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Luisa AchaerandioJuan Carlos GilGastón GiribetIgnacio CrespoFrancis VillatoroHéctor Socassecuenciación de hemophilus influenzaeproyecto genoma humano waxon collinstécnicas lentas proyecto genoma humanogarantías secuenciación orden adecuadoshotgun de venter y celera genomicssecuenciación del genoma humano por celerajcvi y técnica shotgun de ventercelera genomics frente al proyecto genomaWaxonCollinsProyecto Genoma HumanoAemófilos InfluenzalesFrancis VillatoroLuisa AchaerandioJames WatsonCraig CollinsCraig VenterPremio Nobelproyecto Genomo AmanoIgnacioNIH (Institutos Nacionales de la Salud)hospitales Carlos IIIFrancis CollinsIniciativa PúblicaHiggspremios Nobelsiglo XIXCelera GenomicsSupernovaCraig Venter Institute
Proyecto Genoma Humano waxon Collins
Con
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Francis Villatoro explica las características de *Aemófilos Influenzales*, una bacteria que causa infecciones respiratorias, y contrasta su secuenciación con la metodología del Proyecto Genoma Humano.
…como gripe, pero bacterial. Y ya está, solo aquí porque estoy estrenándome con interrupciones en el programa. Muchas gracias por la aclaración y los oyentes que perdonen la voz que tiene Ignacio, pero está un poco tocado. Luisa, ¿tú querías decir algo más? No, eso, lo mismo, lo mismo, que básicamente era eso, que era una gripe bacteriana. O sea, un tipo de infección respiratoria bacteriana de un microorganismo, microorganismo gran negativo que se llama Aemófilos Influenzales. El proyecto Genoma Humano era un proyecto garantizado; era un proyecto riguroso que inició el premio Nobel, Waxon, y que continuó Collins, su sucesor como director del proyecto Genoma Humano, y era saber muy bien dónde se encuentra un trozo que yo voy a secuenciar y después con técnicas extremadamente lentas y extremadamente bioquímicas, demasiado húmedas, demasiado de laboratorio, ir secuenciando poco a poco ese gran trozo. Partirlo en trozos grandes y secuenciar esos trozos y tener garantías siempre de que lo estás haciendo en el orden adecuado y que tienes una muy buena localización de ese trozo. Eso, bueno, era un proyecto que en principio era lento, fue avanzándose en las tecnologías de secuenciación y fue acelerándose y ya alrededor del año 2000 ya estaba a buen ritmo e incluso llegó a utilizar las técnicas de shotgun de perdigonazos de Venter y Venter vio que podía, en paralelo a lo que estaba haciendo con su empresa, su instituto JCVI, podía crear una empresa bien financiada, la creo muy tarde, Celera Genomics, es del 98, con muy buena financiación para utilizar su técnica de secuenciación, de shock gun, para secuenciar el genoma humano. y hacer una iniciativa privada en paralelo a la iniciativa pública y que quizás pudiera vencer a la iniciativa pública. ¿Qué problema tenía la técnica shotgun? Pues la técnica shotgun tiene el problema de que realmente no sabe lo que está secuenciando ni dónde está, ¿vale? Hay una enorme cantidad, por ejemplo, las zonas repetitivas. Tú como una zona repetitiva AT, AT, AT, AT,…
Significado #1 · Palabras #1
Francis Villatoro continúa explicando el contexto del Proyecto Genoma Humano, comparándolo con la técnica más innovadora desarrollada por Craig Venter para secuenciar genomas.
Habla: Francis VillatoroSignificado #4 · Palabras #13proyecto genoma humano públicosecuenciación con técnica estándarsecuenciar hemophilus influenzae…decidió, digamos, poder empezar a, entre comillas, comercializar el secuenciar cosas. Pero claro, en los 90 había una gran iniciativa, que es una iniciativa de principios de los 90, que era el Proyecto Genoma Humano, que desde la gran institución, el NIH, los Institutos Nacionales de Salud en Estados Unidos, que es la gran institución que financia la investigación biomédica, en España serían el Instituto, ¿cómo se llama? Los hospitales Carlos III, bueno, Carlos III, no me acuerdo de las siglas exactas, me acabo de olvidar. Este proyecto genoma humano proponía a nivel público secuenciar todo el genoma humano pero utilizando una técnica estándar, que es una técnica mucho más conservadora en la que secuencias grandes trozos primero; intentas localizar muy bien un trozo en un cromosoma, saber muy bien dónde está ese trozo, un trozo relativamente grande y ahora intentas secuenciar el trozo grande, lo que requiere una enorme cantidad, me aclara Ignacio, que son los institutos de salud Carlos III y si me permites hago otra aclaración porque cuando estabais hablando de hemófilos influenzae no quería interrumpir en ese. Momento, pero Héctor ha dicho el de la gripe; ojo, eso es el virus de la influenza. Estamos hablando aquí, aquí estamos hablando de una bacteria: bacterias respiratorias, sí.…
Francis Villatoro explica las características de *Aemófilos Influenzales*, una bacteria que causa infecciones respiratorias, y contrasta su secuenciación con la metodología del Proyecto Genoma Humano.
Habla: Francis VillatoroSignificado #1 · Palabras #1secuenciación de hemophilus influenzaeproyecto genoma humano waxon collinstécnicas lentas proyecto genoma humanogarantías secuenciación orden adecuadoshotgun de venter y celera genomicssecuenciación del genoma humano por celerajcvi y técnica shotgun de ventercelera genomics frente al proyecto genoma…como gripe, pero bacterial. Y ya está, solo aquí porque estoy estrenándome con interrupciones en el programa. Muchas gracias por la aclaración y los oyentes que perdonen la voz que tiene Ignacio, pero está un poco tocado. Luisa, ¿tú querías decir algo más? No, eso, lo mismo, lo mismo, que básicamente era eso, que era una gripe bacteriana. O sea, un tipo de infección respiratoria bacteriana de un microorganismo, microorganismo gran negativo que se llama Aemófilos Influenzales. El proyecto Genoma Humano era un proyecto garantizado; era un proyecto riguroso que inició el premio Nobel, Waxon, y que continuó Collins, su sucesor como director del proyecto Genoma Humano, y era saber muy bien dónde se encuentra un trozo que yo voy a secuenciar y después con técnicas extremadamente lentas y extremadamente bioquímicas, demasiado húmedas, demasiado de laboratorio, ir secuenciando poco a poco ese gran trozo. Partirlo en trozos grandes y secuenciar esos trozos y tener garantías siempre de que lo estás haciendo en el orden adecuado y que tienes una muy buena localización de ese trozo. Eso, bueno, era un proyecto que en principio era lento, fue avanzándose en las tecnologías de secuenciación y fue acelerándose y ya alrededor del año 2000 ya estaba a buen ritmo e incluso llegó a utilizar las técnicas de shotgun de perdigonazos de Venter y Venter vio que podía, en paralelo a lo que estaba haciendo con su empresa, su instituto JCVI, podía crear una empresa bien financiada, la creo muy tarde, Celera Genomics, es del 98, con muy buena financiación para utilizar su técnica de secuenciación, de shock gun, para secuenciar el genoma humano. y hacer una iniciativa privada en paralelo a la iniciativa pública y que quizás pudiera vencer a la iniciativa pública. ¿Qué problema tenía la técnica shotgun? Pues la técnica shotgun tiene el problema de que realmente no sabe lo que está secuenciando ni dónde está, ¿vale? Hay una enorme cantidad, por ejemplo, las zonas repetitivas. Tú como una zona repetitiva AT, AT, AT, AT,…
Francis Villatoro explica cómo la iniciativa pública del Proyecto Genoma Humano atrajo a casi todos los especialistas en genética y genómica de todo el mundo.
Habla: Francis VillatoroSignificado #18 · Palabras #12especialistas genómica colaboraron iniciativa públicainvestigación genes genomas iniciativa pública…repeticiones porque no lo puedes saber porque te vas a tener muchísimas coincidencias y la técnica que utilizaba Celera Genomics, la iniciativa privada, requería que alguien te enseñara dónde están las cosas que estás viendo y eso era la iniciativa pública. Entonces, ya iniciada la iniciativa pública, que estaba publicando todos los resultados en abierto para que cualquier investigador lo pudiera hacer, en la iniciativa pública prácticamente colaboraron todos los especialistas de genómica del mundo; o sea, es una cosa absolutamente, o sea, había que estar ahí. Si tú querías ser persona que investiga en genes y en genomas, tenías que estar en la iniciativa pública, ¿no? Y hacer tu pequeño granito de arena, en España lo hizo muchísima gente, ¿no? Famoso en este programa, por ejemplo, Carlos López Jotín. Son gente que estuvo en esa iniciativa, pero es que había que estar, no te quedaba otro remedio para hacer a alguien en los…
Francis Villatoro describe las críticas recibidas por Craig Venter y Celera Genomics, quienes fueron acusados de aprovechar los avances del Proyecto Genoma Humano público.
Habla: Francis VillatoroSignificado #11 · Palabras #6avance iniciativa pública proyecto genomasecuenciación genes zonas sin repeticionesfragmentos información craig ventergenes y técnica de secuenciaciónaprovechamiento del proyecto genoma humano públicoresquemor entre comunidades genómicastemor a publicación anticipada de venter…Famoso en este programa, por ejemplo, Carlos López Jotín. Son gente que estuvo en esa iniciativa, pero es que había que estar, no te quedaba otro remedio para hacer a alguien en los 90. Bien, pues la ventaja que tenía Craig Venter es que usando como, digamos, Esqueleto, como lo que estaba siendo publicado por la Iniciativa Pública él podía ir a colocar sus trocitos y entonces las zonas realmente interesantes que son los genes son zonas en las que no hay repeticiones y la técnica chocan rápidamente esta secuencia de los genes. ¿Pero dónde está este gen? Pues había que esperar a que la Iniciativa Pública encontrara parte de ese gen porque en el momento en el que encontrara parte del gen tú ya rápidamente colocabas tu gen en su sitio; eso desde el punto de vista de la Iniciativa Pública. fue digamos muy criticado había mucha gente diciendo es que este señor nos está pisando es que este señor si no existiéramos nosotros él no podría hacer nada y lo está haciendo gracias a nosotros entonces eso generó cierto resquemor y como ahí estaba metido toda la comunidad pues entre todas las comunidades genómicos que se dedicaban al tema de genes humanos pues todos estaban así con un poquito con la mosca de la oreja, ¿no? Haría un cierto temor. ¿Y si él, que está haciendo esto, publica el genoma completo tres meses antes que nosotros? Entonces, ¿debe la iniciativa pública a hablar Collins con Venter? Y decirle, mira, señor, vamos a ponernos de acuerdo y lo publicamos en el mismo momento, ¿no? Claro, el problema que tenía publicar el genoma humano es que es como todo la... Tú ves el fondo cómico microondas y tienes una única imagen. Tú ves el genoma humano…
Francis Villatoro explica cómo la definición de 'gen' que se enseñaba en diferentes niveles educativos, desde primaria hasta universidades, resultó ser una simplificación a raíz del Proyecto Genoma Humano.
Habla: Francis VillatoroPalabras #9definición de gen en educación primaria…a ese gen o todas las proteínas correspondientes a ese gen, porque muchos genes humanos, eucariotas en general, generan varias proteínas, pero eso al final fue un fiasco. Pues en realidad las cosas son infinitamente más complicadas de lo que parece. Cuando se inició el proyecto Genoma Humano, todo el mundo sabía lo que era un gen. Eso se enseñaba en las facultades y se enseñaba en la educación secundaria, y hasta en la educación primaria lo que era un gen. En la situación primaria, lo que decía un monje a finales del siglo XIX que era un gen, pero lo que se descubrió con el protógeno humano es que en realidad los genes no son lo que pensaban que tenemos como 200.000 150.000 proteínas mínimo pero tenemos 20 y pico mil genes a principio pensó que eran 24.000 hoy día son unos 21.000 tenemos otras cosas los pseudogenes, pero además tenemos una enorme cantidad…
Francis Villatoro explica que, a pesar de la secuenciación del genoma humano hace 25 años, la investigación sobre enfermedades genéticas aún está en sus primeras etapas y requiere décadas más de estudio.
Habla: Francis VillatoroSignificado #3 · Palabras #8genoma humano superó expectativassecuenciación completa del genoma humanoproblema tras secuenciación humanainvestigación enfermedades genéticas décadasgenoma humano hace 25 añosproyecto genoma humano iniciativa públicaversiones mejoradas del genoma humano…genes a principio pensó que eran 24.000 hoy día son unos 21.000 tenemos otras cosas los pseudogenes, pero además tenemos una enorme cantidad de estructuras que se heredan porque están en el ADN y que influyen en toda la regulación, en todos los mecanismos. Es decir, todo se convirtió extremadamente complicado. Cuando vimos el genoma completo vimos que este asunto era muy complicado y que lo que se esperaba era publicar el genoma humano completo y en pocos años, por les cinco años, por les diez años, íbamos a resolver el problema de las Enfermedades. Enfermedades de origen genético, pues lo que resulta 25 años más tarde es que todavía estamos en pañales y nos queda todavía muchas décadas de investigación para resolver ese problema. Entonces, pero claro, Collins y la gente de la iniciativa pública, pues tuvo que ir trabajando en vender eso y hacer cosas sobre el proyecto genoma humano, que se ha ido avanzando, se ha ido mejorando; había muchos problemas en ese, era un borrador, realmente era un borrador, no era una versión realmente definitiva. Ahora tenemos versiones mucho mejores, ¿no? Algunas publicadas recientemente. Pero ¿qué hizo Venter? Venter dijo, el premio Nobel me lo van a dar. Así que yo, a mí esto ya no me importa, me importa un comino. Yo voy a dedicar a otro tema. ¿Y cuál es el tema que a principios de los 2000 se puso de moda?…
Francis Villatoro reflexiona sobre el fallecimiento de Craig Venter y expresa la sorpresa generalizada, incluyendo la suya propia, de que este no haya recibido un Premio Nobel por su contribución al proyecto Genoma Humano.
Habla: Francis VillatoroPalabras #4fallecimiento de craig venteresperanza premio nobel craig venter…ha tenido la gran suerte de que la revista Science le ha publicado muchísimas de las cosas que ha hecho y le ha dado mucho bombo y mucho platillo, con lo que se ha convertido uno de los grandes de la genómica de la historia de los últimos 50 años de historia. O sea que estamos ante el fallecimiento de una de las figuras, uno de los gurús más importantes que ha sido polémico y que todo el mundo esperaba, yo primero, esperábamos que recibiera el premio Nobel: un premio Nobel Collins-Benter al proyecto Genoma Humano. ¿Cómo no lo vamos a dar? Es como no darle el premio Nobel al descubrimiento del Higgs, ¿vale? ¿A qué le vamos a dar el descubrimiento del Higgs? El premio novela del Higgs, en lugar de dárselo a quien descubrió el Higgs, se lo han dado a dos teóricos que no pintaban nada y que…
Francis Villatoro continúa la discusión sobre los Premios Nobel en relación con el Proyecto Genoma Humano, mencionando a Watson y Collins como figuras clave.
Habla: Francis VillatoroSignificado #2 · Palabras #2premio nobel para craig venterproyecto genoma humano sin reconocimientoopinión personal de francis villatoropolémica en los 90 contra 20experiencia afín en premios nobelproyecto genoma humano en los noventacandidaturas nobel proyecto genoma humanoanimadversión hacia craig ventercraig venter y proyecto genoma humanonominación de collins por genomo amanofallecimiento de venter y premio nobelpremio nobel proyecto genoma humanoenergía oscura premio nobel supernovafrancis villatoro premios nobelwatson y collins proyecto genomafigura controvertida de collinssegundo de collins…darle el premio Nobel al descubrimiento del Higgs, ¿vale? ¿A qué le vamos a dar el descubrimiento del Higgs? El premio novela del Higgs, en lugar de dárselo a quien descubrió el Higgs, se lo han dado a dos teóricos que no pintaban nada y que hicieron algo en El 64. Ya, ya, pero bueno, pero se lo han dado al Higgs, ¿no? Habría que haberle dado algo al proyecto Genoma Humano; ahora veremos lo que va a pasar, ¿no? La sensación, esto lo estoy inventando, quiero decir, es una opinión mía y no está fundamentada en nada, ni tengo mucho para apoyar esta opinión, así que no me hagáis ningún caso, no creáis nada de lo que voy a decir, pero dado que hubo una enorme polémica en los 90 contra 20, que estaba como pirateando al proyecto público, y dado que la gente que ha tenido que votar, el quien vota a un premio Nobel no vota. Yo Investigo en, yo qué sé, en el virus de la gripe y voto a un experto en genoma humano. Pues no. Si yo investigo en el tema del virus de la gripe, pues voto, pongo como candidato a premio Nobel, pues alguien que traje en un campo afín. Entonces, todos los que pueden hacer candidaturas, nominar a candidatos a un premio Nobel por el proyecto Genoma Humano, son personas que en los 90 estuvieron trabajando para el proyecto Genoma Humano y esas personas son personas que le tenían. Mucha tirria a Venter, el odioso enemigo, el diablo, el que nos quiere robar la fama. Entonces no vamos a nominar a Collins y a Venter, a Collins el guapo dios y a Venter el demonio, el feo; no, no, no, no porque entonces le dan el premio al feo y no queremos que esto no se puede consentir. Ahora que ha fallecido Venter es posible que mucha de esa gente el año que viene, en enero, nomine a Collins por el proyecto Genomo Amano; en enero, el año que viene, aprovechando el fallecimiento de este año de Venter. Las nominaciones de este año ya pasaron, fueron en enero; estamos en mayo, entonces es posible que para el año que viene haya un premio Nobel al proyecto Genomo Amano. Una pregunta, sabemos que el premio Nobel se puede dar como máximo a tres personas, ¿no? Y ya Francis nos ha desvelado quién es el bueno y quién es el feo, quién es el malo en la historia. Bueno, aquí en principio puede haber mucha gente, ¿no? No, quiero decir, habría un tercero al que darle este premio Nobel. No, no, aquí en principio se le daría a los dos grandes jefes, lo que ha pasado a veces, y eso pasó con el proyecto de Supernova, por ejemplo, la energía oscura que a veces le damos al primero y al segundo. En el caso del protogenoma humano, el primero obviamente era Watson y el segundo era Collins. Watson ya no está, pues Collins, podríamos buscar el segundo de Collins. Yo creo que no; yo creo que al final, por todo el papel político y mediático que ha tenido Collins, es verdad que es una figura muy controvertida. Ignacio, por ejemplo, nos puede hacer algún comentario, si le apetece, sobre lo controvertida que es la figura de Collins, sobre todo en los últimos años. Pero ganó el premio Templeton, solo digo eso, para los que saben, ya saben por dónde van los tiros. Yo…
Francis Villatoro continúa su reflexión sobre James Watson, explicando que este tiene una imagen pública negativa, a pesar de haber sido director del proyecto Genoma Humano antes que Craig Venter.
Significado #6 · Palabras #5imagen pública negativa james watsondirector proyecto genoma humano watson…otro personaje que aparece vemos a Collins y el siguiente nombre es Watson, ¿por qué? Porque hemos oído hablar mucho de él, porque ya tiene un premio Nobel, recordemos eso, y darle un segundo sería extraño, puede pasar, pero recordemos que es atípico y porque Tiene muy mala prensa, muy merecida; el malo le vale por eso como apelativo y también le hace un poquito más difícil que se reconozca su peso a pesar de haber sido también director del proyecto Genome Humano previamente a la entrada de Venter. Sobre Collins y acabo esta intervención que no quería que fuera demasiado larga. Francis ya lo ha dejado caer para todos los que Más o menos sepan de qué va el premio ese, pero es cierto que algunos no lo conocerán y Collins se ha acercado de forma muy explícita a la apología de la religión, del cristianismo además, durante los últimos años. No como algo personal, como una experiencia…
Francis Villatoro reflexiona sobre la posibilidad de que Francis Collins reciba un Premio Nobel, considerando escenarios donde este podría compartir el premio con otros científicos por logros independientes.
Palabras #7premio nobel para francis collinsproyecto genoma humano compartidocompartir premio con otros científicos…Nobel y se da a Peebles por cosmología y se junta con exoplanetas a Didier Queloz y Michel Mayo. Creo que Ignacio quiere decir algo; me corrija Francis, pero yo interpretaba que eso sí es una posibilidad. Otra cosa es que el premio que tenga el letrero. De Proyecto Génoma Humano lo comparta con otros, que me parece más implausible. Pero que se lo den a él la mitad del premio y la otra mitad la compartan otras dos personas por una cuestión independiente, habrá que ver. Sí, eso puede ocurrir, o sea, no sabemos los premios. Nobel son como son y pero que proyectos tan relevantes, o sea, con un impacto tan grande que ahora lo trocé, si le des un trocito, vamos a darle un tercio de premio Nobel, vamos a darle la mitad, no es habitual en la historia, es verdad que en los últimos…