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Alberto ApariciBorja TosarGastón GiribetFrancis VillatoroHéctor SocasJuan Carlos Giladn antiguo sarro dentalcontaminación moderna adn dientesadenina citosina marcador adndegradación química nucleótidos altera adnexceso citosinas indicador antigüedad adnartículos cráneo proteómica y adnADNAlberto ApariciADN nuclearFrancis VillatoroHomo longicráneo de HarbinHéctor SocasHarbinThe Man From EarthAbraham LoebADN mitocondrialHomo sapiensNeandertalesDenisovanos
Contaminación Moderna ADN dientes
Con
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Alberto Aparici advierte sobre la importancia de verificar la autenticidad del ADN antiguo extraído de muestras como el sarro dental, señalando que la mayoría del material genético obtenido es contaminación moderna.
…tiene sentido con los estratos para hacer todo este análisis. Eso no lo he contado porque tampoco quiero extenderme yo aquí y pasarme dos horas hablando de los denisovanos para compensar, pero para hacer todo este análisis uno tiene que estar seguro de que el ADN que está utilizando es ADN antiguo, cuidado porque de todo el ADN que sacas de ese poquito de sarro que hay en el diente, el 90% es contaminación moderna solo una cantidad muy pequeñita es antiguo y para identificar que sea antiguo pues hay una serie de marcadores, por ejemplo en el ADN la adenina se convierte en citosina. si no recuerdo mal Hay una serie de cambios químicos que ocurren simplemente porque los nucleótidos se degradan químicamente y hacen que un nucleótido que debería ser de un tipo se convierta en un nucleótido de otro tipo Entonces si tú ves un exceso de citosinas en el ADN, tienes un cierto argumento en favor de que ese ADN es más antiguo y por lo tanto no es contaminación con este cráneo se han publicado dos artículos, uno es sobre ADN, que es de lo que estoy hablando todo el rato, y hay otro que es sobre proteómica se han sacado también proteínas antiguas de ese pedazo de sarro y se han analizado y en las proteínas ocurre lo mismo se producen una serie de desaminaciones, desaparecen ciertos grupos amina cuando las proteínas pasan mucho tiempo y se van degradando y eso te…
Significado #1 · Palabras #1
Alberto Aparici explica cómo se identificó a los Denisovanos como una especie distinta, no por sus restos óseos, sino gracias al análisis de su ADN.
Habla: Alberto ApariciPalabras #16adn denisovanos distinto a sapienscomparación adn neandertales denisovanosidentificación denisovanos por análisis adnprimeros restos fragmentarios denisovanos…suerte de tener toda esa información, porque es una especie muy moderna; se descubrió, los primeros restos se catalogaron en el año 2010, por lo tanto es una especie humana del siglo XXI, 100%, y tiene una peculiaridad que ninguna otra especie humana tiene. ¿Qué es que no se describió como especie por sus restos morfológicos, por la morfología de su esqueleto, sino por su ADN? Ya llegó en la época en la que podíamos sacar ADN de los restos fósiles, se comparó con el ADN de Sapiens y dijeron: esto no es; se comparó con el de los Neandertales y dijeron: esto es parecido pero no es igual. Y entonces es cuando se tomó la decisión de que habríamos de llamarles de una forma distinta. Problema: los primeros restos eran extraordinariamente fragmentarios, donde extraordinariamente fragmentarios quiere decir que eran cuatro dientes y una falangeta, una falangeta del meñique concretamente; es decir, la parte, la parte. Del extremo de un meñique, entonces, claro, con eso los estándares de cómo se describe una especie no permitían describir una especie, o sea, básicamente el manual te decía: usted no tiene suficientes restos para decir que esto es una especie, claro. Esos…
Alberto Aparici explica las dificultades para determinar la edad del cráneo de Harbin debido a la falta de contexto estratigráfico y la posible contaminación moderna por haber permanecido décadas en una residencia privada.
Habla: Alberto ApariciSignificado #9 · Palabras #6cráneo harbin contexto estratigráficocontaminación moderna cráneo residencia privadaedad cráneo harbin contaminación modernacráneo de harbin y contaminación adnthe man from earth y teorías loebedad cráneo harbin 146000 años…de laboratorio se ha puesto una edad probable de 146.000 años pero lo cierto es que podría ser 170 y que incluso si no se encontró ahí o su abuelo fue impreciso a la hora de decir dónde se encontró, pues igual podría tener una edad completamente distinta. Entonces es complicado en ese sentido. No tener el contexto estratigráfico te hace la vida difícil en ese sentido. También tiene otra cosa, que es que si este cráneo ha estado décadas en la casa de una persona, es probable que contenga más contaminación moderna de la que nos gustaría. Cuando lo acaba de sacar de tierra, pues bueno, puede estar contaminado, pero mucho menos que si ha estado 50 años en casa de una persona. Y ahora hablaremos de eso a la hora de tratar de sacar ADN de aquí, que es la forma de identificarlo. Yo tengo una teoría: A ver, a mí me parece muy raro que ese cráneo de 146.000 años, después de haber pasado por todo lo que ha pasado, de estar en un pozo durante 100 años, de estar en la casa de un señor, se haya todavía podido rascar material para hacer un análisis de ADN. Yo creo que lo que han sacado es contaminación de ADN del abuelo; creo que el abuelo es una persona que llevaba 146 .000 años vagando por la tierra. No sé si han visto The Man From Earth, The Man From Earth, qué maravilla de película. Sí, sí, me encanta. Yo lo miraría, no sé, igual es que últimamente estoy leyendo demasiadas cosas de Loeb, pero es mi teoría. Yo creo que tiene sentido. Esta película, si no la han visto los oyentes, muy muy recomendable: The Man From Earth, creo que es del año 2007, muy muy bueno. A lo mejor el origen de los antepasados de este abuelo eran de esa zona de Melanesia en la que el porcentaje de nisovano es mucho…
Alberto Aparici explica los intentos fallidos de extraer ADN del cráneo de Harbin, señalando que se han analizado huesos densos como los dientes y el hueso petroso.
Habla: Alberto ApariciSignificado #4 · Palabras #5adn del cráneo harbinhueso petroso extracción adndientes como fuente adncráneo de harbin sin mandíbula inferiordiente superior cráneo harbinsarro diente cráneo harbinadn en sarro bacterianoproteínas cuerpo segrega sarro…Entonces, tenemos esta situación en la que este cráneo se pasa cuatro años sin poder ser atribuido a nadie. Es una especie humana nueva que, como solo tiene un resto, pues a lo mejor igual se queda en un cajón y nunca se identifica. Con nada se intenta extraer ADN del cráneo varias veces. Los mejores lugares para extraer ADN son los huesos más densos, porque están más estancamente cerrados; digamos, los dientes suelen ser un buen sitio para extraer ADN del interior del diente. También el hueso petroso o el peñasco, que es un hueso de la parte lateral del cráneo, que es literalmente el hueso más denso del cuerpo humano. Intentaron encontrar ADN ahí y no lo consiguieron; fracasaron en ese sentido y dijeron: parece que este cráneo se ha pasado tanto tiempo fuera que a lo mejor ya no le queda ADN de ningún tipo en ningún sitio. Y este es un cráneo peculiar porque tiene toda la Parte de arriba del cráneo pero no tiene la mandíbula inferior. La mandíbula inferior si estaba inicialmente se ha perdido y a lo mejor es que ni siquiera estaba. Y entonces en esa mandíbula superior le queda un diente, un único diente, uno solo. ¿Vale? ¿Intentaron extraer ADN del diente? Tampoco, pero se dieron cuenta y aquí viene el giro que Me parece maravilloso y que te demuestra que uno tiene que perseverar todo lo que pueda. Decidieron probar suerte porque se dieron cuenta de que en el diente hay un poco de sarro. El sarro es una concreción mineral que tiene que ver con placa bacteriana unida con saliva, unida con proteínas que el cuerpo segrega y que cuando aquello se queda digamos estratificado termina formando una capa mineral alrededor del diente. Y dijeron: bueno, en el sarro ha habido muchas cosas biológicas asquerosas; a lo mejor de aquí sale algo de ADN. Siempre cabe esperar que la mayor parte de ADN del sarro sea bacteriano, pero bueno, a lo mejor queda alguna cosa y probaron y salió alguna cosa. Héctor, ¿querías decir algo antes de? Que yo continúe. Sí, es que ha surgido otra tercera teoría sobre el origen del nombre Longis aquí en el chat de YouTube: nos la pone Tomás Vila, que dice que pensaba que lo llamaban así porque el dueño antes de entregarlo había estado varios años haciéndose…
Francis Villatoro explica el proceso de análisis de ADN nuclear realizado sobre el sarro encontrado en un diente del cráneo conocido como 'Homo longi', y las dificultades para secuenciar fragmentos suficientemente largos.
Habla: Francis VillatoroPalabras #3adn nuclear homo longisecuenciación adn denisobanosvariabilidad humana moderno leandertalespuzzle adn referencia humanoadn mitocondrial cráneo homo longireconstrucción adn mitocondrial sarro dentalcobertura baja adn mitocondrial uno pocopaleogenoma cobertura ideal veinte treinta…pura emoción. Aquí los Men in Black empiezan a trabajar porque iba a decir algo importante como que es extraterrestre, que es lo que dice David Loeb. El próximo artículo. Bueno, en principio de este sarro, de esto que han encontrado en el diente han hecho un Análisis de ADN buscando ADN nuclear porque el ADN nuclear es el más claro. El ADN nuclear es muchísimo más largo y, por tanto, aunque encuentres muchos trozos, puedes acoplarlo, puedes ajustarlo a un ADN de referencia, un ADN de referencia humano y ver las diferencias; y esas diferencias de un único nucleótido, etcétera, son las que marcan si estás en una especie o en otra, si están dentro de la variabilidad propia del humano moderno o si corresponden a algo parecido a las variantes que se han observado en leandertales o las que se han observado en denisobanos. Y no se encontró, no se logró aislar adecuadamente, o sea, no se logró secuenciar, en la palabra técnica, trozos suficientemente largos porque lo que hace es coger los trozos e irlos poniendo como en un puzzle. Yo tengo varias. Copias de una pequeña región y tengo trozos un poquito más grandes que esa región y los voy colocando como en vertical y voy pegándolos como si fueran piecitas de Lego que voy colocando con los colores adecuados. Entonces no se logró reconstruir ADN nuclear, pero se intentó reconstruir ADN mitocondrial y se logró reconstruir ADN mitocondrial. Es un ADN mitocondrial reconstruido muy mal, la verdad es que la cobertura es de uno y poco, o sea no llega a dos. En un estudio riguroso, paleogenómico, la cobertura, es decir, el número de copias que tengo de cada trocito en ADN mitocondrial tendría que ser del orden de 20, quizás 30, ¿vale? Eso es una calidad excelente, lo que tengo reconstruido de. Verdad es lo que es, una calidad fetén. 30 de cobertura 20, mira, pues está bien, pero no es lo... 10. Uy, estamos en el borde, pero cuando la cobertura es muy baja, como en este caso, hay que tener cuidado. Te paso a que continúes tú, Alberto. Sí, perdón,…
Alberto Aparici explica que el sarro encontrado en un diente del cráneo 'Homo longi' ha sido la única fuente para obtener ADN.
Habla: Alberto ApariciSignificado #6 · Palabras #15adn mitocondrial cráneo homo longimitocondrias como bacterias ancestralesrespiración celular y mitocondriasancestros unicelulares incorporaron bacterias…el ordenador en un momento dado. De hecho, yo me quedo escuchándoos a vosotros y vosotros decís: “Se ha quedado Alberto como congelado”, no sé cuántos, y yo no. Pero bueno, en fin. Tú seguís hablando ahí. Espero no haber metido la paz con lo que acabo. de comentar Seguro que no, te he convencido que no Bueno, la cosa que este sarro ha sido el único lugar donde se ha podido encontrar algo de ADN Y lógicamente cuando el ADN es muy escaso, lo que se ha encontrado es ADN mitocondrial Hay que pensar siempre, recordemos, las mitocondrias son esta parte de la célula donde ocurre la respiración y la mitocondria originalmente era una bacteria Es una bacteria que nuestros antepasados, nuestros tataratatarabuelos unicelulares, se incorporaron, digamos, esa bacteria al interior de las células Y en cada célula humana normalmente hay decenas, centenares, a Veces miles de mitocondrias. Entonces, copias del ADN de cada mitocondria hay muchísimas en cada célula. En cambio, copias del ADN de la célula, hay una en cada célula, con lo que cuando tienes escasez de ADN lo que encuentras primero siempre es el ADN…
Alberto Aparici advierte sobre la importancia de verificar la autenticidad del ADN antiguo extraído de muestras como el sarro dental, señalando que la mayoría del material genético obtenido es contaminación moderna.
Habla: Alberto ApariciSignificado #1 · Palabras #1adn antiguo sarro dentalcontaminación moderna adn dientesadenina citosina marcador adndegradación química nucleótidos altera adnexceso citosinas indicador antigüedad adnartículos cráneo proteómica y adn…tiene sentido con los estratos para hacer todo este análisis. Eso no lo he contado porque tampoco quiero extenderme yo aquí y pasarme dos horas hablando de los denisovanos para compensar, pero para hacer todo este análisis uno tiene que estar seguro de que el ADN que está utilizando es ADN antiguo, cuidado porque de todo el ADN que sacas de ese poquito de sarro que hay en el diente, el 90% es contaminación moderna solo una cantidad muy pequeñita es antiguo y para identificar que sea antiguo pues hay una serie de marcadores, por ejemplo en el ADN la adenina se convierte en citosina. si no recuerdo mal Hay una serie de cambios químicos que ocurren simplemente porque los nucleótidos se degradan químicamente y hacen que un nucleótido que debería ser de un tipo se convierta en un nucleótido de otro tipo Entonces si tú ves un exceso de citosinas en el ADN, tienes un cierto argumento en favor de que ese ADN es más antiguo y por lo tanto no es contaminación con este cráneo se han publicado dos artículos, uno es sobre ADN, que es de lo que estoy hablando todo el rato, y hay otro que es sobre proteómica se han sacado también proteínas antiguas de ese pedazo de sarro y se han analizado y en las proteínas ocurre lo mismo se producen una serie de desaminaciones, desaparecen ciertos grupos amina cuando las proteínas pasan mucho tiempo y se van degradando y eso te…