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Ignacio CrespoJuan Carlos GilFrancis VillatoroJosé EdelsteinHéctor SocasSilvana TapiaIsabel CorderoLuisa AchaerandioGastón Giribetanticuerpos no deseados en andamios proteínasorigami de adn actuando correctamenteproblemas con antígenos transportadosorigami de ADNLuisa Achaerandiolinfocitos BIgnacio CrespoADNIsabel Corderolinfocitos Tsandamio de ADNEOD-GT8VIHlinfocitos T cooperadoresandamio de ADNJosé Edelsteinandamios de ADN
Anticuerpos no deseados en andamios Proteínas
Ep545: 11F; Dinosaurios; Sag A*; Genes y Psiquiatría; AlphaGenome; ADN Origami
12 de febrero de 202610 momentos
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Luisa Achaerandio explica cómo la utilización de andamios de proteínas para transportar antígenos provocaba la producción de anticuerpos no deseados, enmascarando los anticuerpos esperados.
…B por cada millón y después de utilizar este sistema eso incrementa absolutamente y ahí sí tienen una ventaja muchísimo mayor que cuando se utilizaba el andamiaje de proteínas aquí es cuando consiguen origami de ADN, un punto, andamiaje de proteínas, cero. Aquí es donde está el mayor cambio en cuanto a los distintos sistemas, y es que el portar el antígeno en ese vehículo de proteínas no solamente estimulaba el sistema inmunitario, se producían anticuerpos que no queríamos y enmascaraban a los que sí querían. Ahora, después de solventar todos los problemas y que ya el origami de ADN llegue a actuar donde tiene que. Llegar. Ahora sí, ellos encuentran una explosión de este linaje de linfocitos B y además también recuentan una gran cantidad de anticuerpos frente a ese antígeno que ellos estaban portando en ese origami de ADN. Por tanto, y además se hace un resumen muy…
Significado #1 · Palabras #1
Isabel Cordero continúa la discusión sobre las aplicaciones del origami de ADN, explicando cómo el enfoque busca neutralizar variantes virales a través de proteínas que varían menos.
Habla: Isabel CorderoSignificado #18 · Palabras #10proteínas neutralizan variantes viraleslinaje celular raro en repertorio humanoanticuerpos interesantes enmascarados por linfocitos b…interesan estudiar y hacer vacunas sobre las regiones que no mutan y que no varían. No podemos estar constantemente haciendo vacunas frente a regiones que sabemos que van a variar mucho más rápidamente; siempre intentamos que esas vacunas generen anticuerpos. Frente a los trocitos, a esas proteínas que varían menos en este tipo de virus, y esto le permite neutralizar a cualquier variante del virus. Sin embargo, como todo, hay un inconveniente: y es que este linaje celular, el que produce este tipo de anticuerpos, es muy raro en el repertorio humano. Además está en pequeña cantidad y muchas veces cuando está presente, su actividad se ve enmascarada por la de otros linajes de linfocitos B, que son muchos más activos y empiezan a generar otro tipo de anticuerpos. Por tanto, los anticuerpos interesantes se quedan un poquito relegados y enmascarados con respecto al resto. Por tanto, necesitamos mecanismos que nos permitan, digamos, multiplicar o magnificar estos anticuerpos que son tan interesantes, sobre todo cuando ocurre la primera vacunación, que es donde necesitamos que haya mayor cantidad de estos anticuerpos para…
Ignacio Crespo explica la estrategia para mejorar la producción de anticuerpos, señalando que se basa en optimizar los sistemas existentes y que ya se ha intentado antes mediante el uso de nanopartículas proteicas.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #4 · Palabras #20nanopartículas proteicas anticuerposantígenos sistema inmunitario reaccionavehiculizar antígenos proteínas…pero son minoritarias, entonces estamos hablando que queremos, bueno que quieren los autores que ese anticuerpo que es el capaz de neutralizar al 90% de las partículas víricas sea el que más se produzca y para eso pues tienen que tener una estrategia. ¿En qué se basa esta estrategia? Bueno, pues en este caso mejorar todos los sistemas que existen hoy en día para generar esa producción de anticuerpos. ¿Esto no se ha intentado antes? Sí, se ha hecho. ¿Con qué estrategia? Bueno, pues se han intentado metiendo antígenos, es decir, esa partícula frente a la cual nuestro sistema inmunitario reacciona, reconoce y empieza a sintetizar anticuerpos, pero en este caso lo que se ha hecho hasta el momento es vehiculizarlo en nanopartículas proteicas. Eso es lo que existía hasta el momento. Bueno, había un problema, se ha intentado solucionar en trabajos anteriores vehiculizando esos antígenos en proteínas y estos autores han visto que eso no funcionaba, de hecho seguimos sin disponer. Ni siquiera de prototipos eficientes de vacunas y ellos han querido ir un paso más allá, mejorando esa tecnología de transporte. Esas nanopartículas proteicas iban bien, no es algo que digamos que no ha funcionado nunca, pero tiene una serie de fallos y bueno…
Ignacio Crespo explica cómo el sistema inmunitario divide recursos al producir anticuerpos contra la nanopartícula transportadora del antígeno, en lugar de centrarse en los anticuerpos deseados.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #13 · Palabras #2anticuerpos contra nanopartículas proteicassistema inmunitario y antígenos viralesrecursos divididos por anticuerposanticuerpos contra nanopartícula transportadoracentros germinales y linfocitos bdesplazamiento de anticuerpos deseadossistema inmunitario y proteínas del vehículoantígeno viral poco variableproteínas como vehículos de antígenosrespuesta específica contra antígenoignacio crespo e isabel cordero…fallos y bueno pues hay que seguir mejorando. Estas nanopartículas proteicas eran capaces de llegar a los ganglios linfáticos, interaccionar con los linajes apropiados de los linfocitos B y empezar a generar anticuerpos, pero hay un problema muy importante. Y es que el sistema inmunitario también producía anticuerpos sobre las proteínas que formaban la nanopartícula. Por tanto, el sistema inmunitario no solamente estaba generando anticuerpos frente al antígeno del virus, es lo que queremos destruir, sino que se estaban generando anticuerpos frente a la partícula que estaba iculizando el antígeno. Esto, pues claro, lo que hace es, digamos, dividir los recursos disponibles, no es lo mismo que todo el sistema inmunitario se centra en producir un tipo de anticuerpo o por lo menos que ese sea el mayoritario, que ahora se produzcan muchos anticuerpos diferentes Entonces bueno pues aparte esos linfocitos estimulados por esas proteínas del vehículo entraban en los centros germinales que son lugares de nuestro organismo donde pues ahí se desarrollan y se activan los linfocitos B y además bueno pues eso pues se veían los anticuerpos que nos interesaban se veían desplazados por esos anticuerpos que se habían generado frente a las proteínas de la partícula Por tanto, viendo esto, que tenemos un problema, que se ha intentado solucionar el problema, como hemos dicho, creando unos vehículos en forma de proteínas y que no funciona del todo bien, los autores plantean una alternativa. Ellos lo que quieren es presentar un antígeno, es decir, una molécula presente en el virus y que sea muy poquito variable, que genere una respuesta, pero no contra el vehículo, solamente frente al antígeno. que sea además la respuesta deseada, que sea mayor y que no quede enmascarada por ningún otro mecanismo y aquí es donde a los autores se le ocurre utilizar un Origami de ADN. ¿Por qué? Porque los origamis de ADN se ha visto que son mínimamente inmunostimulantes y no generan ningún tipo de respuesta por parte del sistema inmunitario pudiendo funcionar perfectamente como un andamio o un vehículo inerte. Además, visto…
Isabel Cordero comenta un inmunógeno experimental contra el VIH llamado EOD-GT8, diseñado mediante ingeniería de proteínas para inducir la producción de anticuerpos.
Habla: Isabel CorderoSignificado #14 · Palabras #12eod-gt8 inmunógeno experimental vihingeniería de proteínas para inducir anticuerposorigami de adn antígeno concreto…de ADN, pues bueno, pues simplemente tenemos que ponerle el antígeno y ver cómo funciona tanto en sistema sin vitro como luego en sistema sin vivo Por tanto los autores se plantean precisamente eso, diseñar un origami de ADN que en concreto porte el antígeno Frente al cual el sistema inmunitario tiene que reaccionar. Me ha hecho mucha gracia, yo no lo había escuchado mucho: el antígeno concreto que pone en el origami de ADN se llama EOD-GT8, que es un inmunógeno experimental contra el VIH y se ha diseñado mediante ingeniería de proteínas precisamente para inducir la producción de anticuerpos y además de este tipo inducir con mucha intensidad. Lo que me ha hecho más gracia es el nombre. que digo bueno pues como suele ser habitual en ciencia que ponemos ahí las primeras letras o números que se nos ocurren pero esas seis letras significan todo esto y lo he traducido al español Dominio externo de la proteína GP120 del VIH modificado en el…
Luisa Achaerandio explica cómo los autores del estudio comparan su nuevo sistema basado en origami de ADN con el sistema existente de proteínas y buscan analizar el impacto de la nueva estructura en las respuestas inmunitarias.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #5origami de adn para antígenoingeniería de proteínas optimizadaantígenos neutralizantes contra virusorigami de adn contra proteínasrespuestas inmunitarias en ratonescompetencia clonal de anticuerposactivación temprana de anticuerpos…esto de hecho, bueno, es precioso. Los dibujos se ven ahí, la figura geométrica y es preciosa, pero no sé si serían capaces de hacer estructuras más grandes, en principio para lo que son los objetivos de este artículo y de otros anteriores, que es portar o Vehiculizar algo como una especie de nanocápsula, en principio parece que eso es sencillo; ya otras estructuras más grandes, ya eso pues claro, se aumenta en dificultad. Bueno, entonces uno de los primeros objetivos de los autores es conseguir eso, hacer un origami con el ADN y en el origami, en esa figura geométrica del ADN, pues incluirle ese antígeno concreto que también es algo que se ha generado, como he dicho, por ingeniería de proteínas y está optimizado para intentar estudiar el antígeno. Estimular al máximo nuestro sistema inmunitario y que se produzcan esos antígenos que son tan neutralizantes y que podrían pues como he dicho pues neutralizar al virus, valga la redundancia. Luego además dicen: bueno, nosotros hemos ideado este sistema pero queremos saber si es mejor a lo que ya existe, que es el sistema de proteínas. Entonces también compara y luego lo más importante quieren analizar cómo, o sea, no solamente conseguirlo, hacerlo a nivel estructural sino luego analizarlo: ¿cómo afecta esta nueva estructura a las respuestas inmunitarias? Viendo la composición celular en los centros germinales, por supuesto en ratones, la competencia clonal, es decir, se sintetiza ahora más un anticuerpo que otro, etc. Y la activación temprana precisamente de los anticuerpos que se desean: ¿cómo lo hacen? Pues lo primero en el artículo te explican cómo han hecho el andamio, cómo han diseñado el origami; que por lo visto, y eso no lo sabía yo, hay software específicos de diseño y diseñaron unas partículas icosaédricas. Han probado varios tamaños y varios sitios…
Luisa Achaerandio explica que los autores del estudio lograron fabricar correctamente andamios de ADN, confirmando su estructura y estabilidad.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #11fitometría de flujo linfocitos blinfocitos c implicados procesoproducción de anticuerpos ratonesmicroscopía ganglios linfáticosinmunofluorescencia análisis ratonesandamios de adn con estructura eicosahedroestabilidad del adn en andamiosantígeno unido a adn según estudio…y posteriormente ya pasan a estudios en animales además en varios grupos de ratones a estos ratones se les inmuniza con una inyección subcutánea y bueno después se analiza como esos ratones en su sistema inmunológico Unitario ha reaccionado a esa estructura. A los ratones se hace también un montón de análisis desde fitometría de flujo para analizar los linfocitos B, los linfocitos C, que ya tenemos que también están implicados en el proceso, producción de anticuerpos, se hace también microscopía de los ganglios linfáticos, inmunofluorescencia, etc. Hacen muchos ensayos. para ir ya un poquito concretando cuáles son los resultados más novedosos que encuentran estos autores lo primero que resaltan y demuestran que pueden fabricar correctamente estos andamios de ADN que lo consiguen porque vieron que se desplegaron correctamente de hecho en el material suplementario se ven las figuras perfectamente que tienen la forma que ellos esperaban, únicos eicosahedro y que el antígeno está unido donde se tenía que unir y lo más importante que son estables porque eso también y luego lo dicen en discusión el ADN es más inestable y hay más probabilidades que se degrade que las proteínas pero en principio ellos dicen que aquí en su trabajo eso no ha sido un factor importante. La partícula por tanto está bien construida y en cultivos celulares parece que también reaccionan bien los linfocitos B y empiezan a producir señales frente a ese 9B en vehículo, pero cuando lo pasan a los ensayos sin vivo en ratones es donde empiezan a tener…
Luisa Achaerandio explica cómo los investigadores modificaron la estructura de los andamios de ADN para evitar que se quedaran atascados y mejoraron el espaciamiento entre los antígenos.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #2andamiajes de adn atrapadosestimulación del sistema inmunitariovehículos hechos en proteínasnuevas versiones sandamio de adn60 antígenos en origami de dnaespaciamiento entre antígenos y eficaciaandamios proteicos vs andamios de dnaluisa achaerandio estructura de andamioslinfocitos t cooperadores y reacción inmunitariacentros germinales y expansión celularmodificación andamio por autoresproteína padre en andamios de adnlinfocitos t activados por péptidosorigami de adn y respuesta inmunitariareacción inmunitaria con proteínas pequeñas…como que es, por decirlo de alguna manera, se atasca. Como hemos dicho, los ratones se inoculan, tienen que llegar hasta el sistema inmunitario y llega un momento que, por lo que sea, eso no avanza. Entonces, si el antígeno no llega donde tiene que llegar, pues no tenemos una inmunostimulación correcta. Resulta, y ya un poco por ir más al grano, que esos andamios habían quedado atrapados y por tanto no llegaban a esas células dendríticas foliculares que tenían que llegar para estimular luego todo el proceso inmunitario. Y eso también, un poco en principio, los desanima porque las proteínas, hay punto para las proteínas, pero para el constructo de ADN a las proteínas, a los vehículos que están hechos en proteínas, eso no le pasaba; no se quedaban paradas en los ganglios sino que llegaban hasta el final. Entonces ellos hacen un nuevo intento, dicen bueno pues vamos a modificar la estructura, vamos a modificarla de forma que no se nos quede atascada en los primeros pasos. Entonces hacen un nuevo intento haciendo nuevas versiones de sandamio de ADN, haciéndolo más espaciado y aumentaron también no solamente el número. Total de antígenos sino la densidad por superficie y luego dicen que eso fue un factor clave en que el sistema, y hago spoiler, funcionara; y es que antes habían puesto 60 antígenos muy separados en la estructura, en el origami, unidos al ADN y ahora utilizan esos 60 antígenos pero los ponen muy juntos y no saben o yo no lo he entendido bien en el artículo; no se sabe por qué cuando los ponen juntos funciona perfectamente pero si están separados no es eficaz. De todas formas bueno lo vuelven a intentar y aunque la cosa mejora cuando lo comparan con los andamios proteicos otra vez siguen ganando los andamios proteicos. Conseguimos ahora que no se atasquen pero seguimos sin obtener esa respuesta inmunitaria que se esperaba; ¿Qué seguía fallando? Bueno, pues ahora resulta que ya si parece que esos complejos avanzan más llegan hasta los centros germinales pero ahora resulta que otro punto clave para que se lleve a cabo esa reacción inmunitaria son los linfocitos T cooperadores Este tipo celular por lo visto no se activaba bien con el andamio de ADN y si lo hace con el de proteínas. Si no conseguimos activar a esos linfocitos T, el centro germinal no se expande bien y no se llevan a cabo el resto de reacciones que necesitamos. Por tanto, aquí ¿qué hacen los autores? Pues vuelven a hacer otra modificación sobre su andamio de ADN y esta vez le incluyen una pequeña proteína que la llaman padre, ahí ya no he averiguado, no he entrado a averiguar qué significa cada letra, pero bueno, como además me servía para la explicación, es un péstido muy chiquitito que se lo unen de forma complementaria a ese origami de ADN esa proteína parece ser que les va a ayudar a activar esos linfocitos T pero no va a producir esa reacción inmunitaria que si provocan las proteínas grandes de los vehículos de proteínas es decir, es el punto exacto, un poquito de proteína pero no lo suficiente como para dar una respuesta que no queremos y ahora con ese pequeño cambio si lo consiguen, ahora ven que perfectamente el origami entra, Llega donde tiene que llegar y activa a las células T cooperadoras foliculares, que era el punto clave en el que se había parado la versión anterior. Logran activar los linfocitos T, se activa el linaje que ellos querían de linfocitos B y bueno pues ya parece…
Luisa Achaerandio explica cómo los investigadores lograron resolver un problema relacionado con la activación de linajes de linfocitos B y la producción de anticuerpos.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #11linfocitos b y anticuerpos inmunogénicosactivación de linajes de linfocitos bensayos para medir activación celular achaerandio…ellos querían de linfocitos B y bueno pues ya parece que va todo bien; ahora solamente tienen que ver, bueno se están generando esos anticuerpos altamente inmunizantes que querían. Bueno, pues parece que sí, en un último ensayo demuestran que esos linajes que Ellos estaban buscando activar; que eran raros, que cuando encima producían esos anticuerpos, los anticuerpos eran poquitos y se veían enmascarados por otro anticuerpo frente a otras proteínas. Logran sobrevivir esos linajes de linfocitos B, expandirse y generar esos anticuerpos que eran los altamente inmunogénicos. Además, se hacen ensayos también porque dicen: "Vale, hemos conseguido activar este tipo celular, este linaje; bueno, tipo celular no, este linaje de linfocitos B que estábamos buscando". Pero ¿cuánto lo hemos conseguido activar? Se hacen estudios en ratón y por lo visto llegan a encontrar, pues estoy buscando el número exacto no sé si lo tengo por aquí, bueno, creo que no, pero en condiciones normales cuando no existe ese sistema solamente se encuentran 6 células de este linaje de…
Luisa Achaerandio explica cómo la utilización de andamios de proteínas para transportar antígenos provocaba la producción de anticuerpos no deseados, enmascarando los anticuerpos esperados.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1anticuerpos no deseados en andamios proteínasorigami de adn actuando correctamenteproblemas con antígenos transportados…B por cada millón y después de utilizar este sistema eso incrementa absolutamente y ahí sí tienen una ventaja muchísimo mayor que cuando se utilizaba el andamiaje de proteínas aquí es cuando consiguen origami de ADN, un punto, andamiaje de proteínas, cero. Aquí es donde está el mayor cambio en cuanto a los distintos sistemas, y es que el portar el antígeno en ese vehículo de proteínas no solamente estimulaba el sistema inmunitario, se producían anticuerpos que no queríamos y enmascaraban a los que sí querían. Ahora, después de solventar todos los problemas y que ya el origami de ADN llegue a actuar donde tiene que. Llegar. Ahora sí, ellos encuentran una explosión de este linaje de linfocitos B y además también recuentan una gran cantidad de anticuerpos frente a ese antígeno que ellos estaban portando en ese origami de ADN. Por tanto, y además se hace un resumen muy…
José Edelstein reflexiona sobre el extenso trabajo requerido para un estudio experimental con origami de ADN, mencionando la gran cantidad de técnicas utilizadas para evaluar células y anticuerpos en animales.
Habla: José EdelsteinSignificado #17 · Palabras #16ingeniería de proteínas para vacunasevaluación de anticuerpos en animalestécnicas para evaluar células y anticuerpostrabajo extenso estudio origami adn…pero vamos, varias veces. Sí, las figuras más bonitas, que son figuras como que se ve con un microscopio, son de crío electromicroscopía Bueno, he contado el número de técnicas diferentes, pero si me pongo, yo creo que más de 25 técnicas han utilizado Sí, Sí, entre el diseño, bueno, no recuerdo si el antígeno lo han hecho ellos o no. Ponía que era de ingeniería de proteínas, pero no sé si era de ellos. Todos los ensayos en cultivo, en animales, todas las técnicas luego que se han estudiado para evaluar la cantidad de células y de anticuerpos en los animales. Este ha sido un trabajo que le ha tenido que llevar muchísimo tiempo. Es de muchos autores, ¿no? Sí, 25 creo que conté. Los contaste y todo. Sí, sí, sí. Te esperabas la pregunta, hombre; eso, pero está justificado, no me refiero o sea, esto que dice la gente a la hora de evaluar. A mí me hicieron una pregunta hace poco: oye,…