Búsqueda · 24 momentos en 5 episodios
Luisa AchaerandioFrancis VillatoroHéctor SocasBorja TosarGastón Giribetenzimas bacterias degradan plásticoescherichia coli degrada petpolietileno tereftalato nanométrico petPETLuisa AchaerandioEscherichia coliCRISPR-Casvariante S1cepa K12H.G. WellsLa Guerra de los MundosHéctor SocasARNGen RewireCIMESSkyMálagaSEMAustraliaLanzaroteCanariasFrancis Villatoromedio LuriaBrozAgar
Bacteria modifica genético plástico
Con
0:000:301:001:302:002:303:003:35
Luisa Achaerandio explica cómo se incorporan enzimas de otras bacterias a Escherichia coli para dotarla de una nueva capacidad, permitiéndole degradar plástico sin perder sus funciones originales.
…que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no confundir con aspartamo, que es un edulcorante, ¿vale? Es importante decir todo. y básicamente esta triada catalítica tú la identificas en otras Enzimas de otras bacterias que suelen que ya de manera natural pueden degradar plástico pero se la incorporas a esta bacteria en estos lugares. Con lo cual la dotas de una nueva capacidad sin que pierda sus capacidades anteriores, es decir, esta bacteria puede seguir alimentándose de manera normal o, que eso es lo chulo, puede coger el polietileno tereftalato nanométrico, es decir, nuestro conocido PET; sabía que ibas a poner esa cara porque ya os digo que lo más difícil de esta edición no es mi apellido. Y básicamente con este PET que todos conocemos pero es verdad que no lo conocemos por el nombre extendido de la molécula, pues hace capaz esta nueva capacidad, hace capaz de degradar esta molécula y llegar a obtener el protocatecuato, es decir, el PCA. PCA es…
Significado #1 · Palabras #13
Héctor Socas introduce un artículo de investigación sobre la reprogramación genética de la bacteria Escherichia coli, destacando su potencial para degradar el plástico y haciendo una comparación con la trama de 'La Guerra de los Mundos' de H.G. Wells.
Habla: Héctor SocasSignificado #6 · Palabras #2reprogramación genética escherichia colidegradación plástica bacteria e coliguerra de los mundos h g wells…por el tema de un artículo que ha salido además por unos investigadores creo que el equipo es básicamente español o fundamentalmente de Universidad y Centro de Investigación Españoles sobre la, a ver si Luisa nos lo cuenta bien, pero es como reprogramar. no es una alteración genética de por sí sino como reprogramar la genética de la famosa bacteria Escherichia coli, la bacteria esta de laboratorio, nuestra bacteria de estudio favorita que bueno entre otras cosas se puede conseguir que puede llegar a degradar el plástico y que digo yo que estaría bien, sería muy bonito que al final el futuro de nuestra civilización lo salvaran las bacterias como en la Guerra de los Mundos de H.G. Wells, de otra forma diferente, pero iría por ahí la cosa. Pues mira, no está nada mal hilado, porque realmente Héctor es un poquito eso lo que estamos buscando, es darle una vueltecita de tuerca, estos investigadores le están dando una vueltecita de tuerca a un concepto que ya se llevaba utilizando mucho tiempo en…
Luisa Achaerandio destaca la relevancia de la degradación del plástico como solución al problema de contaminación ambiental, mencionando el potencial uso de Escherichia coli para este fin.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #11degradación plástica bacteria escherichia colicontaminación ambiental consumo textilplásticos de un solo uso problema…sale unos días después, en este caso el 20 de agosto Siempre la nota de prensa está asociada un poquito al clickbait, porque realmente dice palabras como reprogramación, bacteria, ya nada más que de entrada, suena bastante interesante y aprender, el concepto De aprender que habría que llamarlo de otra manera. Y lo que sí es muy interesante es la parte de degradar plástico, sobre todo por el problema que estamos teniendo hoy en día de contaminación del medio ambiente, por los problemas que tenemos tanto de consumo a nivel de textil, de plásticos de un solo uso y demás. Entonces pues realmente parece que tiene muy buena pinta que utilicemos a nuestra querida E. coli, ¿vale? Llamarla Escherichia Coli es peor que decir mi apellido, entonces prefiero en general, en general se suele tender a decir E. coli y bueno pues... Te confieso que lo busqué porque como tiene esas THs no sabía si había que pronunciarlas al estilo, yo digo es…
Luisa Achaerandio explica que la cepa K12 de Escherichia coli es el punto de partida para sus investigaciones y se utiliza como base para buscar formas de degradar plásticos.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #10 · Palabras #12reprogramación genética escherichia colidegradación plástica bacteria e colicepa k12 punto de partida…que en Málaga no mataremos a nadie desde el laboratorio; o sea, cuando estamos allí. Pero es verdad que es una conocida muy común en todos los experimentos tanto a nivel de instituto como a nivel de formación profesional como a nivel de investigación en General y es la cepa K12, pero claro, desde la cepa K12 no podemos hacer nada, sino que ese es el punto de partida. Utilizamos nuestra E. coli, nuestra cepa K12 y a partir de ahí lo que hacemos es buscar en esta bacteria: ¿Cómo? ¿Qué puedo hacer yo con esta bacteria? ¿Qué lugar de esta bacteria, porque ya os digo que hay que hilar bastante fino, puedo utilizar para que me sirva para degradar este plástico? Entonces, los investigadores lo que hacen lo primero es buscar en el genoma de la E. coli dos proteínas en concreto, que son la LSRB y la SSUA. Para encontrar estas proteínas tienen que utilizar bioinformática; es decir, tú necesitas saber, lo primero que…
Luisa Achaerandio explica cómo se incorporan enzimas de otras bacterias a Escherichia coli para dotarla de una nueva capacidad, permitiéndole degradar plástico sin perder sus funciones originales.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #13enzimas bacterias degradan plásticoescherichia coli degrada petpolietileno tereftalato nanométrico pet…que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no confundir con aspartamo, que es un edulcorante, ¿vale? Es importante decir todo. y básicamente esta triada catalítica tú la identificas en otras Enzimas de otras bacterias que suelen que ya de manera natural pueden degradar plástico pero se la incorporas a esta bacteria en estos lugares. Con lo cual la dotas de una nueva capacidad sin que pierda sus capacidades anteriores, es decir, esta bacteria puede seguir alimentándose de manera normal o, que eso es lo chulo, puede coger el polietileno tereftalato nanométrico, es decir, nuestro conocido PET; sabía que ibas a poner esa cara porque ya os digo que lo más difícil de esta edición no es mi apellido. Y básicamente con este PET que todos conocemos pero es verdad que no lo conocemos por el nombre extendido de la molécula, pues hace capaz esta nueva capacidad, hace capaz de degradar esta molécula y llegar a obtener el protocatecuato, es decir, el PCA. PCA es…
Luisa Achaerandio explica cómo se modifica a Escherichia coli para degradar plástico, comparándolo con un 'toquecito molecular' en lugar de una alteración genética.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #13 · Palabras #1degradación plástica bacteria e colivariante s1 cepa k12toquecito molecular escherichia coli…con la maquinaria molecular, tú obtienes insulina que hasta ahora teníamos otras maneras de obtenerla un poquito más agresiva. Pues, en este caso, ¿pero qué es lo que pasa? Que esas bacterias, digamos, ya las estás alterando y de ahí viene lo del ADN externo. Pero aquí no, aquí es darle un toquecito a la bacteria, como si fuera eso, un toquecito molecular. Entonces, ¿cómo te demuestran que la variante S1 de la cepa K12, que es la que tiene esta modificación, va bien? Pues porque te la comparan con la que no le has hecho la modificación y entonces la cultivas. Aquí tenemos una investigación donde están mezclando un montón de tecnologías y de técnicas de laboratorio. La cultivan para aquellos que seáis de laboratorio y que estéis escuchando el podcast; seguro que os suena el medio de cultivo Luria, Broz, Agar, que…
Luisa Achaerandio describe el resultado de comparar bacterias modificadas con una variante para degradar plástico, frente a las no modificadas.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #9 · Palabras #15degradación plástica bacteria escherichia colicurva de crecimiento variante escherichia colibacterias no modificadas mueren…en el laboratorio experimentales de este tipo. Entonces la comparas con la que no tiene esta variante y crecen las dos igual; en el artículo se ve perfectamente con los gráficos. ¿Qué es lo que pasa si utilizas un medio pobre y le echas un polímero plástico? Pues lo que ocurre es que esas bacterias que tienen la variante siguen creciendo, tienen su curva de crecimiento y las que no tienen esa variante ya no se pueden alimentar y mueren. O sea que se ve muy claro con un montón de experimentos que validan su hipótesis y lo que quiere. proponer, que es ese cambio de paradigma biotecnológico para poder aprovechar la capacidad bacteriana y utilizar esta técnica que no lo he dicho Ya os digo, este artículo es que tiene un montón de cosas y sé que me voy a pasar de tiempo, pero es que si no...…
Luisa Achaerandio explica cómo las bacterias modificadas para degradar plástico atraen a otras bacterias, aprovechándose de la degradación inicial.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #3 · Palabras #10degradación plástica bacteria e colimicro nanoplásticos escala nanométricabacterias corum sensi degradación plásticabacteria modificada atrae otras bacterias…ese microscopio y el microscopio, digamos el SEM, que es el microscopio electrónico de escáner, que eso lo tenemos en Málaga, Francis seguro que también lo conoce, en el CIMES, en el Sky, lo tenemos allí y básicamente tú compruebas que eso está muy chulo. ¿Por qué claro, tú necesitas ver esto a escalas nanométricas? Estamos hablando de NPET, no estamos hablando de cualquier tipo de PET, estamos hablando de microplásticos, no, micro nanoplásticos en este caso. Una cosa muy chula que ocurre es que las bacterias son muy guays y resulta que, no sé si gracias a su corum sensi o no sé por qué, pero se ha comprobado que, claro, donde empieza esta bacteria a degradar el plástico, pues como que se añaden otras, es como que se acuden a la fiesta, por así decirlo. ¿Qué es lo que pasa? Que esas bacterias tienen en comparación, como que se aprovechan un poco de la degradación que hace esta bacteria modificada y entonces pues está también simpático esta parte del artículo. ¿Cómo? Porque ya simplemente me quedaría que se supiera, porque tú te lo estarás preguntando. ¿Pero cómo meto yo esa triada catalítica en ese binding pocket? A lo mejor se lo pregunta alguien, ¿vale? No sé si se lo pregunta alguien, pero es una cosa que…
Luisa Achaerandio explica cómo una tecnología CRISPR-Cas y una guía de ARN se integran en el genético de las bacterias modificadas para degradar plástico, permitiendo a estas producir proteínas con una triada lista para la degradación.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #2 · Palabras #3crpr-cas guía arn bacteriasproteínas triada degradación plásticabacteria modifica genético plásticogen tecnología degradación bacteriadegradación plástica bacteria escherichia coliprueba de concepto bacterias modificadastécnica escalable a otros organismos…poco la temperatura, que por su porosidad va a entrar; quiero decir, es muy fácil que entre, sobre todo los que están modificados en el laboratorio y entonces básicamente al entrar eso ya en el citoplasma celular, pasa a través de su membrana, pues gracias a. Esa tecnología de CRISPR-Cas y la guía de ARN va a ese lugar concreto de esas proteínas, bueno, en este caso iría a nivel genético, digamos se integraría y ya después de que la célula pueda utilizar esa parte que ya está introducido como una adición a esa codificación genética, pues ya sí que esas proteínas tienen a la hora de crearse en la bacteria esa triada lista para poder degradar esos pequeños trocitos de plástico que les estamos poniendo a degustar a nuestra bacteria. Pues ya os digo, eso sería a grandes rasgos toda la técnica y lo que ellos han propuesto de Gen. Rewire y lo que ya para terminar simplemente, pues me gustaría decir que en este caso digamos que es una prueba de concepto. Es verdad que tú no puedes ya utilizar estas bacterias; no se trata de que tú cojas estas bacterias y ya las pongas en el medio y nos arreglen ya todos los problemas y tal, sino que pues la puedes utilizar quizá pues a nivel, bueno se propone, ¿no? Se propone como una técnica que se puede utilizar en escalable a otros organismos, pero claro habría que probarlo y. Sobre todo pues que puedes hacer bioreactores concretos que te sirvan en un momento dado para hacer esto, y bueno pues ese es el objetivo realmente, pero no es que ya directamente se nos haya terminado el problema del microplástico sino que bueno es una forma…
Francis Villatoro introduce un resumen sobre el problema de la aversión pública hacia los organismos modificados genéticamente, específicamente en relación con las bacterias Escherichia coli.
Habla: Francis VillatoroPalabras #11aversión pública organismos modificados genéticamentebacterias escherichia coli transgénicosmodificaciones en e coli insulinavisión utilitarista bacterias…realmente, pero no es que ya directamente se nos haya terminado el problema del microplástico sino que bueno es una forma de buscar soluciones a lo que siempre parece que va a acabar con nuestra existencia y para eso está la ciencia. Si me permitís un... Bueno, pregunta, tú pregunta. No, no, di tú primero que seguro que es más interesante. Yo quería hacer un breve resumen, el problema a resolver aquí es que por razones puramente espurias y que no tienen nada que ver con la ciencia, hay una gran parte del público mundial que odia a los transgénicos y que la palabra transgénico la considera una palabra odiosa y hay que evitarlo a toda costa. Entonces tú dices, ¿modificar genéticamente una E. coli moralmente, éticamente afecta a alguien que es antitrangénico? Pues no, porque realmente la E. coli no se la va a comer ni le va a afectar en nada De hecho, se han hecho modificaciones con transgénicos para producir diferentes sustancias, insulina, etc. utilizando este tipo de bacterias Pero eso es una visión utilitarista, yo creo que mucha Gente que se opone a los transgénicos lo hace en una base casi hasta incluso de principio moral: es modificar la genética de una criatura, es jugar a ser Dios. Que bueno, eso lo podemos decir de cualquier avance tecnológico; eso es una cosa que he discutido…
Francis Villatoro explica cómo se puede modificar una bacteria para que realice dos funciones: su función original para sobrevivir y una nueva función impuesta por el investigador para consumir nanoplásticos.
Habla: Francis VillatoroSignificado #12proteína bacteria funciones supervivenciabacteria consume nanoplásticos bioreactorreprogramación genética escherichia coli…especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que en este caso es consumir nanopets, consumir nanoplásticos. Entonces esta es un poco la idea de esta nueva técnica de rewire, de recableado de la función; es algo de la biología sintética el tratar de modificar funciones que tiene la propia maquinaria celular tratando de afectar lo mínimo al funcionamiento de la propia célula para evitar que con el cambio que yo he hecho pues se crezca más lentamente o crezca peor o…
Héctor Socas advierte sobre los posibles problemas derivados de la liberación de bacterias modificadas genéticamente para degradar el plástico a nivel global, recordando ejemplos históricos de soluciones biológicas que generaron nuevos problemas.
Habla: Héctor SocasSignificado #18 · Palabras #5bacterias modificadas genéticamenteliberación bacterias plástico globalconejos en australia y zorrosardillas en lanzarote no intencionadosolución idílica bacterias plásticos…que lo de Esparta es otra peli también, sí, lo de Espartamo y lo de todo eso. Nada, quería comentar también que, claro, hay que cuando pensamos en todo esto ya extrapolando al futuro un poco de ciencia ficción y pensamos en la solución que yo decía H.G. Welliana de empezar a tener estas bacterias que se esparcen por el mundo degradando los plásticos y salvando a la humanidad de vivir en un vertedero de plástico. Hay que tener también un poco de cuidado; o sea, estas cosas tienen que, como todo, o sea, normalmente siempre que usamos la biología para resolver un problema acabamos creando otro, nos acordamos de los conejos en Australia y luego los zorros para eliminar los conejos y las ardillas en Lanzarote, creo. Sí, aquí en Canarias tenemos el problema de las ardillas, pero eso no fue intencionado; fueron cosas que pasan porque el ser humano se difunde y tal, y a veces eso lleva también especies de animales. Pero bueno, lo digo porque al final tampoco sería una solución idílica que de repente empiecen a extenderse unas poblaciones de bacterias que acaben con todos los plásticos del mundo, o sea, tenemos este problema de los plásticos, ¿por qué? Porque producimos muchísimo plástico, ¿por qué producimos muchísimo plástico? Porque es un material muy útil; usamos el plástico porque es muy útil. Si viviéramos en un entorno en el que se degradara, entonces el plástico pues sería, yo que sé, como el papel,…
Héctor Socas advierte sobre los riesgos de liberar bacterias modificadas genéticamente para degradar el plástico en entornos no controlados, como los océanos.
Habla: Héctor SocasSignificado #15 · Palabras #4durabilidad plástico utilidad inherentecontrol producción destrucción plásticobacterias herramienta destrucción final plásticovida útil plásticobacterias modificadas genéticamentedestrucción plástica entornos industrialesproblemas medioambientales liberación bacteriasplásticos pierden utilidad…muchísimo plástico? Porque es un material muy útil; usamos el plástico porque es muy útil. Si viviéramos en un entorno en el que se degradara, entonces el plástico pues sería, yo que sé, como el papel, que lo puedes tener por una cosita ahí puntual. En la propia durabilidad del plástico está su utilidad, entonces hay que tener un control sobre cómo lo producimos y cómo lo destruimos, y efectivamente estas bacterias pueden ser una herramienta súper útil para ayudarnos en esa destrucción final del plástico cuando llegue al final de su vida, ¿no? pero creo que hay que seguir manteniendo la idea del Reciclaje y de que esta destrucción se haga en entornos industriales controlados y no decir: vale, vamos a echar estas bacterias al mar y que se extiendan por todos los océanos y tal, porque al final acabas produciendo otro problema. Yo digo aquí que pierda utilidad los plásticos, pero puede haber otros problemas medioambientales que también se produzcan, o sea. Que todas estas cosas hay que no, experimentos con gaseosa; todos los temas de ecosistemas son tan complejos que siempre cualquier alteración hay que hacerla de forma muy diferente. Encapsulada, Sandbox, que dicen ahora los informáticos, ¿no? Crear un Sandbox…
Luisa Achaerandio y Francis Villatoro discuten sobre el uso controlado de bacterias modificadas genéticamente para degradar plástico, enfatizando que su liberación en entornos naturales como los océanos sería peligrosa debido a la falta de adaptación de estas bacterias.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #14 · Palabras #6reprogramación genética escherichia colidegradación plástica bacteria e colisalinidad afecta supervivencia escherichia coli…prometedor y vendría en eso, en bioreactores específicamente, por ejemplo, en lugares donde tú puedas filtrar de nanoplásticos, por ejemplo, temas de aguas, aguas residuales o en pantanos, en sitios así; en el mar es muy difícil, en el océano es muy difícil. Nadie va a lanzar este tipo de bacterias al océano; el peligro sería terrible porque no están adaptadas, de hecho, a ese medio y como se reproduzcan pueden... Claro, incluso morirían por la salinidad porque, claro, la salinidad afecta a su supervivencia, pero que sí, que es en condiciones controladas; de hecho, eso es un nivel de madurez. De la tecnología TRL4, de eso los que sabéis de biotecnología lo tenéis muchísimo más claro que yo en este sentido y que básicamente es una prueba de concepto para escalarlo si es que se puede y si es que funciona en otros organismos porque en principio una…