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Ignacio CrespoJuan Carlos GilFrancis VillatoroJosé EdelsteinHéctor SocasSilvana TapiaIsabel CorderoLuisa AchaerandioGastón Giribetorigami de adn transporta moléculasproteínas como caballo de troyamoléculas y sistema inmunitarioorigami de ADNJosé EdelsteinADNLuisa AchaerandioFrancis VillatoroProtein Data Bank
Proteínas como caballo de Troya
Con
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José Edelstein explica cómo la técnica de origami de ADN permite crear pequeñas estructuras geométricas para transportar moléculas, comparando este proceso con la forma en que las proteínas cumplen una función similar.
…un vehículo, una cosa sencillita, no tanto tienen las figuras geométricas, simplemente que sea capaz de llevar la molécula que tú quieras, con la liberación de medicamentos pues lo mismo simplemente a lo mejor con algo que logre encapsularlo es suficiente. Claro, la palabra origami hace referencia a algo mucho más grande; aquí simplemente estamos haciendo referencia a que podemos podemos hacer pequeñas estructuras geométricas que permitan cumplir el objetivo que queremos, que es que se lleven una, digamos, una molécula. Las proteínas lo hacen; lo único que tienen es inconveniente, que son reactivas y en el sistema inmunitario reacciona ante ellas. Es un caballo de Troya total. Sí, sí, claro. Yo también quería decir que en el Laboratorio hay un concepto de tasa, es decir, tú puedes hacer un intento, un ensayo, un trial, un ensayo, y en sílico y también a nivel celular, pero luego te sale una tasa, una tasa de efectividad con esos parámetros que tú has puesto, entre ellos está el…
Significado #1 · Palabras #1
Francis Villatoro reflexiona sobre la rapidez con la que se ha avanzado en el plegamiento de proteínas, comparando su propia previsión inicial con la realidad superada.
Habla: Francis VillatoroSignificado #14plegado de proteínas superadorecursos computacionales para proteínassesgo conservador en francis villatoro…automático de prácticamente todas las proteínas conocidas. Eso lo dijeron, lo decían en ese artículo. Su objetivo era que en el Protein Data Bank, en el base de datos de proteínas, tratar de que todas las proteínas, y yo en su momento recuerdo cuando lo Hablé en Coffee Break y dije: bueno, pero esto será despacito, irá un poquito a poco. Lo que nadie se pudo imaginar es que en un año y medio se comieran 200.000 proteínas; es decir, los recursos computacionales que implicaba aplicar ese software a eso eran una cosa absolutamente, en aquel momento no era concebible. Lo mismo me está ocurriendo ahora mismo, tengo un sesgo hacia el conservadurismo y a pensar que no puede haber un salto tan grande. Pero ya veremos, si esto lo logran a genoma completo, a ADN completo, puede ser absolutamente revolucionario o no, pero se intuye que ahí va a haber mucha información que va a ayudar a muchísimas cosas, sobre todo en medicina personalizada, que yo le pueda…
José Edelstein explica cómo la técnica de origami de ADN permite crear pequeñas estructuras geométricas para transportar moléculas, comparando este proceso con la forma en que las proteínas cumplen una función similar.
Habla: José EdelsteinSignificado #1 · Palabras #1origami de adn transporta moléculasproteínas como caballo de troyamoléculas y sistema inmunitario…un vehículo, una cosa sencillita, no tanto tienen las figuras geométricas, simplemente que sea capaz de llevar la molécula que tú quieras, con la liberación de medicamentos pues lo mismo simplemente a lo mejor con algo que logre encapsularlo es suficiente. Claro, la palabra origami hace referencia a algo mucho más grande; aquí simplemente estamos haciendo referencia a que podemos podemos hacer pequeñas estructuras geométricas que permitan cumplir el objetivo que queremos, que es que se lleven una, digamos, una molécula. Las proteínas lo hacen; lo único que tienen es inconveniente, que son reactivas y en el sistema inmunitario reacciona ante ellas. Es un caballo de Troya total. Sí, sí, claro. Yo también quería decir que en el Laboratorio hay un concepto de tasa, es decir, tú puedes hacer un intento, un ensayo, un trial, un ensayo, y en sílico y también a nivel celular, pero luego te sale una tasa, una tasa de efectividad con esos parámetros que tú has puesto, entre ellos está el…
Luisa Achaerandio y Isabel Cordero discuten la complejidad de las estructuras creadas mediante origami de ADN, destacando su belleza visual pero cuestionando si podrían ser escalables para aplicaciones más grandes.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #2origami de adn y aplicacionesestructuras de origami adn escalablesbelleza visual del origami adn…con esos parámetros que tú has puesto, entre ellos está el pH, la temperatura, las condiciones de cantidad de osmolaridad, osmolaridad, es decir, que hay un montón de parámetros y luego una tasa de efectividad no es el 100%, ahí te pones el caballo. Ganador, el caballo de Troya. Ganador. Y a más complejidad, pues peor; esto de hecho, bueno, es precioso. Los dibujos se ven ahí, la figura geométrica y es preciosa, pero no sé si serían capaces de hacer estructuras más grandes, en principio para lo que son los objetivos de este artículo y de otros anteriores, que es portar o Vehiculizar algo como una especie de nanocápsula, en principio parece que eso es sencillo; ya otras estructuras más grandes, ya eso pues claro, se aumenta en dificultad. Bueno, entonces uno de los primeros objetivos de los autores es conseguir eso, hacer un…
Luisa Achaerandio y José Edelstein continúan la discusión sobre la evaluación de artículos científicos, comparando enfoques basados en estructuras de proteína con modificaciones posteriores basadas en ADN.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #6estructura de proteína como basemodificaciones basadas en adnproteínas mejores que adnluisa achaerandio y jose edelstein…han hecho entre 17 personas, además con el mismo conocimiento, entonces bueno, eso ya puede chirriar. Claro, no, pero súper bonito y súper, lo que decían, ¿no? Como parecía que, ay, y me he encontrado la piedra, pero venga, vamos a levantarnos y a ver si... Además, ellos tenían como base la estructura de proteína; digamos que el vehículo de proteínas era como: esto es nuestra línea base y tenemos que ser mejor que eso. Entonces, cuando ellos hacían una modificación decían: no, las proteínas siguen siendo mejores, a ver qué es lo que pasa, qué puedo modificar para que sea mejor. Y vas leyendo el artículo y venga: punto para las proteínas, cero para el ADN. Otra vez, punto para las proteínas, cero para el ADN, hasta que ya consiguen sobrepasar las propiedades que da el vehículo proteico. Estaba pensando, creo que esto es la primera vez que pasa en Coffee Break, que hay un cambio de día durante la grabación. Yo…