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Bacteria sintética Craig Venter
Con
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Francis Villatoro explica cómo Craig Venter buscó llamar la atención de los medios a través de pequeños hitos en su investigación, como la creación de la primera bacteria sintética.
…de 500; y apagar y encender, pues es una barbaridad: son 2 elevado a 500, eso son, no hay átomos en el universo para cada una de las opciones; el universo tiene 10 a 80 átomos, 2 elevado a 500 es una barbaridad, no os hago el cálculo para que no os asustéis. entonces un problema que parecía súper sencillo se convirtió tremendamente complicado y requería cada vez más inversión; y como requería cada vez más inversión decidió empezar a plantearse llamarle mucho la atención de los medios con pequeños hitos: vamos a hacer la primera bacteria sintética, y la primera bacteria sintética sí, vamos a sintetizar átomo a átomo pues cada uno de los aminoácidos de los nucleótidos del ADN de esta bacteria y vamos a meterle un ADN completamente sintético. Así, pero el resto de la bacteria es normal; ya, ya, sí, es normal. Cogemos una bacteria sencillita, le quitamos su ADN, fabricamos en laboratorio con síntesis química una molécula de ADN suficientemente larga y se la colocamos: primera bacteria sintética. En esa bacteria sintética, ¿cómo se sabe que es sintética? Bueno, pues porque le hemos puesto una dirección de una página web, porque le hemos puesto mi nombre; a Venter le encantó. Uno de los genomas que secuenció varios en la iniciativa privada fue el propio genoma de Venter. Venter puso su nombre en muchas cosas de las que hizo, y entonces bueno, eso le volvió famoso porque lo convirtió en una especie como de nuevo Prometeo, de creador de la vida, como el doctor Frankenstein. Cosas tan sencillas como sintetizar un ADN y ponerlo, ¿vale? La ventaja de la química, Juan Carlos aquí es el experto, es que una molécula es una molécula. La sintetice de manera natural una bacteria o la sintetice un químico en un laboratorio: la molécula es…
Significado #1 · Palabras #3
Héctor Socas introduce los temas que se tratarán en el episodio actual, incluyendo descubrimientos en Marte y la figura de Craig Venter, además de anunciar la disponibilidad de episodios anteriores en su página web.
Habla: Héctor SocasPalabras #13descubrimientos marcianos recientesritmos circadianos y envejecimientohorizontes de agujeros negrosfigura del fallecido craig venterepisodios anteriores señalirruido com…menos esto de situarnos en la galaxia. En fin, lo importante es que estamos aquí y ahora y estamos juntos en este pedacito de espacio-tiempo portátil que llamamos Coffee Break, Señal y Ruido, la tertulia de cada semana sobre la actualidad de la ciencia. Hoy Hablaremos de telarañas y de los nuevos descubrimientos en Marte, de la relación entre los ritmos circadianos y el envejecimiento, de los horizontes de agujeros negros y hasta de una curiosidad matemática. Y sí, recordaremos la figura del recientemente fallecido Craig Venter. Ya saben que tenemos una página web que es señalirruido.com; en esa web está toda la información de todos los episodios anteriores, los 500, perdón, 556 anteriores y este número 557. Bueno, no sé, estaba intentando decir el ordinal pero no me sale, en cientos, ¿no? ¿Cómo es el ordinal de 500? Quincuagentésimo, quincuagésimo, séptimo, lo he tenido que comprobar. Gracias Ignacio. Ignacio y al rescate. Bueno, que lo he dicho, que tienen ahí los 557 episodios y toda la información, todas las referencias de todos los temas que tratamos cada semana,…
Héctor Socas invita a Francis Villatoro a hablar sobre Craig Venter, destacando su figura como un científico que combina la tecnología y la ciencia básica.
Habla: Francis VillatoroPalabras #7fallecimiento de craig venterconversación sobre craig venterfalta de tiempo en la tertuliacraig venter y el premio nobelimportancia científica de craig venterciencia ficción en trabajos de ventercraig venter científico tecnólogotecnología de identificación de genescraig venter fallecido en 1946…ve el cielo azul, pero hace un rato cuando estaba en la calle estaba nublado, o sea que, y nada, estamos bastante bien en Málaga y con muchas ganas de disfrutar de la tertulia, con todos vosotros. Hoy muy numerosa. Sí, me he ocurrido ahí, pero bueno, a gusto. Bueno, pues venga, vamos entonces al lío que tenemos mucho y variado. La semana pasada ya les adelantamos el fallecimiento de Craig Venter y dijimos que hablaríamos un poquito más del tema. Pero bueno, como nos suele pasar, al final nos quedamos sin tiempo y no tuvimos ocasión de volver a retomar ese asunto, así que lo vamos a hacer. Hoy hubo gente que se preocupó, tranquilo, no estamos hablando de Vender, el de Futurama sino Venter con V, Venter, con V y T, Venter, que como decíamos fue una persona de la que se ha hablado incluso en conversación de premio Nobel y bueno, hizo muchas cosas muy alucinantes, algunas más serias y otras casi casi rayando la ciencia ficción. entonces quizás Francis, si quieres empezar a hablar un poco y contarnos un poco la figura de este científico tan ilustre que nos ha dejado. Sí, Craig Venter es de estos científicos que están a la mitad entre lo que sería un tecnólogo, un gurú de la tecnología y lo que es un científico de ciencia básica. Craig Venter es eso, muy famoso en la década de los 80. Hay que recordar que él ha fallecido con 79 años, nació en 1946 en Estados Unidos y en la década de los 80 desarrolló una tecnología para identificar genes con pequeñas etiquetas. Esto, hay grandes diferencias, pero grosso modo es parecido a Lo que hace la PCR, que se volvió muy famosa con la COVID, teníamos unos pequeños trozos que identificaban diferentes genes o proteínas del coronavirus y entonces detectando esos trocitos en una muestra, por ejemplo, de saliva de una persona, podíamos saber…
Francis Villatoro explica que el hito de secuenciar el primer genoma completo en 1995 fue importante, pero lo que realmente hizo famoso a Craig Venter fue desarrollar un instituto privado llamado Craig Venter Institute (JCVI).
Habla: Francis VillatoroPalabras #5craig venter instituto jcvihito genómica secuenciación primer genoma…que fue todo un hito en 1995 lograr secuenciar de manera completa un organismo, aunque es un organismo obviamente muy sencillito. El influencer hemofílico es la... Básicamente, influenza viene de gripe. Aemophilus influenzae. La influenza se conoce. La gripe. Entonces, este hito fue un hito que, digamos, entre comillas, lo coloca en la historia de la genómica; pero realmente lo que le hizo muy, muy famoso fue desarrollar con una empresa privada, que era básicamente el... Craig Venter Institute, el instituto de Craig Venter, ¿no? Se suele conocer por las siglas porque él era John Craig Venter, o JCVI. Esto actuaba como un instituto privado, es decir, básicamente como Una empresa, si queréis una empresa sin ánimo de lucro, pero básicamente no era una institución científica per se. Y con este instituto decidió, digamos, poder empezar a, entre comillas, comercializar el secuenciar cosas. Pero claro, en los 90 había una gran…
Francis Villatoro explica cómo Craig Venter aprovechó su técnica de shotgun para secuenciación y creó Celera Genomics, una empresa con gran financiación para competir con el Proyecto Genoma Humano.
Habla: Francis VillatoroPalabras #20shotgun de venter y celera genomicssecuenciación del genoma humano por celerajcvi y técnica shotgun de ventercelera genomics frente al proyecto genoma…húmedas, demasiado de laboratorio, ir secuenciando poco a poco ese gran trozo. Partirlo en trozos grandes y secuenciar esos trozos y tener garantías siempre de que lo estás haciendo en el orden adecuado y que tienes una muy buena localización de ese trozo. Eso, bueno, era un proyecto que en principio era lento, fue avanzándose en las tecnologías de secuenciación y fue acelerándose y ya alrededor del año 2000 ya estaba a buen ritmo e incluso llegó a utilizar las técnicas de shotgun de perdigonazos de Venter y Venter vio que podía, en paralelo a lo que estaba haciendo con su empresa, su instituto JCVI, podía crear una empresa bien financiada, la creo muy tarde, Celera Genomics, es del 98, con muy buena financiación para utilizar su técnica de secuenciación, de shock gun, para secuenciar el genoma humano. y hacer una iniciativa privada en paralelo a la iniciativa pública y que quizás pudiera vencer a la iniciativa pública. ¿Qué problema tenía la técnica shotgun? Pues la técnica shotgun tiene el problema de que realmente no sabe lo que está secuenciando ni dónde está, ¿vale? Hay una enorme cantidad, por ejemplo, las zonas repetitivas. Tú como una zona repetitiva AT, AT, AT, AT,…
Francis Villatoro describe las críticas recibidas por Craig Venter y Celera Genomics, quienes fueron acusados de aprovechar los avances del Proyecto Genoma Humano público.
Habla: Francis VillatoroPalabras #19aprovechamiento del proyecto genoma humano públicoresquemor entre comunidades genómicastemor a publicación anticipada de venter…dónde está este gen? Pues había que esperar a que la Iniciativa Pública encontrara parte de ese gen porque en el momento en el que encontrara parte del gen tú ya rápidamente colocabas tu gen en su sitio; eso desde el punto de vista de la Iniciativa Pública. fue digamos muy criticado había mucha gente diciendo es que este señor nos está pisando es que este señor si no existiéramos nosotros él no podría hacer nada y lo está haciendo gracias a nosotros entonces eso generó cierto resquemor y como ahí estaba metido toda la comunidad pues entre todas las comunidades genómicos que se dedicaban al tema de genes humanos pues todos estaban así con un poquito con la mosca de la oreja, ¿no? Haría un cierto temor. ¿Y si él, que está haciendo esto, publica el genoma completo tres meses antes que nosotros? Entonces, ¿debe la iniciativa pública a hablar Collins con Venter? Y decirle, mira, señor, vamos a ponernos de acuerdo y lo publicamos en el mismo momento, ¿no? Claro, el problema que tenía publicar el genoma humano es que es como todo la... Tú ves el fondo cómico microondas y tienes una única imagen. Tú ves el genoma humano…
Francis Villatoro explica la actitud de Craig Venter tras la secuenciación del genoma humano, indicando que este esperaba recibir un premio Nobel y decidió cambiar de rumbo en su investigación.
Habla: Francis VillatoroPalabras #11premio nobel y craig ventersequenciación del genoma humanocambio de rumbo investigación venter…genoma humano, que se ha ido avanzando, se ha ido mejorando; había muchos problemas en ese, era un borrador, realmente era un borrador, no era una versión realmente definitiva. Ahora tenemos versiones mucho mejores, ¿no? Algunas publicadas recientemente. Pero ¿qué hizo Venter? Venter dijo, el premio Nobel me lo van a dar. Así que yo, a mí esto ya no me importa, me importa un comino. Yo voy a dedicar a otro tema. ¿Y cuál es el tema que a principios de los 2000 se puso de moda? alrededor del año 2000 se puso de moda la biología sintética. Básicamente por investigadores japoneses publicaron la idea de que era necesario y fundamental para el futuro de la humanidad que fuéramos capaces de hacer ingeniería de genes rigurosa y utilizando…
Francis Villatoro explica la motivación detrás del trabajo de Craig Venter en biología sintética: crear bacterias con un número mínimo de genes para utilizarlas como fábricas especializadas.
Habla: Francis VillatoroSignificado #2 · Palabras #2bacterias como fábricas de biocombustiblesfotosíntesis artificial para bacteriasbiología sintética en los años 2000aplicaciones prácticas de biología sintéticabacterias como fábricas especializadasgenomas mínimos de bacteriagenes esenciales para la vida bacterianafabricación de penicilina por bacteriascraig venter y biología sintéticabacterias sencillas para biología sintéticacontrol de bacterias evita problemas sanitariosgenes esenciales en bacterias muy sencillassecuenciación de bacterias más sencillas…Es decir, gente que venía de empresas tipo Toshiba, que tenía una formación básicamente ingenieril, dijo, me meto en un campo que lo voy a crear yo, que es la biología sintética, en el que vamos a aplicar la filosofía de la ingeniería al mundo de los genes. Y vamos a crear bacterias que sean fábricas de cosas, por ejemplo de combustibles, de biocombustibles, por ejemplo de fármacos; bacterias que vivan con energía, con fotosíntesis artificial, que vivan con la energía del sol, crear una revolución absoluta. Claro, eso también se vendió a principios de los 2000 como que iba a ser una cosa inminente y que esto era trivial y que en 20 años íbamos a tener una cantidad de aplicaciones prácticas y una milmillonada de generación de... y ahora mismo pues estamos todavía en eso; se ha ganado mucho dinero con eso, pero todavía estamos muy verdes y todavía queda mucho por hacer, ¿no? Craig Venter se dedicó a esa parte de biología sintética a tratar de construir genomas mínimos, es decir, determinar cuál es el número mínimo de genes, los llamados genes esenciales, que permiten que una bacteria viva. ¿Para qué? Para que esa bacteria viva y nada más. Porque a mí me interesa como fábrica. Yo quiero que esta bacteria fabrique, yo qué sé, penicilina, por decir algo, una barbaridad. Pues para que fabrique penicilina yo quiero que esa bacteria se dedique 24 horas, 7 días a la semana a fabricar penicilina; que viva para fabricar penicilina, que viva, que sobreviva, que no se me muera, que se reproduzca para que los que se mueran sean sustituidas; que tenga lo mínimo imprescindible para estar viva, pero que solamente se dedique a fabricar lo que yo quiero. entonces la idea es, pues coge una bacteria muy sencilla, una bacteria tan sencilla que solo en un entorno muy controlado Eso sí, hay que evitar que se te escape, o se me escapa, problema sanitario, ética, científica, aquí vamos a matar a la gente, no, no, esto tiene que ser una cosa tan sencilla que vive en un entorno en el que si yo la saco de ese entorno, automáticamente muere O sea, usar una bacteria muy sencilla era clave, entonces se dedicó a secuenciar las bacterias más sencillas y empezó a trabajar con esas bacterias y una vez que tenía controlado más o menos Esto también se pensaba que era muy fácil, ¿vale? Que iba a ser muy fácil determinar los genes esenciales. Básicamente se utilizaba la técnica que se utilizaba de toda la vida desde poco después del ADN, que es ir apagando y encendiendo genes. Claro, pensaban que una bacteria mínima tendría 200 genes. Resulta que no, que tiene del orden de 500; y apagar y…
Francis Villatoro explica cómo Craig Venter buscó llamar la atención de los medios a través de pequeños hitos en su investigación, como la creación de la primera bacteria sintética.
Habla: Francis VillatoroSignificado #1 · Palabras #3bacteria sintética craig ventersíntesis química de nucleótidosprimer adn completamente sintéticocraig venter busca atención mediosbacteria sintética con dirección webgenoma de venter iniciativa privadaventer prometeo creador de vidanombre de venter en bacterias…de 500; y apagar y encender, pues es una barbaridad: son 2 elevado a 500, eso son, no hay átomos en el universo para cada una de las opciones; el universo tiene 10 a 80 átomos, 2 elevado a 500 es una barbaridad, no os hago el cálculo para que no os asustéis. entonces un problema que parecía súper sencillo se convirtió tremendamente complicado y requería cada vez más inversión; y como requería cada vez más inversión decidió empezar a plantearse llamarle mucho la atención de los medios con pequeños hitos: vamos a hacer la primera bacteria sintética, y la primera bacteria sintética sí, vamos a sintetizar átomo a átomo pues cada uno de los aminoácidos de los nucleótidos del ADN de esta bacteria y vamos a meterle un ADN completamente sintético. Así, pero el resto de la bacteria es normal; ya, ya, sí, es normal. Cogemos una bacteria sencillita, le quitamos su ADN, fabricamos en laboratorio con síntesis química una molécula de ADN suficientemente larga y se la colocamos: primera bacteria sintética. En esa bacteria sintética, ¿cómo se sabe que es sintética? Bueno, pues porque le hemos puesto una dirección de una página web, porque le hemos puesto mi nombre; a Venter le encantó. Uno de los genomas que secuenció varios en la iniciativa privada fue el propio genoma de Venter. Venter puso su nombre en muchas cosas de las que hizo, y entonces bueno, eso le volvió famoso porque lo convirtió en una especie como de nuevo Prometeo, de creador de la vida, como el doctor Frankenstein. Cosas tan sencillas como sintetizar un ADN y ponerlo, ¿vale? La ventaja de la química, Juan Carlos aquí es el experto, es que una molécula es una molécula. La sintetice de manera natural una bacteria o la sintetice un químico en un laboratorio: la molécula es…
Francis Villatoro explica cómo la gente con animadversión hacia Craig Venter, a quien describe como un enemigo y un diablo, se negó a nominarlo para un Premio Nobel en relación con el Proyecto Genoma Humano.
Habla: Francis VillatoroPalabras #14animadversión hacia craig ventercraig venter y proyecto genoma humanonominación de collins por genomo amanofallecimiento de venter y premio nobel…un campo afín. Entonces, todos los que pueden hacer candidaturas, nominar a candidatos a un premio Nobel por el proyecto Genoma Humano, son personas que en los 90 estuvieron trabajando para el proyecto Genoma Humano y esas personas son personas que le tenían. Mucha tirria a Venter, el odioso enemigo, el diablo, el que nos quiere robar la fama. Entonces no vamos a nominar a Collins y a Venter, a Collins el guapo dios y a Venter el demonio, el feo; no, no, no, no porque entonces le dan el premio al feo y no queremos que esto no se puede consentir. Ahora que ha fallecido Venter es posible que mucha de esa gente el año que viene, en enero, nomine a Collins por el proyecto Genomo Amano; en enero, el año que viene, aprovechando el fallecimiento de este año de Venter. Las nominaciones de este año ya pasaron, fueron en enero; estamos en mayo, entonces es posible que para el año que viene haya un premio Nobel al proyecto Genomo Amano. Una pregunta, sabemos que el premio Nobel se puede dar como máximo a tres personas, ¿no? Y ya Francis nos ha desvelado quién es el bueno y quién es el feo, quién es el malo en la historia. Bueno, aquí en principio puede haber mucha gente, ¿no? No, quiero…
Francis Villatoro continúa su reflexión sobre James Watson, explicando que este tiene una imagen pública negativa, a pesar de haber sido director del proyecto Genoma Humano antes que Craig Venter.
Palabras #16imagen pública negativa james watsondirector proyecto genoma humano watson…otro personaje que aparece vemos a Collins y el siguiente nombre es Watson, ¿por qué? Porque hemos oído hablar mucho de él, porque ya tiene un premio Nobel, recordemos eso, y darle un segundo sería extraño, puede pasar, pero recordemos que es atípico y porque Tiene muy mala prensa, muy merecida; el malo le vale por eso como apelativo y también le hace un poquito más difícil que se reconozca su peso a pesar de haber sido también director del proyecto Genome Humano previamente a la entrada de Venter. Sobre Collins y acabo esta intervención que no quería que fuera demasiado larga. Francis ya lo ha dejado caer para todos los que Más o menos sepan de qué va el premio ese, pero es cierto que algunos no lo conocerán y Collins se ha acercado de forma muy explícita a la apología de la religión, del cristianismo además, durante los últimos años. No como algo personal, como una experiencia…
Tras reflexionar sobre la posibilidad de un Premio Nobel para Francis Collins, Héctor Socas abre el debate a comentarios finales sobre Craig Venter, destacando sus contribuciones visionarias y el alto nivel de vida que disfrutó como líder de una empresa científica.
Habla: Héctor SocasPalabras #18premio nobel para francis collinscontribuciones visionarias de craig ventercraig venter líder de empresa científica…Nobel, vamos a darle la mitad, no es habitual en la historia, es verdad que en los últimos años ha sido muy muy excepcional que le den el premio Nobel a una única persona, pero ha habido algún que otro caso Bueno, pues venga, vamos a ir pasando de tema, si Les parece. ¿Alguien quiere decir, quiere hacer algún último comentario sobre este asunto? Si no, pues nada, descanse en paz Craig Venter. Gracias por toda una vida de contribuciones y de ser un visionario y de hacernos avanzar. Bueno, y eso recordar que este tipo de visionarios que tienen empresas que reciben mucha financiación, al final viven muy bien, quiero decir, son científicos que viven con un nivel de vida muy superior al de un científico promedio ¿eh? y es verdad que dicen que ha sido una persona muy trabajadora y que el centro de su vida era el trabajo, pero también ha tenido dinero suficiente para disfrutar él y su familia de todo lo que implica ser el líder y fundador de una gran empresa. Bueno, hablando de gente que tiene dinero, de su familia y estas cosas, también mencionamos la semana pasada la polémica. Que se había suscitado porque la administración Trump, de golpe y porrazo, despidió, descabezó totalmente a la cúpula de la NSF, la Fundación Nacional para la Ciencia, que como les hemos dicho otras veces es un poco el organismo que lidera, que gestiona, que…