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Alberto ApariciBorja TosarGastón GiribetFrancis VillatoroHéctor SocasJuan Carlos Gildegradación química nucleótidos altera adnexceso citosinas indicador antigüedad adnartículos cráneo proteómica y adnADNAlberto ApariciADN mitocondrialADN nuclearDenisovanosFrancis VillatoroHomo longiNeandertalNeandertalesFrancisHomo SapiensDenisobanosSiberiaCueva de DenisovaDenisova 2Denisova 8Denisova 20
8000 Posiciones nucleótidos ADN
Con
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Alberto Aparici explica cómo la degradación química de los nucleótidos puede alterar la composición del ADN antiguo, llevando a un exceso de citosinas como indicador de antigüedad.
…que sacas de ese poquito de sarro que hay en el diente, el 90% es contaminación moderna solo una cantidad muy pequeñita es antiguo y para identificar que sea antiguo pues hay una serie de marcadores, por ejemplo en el ADN la adenina se convierte en citosina. si no recuerdo mal Hay una serie de cambios químicos que ocurren simplemente porque los nucleótidos se degradan químicamente y hacen que un nucleótido que debería ser de un tipo se convierta en un nucleótido de otro tipo Entonces si tú ves un exceso de citosinas en el ADN, tienes un cierto argumento en favor de que ese ADN es más antiguo y por lo tanto no es contaminación con este cráneo se han publicado dos artículos, uno es sobre ADN, que es de lo que estoy hablando todo el rato, y hay otro que es sobre proteómica se han sacado también proteínas antiguas de ese pedazo de sarro y se han analizado y en las proteínas ocurre lo mismo se producen una serie de desaminaciones, desaparecen ciertos grupos amina cuando las proteínas pasan mucho tiempo y se van degradando y eso te…
Palabras #1
Francis Villatoro explica el proceso de análisis de ADN nuclear realizado sobre el sarro encontrado en un diente del cráneo conocido como 'Homo longi', y las dificultades para secuenciar fragmentos suficientemente largos.
Habla: Francis VillatoroSignificado #12 · Palabras #7adn nuclear homo longisecuenciación adn denisobanosvariabilidad humana moderno leandertalespuzzle adn referencia humano…pura emoción. Aquí los Men in Black empiezan a trabajar porque iba a decir algo importante como que es extraterrestre, que es lo que dice David Loeb. El próximo artículo. Bueno, en principio de este sarro, de esto que han encontrado en el diente han hecho un Análisis de ADN buscando ADN nuclear porque el ADN nuclear es el más claro. El ADN nuclear es muchísimo más largo y, por tanto, aunque encuentres muchos trozos, puedes acoplarlo, puedes ajustarlo a un ADN de referencia, un ADN de referencia humano y ver las diferencias; y esas diferencias de un único nucleótido, etcétera, son las que marcan si estás en una especie o en otra, si están dentro de la variabilidad propia del humano moderno o si corresponden a algo parecido a las variantes que se han observado en leandertales o las que se han observado en denisobanos. Y no se encontró, no se logró aislar adecuadamente, o sea, no se logró secuenciar, en la palabra técnica, trozos suficientemente largos porque lo que hace es coger los trozos e irlos poniendo como en un puzzle. Yo tengo varias. Copias de una pequeña región y tengo trozos un poquito más grandes que esa región y los voy colocando como en vertical y voy pegándolos como si fueran piecitas de Lego que voy colocando con los colores adecuados. Entonces no se logró reconstruir ADN nuclear,…
Alberto Aparici explica las diferencias entre el ADN mitocondrial y el ADN nuclear, destacando la cantidad de genes presentes en cada uno.
Habla: Alberto ApariciSignificado #3adn mitocondrial de denisovanossecuenciación genomas antiguos neandertalesabundancia adn mitocondrial en célulasadn mitocondrial denisovano 16500 basesadn nuclear humano 3200 millones basesdiferencia adn mitocondrial nuclear albertoadn mitocondrial un millón veces más cortoadn mitocondrial humano tiene 37 genesadn nuclear posee unos 21000 genespseudogenes en adn nuclear suman 30000adn basura función desconocidaadn mitocondrial más fácil encontrarreconstruir árbol genealógico humanoposición individuo en familia humanareiniciar archivos alberto apariciadn mitocondrial cráneo homo longirelación denisova 2 con homo longidenisova 3 y 4 como primos lejanos…la mitocondria originalmente era una bacteria Es una bacteria que nuestros antepasados, nuestros tataratatarabuelos unicelulares, se incorporaron, digamos, esa bacteria al interior de las células Y en cada célula humana normalmente hay decenas, centenares, a Veces miles de mitocondrias. Entonces, copias del ADN de cada mitocondria hay muchísimas en cada célula. En cambio, copias del ADN de la célula, hay una en cada célula, con lo que cuando tienes escasez de ADN lo que encuentras primero siempre es el ADN mitocondrial. De hecho, cuando se empezaron a secuenciar los genomas de neandertales y todo esto también lo primero que se encontró es el ADN mitocondrial. Entonces, este ADN aunque es más corto y desde luego da poca información sobre el metabolismo digamos del Denisovano pues sí que permite saber cuál es su posición en el árbol familiar, Francis. Alberto, ¿qué significa más corto? Pues significa que el ADN mitocondrial, humano, neandertal, denisovano, son unos 16.500 bases. Exacto. Y el ADN nuclear, dividido en diferentes cromosomas, en el humano son 3.200 millones de bases. La diferencia entre 3.200 millones y 16.000 es lo que llama Alberto más corto Es concretamente casi un millón de veces más corto, de hecho, es extremadamente breve en comparación con el ADN nuclear, que es como se Llama el otro. El número de genes son 37 genes los que tiene el ADN mitocondrial humano y el ADN nuclear tiene unos 21.000 genes, más unos 30.000 pseudogenes, más una enorme cantidad de cosas aparte. Sí, exacto, este ADN que tradicionalmente se ha llamado ADN basura y que ahora ya no nos gusta mucho usar eso porque nos damos cuenta que muchas partes tienen alguna función, pero bueno, que la cuestión es que a cambio de ser muchísimo más corto hay muchísimas más copias con lo que Es mucho más fácil encontrar ADN mitocondrial que encontrar ADN nuclear, en ese sentido, y ese es el que se ha encontrado y es suficiente como para poder reconstruir la posición de este individuo en concreto dentro del árbol de la familia humana. Y aunque se me han cerrado los archivos porque he tenido que reiniciar, es claro que donde está más cerca es de los Denisobanos de Siberia, los denisobanos de la cueva de Denisova, si no recuerdo mal; espera, dejadme que lo abra y así os digo bien la posición en el árbol familiar de todo esto, pero ya solo con esa pequeña cantidad de ADN podemos más o menos identificar con qué humanos estaba más relacionado. Y efectivamente, lo que veo aquí es que está relacionado con Denisova 2, Denisova 8, Denisova 20, 19, mientras que Denisova 3 y 4, que son más recientes, están como primos; están un poquito más lejos en ese sentido. Con lo que esto confirma la posible datación de estos estratos del puente del río este, tal y cual Porque Denisova 8, Denisova 2, los que están más cerca de este, tienen edades de 190.000 años, 123.000 años, 180.000 años. Con lo que bueno, más o menos estamos…
Alberto Aparici explica cómo la degradación química de los nucleótidos puede alterar la composición del ADN antiguo, llevando a un exceso de citosinas como indicador de antigüedad.
Habla: Alberto ApariciPalabras #1degradación química nucleótidos altera adnexceso citosinas indicador antigüedad adnartículos cráneo proteómica y adn…que sacas de ese poquito de sarro que hay en el diente, el 90% es contaminación moderna solo una cantidad muy pequeñita es antiguo y para identificar que sea antiguo pues hay una serie de marcadores, por ejemplo en el ADN la adenina se convierte en citosina. si no recuerdo mal Hay una serie de cambios químicos que ocurren simplemente porque los nucleótidos se degradan químicamente y hacen que un nucleótido que debería ser de un tipo se convierta en un nucleótido de otro tipo Entonces si tú ves un exceso de citosinas en el ADN, tienes un cierto argumento en favor de que ese ADN es más antiguo y por lo tanto no es contaminación con este cráneo se han publicado dos artículos, uno es sobre ADN, que es de lo que estoy hablando todo el rato, y hay otro que es sobre proteómica se han sacado también proteínas antiguas de ese pedazo de sarro y se han analizado y en las proteínas ocurre lo mismo se producen una serie de desaminaciones, desaparecen ciertos grupos amina cuando las proteínas pasan mucho tiempo y se van degradando y eso te…
Alberto Aparici explica el proceso de análisis de ADN antiguo, detallando cómo los rigurosos tests aplicados reducen significativamente la cantidad de material genético utilizable.
Habla: Alberto ApariciSignificado #1 · Palabras #2tests severos reducen material genético2000 fragmentos adn analizados8000 posiciones nucleótidos adn…pasan mucho tiempo y se van degradando y eso te permite saber que las proteínas que estás sacando de ahí son proteínas antiguas o por lo menos tienen una alta probabilidad de ser proteínas antiguas en ese sentido. O sea que hay toda una serie de tests que Tú tienes que hacer para no estar analizando ADN, ¿qué pasaba por ahí simplemente? Y esos tests se hacen; son tests muy severos y te suelen dejar con muy poquito del ADN que tú sacabas. Tú sacas una gran cantidad de ADN y al final igual te quedas con, me parece que en este caso eran unos 2.000 fragmentos o algo por el estilo. Estoy hablando de memoria, no estoy seguro. No, estoy viendo aquí 8.000 posiciones de nucleótidos. Por lo tanto, 8 .000 pares de bases en total del ADN que tú vas a analizar. Es muy poquito, en realidad. Desde luego, además que no crean los oyentes que lo que estamos sacando de aquí es el ADN de una mitocondria como quien tira de una cuerda y lo saca entero. No, no, tú lo que tienes es muchos trocitos muy chiquitines. Me parece que la media de cada trocito…
Alberto Aparici explica cómo se pueden comparar fragmentos de ADN mitocondrial obtenidos de diferentes especies, incluyendo Homo Sapiens y Neandertales, para determinar la posición del cráneo 'Homo longi' en el árbol evolutivo.
Habla: Alberto ApariciPalabras #12adn mitocondrial homo sapienscráneo homo longi árbol evolutivoposición cráneo denisovanos tetris…No, no, tú lo que tienes es muchos trocitos muy chiquitines. Me parece que la media de cada trocito son 16 pares de bases o algo por el estilo. Son extremadamente pequeños y luego has de hacer una especie de trabajo de reconstruir como si fuera un puzle en Plan de bueno, el final de este trocito se parece al principio de este otro, con lo que igual los podemos poner juntos y comparando eso con el ADN mitocondrial que conoces de Homo Sapiens. Desde luego que es el mejor conocido de Neandertales; de Denisovanos pues puedes armar como una especie de Tetris en donde tienes todas estas cosas y eso ya te permite, digamos, analizar la posición del cráneo en el árbol familiar. Y esto es básicamente lo más importante. ¿Podemos hablar así, Francis? Yo quería hacer un pequeño comentario Que es un comentario de carácter histórico Tras el descubrimiento con Paleogenómica Por el grupo de Svante Pavo del primer Denisovano En 2010 se analizó obviamente restos de la cima de los huesos en España Y se publicó en…
Francis Villatoro explica la cantidad de ADN mitocondrial necesaria para diferenciar especies como Neandertales y Denisovanos, señalando que incluso secuenciar la mitad podría ser suficiente según algunos investigadores.
Habla: Francis VillatoroSignificado #9secuenciación genoma mitocondrial completodiferencias entre especies próximas edad metocondrialprecisión secuenciación par de bases posición 27base de datos diferenciación especiessecuenciación genoma mitocondrial denisovanosadn mitocondrial neandertal y denisovanosecuenciadores adn mitocondrial completo…decir, si yo cojo dos especies de la naturaleza y estudio su ADN mitocondrial la edad del mitocondrial se secuencia perfectamente todas y cada una de las bases y lo tengo completo. Entonces puedo compararlo y puedo hacer cierta filogenia con muchas garantías. En la edad metocondrial hay diferencias entre especies próximas, pero como lo podemos secuenciar con una enorme cobertura, es decir, con una precisión que tiene una garantía absoluta de que el par de bases en la posición 27 son exactamente eso, pues podemos diferenciarlos con muy pocas diferencias; podemos ir directamente a la base de datos y encontrarlos. O sea, no es una cuestión de tipo necesito encontrar: ¿qué necesito encontrar? ¿El 90%? ¿El 80%? Bueno, para diferenciar especies depende del trozo de ADN mitocondrial. En el caso de diferenciar entre Neandertal y Denisovano, pues no sé ahora mismo cuál es el porcentaje concreto necesario para tener la garantía de que haya una diferencia clara, ¿no? Pero lo que sí es cierto es que secuenciando como la mitad, estos investigadores creen que sí es posible hacer la diferencia, pero hay artículos previos del pasado en los que se hizo algo parecido y no funcionó, entonces lo ideal sería poder secuenciar el ADN mitocondrial completo porque es muy pequeñito; es que 16.000, ahora mismo tenemos secuenciadores capaces de. secuenciar tiras completas de 16.000 bases, de pares de bases Pregunta Lorenzo Escartín, esta creo que puedo dar yo por lo menos una primera aproximación, pregunta si existe alguna idea sobre a qué escala se deberían buscar las ondas gravitacionales…