenes psiquiátricos se pueden englobar en cinco tipos, ¿vale? Compulsivo, esquizofrenia bipolar, neurodesarrollo, es…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio se muestra agradecida por ser redirigida y anuncia que va a hablar sobre las bases genéticas de alteraciones psiquiátricas, basándose en un artículo reciente publicado en la revista Nature.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #15bases genéticas alteraciones psiquiátricasartículo nature diciembrepaisaje genético 14 desórdenes psiquiátricosluisa achaerandio psicología genómica…el cero, ¿no? Eran los, eran, no estoy seguro: eran los babilonios los primeros que manejaban el cero o fueron los mayas. Sara, no, no me acuerdo. Por los árabes, ¿no fueron los árabes? Los árabes fueron, los trajeron. Los trajeron, sí, sí, Nefer, aclara. Invoquemos, invoquemos. Bueno, vayamos al grano: Luisa, cuéntanos tu tema de psicología genómica y cosas por el estilo. Pues me alegra que me haya reconducido, Francis. Muy chulo. Pues mira, vamos a hablar de bases genéticas de determinadas alteraciones psiquiátricas. Es un artículo de Nature del 10 de diciembre, hace poquito, del 25, y se titula, a ver, mi inglés no es el mejor del mundo, pero vaya, "Mapping the Genetic Landscape Across 14 Psychiatric Disorders", que se puede traducir como mapeando el paisaje genético alrededor o a través, basándose en 14 desórdenes psiquiátricos concretos, para ver si hay en efecto una base genética que los pueda relacionar o no. El autor es Andrew Grotzinger, espero haberlo pronunciado bien el apellido, y el trabajo está liderado por una cantidad de consorcios y de redes internacionales. Vaya, un consorcio a nivel genético; lo digo en general para los que a lo mejor no estáis tan…
Luisa Achaerandio explica conceptos genéticos clave para comprender los resultados de un estudio sobre alteraciones psiquiátricas publicado en Nature, incluyendo el concepto de locus genético y variantes SNP.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #18 · Palabras #16locus genético asociado a rasgosvariante snp single nucleotid polymorphinspleiotropía variante genética enfermedades…pues tenemos datos de GWAS de un millón de pacientes y de ese millón de pacientes digamos que aparecen estos 14 trastornos. Para poder entender un poquito cuáles son los resultados tengo que recordar algunas cositas genéticas, algunos datos genéticos. Algunos conceptos. El primero es el concepto de locus genético. Un locus es una localización muy concreta del genoma que está asociado a un rasgo. Se puede entender también como variante SNP, Single Nucleotid Polymorphins o simplemente SNP. Otro concepto importante para comprender bien el resultado que nos ofrece este estudio es el concepto de pleiotropía. Se entiende como pleiotropía como que es una variante genética que influye en varias enfermedades concretas. Es decir, tú tienes un SNIP, te pongo por ejemplo. El gen, o sea lo que es la variante del gen MC1R que a mí me encanta, ya sabéis, el receptor 1 de la melanocortina que puede ser, aparte de que es un SNIP, que está en un locus genético concreto, para los más curiosos se encuentra en la posición 89.920.138…
Luisa Achaerandio describe la metodología utilizada en un estudio reciente publicado en Nature sobre trastornos psiquiátricos, explicando que se basa en bioinformática y estadística genética.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1trastornos psiquiátricos pleiotrópicosheredabilidad en genética cuantitativaenfermedades genéticas versus poligénicasvariabilidad fenotípica factores genéticos ambientalesenfermedades psiquiátricas heredabilidad 0 4trastornos psiquiátricos heredabilidad 0 66bioinformática y estadística genéticagwas en trastornos psiquiátricoscorrelación genética luis achaerandio…más sensibles a la anestesia e incluso tener más tendencia al melanoma. Entonces ahí está incluido el concepto tanto de locus en concreto como pleiotropía, como estas diferencias. Vale, pues el artículo identifica 283 loci, que es el plural de locus, ¿vale? Ok, pleiotrópicos, que están compartidos entre estos trastornos. Que en proporción a más de un millón, pues evidentemente 238, pues oye, no es tanto. Ya han encontrado un nexo de unión. Hay otro concepto que me gustaría poner sobre la mesa porque a veces no se entiende la diferencia entre enfermedades genéticas y enfermedades poligénicas. Entonces hay que comprender muy bien lo que es el concepto de heredabilidad en genética cuantitativa. Se refiere a la varianza fenotípica y lo digo así sin paños calientes porque a lo mejor ya hay mucha gente que a esto ya le suena. La heredabilidad se define como el porcentaje de variabilidad total que se debe en parte solo a la genética y el porcentaje de variabilidad que se debe al ambiente, es decir, esa relación. Por lo tanto, si tenemos el valor 1, pues digamos que influye el 100% de la genética o nada puede influir, ¿no? Y por ejemplo, en enfermedades psiquiátricas un 0,4 sería normal y una cosa que me ha llamado la atención de este paper es que hay, por ejemplo, trastornos psiquiátricos que tienen una heredabilidad de 0,66. Por ejemplo se pueden mirar al final del artículo estos valores o sea que realmente bueno pues. Es curioso, tiene un peso; vale, la metodología, como ya decía, como ya había adelantado, está basada en el empleo de la bioinformática y la estadística genética basada en GWAS. No hay experimentos celulares ni cultivos; es un análisis genómico estadístico. Hay muchas herramientas; si queréis, las vemos en más profundidad después; pues si queréis preguntarme, pero básicamente utilizan correlación genética, solapomiento poligénico, correlación genética, quiero decir cosas que, y por supuesto análisis computacional, análisis funcional computacional. El hallazgo principal es que se identifican gracias a este análisis cinco factores genéticos, es decir, que todas estas enfermedades o desordenes psiquiátricos se pueden englobar en cinco tipos, ¿vale? Compulsivo, esquizofrenia bipolar, neurodesarrollo, es…
Luisa Achaerandio describe cómo la genética del P-factor se correlaciona con el neuroticismo, autolesiones e intentos de suicidio, destacando una clara división entre factores sociales y otros factores en la figura del artículo.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5 · Palabras #2genética del p-factor y neuroticismocorrelación genética autolesiones e intentos suicidiofactores sociales y punto de inflexión…5, a los que queréis mirar el artículo, hay una figura que me parece increíble porque nada más que de un vistazo me ha llamado muchísimo la atención. A ver también vosotros cómo la interpretáis porque no sé, a mí me ha parecido muy visual para lo siguiente. Muestra que la genética del P-factor se correlaciona con neuroticismo, autolesiones, intentos de suicidio y nada más que de un vistazo porque te aparece como una correlación genética te da la impresión porque te dice por arriba de un punto de inflexión están como los factores sociales y por debajo de ese punto de inflexión están estos factores, neuroticismo, intentos De suicidio. Entonces, como que a mí, lo puedo interpretar como que esta vulnerabilidad psiquiátrica se relaciona más con la regulación emocional y con el estrés que con rasgos cognitivos. Es decir, tú puedes ser una persona muy inteligente, pero oye, si tú…
Luisa Achaerandio comenta un hallazgo relacionado con la expresión de receptores dopaminérgicos en diferentes tipos de células cerebrales, observando una correlación entre factores asociados a psicosis y neuronas excitadoras.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #3receptores dopaminérgicos y psicosisoligodendrocitos y estrés postraumáticoexpresión de receptores en células cerebralesdesarrollo temprano y cerebro fetalluisa achaerandio y receptores dopaminérgicos…no te dicen que controles tu insulina, por favor, a lo mejor tampoco puedes controlar tan fácilmente la forma en la que tienes de expresarte o de comportarte, ¿vale? Y por eso también me parece súper relevante esta figura a nivel visual, simplemente, ¿vale? Por ese twist que te hace justo en ese punto, por lo menos no me ha dado tiempo de profundizar al máximo, pero me ha llamado mucho la atención. Luego, pues claro, si tú también analizas en bases genéticas donde se expresan este tipo de receptores dopaminérgicos, pues ves que los factores que están asociados a psicosis están más relacionados con neuronas excitadoras; los factores que están relacionados más con trastornos de estrés postraumático y demás, pues se expresan más en oligodendrocitos, es decir, que hay más desajuste genético o más expresión de determinados receptores ya localizados en diferentes células, que eso también está muy interesante. Y que esto ocurre sobre todo, estas tendencias ocurren en el cerebro fetal y desarrollo temprano, también muy chulo; o sea, me parece realmente interesante. Básicamente, ya terminando, tiene una implicación terapéutica clara: que es que, bueno, pues a nivel terapéutico, a lo mejor el inhibidor selectivo de la recaptación de la serotonina te puede servir de manera transdiagnóstica para diferentes manifestaciones…
Luisa Achaerandio señala limitaciones en el estudio genético sobre el P-factor, destacando la predominancia de población europea en los datos y posibles sesgos en los diagnósticos autoinformados.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #2 · Palabras #20sesgo diagnóstico autoinformado pacientepredominio población europea en datos pfactortamaños de muestras desiguales trastornosgwas análisis estadístico correlación causalidad…no sé, lo utilizas para la depresión, pero a lo mejor, oye, podemos abrir un poquito más el campo porque sabemos que en base afectan mucho los genes del clúster dopaminérgico. Ahora, no está exento de limitaciones, que también hay que ver una lectura crítica. La lectura crítica, y es una lectura bastante clara, eso creo que lo podemos deducir cualquiera; es que el predominio de la población es europea, en los datos, ¿vale? Eso se ve claramente. Aparte, que bueno, que los diagnósticos muchas veces están basados en un psiquiatra que te da el diagnóstico autoinformado del paciente. Entonces, bueno, a veces ahí puede haber también cierto sesgo, porque yo tengo la muestra pero a lo mejor lo que no tengo bien es el diagnóstico. A ver si nos entendemos, ¿no? Entonces, que hay tamaños de muestras desiguales entre los diferentes trastornos y que bueno, en definitivas cuentas, aunque sea un millón de muestras de pacientes, GWAS no deja de ser un análisis estadístico; entonces igual correlación no implica causalidad como todos sabemos, pero por eso hay que seguir investigando. De todas maneras me parece sorprendente que todo nos lleve. Como a ese lugar del cromosoma 11 del clúster dopaminérgico. Luego hay, en lo que es los conflictos de intereses, he mirado que bueno siempre va a estar incluida empresas como Biogen pero bueno eso es normal; eso es algo que suele ocurrir y que bueno es…
Isabel Cordero resume la presentación anterior sobre un estudio genético y expresa su interés en los hallazgos, destacando cómo las correlaciones pueden indicar posibles relaciones causales.
Habla: Isabel CorderoSignificado #16estrés como disparadorcorrelación indica causalidad potencialisabel cordero interés hallazgos…un trabajo que tiene bastante potencial para cambiar o para pensar sobre la nosología psiquiátrica, es decir, la descripción y diferenciación y clasificación de este tipo de enfermedades que, bueno, evidentemente están en gran parte muy poco comprendidas Muy Bien, muy bien, estupendo resumen. Yo, sí, súper bonito y súper interesante; o sea, y aunque correlación no implica causalidad, sí te dice por dónde intentar buscarla, ¿no? Entonces, te puede ayudar mucho a encontrar, muy interesante, y que me ha parecido muy interesante que el estrés afecta mucho a muchas cosas, ¿no? Es como el disparador, ¿no? Sí, efectivamente. ¿Quién lo iba a imaginar? Para sorpresa de nadie, pero bueno, ya no tenemos dudas. Tenemos hechos, ¿no? No, pero, o sea, corrobora que también lo que sale no parece una barbaridad, ¿no? O sea, lo vemos, pero sí, sí, muy muy interesante. Muy bien, Francis, yo me había saltado el orden y porque, no sé, leí mal. No se ha notado, si no se ha…