Búsqueda · 23 momentos en 12 episodios
Ignacio CrespoJuan Carlos GilFrancis VillatoroJosé EdelsteinHéctor SocasSilvana TapiaIsabel CorderoLuisa AchaerandioGastón Giribetpatologías psiquiátricas y comorbilidaddepresión asociada esquizofreniaenfermedades psiquiátricas en mujerescomplejidad de las patologías psiquiátricascomorbilidad psiquiátrica y herramientas bioinformáticasbase genética común en patologíasGWASLuisa AchaerandioJuan Carlos GilDRD2NCAM1ANKKP-factorLuisaGastón GiribetHéctor SocasDeepMindFrancis VillatoroTDHANature14 Psychiatric DisordersTOCcromosoma 11
Comorbilidad psiquiátrica y herramientas bioinformáticas
Ep545: 11F; Dinosaurios; Sag A*; Genes y Psiquiatría; AlphaGenome; ADN Origami
12 de febrero de 20267 momentos
Con
0:000:301:001:302:002:303:003:38
Luisa Achaerandio explica el objetivo de un estudio reciente publicado en Nature sobre comorbilidad psiquiátrica y la necesidad de herramientas bioinformáticas para analizar los datos.
…pero sí que lo dice de palabras textuales: Aproximadamente la mitad de la población tendrá en algún momento de su vida un episodio de ansiedad, depresión u otro problema de salud mental que podría llegar a diagnosticarse por un profesional. Esto es, dime. Luisa, un segundo. Juan Carlos, nos tienes que dejar y no queremos que tenga algún problema psicológico por aguantar más de la cuenta. Siento que haya producido la interrupción, Luisa. Sí, venga, muchas gracias, chicos. Venga, un placer, nos vemos. Un placer. Venga, continúa, Luisa. Eso, pues yo creo que es muy impresionante este dato que acabo de decir. Y además las patologías psiquiátricas tienen otro problema, que causan con comorbilidad. Eso significa que se simultanean a la vez varios trastornos en una misma persona. Es decir, quien tiene depresión puede tener a lo mejor asociada una esquizofrenia. Además, las enfermedades psiquiátricas tienen otro añadido, que como las mujeres, voy a meter la cuña, a veces somos complejas y poco comprendidas. Por lo tanto, tienen menos como que se ocultan y a nivel social altera, afecta todo lo relativo con la enfermedad psiquiátrica o psicológica. Este paper responde a una pregunta central que es la siguiente: ¿existe una base genética común que explique esa comorbilidad psiquiátrica? ¿Hay algún nexo de unión entre estas enfermedades o patologías? Pues para ello se estudian datos de estos GWAS de más de un millón de pacientes; ojo al dato también, o sea, es que son datos realmente relevantes, un millón de pacientes, esto importantísimo también, imposible hacerlo sin las herramientas de bioinformática, ¿vale? Esto es posible porque tenemos estas herramientas que nos lo permiten, pues tenemos datos de GWAS de un millón de pacientes y de ese millón de pacientes digamos que aparecen estos 14 trastornos. Para poder entender un poquito cuáles son los resultados tengo que recordar algunas cositas genéticas, algunos datos genéticos. Algunos conceptos. El primero es el concepto de locus genético. Un locus es una localización muy concreta del genoma que está asociado a un rasgo. Se puede entender también como variante SNP, Single Nucleotid Polymorphins o simplemente SNP. Otro concepto…
Significado #1 · Palabras #1
Héctor Socas introduce el tema de una relación entre desórdenes psiquiátricos y un mapa genético, expresando su interés en la conexión entre genética y trastornos mentales.
Habla: Héctor SocasSignificado #7 · Palabras #15genética y trastornos psiquiátricosmente como máquina compleja gastónconexión genética comportamiento humano…Bueno, venga, vamos entonces con el siguiente tema. ¿O queda algo que comentar sobre esto? No, que hable ahora o calle para siempre. A ver, Luisa, ¿cómo es esto de que hay una relación entre desórdenes psiquiátricos y un mapa genético que han hecho que conecta propensiones genéticas con trastornos psiquiátricos? Bueno, debo decir que no me sorprende, pero me interesa mucho, y además me gusta que haya estas cosas porque, y esto lo hemos hablado con Gastón, los que somos así como muy profundamente mecanicistas y reduccionistas sobre la mente, que al final es algo emergente de una máquina muy compleja, ¿no? Pues bueno, este tipo de conexiones entre la genética y las cosas que nos pasan en la cabeza, pues nos reafirman un poco en estas posiciones, mientras que la gente que ve la mente como algo más etéreo, espiritual, no sé, algo trascendente, humano, que no se puede convertir en un simple soporte material, pues a ver cómo explicas que lo que tienes en los genes afecte a... a cómo te comportas, a cómo piensas, a tu conducta, ¿no? Una cosita, Héctor: no íbamos a hablar del tema del 11M rápidamente, ya que tenemos a tres compañeras. ¿Cierto, cierto? Con lo bien que está bailado. Bueno, 11F, no 11M; 11F, venga, todas las letras. Y el 8M. Yo no sé, Luisa y Silvana, pero yo empiezo esta…
Luisa Achaerandio se muestra agradecida por ser redirigida y anuncia que va a hablar sobre las bases genéticas de alteraciones psiquiátricas, basándose en un artículo reciente publicado en la revista Nature.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #14 · Palabras #14bases genéticas alteraciones psiquiátricasartículo nature diciembrepaisaje genético 14 desórdenes psiquiátricosluisa achaerandio psicología genómica…el cero, ¿no? Eran los, eran, no estoy seguro: eran los babilonios los primeros que manejaban el cero o fueron los mayas. Sara, no, no me acuerdo. Por los árabes, ¿no fueron los árabes? Los árabes fueron, los trajeron. Los trajeron, sí, sí, Nefer, aclara. Invoquemos, invoquemos. Bueno, vayamos al grano: Luisa, cuéntanos tu tema de psicología genómica y cosas por el estilo. Pues me alegra que me haya reconducido, Francis. Muy chulo. Pues mira, vamos a hablar de bases genéticas de determinadas alteraciones psiquiátricas. Es un artículo de Nature del 10 de diciembre, hace poquito, del 25, y se titula, a ver, mi inglés no es el mejor del mundo, pero vaya, "Mapping the Genetic Landscape Across 14 Psychiatric Disorders", que se puede traducir como mapeando el paisaje genético alrededor o a través, basándose en 14 desórdenes psiquiátricos concretos, para ver si hay en efecto una base genética que los pueda relacionar o no. El autor es Andrew Grotzinger, espero haberlo pronunciado bien el apellido, y el trabajo está liderado por una cantidad de consorcios y de redes internacionales. Vaya, un consorcio a nivel genético; lo digo en general para los que a lo mejor no estáis tan…
Luisa Achaerandio explica el objetivo de un estudio reciente publicado en Nature sobre comorbilidad psiquiátrica y la necesidad de herramientas bioinformáticas para analizar los datos.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1patologías psiquiátricas y comorbilidaddepresión asociada esquizofreniaenfermedades psiquiátricas en mujerescomplejidad de las patologías psiquiátricascomorbilidad psiquiátrica y herramientas bioinformáticasbase genética común en patologías…pero sí que lo dice de palabras textuales: Aproximadamente la mitad de la población tendrá en algún momento de su vida un episodio de ansiedad, depresión u otro problema de salud mental que podría llegar a diagnosticarse por un profesional. Esto es, dime. Luisa, un segundo. Juan Carlos, nos tienes que dejar y no queremos que tenga algún problema psicológico por aguantar más de la cuenta. Siento que haya producido la interrupción, Luisa. Sí, venga, muchas gracias, chicos. Venga, un placer, nos vemos. Un placer. Venga, continúa, Luisa. Eso, pues yo creo que es muy impresionante este dato que acabo de decir. Y además las patologías psiquiátricas tienen otro problema, que causan con comorbilidad. Eso significa que se simultanean a la vez varios trastornos en una misma persona. Es decir, quien tiene depresión puede tener a lo mejor asociada una esquizofrenia. Además, las enfermedades psiquiátricas tienen otro añadido, que como las mujeres, voy a meter la cuña, a veces somos complejas y poco comprendidas. Por lo tanto, tienen menos como que se ocultan y a nivel social altera, afecta todo lo relativo con la enfermedad psiquiátrica o psicológica. Este paper responde a una pregunta central que es la siguiente: ¿existe una base genética común que explique esa comorbilidad psiquiátrica? ¿Hay algún nexo de unión entre estas enfermedades o patologías? Pues para ello se estudian datos de estos GWAS de más de un millón de pacientes; ojo al dato también, o sea, es que son datos realmente relevantes, un millón de pacientes, esto importantísimo también, imposible hacerlo sin las herramientas de bioinformática, ¿vale? Esto es posible porque tenemos estas herramientas que nos lo permiten, pues tenemos datos de GWAS de un millón de pacientes y de ese millón de pacientes digamos que aparecen estos 14 trastornos. Para poder entender un poquito cuáles son los resultados tengo que recordar algunas cositas genéticas, algunos datos genéticos. Algunos conceptos. El primero es el concepto de locus genético. Un locus es una localización muy concreta del genoma que está asociado a un rasgo. Se puede entender también como variante SNP, Single Nucleotid Polymorphins o simplemente SNP. Otro concepto…
Luisa Achaerandio describe la metodología utilizada en un estudio reciente publicado en Nature sobre trastornos psiquiátricos, explicando que se basa en bioinformática y estadística genética.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #3 · Palabras #2bioinformática y estadística genéticagwas en trastornos psiquiátricoscorrelación genética luis achaerandiofactores genéticos y desordenes psiquiátricostrastorno estrés postraumático y depresiónvarianza genética en esquizofrenia bipolarfactor internalizante y adiccionesp factor vulnerabilidad genéticapredisposición genética psicopatologíafactor inteligencia en trastornos psiquiátricosvulnerabilidad psiquiátrica globalgenes drd2 implicadosgen ncam1 relacionadogen ankk en vulnerabilidadgenes dopamina cromosoma 11alteraciones cromosoma 11 trastornos psiquiátricosclúster génico dopaminérgicos…un 0,4 sería normal y una cosa que me ha llamado la atención de este paper es que hay, por ejemplo, trastornos psiquiátricos que tienen una heredabilidad de 0,66. Por ejemplo se pueden mirar al final del artículo estos valores o sea que realmente bueno pues. Es curioso, tiene un peso; vale, la metodología, como ya decía, como ya había adelantado, está basada en el empleo de la bioinformática y la estadística genética basada en GWAS. No hay experimentos celulares ni cultivos; es un análisis genómico estadístico. Hay muchas herramientas; si queréis, las vemos en más profundidad después; pues si queréis preguntarme, pero básicamente utilizan correlación genética, solapomiento poligénico, correlación genética, quiero decir cosas que, y por supuesto análisis computacional, análisis funcional computacional. El hallazgo principal es que se identifican gracias a este análisis cinco factores genéticos, es decir, que todas estas enfermedades o desordenes psiquiátricos se pueden englobar en cinco tipos, ¿vale? Compulsivo, esquizofrenia bipolar, neurodesarrollo, es decir, TDHA, todo esto que conocemos, sobre todo en el ámbito educativo y factor internalizante, por ejemplo, el trastorno de estrés postraumático, depresión, ansiedad y las adicciones Es decir, que si tienes que ordenar los desórdenes psiquiátricos, en principio lo ordenas en estos cinco puntos ¿Y qué explican el 66% de la varianza genética? Esto está muy chulo ¿vale? O sea, realmente puedes englobar estos trastornos psiquiátricos en esta clasificación. Y lo que también me ha parecido muy chulo es que justo por encima se ha podido deducir o propone este artículo el P-factor, ¿no? Que es básicamente que por encima, a un nivel superior, aparece este concepto de P-factor, es decir, la vulnerabilidad genética general en psicopatología. Es decir, que no es que sea una enfermedad, sino que se establece un P-factor como si fuera el factor de inteligencia que te establece una predisposición genética general que aumenta la probabilidad de poder desarrollar distintos trastornos a lo largo de la vida, cosa que está muy chula. Es decir, tú puedes tener un P-factor de, yo qué sé, 3, yo de 4 y, bueno, pues ahí ya vamos viendo, ¿no? Entonces, es la idea de establecer como una cuantificación de la vulnerabilidad psiquiátrica global, ¿vale? Sobre la que luego fenotípicamente aparece el trastorno o se desarrollan trastornos concretos. A nivel del hotspot genético, es decir, ¿qué genes están implicados? Ojo, aquí tenemos algo que no nos sorprende a nadie porque son el DRD2, el NCAM1, el ANKK... Uy, perdón, esto es que no tiene muy buen oído, pero bueno, hay una serie de genes que están relacionados. Con la dopamina, ¿vale? En concreto y además que me parece increíble que sobre todo se encuentran en el cromosoma 11. Por lo tanto, cualquier alteración, tanto estructural como genética, como a nivel de ni en el cromosoma 11 relacionado con genes que están asociados o que son dopaminérgicos, es decir, que forman parte de este clúster génico o genético, oye, pues puede desembocar a la larga en un trastorno psiquiátrico. Cosa que me parece bastante interesante. Luego, si te vas a la figura 5, a los que queréis mirar el artículo, hay una figura que me parece increíble porque nada más que de un vistazo me ha llamado muchísimo la atención. A ver también vosotros cómo la interpretáis porque no sé, a mí me ha parecido…
Luisa Achaerandio explica cómo la vulnerabilidad psiquiátrica se relaciona más con la regulación emocional y el estrés que con los rasgos cognitivos, comparando esto con la dificultad de controlar la insulina.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #8vulnerabilidad psiquiátrica regulación emocionalregulación emocional estrés cognitivos achaerandiocontrol insulina expresión comportamientoreceptores dopaminérgicos y psicosisoligodendrocitos y estrés postraumáticoexpresión de receptores en células cerebralesdesarrollo temprano y cerebro fetalluisa achaerandio y receptores dopaminérgicosinhibidor selectivo serotonina transdiagnósticogenes clúster dopaminérgico y trastornoslectura crítica implicaciones terapéuticas p-factor…más que de un vistazo porque te aparece como una correlación genética te da la impresión porque te dice por arriba de un punto de inflexión están como los factores sociales y por debajo de ese punto de inflexión están estos factores, neuroticismo, intentos De suicidio. Entonces, como que a mí, lo puedo interpretar como que esta vulnerabilidad psiquiátrica se relaciona más con la regulación emocional y con el estrés que con rasgos cognitivos. Es decir, tú puedes ser una persona muy inteligente, pero oye, si tú no sabes gestionar tus emociones es más común, pues no sabes o no puedes, ojo, que yo siempre digo. Igual que a ti no te dicen que controles tu insulina, por favor, a lo mejor tampoco puedes controlar tan fácilmente la forma en la que tienes de expresarte o de comportarte, ¿vale? Y por eso también me parece súper relevante esta figura a nivel visual, simplemente, ¿vale? Por ese twist que te hace justo en ese punto, por lo menos no me ha dado tiempo de profundizar al máximo, pero me ha llamado mucho la atención. Luego, pues claro, si tú también analizas en bases genéticas donde se expresan este tipo de receptores dopaminérgicos, pues ves que los factores que están asociados a psicosis están más relacionados con neuronas excitadoras; los factores que están relacionados más con trastornos de estrés postraumático y demás, pues se expresan más en oligodendrocitos, es decir, que hay más desajuste genético o más expresión de determinados receptores ya localizados en diferentes células, que eso también está muy interesante. Y que esto ocurre sobre todo, estas tendencias ocurren en el cerebro fetal y desarrollo temprano, también muy chulo; o sea, me parece realmente interesante. Básicamente, ya terminando, tiene una implicación terapéutica clara: que es que, bueno, pues a nivel terapéutico, a lo mejor el inhibidor selectivo de la recaptación de la serotonina te puede servir de manera transdiagnóstica para diferentes manifestaciones clínicas, porque tú pensabas que a lo mejor para el TOC era una cosa y no podías darle la otra que le das a la esquizofrenia o, no sé, lo utilizas para la depresión, pero a lo mejor, oye, podemos abrir un poquito más el campo porque sabemos que en base afectan mucho los genes del clúster dopaminérgico. Ahora, no está exento de limitaciones, que también hay que ver una lectura crítica. La lectura crítica, y es una lectura bastante clara, eso creo que lo podemos deducir cualquiera; es que el predominio de la población es europea, en los datos, ¿vale? Eso se ve claramente. Aparte, que bueno, que los diagnósticos muchas veces están basados en…
Luisa Achaerandio plantea un problema con los diagnósticos actuales de trastornos mentales, sugiriendo que estos podrían no reflejar la organización biológica real de la psicopatología.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #4diagnósticos trastornos mentalesorganización biológica psicopatologíanosología psiquiátrica luisa achaerandio…eso es algo que suele ocurrir y que bueno es evidente porque esto tiene tirón, o sea quiero decir, esto puede tener bastante repercusión por todo lo que estamos diciendo. Con lo cual termino diciendo que puede establecer ese cambio de paradigma, porque los diagnósticos actuales están basados en un manual de diagnóstico de trastornos mentales, uno u otro, tienen diferentes siglas, y podía, bueno, pues yo creo que es un problema puesto encima de la mesa, que puede no reflejar esta organización biológica real de esta psicopatología, ¿no? Por lo tanto, es un trabajo que tiene bastante potencial para cambiar o para pensar sobre la nosología psiquiátrica, es decir, la descripción y diferenciación y clasificación de este tipo de enfermedades que, bueno, evidentemente están en gran parte muy poco comprendidas Muy Bien, muy bien, estupendo resumen. Yo, sí, súper bonito y súper interesante; o sea, y aunque correlación no implica causalidad, sí te dice por dónde intentar buscarla, ¿no? Entonces, te puede ayudar mucho a encontrar, muy interesante, y que me ha parecido muy…
Francis Villatoro explica cómo DeepMind ofrece resultados comparables a otras herramientas de inteligencia artificial disponibles para bioquímicos.
Habla: Francis VillatoroSignificado #9deepmind para bioquímicaentorno de genes con deepmindgenes relevantes con deepmind…falta avanzar mucho en humano y en ratón para que esto sea útil. Pero la ventaja que tenemos es que se ha validado con todos los softwares de inteligencia artificial que están disponibles y lo que se ha observado es que esta inteligencia artificial única de DeepMind en todas las respuestas da resultados comparables a todas las demás herramientas, con lo que cuando un bioquímico normalmente tenía que usar dos o tres herramientas, pues quiero ver en este: tengo un gen o un par de genes y quiero ver el entorno entre ellos, qué zonas son relevantes, regulatorias o no. Pues uso una técnica para ver el tema del splicing, para ver cómo qué tipo de variante de ese gen producen diferentes proteínas, qué tipo de transcriptos genero. Tengo otra técnica para ver, pues, posibles lugares donde se acoplan factores de transcripción de…