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Alteración funcionamiento Proteínas bacterias
Con
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Francis Villatoro explica que, siguiendo lo expuesto por Luisa Achaerandio, las bacterias modificadas genéticamente deben tener propiedades especiales para permitir la alteración de su funcionamiento y la adición de nuevas funciones a sus proteínas.
…una forma de más que no sabemos luego qué efectos tendrá en tu futuro de llevar esas gafas toda tu vida? ¿Cómo alterará eso? Bueno, al final, bueno, eso. Esos antitrangénicos tan radicales deben de ser un porcentaje muy bajo en los antitrangénicos mundiales. En cualquier caso, la idea de Manuel Ferrer es desarrollar una nueva tecnología de edición genética que evita la transgénesis. Entonces, lo que tú haces es decir: ¿cómo evito la transgénesis? Pues cojo una proteína que ya tenga el organismo, en este caso la bacteria, y le añado una nueva función. No puedo sustituir la función que ya tiene, porque si sustituyo la función que ya tiene, puede que esté alterando el funcionamiento biológico de la propia bacteria y no se reproduzca bien, pierda propiedades y características. En ciertas circunstancias, deje de ser y me critiquen porque la he modificado. Lo que hago es coger una proteína que, como ha Contado Luisa, pues tiene que tener una serie de propiedades especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que en este caso es consumir nanopets, consumir nanoplásticos. Entonces esta es un poco la idea de esta nueva técnica de rewire, de recableado de la función; es algo de la biología sintética el tratar de modificar funciones que tiene la propia maquinaria celular tratando de afectar lo mínimo al funcionamiento de la propia célula para evitar que con el cambio que yo he hecho pues se crezca más lentamente o crezca peor o por ejemplo este tema de curum sensing, esta es una proteína de curum sensing de transferencia de señales entre bacterias, ¿no? Hay una comunicación bacteriana que yo puedo afectar si yo modifico la función. Entonces la idea es añadir una nueva función a lo que ya tengo y ya nadie me puede decir que Es transgénesis. Ya he evitado la palabra maldita y he logrado una nueva cosa, y como esto es algo nuevo, pues obviamente este artículo de Manuel Ferrer será muy, muy usado por la industria farmacológica que podrá vender ahora. Esto no tiene transgénesis.…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio explica el siguiente paso en la investigación sobre la degradación de plásticos utilizando Escherichia coli: buscar proteínas similares a las enzimas que ya degradan plásticos.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #15proteínas lsrb y ssua en e coliespacio periplasmático de e coliquorum sensi bacteriasenzimas degradan plásticos…doctor Manuel Ferrer pues tiene digamos esa especialidad que lo ha hecho ha posibilitado que se pueda llegar a esta conclusión y luego tenemos a Paula Vidal, que es una investigadora predoctoral que ha desarrollado este artículo como investigadora principal. Entonces, primero tienes que saber que existen enzimas que degradan plásticos. Una vez que tienes este conocimiento, intentas buscar proteínas parecidas en la E. coli. Como he dicho, se encuentran estas dos proteínas que son la LSRB y la SSUA, y nuevamente os invito a mirar el artículo que se publicó en Trends in Biotechnology porque esas proteínas no están en un lugar cualquiera; esas proteínas están en el espacio periplasmático de esta E. coli. ¿Eso qué significa? Pues que están justo en la parte exterior, y digamos que su función en parte, la LSRB es de comunicación, porque las bacterias también se comunican; es una comunicación química, como me gusta a mí decirlo mucho: no tienen ojos, no tienen boca, es la comunicación que nosotros entendemos, pero sí que es una comunicación química que tiene un nombre muy bonito que se llama Quorum Sensi, muy chulo; es muy bonito ese concepto. Pues resulta que una de esas proteínas nos sirve para nuestro cometido, por el lugar en el que está, por la estructura que tiene y además porque en la parte central de esta estructura proteica a nivel tridimensional tiene lo que se llama un ligando, por así…
Luisa Achaerandio utiliza una metáfora para explicar cómo se están rediseñando proteínas en Escherichia coli, comparándolo con dotar a un personaje de adamantium, como en los cómics.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #7 · Palabras #9rediseño proteínas nativas escherichia colisuperpoder en escherichia colimétodos computacionales luisa achaerandioproteínas en escherichia coli adamantiumbacterias con superpoderes juan carlosdiseño bacterias mejorar no cortartecnología crispr cas guia tradicional…juego un poquito; estamos utilizando todas las posibilidades de nuestro entorno que todavía no te las he contado todas porque todavía te faltan datos para entender cómo se llega a esto, pero estamos utilizando todo lo que se sabe para ir un poquito más allá. De hecho, una de las cosas que dice una de las autoras, dice que si las proteínas nativas pueden ser rediseñadas computacionalmente para hacer algo nuevo, no necesitamos alterar el equilibrio genético de la célula con elementos externos, sino que dotamos a nuestra querida E. coli de un nuevo superpoder. es así un poquito como pensar en, lo ves, no como ser humano, pero con el adamantium. O sea, no solo puedo ser un ser humano, o en este caso una bacteria, sino tener como algo adicional, ¿no? Que efectivamente me puede alterar un poquito... Perdón, dime, dime. Estas metáforas de bacterias con superpoderes y superbacterias, no sé si escuchaste el programa con Juan Carlos en el que hacía este tipo de... Sí, de asimilar bacterias con superhéroes y tal Es que pega muchísimo, sobre todo en esta, justamente en este diseño que hacen, porque tú es como, lo que haces es mejorar, no estás cambiando, no estás cortando, no es el CRISPR -Cas, la tecnología de CRISPR-Cas con guía tradicional No es edición genética, ¿no? Efectivamente Genes que están ahí Exactamente, es una zona concreta que está ahí, que me puede servir para añadir lo que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no…
Luisa Achaerandio explica cómo los investigadores demuestran que la modificación de bacterias no implica maltrato, sino una colaboración basada en la cooperación y no en la sustitución o el abuso, haciendo referencia a su uso en la producción de insulina.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #6bacterias colaboran producción insulinamodificación bacterias no implica maltratoescherichia coli producción insulinacolaboración en lugar de abuso e coli…reutilizar, o sea que básicamente, y además una cosa muy chula también ocurre aquí, que los investigadores, ya os digo, el artículo es una maravilla, a mí me parece que está súper bien presentado, súper bien organizado y súper bien planteado y muy digamos que Te hace muy fácil su comprensión tal y como está expuesto, narrado. Entonces una cosa muy chula que te pone para que te demuestre que digamos estas bacterias no las estás maltratando, te basas en la colaboración y no en la sustitución o el abuso porque acordaros que la E. coli sirve por ejemplo para hacer insulina. Tú, utilizando un plásmido, que es una molécula de ADN circular, puedes meter un trozo de insulina, digamos, la codificación para la insulina, por así decirlo, ese gen, ¿vale? Lo metes en la bacteria con determinadas técnicas, que hay muchas técnicas para…
Luisa Achaerandio explica cómo se modifica a Escherichia coli para degradar plástico, comparándolo con un 'toquecito molecular' en lugar de una alteración genética.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #15degradación plástica bacteria e colivariante s1 cepa k12toquecito molecular escherichia coli…con la maquinaria molecular, tú obtienes insulina que hasta ahora teníamos otras maneras de obtenerla un poquito más agresiva. Pues, en este caso, ¿pero qué es lo que pasa? Que esas bacterias, digamos, ya las estás alterando y de ahí viene lo del ADN externo. Pero aquí no, aquí es darle un toquecito a la bacteria, como si fuera eso, un toquecito molecular. Entonces, ¿cómo te demuestran que la variante S1 de la cepa K12, que es la que tiene esta modificación, va bien? Pues porque te la comparan con la que no le has hecho la modificación y entonces la cultivas. Aquí tenemos una investigación donde están mezclando un montón de tecnologías y de técnicas de laboratorio. La cultivan para aquellos que seáis de laboratorio y que estéis escuchando el podcast; seguro que os suena el medio de cultivo Luria, Broz, Agar, que…
Luisa Achaerandio describe el resultado de comparar bacterias modificadas con una variante para degradar plástico, frente a las no modificadas.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #16degradación plástica bacteria escherichia colicurva de crecimiento variante escherichia colibacterias no modificadas mueren…en el laboratorio experimentales de este tipo. Entonces la comparas con la que no tiene esta variante y crecen las dos igual; en el artículo se ve perfectamente con los gráficos. ¿Qué es lo que pasa si utilizas un medio pobre y le echas un polímero plástico? Pues lo que ocurre es que esas bacterias que tienen la variante siguen creciendo, tienen su curva de crecimiento y las que no tienen esa variante ya no se pueden alimentar y mueren. O sea que se ve muy claro con un montón de experimentos que validan su hipótesis y lo que quiere. proponer, que es ese cambio de paradigma biotecnológico para poder aprovechar la capacidad bacteriana y utilizar esta técnica que no lo he dicho Ya os digo, este artículo es que tiene un montón de cosas y sé que me voy a pasar de tiempo, pero es que si no...…
Luisa Achaerandio explica cómo una tecnología CRISPR-Cas y una guía de ARN se integran en el genético de las bacterias modificadas para degradar plástico, permitiendo a estas producir proteínas con una triada lista para la degradación.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #18crpr-cas guía arn bacteriasproteínas triada degradación plásticabacteria modifica genético plásticogen tecnología degradación bacteria…poco la temperatura, que por su porosidad va a entrar; quiero decir, es muy fácil que entre, sobre todo los que están modificados en el laboratorio y entonces básicamente al entrar eso ya en el citoplasma celular, pasa a través de su membrana, pues gracias a. Esa tecnología de CRISPR-Cas y la guía de ARN va a ese lugar concreto de esas proteínas, bueno, en este caso iría a nivel genético, digamos se integraría y ya después de que la célula pueda utilizar esa parte que ya está introducido como una adición a esa codificación genética, pues ya sí que esas proteínas tienen a la hora de crearse en la bacteria esa triada lista para poder degradar esos pequeños trocitos de plástico que les estamos poniendo a degustar a nuestra bacteria. Pues ya os digo, eso sería a grandes rasgos toda la técnica y lo que ellos han propuesto de Gen. Rewire y lo que ya para terminar simplemente, pues me gustaría decir que en este caso digamos que es una prueba de concepto. Es verdad que tú no puedes ya utilizar estas bacterias; no se trata de que tú cojas estas bacterias y ya las pongas en el medio y nos…
Francis Villatoro explica que, siguiendo lo expuesto por Luisa Achaerandio, las bacterias modificadas genéticamente deben tener propiedades especiales para permitir la alteración de su funcionamiento y la adición de nuevas funciones a sus proteínas.
Habla: Francis VillatoroSignificado #1 · Palabras #1proteína bacteria nueva funciónevitar transgénesis tecnología edición genéticaalteración funcionamiento biológico bacteriamanuel ferrer propuesta transgénesisproteínas modificadas genéticamente luisaalteración funcionamiento proteínas bacteriascatálisis función bioquímica básicasitio activo proteína modificaciónproteína bacteria funciones supervivenciabacteria consume nanoplásticos bioreactorreprogramación genética escherichia coliquorum sensing afecta comunicación bacterianabiología sintética modifica funciones celularesproteína quorum sensing transferencia señalesimpacto mínimo en funcionamiento célula…una forma de más que no sabemos luego qué efectos tendrá en tu futuro de llevar esas gafas toda tu vida? ¿Cómo alterará eso? Bueno, al final, bueno, eso. Esos antitrangénicos tan radicales deben de ser un porcentaje muy bajo en los antitrangénicos mundiales. En cualquier caso, la idea de Manuel Ferrer es desarrollar una nueva tecnología de edición genética que evita la transgénesis. Entonces, lo que tú haces es decir: ¿cómo evito la transgénesis? Pues cojo una proteína que ya tenga el organismo, en este caso la bacteria, y le añado una nueva función. No puedo sustituir la función que ya tiene, porque si sustituyo la función que ya tiene, puede que esté alterando el funcionamiento biológico de la propia bacteria y no se reproduzca bien, pierda propiedades y características. En ciertas circunstancias, deje de ser y me critiquen porque la he modificado. Lo que hago es coger una proteína que, como ha Contado Luisa, pues tiene que tener una serie de propiedades especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que en este caso es consumir nanopets, consumir nanoplásticos. Entonces esta es un poco la idea de esta nueva técnica de rewire, de recableado de la función; es algo de la biología sintética el tratar de modificar funciones que tiene la propia maquinaria celular tratando de afectar lo mínimo al funcionamiento de la propia célula para evitar que con el cambio que yo he hecho pues se crezca más lentamente o crezca peor o por ejemplo este tema de curum sensing, esta es una proteína de curum sensing de transferencia de señales entre bacterias, ¿no? Hay una comunicación bacteriana que yo puedo afectar si yo modifico la función. Entonces la idea es añadir una nueva función a lo que ya tengo y ya nadie me puede decir que Es transgénesis. Ya he evitado la palabra maldita y he logrado una nueva cosa, y como esto es algo nuevo, pues obviamente este artículo de Manuel Ferrer será muy, muy usado por la industria farmacológica que podrá vender ahora. Esto no tiene transgénesis.…