Búsqueda · 28 momentos en 9 episodios
Luisa AchaerandioFrancis VillatoroHéctor SocasBorja TosarGastón Giribetproteína bacteria funciones supervivenciabacteria consume nanoplásticos bioreactorreprogramación genética escherichia coliFrancis VillatoroLuisa AchaerandioCIMESSkyMálagaSEMPETEscherichia coliCRISPR-CasHéctor Socascepa K12100 nanómetros80 nanómetrosARNGen RewireH.G. WellsLa Guerra de los Mundos
Bacteria consume nanoplásticos bioreactor
Con
0:000:301:001:302:002:303:003:35
Francis Villatoro explica cómo se puede modificar una bacteria para que realice dos funciones: su función original para sobrevivir y una nueva función impuesta por el investigador para consumir nanoplásticos.
…especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que en este caso es consumir nanopets, consumir nanoplásticos. Entonces esta es un poco la idea de esta nueva técnica de rewire, de recableado de la función; es algo de la biología sintética el tratar de modificar funciones que tiene la propia maquinaria celular tratando de afectar lo mínimo al funcionamiento de la propia célula para evitar que con el cambio que yo he hecho pues se crezca más lentamente o crezca peor o…
Significado #1 · Palabras #1
Héctor Socas introduce un artículo de investigación sobre la reprogramación genética de la bacteria Escherichia coli, destacando su potencial para degradar el plástico y haciendo una comparación con la trama de 'La Guerra de los Mundos' de H.G. Wells.
Habla: Héctor SocasSignificado #17reprogramación genética escherichia colidegradación plástica bacteria e coliguerra de los mundos h g wells…por el tema de un artículo que ha salido además por unos investigadores creo que el equipo es básicamente español o fundamentalmente de Universidad y Centro de Investigación Españoles sobre la, a ver si Luisa nos lo cuenta bien, pero es como reprogramar. no es una alteración genética de por sí sino como reprogramar la genética de la famosa bacteria Escherichia coli, la bacteria esta de laboratorio, nuestra bacteria de estudio favorita que bueno entre otras cosas se puede conseguir que puede llegar a degradar el plástico y que digo yo que estaría bien, sería muy bonito que al final el futuro de nuestra civilización lo salvaran las bacterias como en la Guerra de los Mundos de H.G. Wells, de otra forma diferente, pero iría por ahí la cosa. Pues mira, no está nada mal hilado, porque realmente Héctor es un poquito eso lo que estamos buscando, es darle una vueltecita de tuerca, estos investigadores le están dando una vueltecita de tuerca a un concepto que ya se llevaba utilizando mucho tiempo en…
Luisa Achaerandio destaca la relevancia de la degradación del plástico como solución al problema de contaminación ambiental, mencionando el potencial uso de Escherichia coli para este fin.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #9degradación plástica bacteria escherichia colicontaminación ambiental consumo textilplásticos de un solo uso problema…sale unos días después, en este caso el 20 de agosto Siempre la nota de prensa está asociada un poquito al clickbait, porque realmente dice palabras como reprogramación, bacteria, ya nada más que de entrada, suena bastante interesante y aprender, el concepto De aprender que habría que llamarlo de otra manera. Y lo que sí es muy interesante es la parte de degradar plástico, sobre todo por el problema que estamos teniendo hoy en día de contaminación del medio ambiente, por los problemas que tenemos tanto de consumo a nivel de textil, de plásticos de un solo uso y demás. Entonces pues realmente parece que tiene muy buena pinta que utilicemos a nuestra querida E. coli, ¿vale? Llamarla Escherichia Coli es peor que decir mi apellido, entonces prefiero en general, en general se suele tender a decir E. coli y bueno pues... Te confieso que lo busqué porque como tiene esas THs no sabía si había que pronunciarlas al estilo, yo digo es…
Luisa Achaerandio explica que la cepa K12 de Escherichia coli es el punto de partida para sus investigaciones y se utiliza como base para buscar formas de degradar plásticos.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #8reprogramación genética escherichia colidegradación plástica bacteria e colicepa k12 punto de partida…que en Málaga no mataremos a nadie desde el laboratorio; o sea, cuando estamos allí. Pero es verdad que es una conocida muy común en todos los experimentos tanto a nivel de instituto como a nivel de formación profesional como a nivel de investigación en General y es la cepa K12, pero claro, desde la cepa K12 no podemos hacer nada, sino que ese es el punto de partida. Utilizamos nuestra E. coli, nuestra cepa K12 y a partir de ahí lo que hacemos es buscar en esta bacteria: ¿Cómo? ¿Qué puedo hacer yo con esta bacteria? ¿Qué lugar de esta bacteria, porque ya os digo que hay que hilar bastante fino, puedo utilizar para que me sirva para degradar este plástico? Entonces, los investigadores lo que hacen lo primero es buscar en el genoma de la E. coli dos proteínas en concreto, que son la LSRB y la SSUA. Para encontrar estas proteínas tienen que utilizar bioinformática; es decir, tú necesitas saber, lo primero que…
Luisa Achaerandio explica cómo se incorporan enzimas de otras bacterias a Escherichia coli para dotarla de una nueva capacidad, permitiéndole degradar plástico sin perder sus funciones originales.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #6enzimas bacterias degradan plásticoescherichia coli degrada petpolietileno tereftalato nanométrico pet…que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no confundir con aspartamo, que es un edulcorante, ¿vale? Es importante decir todo. y básicamente esta triada catalítica tú la identificas en otras Enzimas de otras bacterias que suelen que ya de manera natural pueden degradar plástico pero se la incorporas a esta bacteria en estos lugares. Con lo cual la dotas de una nueva capacidad sin que pierda sus capacidades anteriores, es decir, esta bacteria puede seguir alimentándose de manera normal o, que eso es lo chulo, puede coger el polietileno tereftalato nanométrico, es decir, nuestro conocido PET; sabía que ibas a poner esa cara porque ya os digo que lo más difícil de esta edición no es mi apellido. Y básicamente con este PET que todos conocemos pero es verdad que no lo conocemos por el nombre extendido de la molécula, pues hace capaz esta nueva capacidad, hace capaz de degradar esta molécula y llegar a obtener el protocatecuato, es decir, el PCA. PCA es…
Luisa Achaerandio explica cómo las bacterias modificadas para degradar plástico atraen a otras bacterias, aprovechándose de la degradación inicial.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5 · Palabras #4degradación plástica bacteria e colimicro nanoplásticos escala nanométricabacterias corum sensi degradación plásticabacteria modificada atrae otras bacterias…ese microscopio y el microscopio, digamos el SEM, que es el microscopio electrónico de escáner, que eso lo tenemos en Málaga, Francis seguro que también lo conoce, en el CIMES, en el Sky, lo tenemos allí y básicamente tú compruebas que eso está muy chulo. ¿Por qué claro, tú necesitas ver esto a escalas nanométricas? Estamos hablando de NPET, no estamos hablando de cualquier tipo de PET, estamos hablando de microplásticos, no, micro nanoplásticos en este caso. Una cosa muy chula que ocurre es que las bacterias son muy guays y resulta que, no sé si gracias a su corum sensi o no sé por qué, pero se ha comprobado que, claro, donde empieza esta bacteria a degradar el plástico, pues como que se añaden otras, es como que se acuden a la fiesta, por así decirlo. ¿Qué es lo que pasa? Que esas bacterias tienen en comparación, como que se aprovechan un poco de la degradación que hace esta bacteria modificada y entonces pues está también simpático esta parte del artículo. ¿Cómo? Porque ya simplemente me quedaría que se supiera, porque tú te lo estarás preguntando. ¿Pero cómo meto yo esa triada catalítica en ese binding pocket? A lo mejor se lo pregunta alguien, ¿vale? No sé si se lo pregunta alguien, pero es una cosa que…
Luisa Achaerandio explica que el objetivo final es utilizar bioreactores específicos para abordar el problema del microplástico, aunque reconoce que aún no se ha resuelto completamente.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #4 · Palabras #9crpr-cas guía arn bacteriasproteínas triada degradación plásticabacteria modifica genético plásticogen tecnología degradación bacteriadegradación plástica bacteria escherichia coliprueba de concepto bacterias modificadastécnica escalable a otros organismosbioreactores específicos microplásticoproblema microplástico sin resolverciencia contra la extinción…poco la temperatura, que por su porosidad va a entrar; quiero decir, es muy fácil que entre, sobre todo los que están modificados en el laboratorio y entonces básicamente al entrar eso ya en el citoplasma celular, pasa a través de su membrana, pues gracias a. Esa tecnología de CRISPR-Cas y la guía de ARN va a ese lugar concreto de esas proteínas, bueno, en este caso iría a nivel genético, digamos se integraría y ya después de que la célula pueda utilizar esa parte que ya está introducido como una adición a esa codificación genética, pues ya sí que esas proteínas tienen a la hora de crearse en la bacteria esa triada lista para poder degradar esos pequeños trocitos de plástico que les estamos poniendo a degustar a nuestra bacteria. Pues ya os digo, eso sería a grandes rasgos toda la técnica y lo que ellos han propuesto de Gen. Rewire y lo que ya para terminar simplemente, pues me gustaría decir que en este caso digamos que es una prueba de concepto. Es verdad que tú no puedes ya utilizar estas bacterias; no se trata de que tú cojas estas bacterias y ya las pongas en el medio y nos arreglen ya todos los problemas y tal, sino que pues la puedes utilizar quizá pues a nivel, bueno se propone, ¿no? Se propone como una técnica que se puede utilizar en escalable a otros organismos, pero claro habría que probarlo y. Sobre todo pues que puedes hacer bioreactores concretos que te sirvan en un momento dado para hacer esto, y bueno pues ese es el objetivo realmente, pero no es que ya directamente se nos haya terminado el problema del microplástico sino que bueno es una forma de buscar soluciones a lo que siempre parece que va a acabar con nuestra existencia y para eso está la ciencia. Si me permitís un... Bueno, pregunta, tú pregunta. No, no, di tú primero que seguro que es más interesante. Yo quería hacer un breve resumen, el problema a resolver aquí es que por razones puramente espurias y que no tienen nada que ver con la ciencia, hay una gran parte del…
Francis Villatoro explica cómo se puede modificar una bacteria para que realice dos funciones: su función original para sobrevivir y una nueva función impuesta por el investigador para consumir nanoplásticos.
Habla: Francis VillatoroSignificado #1 · Palabras #1proteína bacteria funciones supervivenciabacteria consume nanoplásticos bioreactorreprogramación genética escherichia coli…especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que en este caso es consumir nanopets, consumir nanoplásticos. Entonces esta es un poco la idea de esta nueva técnica de rewire, de recableado de la función; es algo de la biología sintética el tratar de modificar funciones que tiene la propia maquinaria celular tratando de afectar lo mínimo al funcionamiento de la propia célula para evitar que con el cambio que yo he hecho pues se crezca más lentamente o crezca peor o…
Francis Villatoro explica que mantener un bioreactor para contener bacterias que degradan nanopetróleo es costoso, pero permite controlar su alimentación y fomentar el consumo de nanopetróleo en lugar de azúcar.
Habla: Francis VillatoroSignificado #3 · Palabras #2experimentos gaseosa ecosistemas complejosalteraciones ecosistemas forma diferentesandbox informáticos condiciones controladasbioreactores centrales tratamiento residuosretención nanoplásticos tamaño nanométricofiltros microplásticos escala micrométricadificultad filtros escala nanométricabacterias consumen nanopetalimentación bacterias con petazúcar como alimento alternativobioquímica y tema energéticodegradación plástica bacteria e colibioreactores para nanoplásticosaguas residuales y pantanosinvestigación décadas bacterias plásticofrancis villatoro bioreactoresreprogramación genética escherichia colisalinidad afecta supervivencia escherichia coli…a echar estas bacterias al mar y que se extiendan por todos los océanos y tal, porque al final acabas produciendo otro problema. Yo digo aquí que pierda utilidad los plásticos, pero puede haber otros problemas medioambientales que también se produzcan, o sea. Que todas estas cosas hay que no, experimentos con gaseosa; todos los temas de ecosistemas son tan complejos que siempre cualquier alteración hay que hacerla de forma muy diferente. Encapsulada, Sandbox, que dicen ahora los informáticos, ¿no? Crear un Sandbox y ahí tener... condiciones controladas, condiciones controladas. Sí, esto probablemente se está pensando para bioreactores centrales de tratamiento de residuos, ¿no? De aguas residuales, etcétera, en el que hay una serie de filtros. El problema de los nanoplásticos respecto a los microplásticos es que con filtros es relativamente fácil retener los microplásticos y las cosas que tienen un tamaño micrométrico y submicrométrico, pero cuando bajas ya a la escala nanométrica del orden de 100 nanómetros, 80 nanómetros, es extremadamente difícil hacer filtros para eso, ¿no? Entonces, tener algún mecanismo biológico, que hombre, es un bioreactor y mantener un bioreactor tiene un alto coste, pero bueno, tú mantienes vivas a las bacterias, estas bacterias que consumen este nanopet, este pet, se pueden alimentar de él, pueden crecer en presencia de pet, con lo que le puedes dar menos alimento para provocar las que le das menos azúcar, que no vivan felices con el azúcar y quieran consumir el pet y habrá que mejorar, por supuesto, toda la bioquímica y el tema energético para que sea preferido. Este trabajo no está ya definitivo para llevarlo a implementar. Que da muchísimas, te puedo decir, puede que décadas de trabajo. Pero bueno, es un trabajo muy prometedor y vendría en eso, en bioreactores específicamente, por ejemplo, en lugares donde tú puedas filtrar de nanoplásticos, por ejemplo, temas de aguas, aguas residuales o en pantanos, en sitios así; en el mar es muy difícil, en el océano es muy difícil. Nadie va a lanzar este tipo de bacterias al océano; el peligro sería terrible porque no están adaptadas, de hecho, a ese medio y como se reproduzcan pueden... Claro, incluso morirían por la salinidad porque, claro, la salinidad afecta a su supervivencia, pero que sí, que es en condiciones controladas; de hecho, eso es un nivel de madurez. De la tecnología TRL4, de eso los que sabéis de biotecnología lo tenéis muchísimo más claro que yo en este sentido y que básicamente es una prueba de concepto para escalarlo si es que se puede y si es que funciona en otros organismos porque en principio una…