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Silvana TapiaLuisa AchaerandioJuan Carlos GilFrancis VillatoroBorja TosarHéctor Socassilvana tapia y criterios e colisecuenciación masiva identifica bacteriasidentificación de bacterias laboratoriotaxonomía bacteriana está cambiandocaracterísticas propiedades observablesfenotipo bacteriano como criteriotaxonomía bacteriana dando vuelcocriterios moleculares en bacteriasgenomas distintos con fenotipos similarescomparación de genomas bacterianosespecie nueva con diferencia del 3subespecies y cepas concretasbacterias aisladas de diferentes nichosdiferenciación de cepas bacterianasfenotipos de cepas diferentesgenes del 3 en especiesgenoma bacteriano 3 diferenteclasificación bacteriana no transitivaespecies bacterianas y porcentajes de similitudclasificación bacteriana evolucionagenomas comparados cuestionan especiee coli y salmonella como mezclasconcepto de especie se desdibujaSilvana TapiaE. coliSalmonellaJuan Carlos GilPlaca de PetriBacteriasNutrientesLuisa AchaerandioClorofila*E. coli*Zepa X
Clasificación bacteriana evoluciona
Con
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Silvana Tapia explica cómo, hasta hace poco tiempo, la identificación de bacterias se basaba en sus características y propiedades observables en el laboratorio.
…estamos aquí todos juntos en tertulia y que, por supuesto, cualquiera se sienta libre de intervenir y aportar algo cuando consideren, ¿no? aunque en este caso la pregunta iba dirigida específicamente a Silvana pero que les animo a cualquier cosa que quieran. De hecho, yo quería preguntar a Silvana si hay un criterio para considerar que mi E. coli ya mutada o variada o estropeada ya no es E. coli, ¿que ha cambiado la especie? Pues ahora mismo, claro, además los criterios han ido cambiando porque bueno, conforme han ido evolucionando las tecnologías, sobre todo de secuenciación masiva, pues hoy en día prácticamente identificamos a las bacterias cogiendo su genoma y secuenciándolo y comparándolo con otros que han subido otros investigadores antes a ciertas bases de datos, pero antes. Y estoy diciendo hace muy poquitos años se hacía simplemente pues viendo cómo se comportaba esa bacteria. Si tú aislabas una bacteria en el laboratorio y tenía una serie de características o de propiedades, luego aislabas otra en otro entorno y tenía las mismas características que la primera, decías bueno pues es la misma especie. Y hoy en día por eso digo que la taxonomía bacteriana está cambiando totalmente porque ahora qué criterio utilizamos para decir que una bacteria es de la misma especie que la otra y hemos visto que por esas características que llamamos el fenotipo no nos sirve porque hay dos bacterias que pueden hacer lo mismo en una circunstancia pero luego tener genomas totalmente diferentes entonces ese criterio se está abandonando y la taxonomía bacteriana que es la que pone nombres a cada grupo bacteriano pues está dando pues un vuelco tremendo y no está cambiando toda la taxonomía y hoy en día pues se siguen criterios moleculares. Cuando una bacteria se comparan los genomas y son diferentes en un 3% de ese genoma, ya podemos considerar que estamos ante una especie nueva. Luego hay pequeñas particularidades dentro de ese porcentaje; bueno pues luego dependiendo de otros criterios se dice si es una subespecie o si es una cepa concreta. Cepas son pequeñas características, por ejemplo nosotros hemos aislado una misma bacteria pero de nichos o de entornos diferentes el simple hecho que una bacteria aguante en un nicho por ejemplo una temperatura y ahora yo la encuentro a otra temperatura totalmente diferente aunque yo sepa que es la misma especie digo que son dos cepas diferentes porque bueno pues tienen características particulares dentro de ese pequeño 3% que hace que un aguante por ejemplo a 4 grados y la otra 40 grados entonces bueno hoy en día se utilizan sobre todo criterios moleculares aunque todavía pese a ese 30% que nos dan de margen decir bueno pues si hay diferencia en ese 3% de genes ya estamos hablando de una especie diferente y luego todavía seguimos teniendo en cuenta pues algunas características fenotípicas pero como digo eso está en constante cambio y más ahora pues con las técnicas moleculares que tenemos que son capaces de afinar muchísimo más. Bueno, pues total que es cuestión de sepas, para que lo sepa Iba a complicar un poco la situación, me ha recordado Los dados no transitivos. ¿Es posible que una bacteria tenga un genoma 3% diferente a otra? La primera con una tercera y la B y la C, que por casualidad no, quiero decir: ¿es no transitivo el hecho de pertenecer a distintas especies? De hecho, había un autor que dice que en el futuro seguramente no podamos asignar un solo nombre a una bacteria, sino que sea por distinto porcentaje debido al parecido que tenga con otras bacterias. Es decir, que a lo mejor no podemos decir en el futuro que tengamos una E. coli, sino una bacteria 50% E. coli, 50% Salmonella, por decir dos nombres así al azar. Hay autores que proponen eso, que no hay una especie como tal, sino que pueden ser mezclas; el genoma puede tener bastante porcentaje de similitud a otros grupos básicos. O sea, eso, el concepto de especie en biología real pues se desdibuja, claro. Claro, totalmente; en microbiología el concepto de especie real es bastante diferente. Bueno, Vamos con la siguiente pregunta, no está mal para empezar. Nos pregunta Víctor: ¿qué son los priones? ¿Se pueden considerar la forma de vida más simple, incluso más que los virus? Luisa, por ejemplo, ¿quieres decirnos algo? Sí, yo lo primero dar las gracias a…
Significado #1
Silvana Tapia explica cómo la bacteria E. coli puede formar parte de la microbiota sin causar problemas y aborda la complejidad de la taxonomía microbiana.
Habla: Silvana TapiaSignificado #6bacteria e coli en microbiotataxonomía microbiana complejamultiplicación rápida de colicélula hija cada 20 minutos…formaba parte de la microbiota beneficiosa, pero ahora no sé si siempre es perjudicial. No, efectivamente, forma parte de la microbiota; lo único que hay unas cepas que son particularmente peligrosas o que están asociadas a ciertas enfermedades, pero que E. Coli es una especie que está habitualmente formando parte de la microbiota sin ningún tipo de problema. Hay que explicar y bueno, el tema de la taxonomía microbiana es un poquito compleja porque no funciona igual que con el resto de organismos. Una bacteria se puede multiplicar o sea, hace generaciones de sí misma. En el caso por ejemplo de coli, que es una de las que en el laboratorio en condiciones controladas tiene una multiplicación más rápida, con una multiplicación rápida puedo decir que cada 20 minutos se produce una célula hija; es decir, donde hay dos a los 20 minutos, 4, 8, 16 de forma exponencial. Esto hace que, bueno, pues como todas proceden de una misma célula. Por divisiones, como si se hicieran fotocopias, se le pone un nombre, *Escherichia coli* en este caso. En el caso de los seres humanos, nosotros, bueno, pues nuestras generaciones son muy diferentes a nosotros por los procesos de división celular, de meiosis,…
Silvana Tapia explica cómo *E. coli* ha adquirido nuevas características y propiedades a lo largo de su evolución debido a errores en la división celular.
Habla: Silvana TapiaSignificado #11e coli subespecie zepa xmultiplicación de e coli y evoluciónerrores en división celular e coli…sería el cromosoma el genoma y esto puede hacer que esa bacteria tenga una propiedad diferente que no tenía las anteriores, si esa propiedad hace que esa bacteria se comporte o esa célula se comporte diferente a las células de las cuales procedía, pues se. Habla ya de subespecie, E. coli subespecie, tal cosa, o Zepa X, y eso es lo que ha pasado con E. coli: que a lo largo de las numerosas multiplicaciones que ha podido sufrir a lo largo de la evolución, pues ha ido adquiriendo nuevas características, que le han dado propiedades nuevas. Hay algunas, por ejemplo, no sé si nos suena, por ejemplo, una E. coli que puede ser entero hemorrágica, que es aquella que produce la toxina chiga, que es una de las más peligrosas de las E. coli más peligrosas que existen ahora mismo; que una persona se…
Silvana Tapia explica cómo, hasta hace poco tiempo, la identificación de bacterias se basaba en sus características y propiedades observables en el laboratorio.
Habla: Silvana TapiaSignificado #1silvana tapia y criterios e colisecuenciación masiva identifica bacteriasidentificación de bacterias laboratoriotaxonomía bacteriana está cambiandocaracterísticas propiedades observablesfenotipo bacteriano como criteriotaxonomía bacteriana dando vuelcocriterios moleculares en bacteriasgenomas distintos con fenotipos similarescomparación de genomas bacterianosespecie nueva con diferencia del 3subespecies y cepas concretasbacterias aisladas de diferentes nichosdiferenciación de cepas bacterianasfenotipos de cepas diferentesgenes del 3 en especiesgenoma bacteriano 3 diferenteclasificación bacteriana no transitivaespecies bacterianas y porcentajes de similitudclasificación bacteriana evolucionagenomas comparados cuestionan especiee coli y salmonella como mezclasconcepto de especie se desdibuja…estamos aquí todos juntos en tertulia y que, por supuesto, cualquiera se sienta libre de intervenir y aportar algo cuando consideren, ¿no? aunque en este caso la pregunta iba dirigida específicamente a Silvana pero que les animo a cualquier cosa que quieran. De hecho, yo quería preguntar a Silvana si hay un criterio para considerar que mi E. coli ya mutada o variada o estropeada ya no es E. coli, ¿que ha cambiado la especie? Pues ahora mismo, claro, además los criterios han ido cambiando porque bueno, conforme han ido evolucionando las tecnologías, sobre todo de secuenciación masiva, pues hoy en día prácticamente identificamos a las bacterias cogiendo su genoma y secuenciándolo y comparándolo con otros que han subido otros investigadores antes a ciertas bases de datos, pero antes. Y estoy diciendo hace muy poquitos años se hacía simplemente pues viendo cómo se comportaba esa bacteria. Si tú aislabas una bacteria en el laboratorio y tenía una serie de características o de propiedades, luego aislabas otra en otro entorno y tenía las mismas características que la primera, decías bueno pues es la misma especie. Y hoy en día por eso digo que la taxonomía bacteriana está cambiando totalmente porque ahora qué criterio utilizamos para decir que una bacteria es de la misma especie que la otra y hemos visto que por esas características que llamamos el fenotipo no nos sirve porque hay dos bacterias que pueden hacer lo mismo en una circunstancia pero luego tener genomas totalmente diferentes entonces ese criterio se está abandonando y la taxonomía bacteriana que es la que pone nombres a cada grupo bacteriano pues está dando pues un vuelco tremendo y no está cambiando toda la taxonomía y hoy en día pues se siguen criterios moleculares. Cuando una bacteria se comparan los genomas y son diferentes en un 3% de ese genoma, ya podemos considerar que estamos ante una especie nueva. Luego hay pequeñas particularidades dentro de ese porcentaje; bueno pues luego dependiendo de otros criterios se dice si es una subespecie o si es una cepa concreta. Cepas son pequeñas características, por ejemplo nosotros hemos aislado una misma bacteria pero de nichos o de entornos diferentes el simple hecho que una bacteria aguante en un nicho por ejemplo una temperatura y ahora yo la encuentro a otra temperatura totalmente diferente aunque yo sepa que es la misma especie digo que son dos cepas diferentes porque bueno pues tienen características particulares dentro de ese pequeño 3% que hace que un aguante por ejemplo a 4 grados y la otra 40 grados entonces bueno hoy en día se utilizan sobre todo criterios moleculares aunque todavía pese a ese 30% que nos dan de margen decir bueno pues si hay diferencia en ese 3% de genes ya estamos hablando de una especie diferente y luego todavía seguimos teniendo en cuenta pues algunas características fenotípicas pero como digo eso está en constante cambio y más ahora pues con las técnicas moleculares que tenemos que son capaces de afinar muchísimo más. Bueno, pues total que es cuestión de sepas, para que lo sepa Iba a complicar un poco la situación, me ha recordado Los dados no transitivos. ¿Es posible que una bacteria tenga un genoma 3% diferente a otra? La primera con una tercera y la B y la C, que por casualidad no, quiero decir: ¿es no transitivo el hecho de pertenecer a distintas especies? De hecho, había un autor que dice que en el futuro seguramente no podamos asignar un solo nombre a una bacteria, sino que sea por distinto porcentaje debido al parecido que tenga con otras bacterias. Es decir, que a lo mejor no podemos decir en el futuro que tengamos una E. coli, sino una bacteria 50% E. coli, 50% Salmonella, por decir dos nombres así al azar. Hay autores que proponen eso, que no hay una especie como tal, sino que pueden ser mezclas; el genoma puede tener bastante porcentaje de similitud a otros grupos básicos. O sea, eso, el concepto de especie en biología real pues se desdibuja, claro. Claro, totalmente; en microbiología el concepto de especie real es bastante diferente. Bueno, Vamos con la siguiente pregunta, no está mal para empezar. Nos pregunta Víctor: ¿qué son los priones? ¿Se pueden considerar la forma de vida más simple, incluso más que los virus? Luisa, por ejemplo, ¿quieres decirnos algo? Sí, yo lo primero dar las gracias a…
Silvana Tapia describe una imagen navideña creada con cultivos bacterianos en una placa de Petri, explicando cómo se realizó utilizando la fluorescencia de actividad bacteriana.
Habla: Héctor SocasPalabras #9imagen navideña cultivos petrifluorescencia actividad bacteriana silvana tapiacultivo bacterias emitiendo fluorescencia…constancia, no sé si existe realmente este color con ultravioleta, ¿no? Si se puede, bueno, no sé si, ah sí, sí, sí, con la clorofila, con la clorofila de Luisa. Espera, déjame primero para los oyentes describir a qué se está refiriendo Luisa ahora mismo. porque tiene puesto en su fondo una especie de imagen navideña que está hecha con cultivos en una placa de Petri y nos está explicando ahora cómo lo ha hecho pero que se ve pues la estrella de Navidad, un árbol de Navidad y como unos copos de nieve todo muy navideño pero hecho al parecer según nos está diciendo con la fluorescencia de actividad bacteriana ahí en ese cultivo Con bacterias que emiten fluorescencia cuando tienen nutrientes, es una platita con nutrientes y ella simplemente ha extendido una bacteria que cuando ha empezado a consumir esos nutrientes da fluorescencia Nosotros en el laboratorio tenemos a Vibrio Fischeri, que es una bacteria marina que también produce bioluminescencia de color azul en oscuridad más que para darle luz y luego hay en la naturaleza un montón de bacterias con pigmentos de todos los colores,…