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Ignacio CrespoBorja TosarJosé EdelsteinIsabel CorderoFrancis VillatoroHéctor Socasintrogresión genética homininosmuestras adn neandertal limitadasespecies homininos denisobanos muestrasintrogresión genética homininos sin adnpaper sobre estrella de tabi scienceinvestigación yulin zhang genetista crísprfragmento adn homo sapiens especies desconocidasNeandertalADNIgnacio CrespoDenisovanoHomo sapiensHéctor SocasCoffee BreakYulin ZhangScienceCRISPR
Aproximaciones homininos limitados
Ep565: Introgresión; Eclipse; Inestabilidad Kelvin-Helmholtz; Piezoquiralidad
6 de agosto de 20264 momentos
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Ignacio Crespo explica la dificultad para confirmar la introgresión genética debido a la limitada cantidad de muestras de ADN bien conservadas de otras especies de homininos, como neandertales y denisobanos.
…ADN de las poblaciones sapiens. Importante, introgresión no solamente que esté ese ADN, es que esté de forma estable, que evidentemente, si se ha quedado durante cientos de miles de años, es estable. Pero lo hemos visto como una excepción porque tenemos una Ventana muy limitada. Para encontrar estos fragmentos y confirmar que efectivamente ha habido introgresión de otras especies, tenemos que tener en principio el ADN de esas especies. Para decir, ah, mira, es que compartimos justo este gen, qué curioso; y tenemos muy pocos genes de estos homininos, bueno, muy pocas muestras de ADN. Tenemos cuatro de neandertal suficientemente bien conservadas, un par de denisobanos según como lo contemos y cuántos estemos dispuestos a aceptar, pero es una muestra muy, muy limitada; y no tenemos más. Esto es lo importante: no tenemos más muestras suficientemente bien conservadas de otras especies de homininos. Así que, ¿es una excepción que tengamos genes neandertales y denisobanos o esta cruce entre distintas especies de homininos ha sido más una norma y nos podríamos encontrar más casos de introgresión en nuestro ADN de especies que tal vez ni siquiera conocemos? Y este grupo de científicos que ha publicado el paper en Science, entre ellos está Yulin Zhang, no confundir con Zhang, el otro genetista conocido de CRISPR. Esta investigadora lo que ha planteado es: ¿y si sí pudiéramos confirmar si tenemos o no introgresión de otras especies de homininos incluso sin tener el ADN de esos homininos? Es más, incluso sin saber si existe tal especie de hominino. Esto parece magia, es lo que comentaba al principio. Si no tienes nada con qué compararlo, ¿cómo puedes saber que ese fragmento del ADN de los Homo sapiens actuales viene de otra especie con la que tal vez se cruzaron hace cientos de miles de años o decenas de miles de años y que no le hemos puesto ni nombre, no tenemos ni un hueso que hayamos identificado como tal? En principio suena imposible, lo intentan y salen cosas interesantes. Ellos lo que plantean es el uso de una herramienta que han creado llamada Trace, que lo que hace es, para intentarlo explicar, utiliza a la vez herramientas previas, primero para construir un árbol genealógico de los genomas de Homo sapiens, cerca de unos 500…
Palabras #1
Ignacio Crespo explica la dificultad para confirmar la introgresión genética debido a la limitada cantidad de muestras de ADN bien conservadas de otras especies de homininos, como neandertales y denisobanos.
Habla: Ignacio CrespoPalabras #1introgresión genética homininosmuestras adn neandertal limitadasespecies homininos denisobanos muestrasintrogresión genética homininos sin adnpaper sobre estrella de tabi scienceinvestigación yulin zhang genetista crísprfragmento adn homo sapiens especies desconocidas…ADN de las poblaciones sapiens. Importante, introgresión no solamente que esté ese ADN, es que esté de forma estable, que evidentemente, si se ha quedado durante cientos de miles de años, es estable. Pero lo hemos visto como una excepción porque tenemos una Ventana muy limitada. Para encontrar estos fragmentos y confirmar que efectivamente ha habido introgresión de otras especies, tenemos que tener en principio el ADN de esas especies. Para decir, ah, mira, es que compartimos justo este gen, qué curioso; y tenemos muy pocos genes de estos homininos, bueno, muy pocas muestras de ADN. Tenemos cuatro de neandertal suficientemente bien conservadas, un par de denisobanos según como lo contemos y cuántos estemos dispuestos a aceptar, pero es una muestra muy, muy limitada; y no tenemos más. Esto es lo importante: no tenemos más muestras suficientemente bien conservadas de otras especies de homininos. Así que, ¿es una excepción que tengamos genes neandertales y denisobanos o esta cruce entre distintas especies de homininos ha sido más una norma y nos podríamos encontrar más casos de introgresión en nuestro ADN de especies que tal vez ni siquiera conocemos? Y este grupo de científicos que ha publicado el paper en Science, entre ellos está Yulin Zhang, no confundir con Zhang, el otro genetista conocido de CRISPR. Esta investigadora lo que ha planteado es: ¿y si sí pudiéramos confirmar si tenemos o no introgresión de otras especies de homininos incluso sin tener el ADN de esos homininos? Es más, incluso sin saber si existe tal especie de hominino. Esto parece magia, es lo que comentaba al principio. Si no tienes nada con qué compararlo, ¿cómo puedes saber que ese fragmento del ADN de los Homo sapiens actuales viene de otra especie con la que tal vez se cruzaron hace cientos de miles de años o decenas de miles de años y que no le hemos puesto ni nombre, no tenemos ni un hueso que hayamos identificado como tal? En principio suena imposible, lo intentan y salen cosas interesantes. Ellos lo que plantean es el uso de una herramienta que han creado llamada Trace, que lo que hace es, para intentarlo explicar, utiliza a la vez herramientas previas, primero para construir un árbol genealógico de los genomas de Homo sapiens, cerca de unos 500…
Ignacio Crespo explica cómo los genes provenientes de especies de homininos desconocidos y los genes sapiens pueden coincidir en árboles genealógicos, planteando preguntas sobre cuándo divergieron sus caminos.
Habla: Ignacio CrespoPalabras #13genes homininos desconocidos sapiensárbol genealógico antepasado comúncoalescencia gen héctórdivergencia caminos sapiens hominino…coalescencia. Ese punto en el que tirando hacia atrás veo que coinciden exactamente. Y ellos plantean lo siguiente: si tenemos genes en nuestro genoma que provienen de otras especies de homininos, su historia genealógica estará muy separada de la nuestra. Esa coalescencia entre ese gen que tengo yo en una ubicación que proviene tal vez de un hominino desconocido y esa misma ubicación en, por ejemplo, en ti Héctor, que tal vez no tiene ese gen, que tiene un gen sapiens, ¿en qué momento coincidieron hacia atrás en ese árbol genealógico? ¿En qué momento empezaron a divergir su camino? Y supuestamente esas ramas tienen que ser muy largas, tan largas como que tiene que ser el último antepasado común de ese gen que no era ni sapiens ni de esa otra especie de hominino y por lo tanto se remonta decenas o cientos de miles de años. Es un poco la idea, ramas largas en ese árbol genealógico, es el primer paso. Y suman después otro, que es que precisamente sabiendo que actúa esa recombinación en el genoma, si consiguen encontrar, porque de nuevo comparan un montón de genomas sapiens actuales, si consiguen encontrar que esos fragmentos aparentemente antiguos son…
Héctor Socas expresa una opinión sobre el criterio utilizado para definir al Homo sapiens como humano moderno, sugiriendo que es más restrictivo en comparación con cómo se definen otras especies.
Habla: Héctor SocasSignificado #3sesgo en definición ser humanohector socas opinión sobre especies…¿Y cuántas te estás dejando por el camino? No sé, yo al final no quisiera ser reiterativo y esto además ya lo hemos comentado otras veces en Coffee Break, pero creo que tenemos como, bueno, por volver a lo de la definición de especies, igual creo que estamos. De acuerdo en esto, el criterio que usamos para definir la especie humana como humano moderno seguramente es mucho más restrictivo de lo que aplicamos a otras especies; tenemos un poco ese sesgo de que nos auto percibimos de forma que somos más exquisitos a la hora de definir lo que es un ser humano. No sé, yo veo la reconstrucción de un neandertal o un denisovano y digo: pues esto es un señor, una señora es una persona, un poco peculiar; pero yo qué sé, yo también tengo una tía que es un poco peculiar. Y si vemos perros que son súper diferentes, me dice:…
Ignacio Crespo reflexiona sobre la dificultad de definir la especie humana a lo largo de la historia, señalando una tendencia a ser restrictivos en cuanto a quién pertenece a ella.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #1especie humana restrictiva historiasesgo turbio especie humanahomogeneidad especie humana actual…sé, yo también tengo una tía que es un poco peculiar. Y si vemos perros que son súper diferentes, me dice: un chihuahua y un pastor alemán son la misma especie, y este señor y yo no somos la misma especie. Es como que hay un poco de hipocresía ahí, me parece. Es una situación difícil porque, por un lado, evidentemente a lo largo de la historia se ha sido muy restrictivo con qué es la especie humana y quién no pertenecía a ella. Entonces ahí teníamos un sesgo muy turbio. Casi prefiero pecar de esto, donde al menos aceptamos esa homogeneidad de la especie humana actual; y es verdad que si lo pensamos... Fíjate, creo que sigue siendo el mismo sesgo, el sesgo de ser restrictivo con a quien admitimos en nuestro círculo. Pero por eso digo que al menos hemos hecho un poquito laxo eso, para llevarnos bien, pero sí que creo que hay más pasos, porque si pensamos,…