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Luisa AchaerandioJuan Carlos GilGastón GiribetIgnacio CrespoFrancis VillatoroHéctor Socasespecialistas genómica colaboraron iniciativa públicainvestigación genes genomas iniciativa públicaproyecto genoma humano en españacarlos lopez jotín iniciativa públicacraig venter y el proyecto genomaavance iniciativa pública proyecto genomasecuenciación genes zonas sin repeticionesfragmentos información craig ventergenes y técnica de secuenciaciónaprovechamiento del proyecto genoma humano públicoresquemor entre comunidades genómicastemor a publicación anticipada de venterpublicación del genoma humanofondo cósmico microondas como analogíaacuerdo iniciativa pública craig ventertécnicas shotgun y tecnología venterpublicación simultánea del genoma humanopremio nobel tras publicación genomaprotógeno humano resuelve enfermedades monogenéticasCraig VenterProyecto Genoma HumanoChogánFrancis VillatoroCollinspremio NobelIniciativa PúblicaCraig Venter InstituteCelera GenomicsCarlos López JotínEspañaJohn Craig VenterFrancis CollinsPrometeodoctor FrankensteinCraig Venter Institute (JCVI)Héctor SocasEstados UnidosJames WatsonFuturamaScienceQuiralidadSíntesis químicaMarte
Acuerdo Iniciativa Pública Craig Venter
Con
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Francis Villatoro continúa explicando cómo se gestionó la publicación del genoma humano, comparando el proceso con la observación del fondo cósmico de microondas y destacando un acuerdo entre la iniciativa pública y Craig Venter.
…repeticiones porque no lo puedes saber porque te vas a tener muchísimas coincidencias y la técnica que utilizaba Celera Genomics, la iniciativa privada, requería que alguien te enseñara dónde están las cosas que estás viendo y eso era la iniciativa pública. Entonces, ya iniciada la iniciativa pública, que estaba publicando todos los resultados en abierto para que cualquier investigador lo pudiera hacer, en la iniciativa pública prácticamente colaboraron todos los especialistas de genómica del mundo; o sea, es una cosa absolutamente, o sea, había que estar ahí. Si tú querías ser persona que investiga en genes y en genomas, tenías que estar en la iniciativa pública, ¿no? Y hacer tu pequeño granito de arena, en España lo hizo muchísima gente, ¿no? Famoso en este programa, por ejemplo, Carlos López Jotín. Son gente que estuvo en esa iniciativa, pero es que había que estar, no te quedaba otro remedio para hacer a alguien en los 90. Bien, pues la ventaja que tenía Craig Venter es que usando como, digamos, Esqueleto, como lo que estaba siendo publicado por la Iniciativa Pública él podía ir a colocar sus trocitos y entonces las zonas realmente interesantes que son los genes son zonas en las que no hay repeticiones y la técnica chocan rápidamente esta secuencia de los genes. ¿Pero dónde está este gen? Pues había que esperar a que la Iniciativa Pública encontrara parte de ese gen porque en el momento en el que encontrara parte del gen tú ya rápidamente colocabas tu gen en su sitio; eso desde el punto de vista de la Iniciativa Pública. fue digamos muy criticado había mucha gente diciendo es que este señor nos está pisando es que este señor si no existiéramos nosotros él no podría hacer nada y lo está haciendo gracias a nosotros entonces eso generó cierto resquemor y como ahí estaba metido toda la comunidad pues entre todas las comunidades genómicos que se dedicaban al tema de genes humanos pues todos estaban así con un poquito con la mosca de la oreja, ¿no? Haría un cierto temor. ¿Y si él, que está haciendo esto, publica el genoma completo tres meses antes que nosotros? Entonces, ¿debe la iniciativa pública a hablar Collins con Venter? Y decirle, mira, señor, vamos a ponernos de acuerdo y lo publicamos en el mismo momento, ¿no? Claro, el problema que tenía publicar el genoma humano es que es como todo la... Tú ves el fondo cómico microondas y tienes una única imagen. Tú ves el genoma humano y tienes un único genoma humano. ¿Es correcto o no es correcto? Entonces se llegó a la conclusión de que, bueno, venga, vamos a ver aquí entre amigos, dado que nosotros hemos usado lo vuestro y vosotros, la iniciativa pública también llega a usar técnicas Chogán y tecnología bioinformática desarrollada por Venter, vamos a intentar publicarlo Más o menos en el mismo momento, ¿no? Entonces se publicaron de manera simultánea, ¿no? Y eso pues relajó un poco la atención, pero siempre ha quedado esa atención, ¿no? Una vez hecho esto, pues ya estaba, digamos, la antesala para el premio Nobel. Aquí estaba más claro que el agua. A nosotros nos vendieron que el protógeno humano iba a resolver el problema de todas las enfermedades de origen monogenético. Y vamos a saber perfectamente para cada enfermedad monogenética, debido a un único gen, cuál era este gen y vamos a descubrir, desvelar la función de la proteína correspondiente a ese gen o todas las proteínas correspondientes a ese gen, porque muchos genes…
Significado #1 · Palabras #1
Héctor Socas introduce los temas que se tratarán en el episodio actual, incluyendo descubrimientos en Marte y la figura de Craig Venter, además de anunciar la disponibilidad de episodios anteriores en su página web.
Habla: Héctor SocasPalabras #19descubrimientos marcianos recientesritmos circadianos y envejecimientohorizontes de agujeros negrosfigura del fallecido craig venterepisodios anteriores señalirruido com…menos esto de situarnos en la galaxia. En fin, lo importante es que estamos aquí y ahora y estamos juntos en este pedacito de espacio-tiempo portátil que llamamos Coffee Break, Señal y Ruido, la tertulia de cada semana sobre la actualidad de la ciencia. Hoy Hablaremos de telarañas y de los nuevos descubrimientos en Marte, de la relación entre los ritmos circadianos y el envejecimiento, de los horizontes de agujeros negros y hasta de una curiosidad matemática. Y sí, recordaremos la figura del recientemente fallecido Craig Venter. Ya saben que tenemos una página web que es señalirruido.com; en esa web está toda la información de todos los episodios anteriores, los 500, perdón, 556 anteriores y este número 557. Bueno, no sé, estaba intentando decir el ordinal pero no me sale, en cientos, ¿no? ¿Cómo es el ordinal de 500? Quincuagentésimo, quincuagésimo, séptimo, lo he tenido que comprobar. Gracias Ignacio. Ignacio y al rescate. Bueno, que lo he dicho, que tienen ahí los 557 episodios y toda la información, todas las referencias de todos los temas que tratamos cada semana,…
Héctor Socas introduce el siguiente tema a tratar en la tertulia, anunciando que retomarán la conversación sobre el fallecimiento de Craig Venter, un tema que no pudieron cubrir completamente en la semana anterior debido a la falta de tiempo.
Habla: Héctor SocasSignificado #10 · Palabras #14fallecimiento de craig venterconversación sobre craig venterfalta de tiempo en la tertuliacraig venter y el premio nobelimportancia científica de craig venterciencia ficción en trabajos de ventercraig venter científico tecnólogotecnología de identificación de genescraig venter fallecido en 1946…ve el cielo azul, pero hace un rato cuando estaba en la calle estaba nublado, o sea que, y nada, estamos bastante bien en Málaga y con muchas ganas de disfrutar de la tertulia, con todos vosotros. Hoy muy numerosa. Sí, me he ocurrido ahí, pero bueno, a gusto. Bueno, pues venga, vamos entonces al lío que tenemos mucho y variado. La semana pasada ya les adelantamos el fallecimiento de Craig Venter y dijimos que hablaríamos un poquito más del tema. Pero bueno, como nos suele pasar, al final nos quedamos sin tiempo y no tuvimos ocasión de volver a retomar ese asunto, así que lo vamos a hacer. Hoy hubo gente que se preocupó, tranquilo, no estamos hablando de Vender, el de Futurama sino Venter con V, Venter, con V y T, Venter, que como decíamos fue una persona de la que se ha hablado incluso en conversación de premio Nobel y bueno, hizo muchas cosas muy alucinantes, algunas más serias y otras casi casi rayando la ciencia ficción. entonces quizás Francis, si quieres empezar a hablar un poco y contarnos un poco la figura de este científico tan ilustre que nos ha dejado. Sí, Craig Venter es de estos científicos que están a la mitad entre lo que sería un tecnólogo, un gurú de la tecnología y lo que es un científico de ciencia básica. Craig Venter es eso, muy famoso en la década de los 80. Hay que recordar que él ha fallecido con 79 años, nació en 1946 en Estados Unidos y en la década de los 80 desarrolló una tecnología para identificar genes con pequeñas etiquetas. Esto, hay grandes diferencias, pero grosso modo es parecido a Lo que hace la PCR, que se volvió muy famosa con la COVID, teníamos unos pequeños trozos que identificaban diferentes genes o proteínas del coronavirus y entonces detectando esos trocitos en una muestra, por ejemplo, de saliva de una persona, podíamos saber…
Francis Villatoro explica que el hito de secuenciar el primer genoma completo en 1995 fue importante, pero lo que realmente hizo famoso a Craig Venter fue desarrollar un instituto privado llamado Craig Venter Institute (JCVI).
Habla: Francis VillatoroSignificado #11 · Palabras #6craig venter instituto jcvihito genómica secuenciación primer genomacraig venter institute comercializa secuenciacióninstitución científica proyecto genoma humano…que fue todo un hito en 1995 lograr secuenciar de manera completa un organismo, aunque es un organismo obviamente muy sencillito. El influencer hemofílico es la... Básicamente, influenza viene de gripe. Aemophilus influenzae. La influenza se conoce. La gripe. Entonces, este hito fue un hito que, digamos, entre comillas, lo coloca en la historia de la genómica; pero realmente lo que le hizo muy, muy famoso fue desarrollar con una empresa privada, que era básicamente el... Craig Venter Institute, el instituto de Craig Venter, ¿no? Se suele conocer por las siglas porque él era John Craig Venter, o JCVI. Esto actuaba como un instituto privado, es decir, básicamente como Una empresa, si queréis una empresa sin ánimo de lucro, pero básicamente no era una institución científica per se. Y con este instituto decidió, digamos, poder empezar a, entre comillas, comercializar el secuenciar cosas. Pero claro, en los 90 había una gran iniciativa, que es una iniciativa de principios de los 90, que era el Proyecto Genoma Humano, que desde la gran institución, el NIH, los Institutos Nacionales de Salud en Estados Unidos, que es la gran institución que financia la investigación biomédica, en España serían el Instituto, ¿cómo se llama? Los hospitales Carlos III, bueno, Carlos III, no me acuerdo de las siglas exactas, me…
Francis Villatoro explica cómo Craig Venter aprovechó su técnica de shotgun para secuenciación y creó Celera Genomics, una empresa con gran financiación para competir con el Proyecto Genoma Humano.
Habla: Francis VillatoroPalabras #4shotgun de venter y celera genomicssecuenciación del genoma humano por celerajcvi y técnica shotgun de ventercelera genomics frente al proyecto genoma…húmedas, demasiado de laboratorio, ir secuenciando poco a poco ese gran trozo. Partirlo en trozos grandes y secuenciar esos trozos y tener garantías siempre de que lo estás haciendo en el orden adecuado y que tienes una muy buena localización de ese trozo. Eso, bueno, era un proyecto que en principio era lento, fue avanzándose en las tecnologías de secuenciación y fue acelerándose y ya alrededor del año 2000 ya estaba a buen ritmo e incluso llegó a utilizar las técnicas de shotgun de perdigonazos de Venter y Venter vio que podía, en paralelo a lo que estaba haciendo con su empresa, su instituto JCVI, podía crear una empresa bien financiada, la creo muy tarde, Celera Genomics, es del 98, con muy buena financiación para utilizar su técnica de secuenciación, de shock gun, para secuenciar el genoma humano. y hacer una iniciativa privada en paralelo a la iniciativa pública y que quizás pudiera vencer a la iniciativa pública. ¿Qué problema tenía la técnica shotgun? Pues la técnica shotgun tiene el problema de que realmente no sabe lo que está secuenciando ni dónde está, ¿vale? Hay una enorme cantidad, por ejemplo, las zonas repetitivas. Tú como una zona repetitiva AT, AT, AT, AT,…
Francis Villatoro continúa explicando cómo se gestionó la publicación del genoma humano, comparando el proceso con la observación del fondo cósmico de microondas y destacando un acuerdo entre la iniciativa pública y Craig Venter.
Habla: Francis VillatoroSignificado #1 · Palabras #1especialistas genómica colaboraron iniciativa públicainvestigación genes genomas iniciativa públicaproyecto genoma humano en españacarlos lopez jotín iniciativa públicacraig venter y el proyecto genomaavance iniciativa pública proyecto genomasecuenciación genes zonas sin repeticionesfragmentos información craig ventergenes y técnica de secuenciaciónaprovechamiento del proyecto genoma humano públicoresquemor entre comunidades genómicastemor a publicación anticipada de venterpublicación del genoma humanofondo cósmico microondas como analogíaacuerdo iniciativa pública craig ventertécnicas shotgun y tecnología venterpublicación simultánea del genoma humanopremio nobel tras publicación genomaprotógeno humano resuelve enfermedades monogenéticas…repeticiones porque no lo puedes saber porque te vas a tener muchísimas coincidencias y la técnica que utilizaba Celera Genomics, la iniciativa privada, requería que alguien te enseñara dónde están las cosas que estás viendo y eso era la iniciativa pública. Entonces, ya iniciada la iniciativa pública, que estaba publicando todos los resultados en abierto para que cualquier investigador lo pudiera hacer, en la iniciativa pública prácticamente colaboraron todos los especialistas de genómica del mundo; o sea, es una cosa absolutamente, o sea, había que estar ahí. Si tú querías ser persona que investiga en genes y en genomas, tenías que estar en la iniciativa pública, ¿no? Y hacer tu pequeño granito de arena, en España lo hizo muchísima gente, ¿no? Famoso en este programa, por ejemplo, Carlos López Jotín. Son gente que estuvo en esa iniciativa, pero es que había que estar, no te quedaba otro remedio para hacer a alguien en los 90. Bien, pues la ventaja que tenía Craig Venter es que usando como, digamos, Esqueleto, como lo que estaba siendo publicado por la Iniciativa Pública él podía ir a colocar sus trocitos y entonces las zonas realmente interesantes que son los genes son zonas en las que no hay repeticiones y la técnica chocan rápidamente esta secuencia de los genes. ¿Pero dónde está este gen? Pues había que esperar a que la Iniciativa Pública encontrara parte de ese gen porque en el momento en el que encontrara parte del gen tú ya rápidamente colocabas tu gen en su sitio; eso desde el punto de vista de la Iniciativa Pública. fue digamos muy criticado había mucha gente diciendo es que este señor nos está pisando es que este señor si no existiéramos nosotros él no podría hacer nada y lo está haciendo gracias a nosotros entonces eso generó cierto resquemor y como ahí estaba metido toda la comunidad pues entre todas las comunidades genómicos que se dedicaban al tema de genes humanos pues todos estaban así con un poquito con la mosca de la oreja, ¿no? Haría un cierto temor. ¿Y si él, que está haciendo esto, publica el genoma completo tres meses antes que nosotros? Entonces, ¿debe la iniciativa pública a hablar Collins con Venter? Y decirle, mira, señor, vamos a ponernos de acuerdo y lo publicamos en el mismo momento, ¿no? Claro, el problema que tenía publicar el genoma humano es que es como todo la... Tú ves el fondo cómico microondas y tienes una única imagen. Tú ves el genoma humano y tienes un único genoma humano. ¿Es correcto o no es correcto? Entonces se llegó a la conclusión de que, bueno, venga, vamos a ver aquí entre amigos, dado que nosotros hemos usado lo vuestro y vosotros, la iniciativa pública también llega a usar técnicas Chogán y tecnología bioinformática desarrollada por Venter, vamos a intentar publicarlo Más o menos en el mismo momento, ¿no? Entonces se publicaron de manera simultánea, ¿no? Y eso pues relajó un poco la atención, pero siempre ha quedado esa atención, ¿no? Una vez hecho esto, pues ya estaba, digamos, la antesala para el premio Nobel. Aquí estaba más claro que el agua. A nosotros nos vendieron que el protógeno humano iba a resolver el problema de todas las enfermedades de origen monogenético. Y vamos a saber perfectamente para cada enfermedad monogenética, debido a un único gen, cuál era este gen y vamos a descubrir, desvelar la función de la proteína correspondiente a ese gen o todas las proteínas correspondientes a ese gen, porque muchos genes…
Francis Villatoro explica la actitud de Craig Venter tras la secuenciación del genoma humano, indicando que este esperaba recibir un premio Nobel y decidió cambiar de rumbo en su investigación.
Habla: Francis VillatoroPalabras #15premio nobel y craig ventersequenciación del genoma humanocambio de rumbo investigación venter…genoma humano, que se ha ido avanzando, se ha ido mejorando; había muchos problemas en ese, era un borrador, realmente era un borrador, no era una versión realmente definitiva. Ahora tenemos versiones mucho mejores, ¿no? Algunas publicadas recientemente. Pero ¿qué hizo Venter? Venter dijo, el premio Nobel me lo van a dar. Así que yo, a mí esto ya no me importa, me importa un comino. Yo voy a dedicar a otro tema. ¿Y cuál es el tema que a principios de los 2000 se puso de moda? alrededor del año 2000 se puso de moda la biología sintética. Básicamente por investigadores japoneses publicaron la idea de que era necesario y fundamental para el futuro de la humanidad que fuéramos capaces de hacer ingeniería de genes rigurosa y utilizando…
Francis Villatoro explica cómo se identificó la primera bacteria sintética, incorporando información personal y referencias al propio Craig Venter para marcarla.
Habla: Francis VillatoroSignificado #8 · Palabras #8bacteria sintética con dirección webgenoma de venter iniciativa privadaventer prometeo creador de vidanombre de venter en bacterias…Así, pero el resto de la bacteria es normal; ya, ya, sí, es normal. Cogemos una bacteria sencillita, le quitamos su ADN, fabricamos en laboratorio con síntesis química una molécula de ADN suficientemente larga y se la colocamos: primera bacteria sintética. En esa bacteria sintética, ¿cómo se sabe que es sintética? Bueno, pues porque le hemos puesto una dirección de una página web, porque le hemos puesto mi nombre; a Venter le encantó. Uno de los genomas que secuenció varios en la iniciativa privada fue el propio genoma de Venter. Venter puso su nombre en muchas cosas de las que hizo, y entonces bueno, eso le volvió famoso porque lo convirtió en una especie como de nuevo Prometeo, de creador de la vida, como el doctor Frankenstein. Cosas tan sencillas como sintetizar un ADN y ponerlo, ¿vale? La ventaja de la química, Juan Carlos aquí es el experto, es que una molécula es una molécula. La sintetice de manera natural una bacteria o la sintetice un químico en un laboratorio: la molécula es…
Francis Villatoro explica cómo Craig Venter logró gran visibilidad mediática gracias a publicaciones en la revista Science y cómo esto contribuyó a su reconocimiento como una figura destacada en la genómica.
Habla: Francis VillatoroPalabras #18síntesis química quiral premio nobelventer en science y genómicaquiralidad controlada técnicas recientes…¿vale? Si la molécula es la misma, ¿vale? Otra cosa es que hayamos añadido algún residuo, alguna cosita, un grupo funcional, alguna movida, ¿no? Entonces y bueno, hizo... o en antiómeros, o efectos ópticos. O efectos ópticos: mucha síntesis antigua generaba. Varias versiones quirales de las moléculas. Exactamente, quiralidad; y bueno, hoy en día ya eso está bastante controlado. Hay técnicas, de hecho han recibido premio Nobel recientemente las técnicas que han permitido sesgar toda la síntesis química para que solo salgan las que tengan una cierta quiralidad, etc. Entonces, Venter ha estado constantemente en los medios y ha tenido la gran suerte de que la revista Science le ha publicado muchísimas de las cosas que ha hecho y le ha dado mucho bombo y mucho platillo, con lo que se ha convertido uno de los grandes de la genómica de la historia de los últimos 50 años de historia. O sea que estamos ante el fallecimiento de una de las figuras, uno de los gurús más importantes que ha sido polémico y que todo el mundo esperaba, yo primero, esperábamos que recibiera el premio Nobel: un premio Nobel Collins-Benter al proyecto Genoma Humano.…
Francis Villatoro continúa su reflexión sobre James Watson, explicando que este tiene una imagen pública negativa, a pesar de haber sido director del proyecto Genoma Humano antes que Craig Venter.
Palabras #13imagen pública negativa james watsondirector proyecto genoma humano watson…otro personaje que aparece vemos a Collins y el siguiente nombre es Watson, ¿por qué? Porque hemos oído hablar mucho de él, porque ya tiene un premio Nobel, recordemos eso, y darle un segundo sería extraño, puede pasar, pero recordemos que es atípico y porque Tiene muy mala prensa, muy merecida; el malo le vale por eso como apelativo y también le hace un poquito más difícil que se reconozca su peso a pesar de haber sido también director del proyecto Genome Humano previamente a la entrada de Venter. Sobre Collins y acabo esta intervención que no quería que fuera demasiado larga. Francis ya lo ha dejado caer para todos los que Más o menos sepan de qué va el premio ese, pero es cierto que algunos no lo conocerán y Collins se ha acercado de forma muy explícita a la apología de la religión, del cristianismo además, durante los últimos años. No como algo personal, como una experiencia…
Tras reflexionar sobre la posibilidad de un Premio Nobel para Francis Collins, Héctor Socas abre el debate a comentarios finales sobre Craig Venter, destacando sus contribuciones visionarias y el alto nivel de vida que disfrutó como líder de una empresa científica.
Habla: Héctor SocasSignificado #9premio nobel para francis collinscontribuciones visionarias de craig ventercraig venter líder de empresa científica…Nobel, vamos a darle la mitad, no es habitual en la historia, es verdad que en los últimos años ha sido muy muy excepcional que le den el premio Nobel a una única persona, pero ha habido algún que otro caso Bueno, pues venga, vamos a ir pasando de tema, si Les parece. ¿Alguien quiere decir, quiere hacer algún último comentario sobre este asunto? Si no, pues nada, descanse en paz Craig Venter. Gracias por toda una vida de contribuciones y de ser un visionario y de hacernos avanzar. Bueno, y eso recordar que este tipo de visionarios que tienen empresas que reciben mucha financiación, al final viven muy bien, quiero decir, son científicos que viven con un nivel de vida muy superior al de un científico promedio ¿eh? y es verdad que dicen que ha sido una persona muy trabajadora y que el centro de su vida era el trabajo, pero también ha tenido dinero suficiente para disfrutar él y su familia de todo lo que implica ser el líder y fundador de una gran empresa. Bueno, hablando de gente que tiene dinero, de su familia y estas cosas, también mencionamos la semana pasada la polémica. Que se había suscitado porque la administración Trump, de golpe y porrazo, despidió, descabezó totalmente a la cúpula de la NSF, la Fundación Nacional para la Ciencia, que como les hemos dicho otras veces es un poco el organismo que lidera, que gestiona, que…