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Alberto ApariciBorja TosarGastón GiribetFrancis VillatoroHéctor SocasJuan Carlos Gilsarro diente cráneo harbinadn en sarro bacterianoproteínas cuerpo segrega sarroHéctor SocasADNAlberto ApariciHarbinHomo longiADN nuclearFrancis VillatoroADN mitocondrialDenisovanosNeandertales
ADN en sarro bacteriano
Con
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Alberto Aparici describe un giro sorprendente en los intentos de investigación sobre el cráneo de Harbin: se decidió analizar el sarro presente en un diente para buscar ADN.
…si estaba inicialmente se ha perdido y a lo mejor es que ni siquiera estaba. Y entonces en esa mandíbula superior le queda un diente, un único diente, uno solo. ¿Vale? ¿Intentaron extraer ADN del diente? Tampoco, pero se dieron cuenta y aquí viene el giro que Me parece maravilloso y que te demuestra que uno tiene que perseverar todo lo que pueda. Decidieron probar suerte porque se dieron cuenta de que en el diente hay un poco de sarro. El sarro es una concreción mineral que tiene que ver con placa bacteriana unida con saliva, unida con proteínas que el cuerpo segrega y que cuando aquello se queda digamos estratificado termina formando una capa mineral alrededor del diente. Y dijeron: bueno, en el sarro ha habido muchas cosas biológicas asquerosas; a lo mejor de aquí sale algo de ADN. Siempre cabe esperar que la mayor parte de ADN del sarro sea bacteriano, pero bueno, a lo mejor queda alguna cosa y probaron y salió alguna cosa. Héctor, ¿querías decir algo antes de? Que yo continúe. Sí, es que ha surgido otra tercera teoría sobre el origen del nombre Longis aquí en el chat de YouTube: nos la pone Tomás Vila, que dice que pensaba que lo llamaban así porque el dueño antes de entregarlo había estado varios años haciéndose…
Significado #1 · Palabras #1
Alberto Aparici describe un giro sorprendente en los intentos de investigación sobre el cráneo de Harbin: se decidió analizar el sarro presente en un diente para buscar ADN.
Habla: Alberto ApariciSignificado #1 · Palabras #1sarro diente cráneo harbinadn en sarro bacterianoproteínas cuerpo segrega sarro…si estaba inicialmente se ha perdido y a lo mejor es que ni siquiera estaba. Y entonces en esa mandíbula superior le queda un diente, un único diente, uno solo. ¿Vale? ¿Intentaron extraer ADN del diente? Tampoco, pero se dieron cuenta y aquí viene el giro que Me parece maravilloso y que te demuestra que uno tiene que perseverar todo lo que pueda. Decidieron probar suerte porque se dieron cuenta de que en el diente hay un poco de sarro. El sarro es una concreción mineral que tiene que ver con placa bacteriana unida con saliva, unida con proteínas que el cuerpo segrega y que cuando aquello se queda digamos estratificado termina formando una capa mineral alrededor del diente. Y dijeron: bueno, en el sarro ha habido muchas cosas biológicas asquerosas; a lo mejor de aquí sale algo de ADN. Siempre cabe esperar que la mayor parte de ADN del sarro sea bacteriano, pero bueno, a lo mejor queda alguna cosa y probaron y salió alguna cosa. Héctor, ¿querías decir algo antes de? Que yo continúe. Sí, es que ha surgido otra tercera teoría sobre el origen del nombre Longis aquí en el chat de YouTube: nos la pone Tomás Vila, que dice que pensaba que lo llamaban así porque el dueño antes de entregarlo había estado varios años haciéndose…
Francis Villatoro explica el proceso de análisis de ADN nuclear realizado sobre el sarro encontrado en un diente del cráneo conocido como 'Homo longi', y las dificultades para secuenciar fragmentos suficientemente largos.
Habla: Francis VillatoroPalabras #4adn nuclear homo longisecuenciación adn denisobanosvariabilidad humana moderno leandertalespuzzle adn referencia humanoadn mitocondrial cráneo homo longireconstrucción adn mitocondrial sarro dentalcobertura baja adn mitocondrial uno pocopaleogenoma cobertura ideal veinte treinta…pura emoción. Aquí los Men in Black empiezan a trabajar porque iba a decir algo importante como que es extraterrestre, que es lo que dice David Loeb. El próximo artículo. Bueno, en principio de este sarro, de esto que han encontrado en el diente han hecho un Análisis de ADN buscando ADN nuclear porque el ADN nuclear es el más claro. El ADN nuclear es muchísimo más largo y, por tanto, aunque encuentres muchos trozos, puedes acoplarlo, puedes ajustarlo a un ADN de referencia, un ADN de referencia humano y ver las diferencias; y esas diferencias de un único nucleótido, etcétera, son las que marcan si estás en una especie o en otra, si están dentro de la variabilidad propia del humano moderno o si corresponden a algo parecido a las variantes que se han observado en leandertales o las que se han observado en denisobanos. Y no se encontró, no se logró aislar adecuadamente, o sea, no se logró secuenciar, en la palabra técnica, trozos suficientemente largos porque lo que hace es coger los trozos e irlos poniendo como en un puzzle. Yo tengo varias. Copias de una pequeña región y tengo trozos un poquito más grandes que esa región y los voy colocando como en vertical y voy pegándolos como si fueran piecitas de Lego que voy colocando con los colores adecuados. Entonces no se logró reconstruir ADN nuclear, pero se intentó reconstruir ADN mitocondrial y se logró reconstruir ADN mitocondrial. Es un ADN mitocondrial reconstruido muy mal, la verdad es que la cobertura es de uno y poco, o sea no llega a dos. En un estudio riguroso, paleogenómico, la cobertura, es decir, el número de copias que tengo de cada trocito en ADN mitocondrial tendría que ser del orden de 20, quizás 30, ¿vale? Eso es una calidad excelente, lo que tengo reconstruido de. Verdad es lo que es, una calidad fetén. 30 de cobertura 20, mira, pues está bien, pero no es lo... 10. Uy, estamos en el borde, pero cuando la cobertura es muy baja, como en este caso, hay que tener cuidado. Te paso a que continúes tú, Alberto. Sí, perdón,…
Alberto Aparici explica que el sarro encontrado en un diente del cráneo 'Homo longi' ha sido la única fuente para obtener ADN.
Habla: Alberto ApariciSignificado #3 · Palabras #3adn mitocondrial cráneo homo longimitocondrias como bacterias ancestralesrespiración celular y mitocondriasancestros unicelulares incorporaron bacteriasadn mitocondrial de denisovanossecuenciación genomas antiguos neandertalesabundancia adn mitocondrial en células…el ordenador en un momento dado. De hecho, yo me quedo escuchándoos a vosotros y vosotros decís: “Se ha quedado Alberto como congelado”, no sé cuántos, y yo no. Pero bueno, en fin. Tú seguís hablando ahí. Espero no haber metido la paz con lo que acabo. de comentar Seguro que no, te he convencido que no Bueno, la cosa que este sarro ha sido el único lugar donde se ha podido encontrar algo de ADN Y lógicamente cuando el ADN es muy escaso, lo que se ha encontrado es ADN mitocondrial Hay que pensar siempre, recordemos, las mitocondrias son esta parte de la célula donde ocurre la respiración y la mitocondria originalmente era una bacteria Es una bacteria que nuestros antepasados, nuestros tataratatarabuelos unicelulares, se incorporaron, digamos, esa bacteria al interior de las células Y en cada célula humana normalmente hay decenas, centenares, a Veces miles de mitocondrias. Entonces, copias del ADN de cada mitocondria hay muchísimas en cada célula. En cambio, copias del ADN de la célula, hay una en cada célula, con lo que cuando tienes escasez de ADN lo que encuentras primero siempre es el ADN mitocondrial. De hecho, cuando se empezaron a secuenciar los genomas de neandertales y todo esto también lo primero que se encontró es el ADN mitocondrial. Entonces, este ADN aunque es más corto y desde luego da poca información sobre el metabolismo digamos del Denisovano pues sí que permite saber cuál es su posición en el árbol familiar, Francis. Alberto, ¿qué significa más corto? Pues significa que el ADN mitocondrial, humano, neandertal, denisovano, son unos 16.500 bases. Exacto. Y el ADN nuclear, dividido en diferentes cromosomas, en el humano son 3.200 millones de bases. La diferencia entre 3.200 millones y 16.000 es lo que llama…
Alberto Aparici advierte sobre la importancia de verificar la autenticidad del ADN antiguo extraído de muestras como el sarro dental, señalando que la mayoría del material genético obtenido es contaminación moderna.
Habla: Alberto ApariciSignificado #2 · Palabras #2adn antiguo sarro dentalcontaminación moderna adn dientesadenina citosina marcador adndegradación química nucleótidos altera adnexceso citosinas indicador antigüedad adnartículos cráneo proteómica y adnanálisis proteico antiguo complementa adndesaminaciones indican degradación proteínas antiguasgrupos amina desaparecen con el tiempo…tiene sentido con los estratos para hacer todo este análisis. Eso no lo he contado porque tampoco quiero extenderme yo aquí y pasarme dos horas hablando de los denisovanos para compensar, pero para hacer todo este análisis uno tiene que estar seguro de que el ADN que está utilizando es ADN antiguo, cuidado porque de todo el ADN que sacas de ese poquito de sarro que hay en el diente, el 90% es contaminación moderna solo una cantidad muy pequeñita es antiguo y para identificar que sea antiguo pues hay una serie de marcadores, por ejemplo en el ADN la adenina se convierte en citosina. si no recuerdo mal Hay una serie de cambios químicos que ocurren simplemente porque los nucleótidos se degradan químicamente y hacen que un nucleótido que debería ser de un tipo se convierta en un nucleótido de otro tipo Entonces si tú ves un exceso de citosinas en el ADN, tienes un cierto argumento en favor de que ese ADN es más antiguo y por lo tanto no es contaminación con este cráneo se han publicado dos artículos, uno es sobre ADN, que es de lo que estoy hablando todo el rato, y hay otro que es sobre proteómica se han sacado también proteínas antiguas de ese pedazo de sarro y se han analizado y en las proteínas ocurre lo mismo se producen una serie de desaminaciones, desaparecen ciertos grupos amina cuando las proteínas pasan mucho tiempo y se van degradando y eso te permite saber que las proteínas que estás sacando de ahí son proteínas antiguas o por lo menos tienen una alta probabilidad de ser proteínas antiguas en ese sentido. O sea que hay toda una serie de tests que Tú tienes que hacer para no estar analizando ADN, ¿qué pasaba por ahí simplemente? Y esos tests se hacen; son tests muy severos y te suelen dejar con muy poquito del ADN que tú sacabas. Tú sacas una gran cantidad de ADN y al final igual te quedas con, me…