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Ribosoma añade aminoácido a aminoácido
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Francis Villatoro explica el origen y las causas del mal plegamiento de proteínas, específicamente en relación con los priones.
…¿Silverine o Silverine Maxilver?. Preguntaba originariamente Néstor si las proteínas con quiralidad invertida son los temibles priones y añadía Maxilver que es difícil que los priones tengan aminoácidos de estrógidos cuando en la Tierra son levógidos, ¿no? Sí, no tiene nada que ver. El prion básicamente es una proteína que está mal plegada. Claro, son las mal plegadas. ¿Y por qué está mal plegada? Pues porque tiene una mutación. Hay ciertos aminoácidos que están cambiados. Hay una mutación que hace que un aminoácido que es clave en el plegamiento y que hace que muchas veces en el plegamiento el ribosoma va añadiendo aminoácido a aminoácido y hay un proceso en el que se va reestructurando la estructura conforme se va sintetizando la proteína. La proteína está como una cosa alargada y se va doblando y se conformando y depende pues del entorno, del agua, que lo envuelve todo, pero también de la propia estructura del ribosoma, de la propia estructura de la propia proteína. Entonces a veces cambiar un único aminoácido hace que una proteína se pliegue de una manera ligeramente distinta. Y un aplicamiento ligeramente distinto, pues normalmente no tiene ningún tipo de consecuencia; de hecho, hay muchas proteínas que tienen partes móviles, pero si afecta al sitio activo, al lugar donde está, digamos, radicada la función biológica de la…
Significado #2 · Palabras #1
Gastón Giribet explica la relación entre los aminoácidos y la vida en la Tierra, comparando la complejidad de las proteínas con la de estos compuestos orgánicos básicos.
Habla: Gastón GiribetSignificado #5 · Palabras #7nucleobase composición del adn arnaminoácidos en el asteroide bennuproteínas macromoléculas orgánicasaminoácidos como ladrillos fundamentalesproteína complejidad superior a aminoácidomoléculas orgánicas y vida en la tierradécada del 50 y conocimiento de aminoácidos…Pero bueno, lo sorprendente de Bennu es que se encontraron que en sus tierras, digamos, había 5 de las nucleobases que forman los ácidos desoxirribonucleicos y ácidos ribonucleicos que conocemos. Es decir, el ADN y el ARN en la Tierra tienen en particular... recordemos lo que es una nucleobase, una nucleobase es una base nitrogenada Es una, es aquellas cosas de las que se componen los nucleócidos que luego dan lugar a los nucleótidos Pero bueno, lo importante es que son bases nitrogenadas que están, son 5 de las formas de las que forman el ADN y el ARN que tenemos en la tierra Esa es una observación, pero no solamente eso, sino que si no recuerdo mal, 14 de los 20 aminoácidos que existen en las proteínas Recordemos que las proteínas son unas macromoléculas orgánicas que tienen cadenas de aminoácidos Los aminoácidos son moléculas más pequeñas, moléculas orgánicas también, y 14 de los 20 aminoácidos que existen en las proteínas conocidas están en Bennu En la Tierra los aminoácidos son elementos que tienen que ver con la vida en la Tierra. Estas moléculas orgánicas a ver, para que entendamos, la proteína es una cosa mucho más compleja que un aminoácido, muchísimo más compleja que un aminoácido, pero los aminoácidos son elementos, son ladrillos fundamentales para la vida que conocemos. Recordemos, ustedes recordarán por ejemplo allá por la década del 50, no porque ustedes se acuerden, ninguno de nosotros había. nacido, pero el experimento Stanley Miller, ¿no? de la década del 50, ese experimento pionero en el cual el tipo era una gran probeta, puso no solamente... ¿Cómo? Era Uri Miller, el experimento. Ah, puede ser ese Uri Miller. Uri, Stanley Miller. Stanley…
Gastón Giribet continúa hablando sobre el experimento realizado por Uri Stanley Miller para simular las condiciones iniciales de la Tierra, mencionando los resultados obtenidos.
Habla: Gastón GiribetPalabras #16aminoácidos en experimento millernucleobases en binnuproteínas formadas por aminoácidos…al menos en ese momento ellos creían que la Tierra había tenido en el momento de formación de la vida. Era una condición, por decirlo de alguna forma, necesaria: eran las condiciones suficientes para que la vida se diera, y en efecto, Miller había logrado. Encontrar no proteínas pero aminoácidos, si no recuerdo mal. O sea que era como uno de los primeros intentos por emular esas, si no recuerdo mal, había logrado aminoácidos. Bueno, los aminoácidos son constituyentes muy importantes; forman las proteínas y en particular estas nucleobases que encontraron ahí, cinco de las nucleobases que forman el ácido desoxirribonucleico y ácido ribonucleico en la Tierra están en la presencia en Bennu y 14 de los 20 aminoácidos que existen en las proteínas conocidas también. Entonces, eso es interesante, pero hay un caveat acá que lo hace, en mi opinión, más interesante todavía, que es que los aminoácidos que forman la vida en la Tierra son predominantemente levógiros, no dexógiros, es decir, giran para un lado. Son moléculas que…
Gastón Giribet explica que los aminoácidos encontrados en la Tierra y en el asteroide Bennu, aunque sean imágenes especulares entre sí, provienen de fuentes diferentes.
Habla: Gastón GiribetSignificado #14 · Palabras #15aminoácidos encontrados en tierraasteroide bennu imágenes especularesfuentes distintas de aminoácidos…es química, la química es electromagnetismo y mecánica cuántica, y todas estas teorías son simétricas ante derecha e izquierda; si una molécula es posible, su versión especular también lo es. Así que a priori no hay ningún problema con que eso sea así. Pero lo que nos está diciendo es que sea cual fuere la fuente original de los aminoácidos que nosotros encontramos en la Tierra y de los aminoácidos que encontramos en Bennu, que son los mismos pero reflejados en el espejo, son fuentes distintas. ¿Está bien? Porque no hemos sido impregnados. Con el mismo material por la misma fuente, porque si no tendríamos los mismos aminoácidos girando para el mismo lado. Entonces, en ese sentido, hay un par de trabajos que salieron esta semana: hay un trabajo de McCoy y hay un trabajo de Daniel Glavin. Y…
Gastón Giribet reflexiona sobre el hallazgo de aminoácidos especulares en el asteroide Bennu, destacando la importancia de una misión espacial que recolectó muestras.
Habla: Gastón GiribetPalabras #19sonda lanzada en 2016 a asteroide…está más cerca que todos esos otros astros del sistema solar en los cuales todavía albergamos la esperanza de que haya condiciones para la formación de algún tipo de vida simple, pero vida al fin. Así que bueno, me pareció un resultado muy importante de. Esta, bueno, es una terrible empresa, ¿no? También lanzar en el 2016 una sonda que llegue a un asteroide, que le pega un asteroide de 500 kilómetros de diámetro, llegue ahí, inserte un brazo, saque un pedazo de polvo, lo trae a la Tierra y encontremos aminoácidos ahí, encima aminoácidos, que son la versión especular de los que encontramos en la Tierra, lo cual está buenísimo, porque ahí no podemos abusir que hay algún tipo de contaminación ni nada, estamos encontrando algo que se parece mucho, pero que no es exactamente, entonces a mí me pareció una de las noticias más relevantes del año, Por eso el otro día cuando hablábamos en otro…
Héctor Socas reflexiona sobre la percepción popular de los aminoácidos y cómo su descubrimiento generalizado en diversos lugares del universo ha cambiado esa visión.
Habla: Héctor SocasPalabras #8aminoácidos en asteroidesnubes moleculares y aminoácidosaminoácidos en nubes interestelaresbases de la vida en cualquier sitioproteínas y aminoácidos relacióncélula como base de proteínaproteína comparada con la vida…encontrado compuestos orgánicos, moléculas orgánicas, que se han encontrado aminoácidos, que son la base del ADN, la base de la vida, o sea, generamos una impresión como que hay una relación más directa o hay una distancia corta entre aminoácidos y la vida. O sea, que parece que ya aquello hay. Uno me dice aminoácidos y yo me imagino un conejo. Claro, y hay que recordar, yo tenía esa impresión también, y cuando empecé a ver, bueno, al poco de terminar la carrera, y empecé a ver noticias así de los últimos avances en astrofísica y tal, había esta explosión de encontrar aminoácidos por todas partes: se encontraban aminoácidos en asteroides, en nubes moleculares, en mitad del espacio interestelar. Aminoácidos, pues sí, se han encontrado aminoácidos en nubes interestelares. O sea que esto lo que nos dice es dos cosas: primero, que las bases de la vida se forman prácticamente en cualquier sitio, a poco que les dé lo mínimo indispensable. Pero que de ahí, como decía Gastón, a las proteínas hay un buen trecho; o sea, una proteína es algo, o sea, un aminoácido para una proteína puede ser, no sé, me lo estoy inventando, pero como una célula para nosotros, es una base, pero es algo muy pequeñito comparado con lo que es la proteína, que a su vez es algo muy pequeñito comparado con cualquier cosa que podamos pensar como vida. Entonces, llamar un poco la cautela en eso; creo que el resultado, no es que se haya descubierto Que los asteroides hay aminoácidos, eso no es tan sorprendente, pero bueno, si el tener, como siempre, la cuantificación, el detalle, es la primera vez que se ve esto en tanto detalle, por supuesto, o sea, una cosa es decir que hay aminoácidos y otra cosa es…
Francis Villatoro explica la diferencia en la quiralidad entre los aminoácidos y los nucleótidos, destacando que los primeros son levógiros mientras que estos últimos son dextrógiros.
Habla: Francis VillatoroSignificado #7 · Palabras #6aminoácidos levógiros en la vidanucleótidos dextrógiros de adn arnquiralidad de aminoácidos y nucleótidos gastón…en el espacio hay un equilibrio de quiralidades, ¿no? No de todos se han encontrado las dos versiones, pero de muchos se han encontrado las dos versiones y en proporción relativamente similar; pero pues serán pocas las moléculas que se han detectado. Gastón ha destacado los aminoácidos que están en la vida. Para los países se han encontrado claramente 33 aminoácidos, entre ellos 14 de los 20 que están en nuestras proteínas de manera normal, porque también la vida terrestre también tiene algunas excepciones con algún que otro aminoácido. Y se han encontrado 23 nucleótidos, entre ellos los 5 de ADN y ARN. No sé si quedó claro cuando lo contó Gastón, los aminoácidos tienen quiralidad levógira, pero en los nucleótidos tienes una núcleo base, que es un azúcar; ese azúcar es de quiralidad estrógira, ¿vale? Los aminoácidos son levogiro y los nucleótidos son destrógiro. Y también creo recordar que Bennu es un asteroide muy primitivo, que por eso fue un objetivo elegido para esta misión, con lo cual eso nos salva la pregunta de si puede haber ese material; puede haber llegado ahí en algún impacto o algo así. Eso, en…
Francis Villatoro explica cómo los aminoácidos presentes en Bennu podrían haberse formado previamente en una nube molecular ubicada en la parte externa del sistema solar.
Habla: Francis VillatoroPalabras #18aminoácidos en nube molecular bennuprecursor de bennu sistema solar exterior…al caer a la Tierra se impregnaron la tierra de... eso es lo que sería panspermium; en cambio no, esto es algo que se debe haber formado ahí in situ, igual que probablemente se forma en cualquier sitio donde haya los elementos químicos. Dijiste al principio. No que se haya formado Bennu, sino que la nube molecular de la cual salen los restos que forman el precursor de Bennu contenía ya los aminoácidos. O sea, los aminoácidos se habían formado en una nube molecular que estaba en la parte externa porque parece que se formó lejos; ahora está muy cerca en la parte del sistema solar interior, pero el precursor estaba en la parte del sistema solar exterior y entonces se cree que había una nube molecular que tenía ya esos aminoácidos y esas sustancias. Estas circunstancias orgánicas que estaban en esos residuos, que formaron esos planetes animales, que acabaron formando el precursor de Bennu. Exacto, porque como hemos dicho, se encuentran estos aminoácidos en nubes moleculares. Sí, sí, y se han encontrado…
Francis Villatoro explica el origen y las causas del mal plegamiento de proteínas, específicamente en relación con los priones.
Habla: Francis VillatoroSignificado #2 · Palabras #1prion proteína mal plegadamutación aminoácidos clave plegamientoribosoma añade aminoácido a aminoácidoestructura proteína entorno agua…¿Silverine o Silverine Maxilver?. Preguntaba originariamente Néstor si las proteínas con quiralidad invertida son los temibles priones y añadía Maxilver que es difícil que los priones tengan aminoácidos de estrógidos cuando en la Tierra son levógidos, ¿no? Sí, no tiene nada que ver. El prion básicamente es una proteína que está mal plegada. Claro, son las mal plegadas. ¿Y por qué está mal plegada? Pues porque tiene una mutación. Hay ciertos aminoácidos que están cambiados. Hay una mutación que hace que un aminoácido que es clave en el plegamiento y que hace que muchas veces en el plegamiento el ribosoma va añadiendo aminoácido a aminoácido y hay un proceso en el que se va reestructurando la estructura conforme se va sintetizando la proteína. La proteína está como una cosa alargada y se va doblando y se conformando y depende pues del entorno, del agua, que lo envuelve todo, pero también de la propia estructura del ribosoma, de la propia estructura de la propia proteína. Entonces a veces cambiar un único aminoácido hace que una proteína se pliegue de una manera ligeramente distinta. Y un aplicamiento ligeramente distinto, pues normalmente no tiene ningún tipo de consecuencia; de hecho, hay muchas proteínas que tienen partes móviles, pero si afecta al sitio activo, al lugar donde está, digamos, radicada la función biológica de la…
Francis Villatoro explica que el organismo humano no puede utilizar aminoácidos de quiralidad incorrecta y que las proteínas artificiales con estos aminoácidos son destruidas durante el reciclaje celular.
Habla: Francis VillatoroSignificado #11 · Palabras #12aminoácidos de quiralidad incorrectaproteínas artificiales reciclaje celularmaquinaria humana aminoácidos utilizables…ese tipo de cosas, y son proteínas que alteran ligeramente la función que tienen que hacer y entonces esa función alterada pues tiene una implicación, una función biológica modificada, una implicación patológica. Pero no tiene nada que ver; no es que en el organismo humano, si tú introduces aminoácidos de la quilaridad incorrecta, no son utilizables por la maquinaria. O sea, la maquinaria no es capaz de construir proteínas con esos aminoácidos. Y si tú introduces una proteína que tenga algunos de esos aminoácidos de la quilaridad opuesta, en principio podría funcionar, o sea, podría ser una proteína artificial, podría ser función si la parte funcional no se ve afectada, pero cuando las proteínas acaban siendo recicladas, acaban siendo, digamos, destruidas, cortadas, etc., acabaría cortándose y acabaría resultando que quedan ahí unos aminoácidos que después no se pueden aprovechar para hacer otras proteínas. O sea que en principio no tiene nada que ver. Gastón, creo que querías comentar algo. No, yo no sé nada de biología, la verdad; de química orgánica muy poco, pero los priones tienen esta cosa también de que ese plegado es una proteína plegada, como bien explicaba Francis; pero también tiene a veces cierta propensión a contagiar ese plegado, a…
Francis Villatoro explica cómo la presencia de una proteína priónica afecta el proceso de síntesis proteica en las células, interfiriendo con la función del ribosoma.
Habla: Francis VillatoroSignificado #1 · Palabras #2proteína priónica afecta síntesis proteicaribosoma pliega mal proteínas sintetizadasarn mensajero codifica proteína ribosomaprión altera función del ribosoma…entonces los priones tienen esa peculiaridad de que se replican, es decir, cuando en una célula tenemos esa proteína modificada que es el prion, cuando se va a sintetizar esa proteína a partir del código genético, si está, perdón, a partir del gen que Codifica la proteína, del ARN mensajero que le llega al ribosoma; si hay el prion, el ribosoma tiende a plegar mal lo que está sintetizando. Es decir, recibe un código que le dice qué aminoácidos tiene que poner, pero cuando está plegándose la proteína, si está cerca la proteína priónica, altera la función del ribosoma; muchas veces bloquea, porque esto es un proceso, ya os digo, está fabricando uno a uno. O sea, se están pegando yo recibo los aminoácidos y los voy pegando y se va plegando la proteína si. las pocas proteínas que son priones está cerca, altera ese plegamiento y hace que se pliegue mal entonces la proteína mal plegada altera la formación de la proteína buena con lo que eso hace que se replique el prion y actúa entre comillas con una especie como…