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Luisa AchaerandioIsabel CorderoJuan Carlos GilIgnacio CrespoFrancis VillatoroHéctor SocasGastón Giribetángulos dihidros conectan grupos aminosestructura tridimensional proteína alineación aminoácidoshojas beta y hélices alfa proteínasLuisa AchaerandioRyugu6-metiluracilo
Ángulos dihidros conectan grupos aminos
Ep551: Ryugu; Gravitondas; DeepMind y Debate IA; Criogenización; Consciencia
26 de marzo de 20262 momentos
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Luisa Achaerandio explica cómo conectar la biología molecular con la estructura de las proteínas y su representación en ordenador, introduciendo el concepto de ángulos dihidros.
…la biología, es decir, la biología estructural con la genómica computacional, es decir, el cómo llegas ahí, ¿vale? ¿Cómo es realmente que se pliega esa proteína? Con tres frases lo digo cuando tú quieras. Venga, porque lo diga ya. Ah, vale, pues ahora, claro. Claro, sí, sí. Pues básicamente, si tú quieres conectar biología molecular con la estructura de esas proteínas, con realmente pasarlas a un ordenador, hay una regla básica. Una regla básica de estructura, es decir, de ángulos, en este caso son los ángulos dihidros que conectan los grupos aminos, ¿vale? Esos ángulos tienen una, digamos, una orientación que solamente pueden estar en un sentido y en otro no; y luego a nivel molecular tú puedes montar la estructura tridimensional de la proteína como con una alineación de esos aminoácidos, uno al lado del otro, formando hojas beta o uno enfrente de otro de alguna manera para formar hélices alfa. Y solamente una estructura concreta funciona como si fuera una llave a una cerradura, no otra. Por eso hay reglas básicas. Por lo tanto, podemos trasladar esos ángulos, esas posiciones, esas apetencias nucleares a nivel atómicas para decir: esta estructura lo…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio explica cómo se producen los isómeros, detallando el proceso de desaminación y ejemplificándolo con la formación de 6-metiluracilo a partir de timina en muestras del asteroide Ryugu.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #14 · Palabras #2desaminación en asteroide ryugu6-metiluracilo derivado de timinaisómeros estructurales de timinaluisa achaerandio explica desaminación…también aparecen isómeros. ¿Qué es un isómero? ¿Alguien lo sabe por aquí? Lo respondemos rápido, brevemente, ¿qué es un isómero? Se nota que eres una profesora. Ahora estamos todos mirando para otro lado diciendo que no me mire, que no me mire a mí la profe. Tienen la misma molécula pero se organizan de forma distinta. Exactamente, con una estructura diferente. ¿Pero sabéis cómo se pueden producir esos isómeros? Pues básicamente hay una estrategia o una química que puede ocurrir ahí que es la desaminación, que no la desanimación, ¿vale? La desaminación. Eso significa que un grupo amino, por eso os digo que es muy bueno tenerlo a la vista, estos anillos, un grupo amino de estas bases, recordamos que pueden ser púricas o pirimidínicas, pirimidínicas de un solo anillo, púricas de dos, ese grupo amino se sustituye por un óxido, con lo cual se oxida, se oxida esa base. Y por lo tanto en Ryugu nos encontramos con isómeros como el 6-metiluracilo que es un isómero estructural de la timina. El 5-metiluracilo es timina. Fijaros la magia también de las cosas. Otros isómenos que se encuentran son hiposantina, que es un isómero de la adenina, también por desaminación, la santina, que es lo mismo, un isómero por desaminación de la guanina, entre otros. Estos fenómenos simplemente porque lo sepáis, ocurren también en…
Luisa Achaerandio explica cómo conectar la biología molecular con la estructura de las proteínas y su representación en ordenador, introduciendo el concepto de ángulos dihidros.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1ángulos dihidros conectan grupos aminosestructura tridimensional proteína alineación aminoácidoshojas beta y hélices alfa proteínas…la biología, es decir, la biología estructural con la genómica computacional, es decir, el cómo llegas ahí, ¿vale? ¿Cómo es realmente que se pliega esa proteína? Con tres frases lo digo cuando tú quieras. Venga, porque lo diga ya. Ah, vale, pues ahora, claro. Claro, sí, sí. Pues básicamente, si tú quieres conectar biología molecular con la estructura de esas proteínas, con realmente pasarlas a un ordenador, hay una regla básica. Una regla básica de estructura, es decir, de ángulos, en este caso son los ángulos dihidros que conectan los grupos aminos, ¿vale? Esos ángulos tienen una, digamos, una orientación que solamente pueden estar en un sentido y en otro no; y luego a nivel molecular tú puedes montar la estructura tridimensional de la proteína como con una alineación de esos aminoácidos, uno al lado del otro, formando hojas beta o uno enfrente de otro de alguna manera para formar hélices alfa. Y solamente una estructura concreta funciona como si fuera una llave a una cerradura, no otra. Por eso hay reglas básicas. Por lo tanto, podemos trasladar esos ángulos, esas posiciones, esas apetencias nucleares a nivel atómicas para decir: esta estructura lo…