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Alteración funcionamiento biológico bacteria
Con
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Francis Villatoro explica la propuesta de Manuel Ferrer para desarrollar una nueva tecnología de edición genética que busca evitar la transgénesis.
…una forma de más que no sabemos luego qué efectos tendrá en tu futuro de llevar esas gafas toda tu vida? ¿Cómo alterará eso? Bueno, al final, bueno, eso. Esos antitrangénicos tan radicales deben de ser un porcentaje muy bajo en los antitrangénicos mundiales. En cualquier caso, la idea de Manuel Ferrer es desarrollar una nueva tecnología de edición genética que evita la transgénesis. Entonces, lo que tú haces es decir: ¿cómo evito la transgénesis? Pues cojo una proteína que ya tenga el organismo, en este caso la bacteria, y le añado una nueva función. No puedo sustituir la función que ya tiene, porque si sustituyo la función que ya tiene, puede que esté alterando el funcionamiento biológico de la propia bacteria y no se reproduzca bien, pierda propiedades y características. En ciertas circunstancias, deje de ser y me critiquen porque la he modificado. Lo que hago es coger una proteína que, como ha Contado Luisa, pues tiene que tener una serie de propiedades especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que en este caso es consumir nanopets, consumir nanoplásticos. Entonces esta es un poco la idea de esta nueva técnica de rewire, de recableado de la función; es algo de la biología sintética el tratar de modificar funciones que tiene la propia maquinaria celular tratando de afectar lo mínimo al funcionamiento de la propia célula para evitar que con el cambio que yo he hecho pues se crezca más lentamente o crezca peor o…
Palabras #1
Héctor Socas introduce un artículo de investigación sobre la reprogramación genética de la bacteria Escherichia coli, destacando su potencial para degradar el plástico y haciendo una comparación con la trama de 'La Guerra de los Mundos' de H.G. Wells.
Habla: Héctor SocasPalabras #12reprogramación genética escherichia colidegradación plástica bacteria e coliguerra de los mundos h g wells…por el tema de un artículo que ha salido además por unos investigadores creo que el equipo es básicamente español o fundamentalmente de Universidad y Centro de Investigación Españoles sobre la, a ver si Luisa nos lo cuenta bien, pero es como reprogramar. no es una alteración genética de por sí sino como reprogramar la genética de la famosa bacteria Escherichia coli, la bacteria esta de laboratorio, nuestra bacteria de estudio favorita que bueno entre otras cosas se puede conseguir que puede llegar a degradar el plástico y que digo yo que estaría bien, sería muy bonito que al final el futuro de nuestra civilización lo salvaran las bacterias como en la Guerra de los Mundos de H.G. Wells, de otra forma diferente, pero iría por ahí la cosa. Pues mira, no está nada mal hilado, porque realmente Héctor es un poquito eso lo que estamos buscando, es darle una vueltecita de tuerca, estos investigadores le están dando una vueltecita de tuerca a un concepto que ya se llevaba utilizando mucho tiempo en…
Luisa Achaerandio utiliza una metáfora para explicar cómo se están rediseñando proteínas en Escherichia coli, comparándolo con dotar a un personaje de adamantium, como en los cómics.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #18proteínas en escherichia coli adamantiumbacterias con superpoderes juan carlosdiseño bacterias mejorar no cortartecnología crispr cas guia tradicional…autoras, dice que si las proteínas nativas pueden ser rediseñadas computacionalmente para hacer algo nuevo, no necesitamos alterar el equilibrio genético de la célula con elementos externos, sino que dotamos a nuestra querida E. coli de un nuevo superpoder. es así un poquito como pensar en, lo ves, no como ser humano, pero con el adamantium. O sea, no solo puedo ser un ser humano, o en este caso una bacteria, sino tener como algo adicional, ¿no? Que efectivamente me puede alterar un poquito... Perdón, dime, dime. Estas metáforas de bacterias con superpoderes y superbacterias, no sé si escuchaste el programa con Juan Carlos en el que hacía este tipo de... Sí, de asimilar bacterias con superhéroes y tal Es que pega muchísimo, sobre todo en esta, justamente en este diseño que hacen, porque tú es como, lo que haces es mejorar, no estás cambiando, no estás cortando, no es el CRISPR -Cas, la tecnología de CRISPR-Cas con guía tradicional No es edición genética, ¿no? Efectivamente Genes que están ahí Exactamente, es una zona concreta que está ahí, que me puede servir para añadir lo que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no…
Luisa Achaerandio explica cómo se incorporan enzimas de otras bacterias a Escherichia coli para dotarla de una nueva capacidad, permitiéndole degradar plástico sin perder sus funciones originales.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #18enzimas bacterias degradan plásticoescherichia coli degrada petpolietileno tereftalato nanométrico pet…que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no confundir con aspartamo, que es un edulcorante, ¿vale? Es importante decir todo. y básicamente esta triada catalítica tú la identificas en otras Enzimas de otras bacterias que suelen que ya de manera natural pueden degradar plástico pero se la incorporas a esta bacteria en estos lugares. Con lo cual la dotas de una nueva capacidad sin que pierda sus capacidades anteriores, es decir, esta bacteria puede seguir alimentándose de manera normal o, que eso es lo chulo, puede coger el polietileno tereftalato nanométrico, es decir, nuestro conocido PET; sabía que ibas a poner esa cara porque ya os digo que lo más difícil de esta edición no es mi apellido. Y básicamente con este PET que todos conocemos pero es verdad que no lo conocemos por el nombre extendido de la molécula, pues hace capaz esta nueva capacidad, hace capaz de degradar esta molécula y llegar a obtener el protocatecuato, es decir, el PCA. PCA es…
Luisa Achaerandio explica cómo los investigadores demuestran que la modificación de bacterias no implica maltrato, sino una colaboración basada en la cooperación y no en la sustitución o el abuso, haciendo referencia a su uso en la producción de insulina.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #10bacterias colaboran producción insulinamodificación bacterias no implica maltratoescherichia coli producción insulinacolaboración en lugar de abuso e coli…reutilizar, o sea que básicamente, y además una cosa muy chula también ocurre aquí, que los investigadores, ya os digo, el artículo es una maravilla, a mí me parece que está súper bien presentado, súper bien organizado y súper bien planteado y muy digamos que Te hace muy fácil su comprensión tal y como está expuesto, narrado. Entonces una cosa muy chula que te pone para que te demuestre que digamos estas bacterias no las estás maltratando, te basas en la colaboración y no en la sustitución o el abuso porque acordaros que la E. coli sirve por ejemplo para hacer insulina. Tú, utilizando un plásmido, que es una molécula de ADN circular, puedes meter un trozo de insulina, digamos, la codificación para la insulina, por así decirlo, ese gen, ¿vale? Lo metes en la bacteria con determinadas técnicas, que hay muchas técnicas para…
Luisa Achaerandio explica cómo se modifica a Escherichia coli para degradar plástico, comparándolo con un 'toquecito molecular' en lugar de una alteración genética.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #13degradación plástica bacteria e colivariante s1 cepa k12toquecito molecular escherichia coli…con la maquinaria molecular, tú obtienes insulina que hasta ahora teníamos otras maneras de obtenerla un poquito más agresiva. Pues, en este caso, ¿pero qué es lo que pasa? Que esas bacterias, digamos, ya las estás alterando y de ahí viene lo del ADN externo. Pero aquí no, aquí es darle un toquecito a la bacteria, como si fuera eso, un toquecito molecular. Entonces, ¿cómo te demuestran que la variante S1 de la cepa K12, que es la que tiene esta modificación, va bien? Pues porque te la comparan con la que no le has hecho la modificación y entonces la cultivas. Aquí tenemos una investigación donde están mezclando un montón de tecnologías y de técnicas de laboratorio. La cultivan para aquellos que seáis de laboratorio y que estéis escuchando el podcast; seguro que os suena el medio de cultivo Luria, Broz, Agar, que…
Luisa Achaerandio describe el resultado de comparar bacterias modificadas con una variante para degradar plástico, frente a las no modificadas.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #3degradación plástica bacteria escherichia colicurva de crecimiento variante escherichia colibacterias no modificadas mueren…en el laboratorio experimentales de este tipo. Entonces la comparas con la que no tiene esta variante y crecen las dos igual; en el artículo se ve perfectamente con los gráficos. ¿Qué es lo que pasa si utilizas un medio pobre y le echas un polímero plástico? Pues lo que ocurre es que esas bacterias que tienen la variante siguen creciendo, tienen su curva de crecimiento y las que no tienen esa variante ya no se pueden alimentar y mueren. O sea que se ve muy claro con un montón de experimentos que validan su hipótesis y lo que quiere. proponer, que es ese cambio de paradigma biotecnológico para poder aprovechar la capacidad bacteriana y utilizar esta técnica que no lo he dicho Ya os digo, este artículo es que tiene un montón de cosas y sé que me voy a pasar de tiempo, pero es que si no...…
Luisa Achaerandio explica cómo las bacterias modificadas para degradar plástico atraen a otras bacterias, aprovechándose de la degradación inicial.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #12degradación plástica bacteria e colimicro nanoplásticos escala nanométricabacterias corum sensi degradación plásticabacteria modificada atrae otras bacterias…ese microscopio y el microscopio, digamos el SEM, que es el microscopio electrónico de escáner, que eso lo tenemos en Málaga, Francis seguro que también lo conoce, en el CIMES, en el Sky, lo tenemos allí y básicamente tú compruebas que eso está muy chulo. ¿Por qué claro, tú necesitas ver esto a escalas nanométricas? Estamos hablando de NPET, no estamos hablando de cualquier tipo de PET, estamos hablando de microplásticos, no, micro nanoplásticos en este caso. Una cosa muy chula que ocurre es que las bacterias son muy guays y resulta que, no sé si gracias a su corum sensi o no sé por qué, pero se ha comprobado que, claro, donde empieza esta bacteria a degradar el plástico, pues como que se añaden otras, es como que se acuden a la fiesta, por así decirlo. ¿Qué es lo que pasa? Que esas bacterias tienen en comparación, como que se aprovechan un poco de la degradación que hace esta bacteria modificada y entonces pues está también simpático esta parte del artículo. ¿Cómo? Porque ya simplemente me quedaría que se supiera, porque tú te lo estarás preguntando. ¿Pero cómo meto yo esa triada catalítica en ese binding pocket? A lo mejor se lo pregunta alguien, ¿vale? No sé si se lo pregunta alguien, pero es una cosa que…
Francis Villatoro explica la propuesta de Manuel Ferrer para desarrollar una nueva tecnología de edición genética que busca evitar la transgénesis.
Habla: Francis VillatoroPalabras #1proteína bacteria nueva funciónevitar transgénesis tecnología edición genéticaalteración funcionamiento biológico bacteriamanuel ferrer propuesta transgénesisproteínas modificadas genéticamente luisaalteración funcionamiento proteínas bacteriascatálisis función bioquímica básicasitio activo proteína modificaciónproteína bacteria funciones supervivenciabacteria consume nanoplásticos bioreactorreprogramación genética escherichia coli…una forma de más que no sabemos luego qué efectos tendrá en tu futuro de llevar esas gafas toda tu vida? ¿Cómo alterará eso? Bueno, al final, bueno, eso. Esos antitrangénicos tan radicales deben de ser un porcentaje muy bajo en los antitrangénicos mundiales. En cualquier caso, la idea de Manuel Ferrer es desarrollar una nueva tecnología de edición genética que evita la transgénesis. Entonces, lo que tú haces es decir: ¿cómo evito la transgénesis? Pues cojo una proteína que ya tenga el organismo, en este caso la bacteria, y le añado una nueva función. No puedo sustituir la función que ya tiene, porque si sustituyo la función que ya tiene, puede que esté alterando el funcionamiento biológico de la propia bacteria y no se reproduzca bien, pierda propiedades y características. En ciertas circunstancias, deje de ser y me critiquen porque la he modificado. Lo que hago es coger una proteína que, como ha Contado Luisa, pues tiene que tener una serie de propiedades especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que en este caso es consumir nanopets, consumir nanoplásticos. Entonces esta es un poco la idea de esta nueva técnica de rewire, de recableado de la función; es algo de la biología sintética el tratar de modificar funciones que tiene la propia maquinaria celular tratando de afectar lo mínimo al funcionamiento de la propia célula para evitar que con el cambio que yo he hecho pues se crezca más lentamente o crezca peor o…
Francis Villatoro explica que mantener un bioreactor para contener bacterias que degradan nanopetróleo es costoso, pero permite controlar su alimentación y fomentar el consumo de nanopetróleo en lugar de azúcar.
Habla: Francis VillatoroPalabras #19bacterias consumen nanopetalimentación bacterias con petazúcar como alimento alternativobioquímica y tema energético…es relativamente fácil retener los microplásticos y las cosas que tienen un tamaño micrométrico y submicrométrico, pero cuando bajas ya a la escala nanométrica del orden de 100 nanómetros, 80 nanómetros, es extremadamente difícil hacer filtros para eso, ¿no? Entonces, tener algún mecanismo biológico, que hombre, es un bioreactor y mantener un bioreactor tiene un alto coste, pero bueno, tú mantienes vivas a las bacterias, estas bacterias que consumen este nanopet, este pet, se pueden alimentar de él, pueden crecer en presencia de pet, con lo que le puedes dar menos alimento para provocar las que le das menos azúcar, que no vivan felices con el azúcar y quieran consumir el pet y habrá que mejorar, por supuesto, toda la bioquímica y el tema energético para que sea preferido. Este trabajo no está ya definitivo para llevarlo a implementar. Que da muchísimas, te puedo decir, puede que décadas de trabajo. Pero bueno, es un trabajo muy prometedor y vendría en eso, en bioreactores específicamente, por ejemplo, en lugares donde tú…