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Proteína bacteria funciones supervivencia
Con
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Francis Villatoro explica cómo se puede modificar una bacteria para que realice dos funciones: su función original para sobrevivir y una nueva función impuesta por el investigador para consumir nanoplásticos.
…una forma de más que no sabemos luego qué efectos tendrá en tu futuro de llevar esas gafas toda tu vida? ¿Cómo alterará eso? Bueno, al final, bueno, eso. Esos antitrangénicos tan radicales deben de ser un porcentaje muy bajo en los antitrangénicos mundiales. En cualquier caso, la idea de Manuel Ferrer es desarrollar una nueva tecnología de edición genética que evita la transgénesis. Entonces, lo que tú haces es decir: ¿cómo evito la transgénesis? Pues cojo una proteína que ya tenga el organismo, en este caso la bacteria, y le añado una nueva función. No puedo sustituir la función que ya tiene, porque si sustituyo la función que ya tiene, puede que esté alterando el funcionamiento biológico de la propia bacteria y no se reproduzca bien, pierda propiedades y características. En ciertas circunstancias, deje de ser y me critiquen porque la he modificado. Lo que hago es coger una proteína que, como ha Contado Luisa, pues tiene que tener una serie de propiedades especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que en este caso es consumir nanopets, consumir nanoplásticos. Entonces esta es un poco la idea de esta nueva técnica de rewire, de recableado de la función; es algo de la biología sintética el tratar de modificar funciones que tiene la propia maquinaria celular tratando de afectar lo mínimo al funcionamiento de la propia célula para evitar que con el cambio que yo he hecho pues se crezca más lentamente o crezca peor o por ejemplo este tema de curum sensing, esta es una proteína de curum sensing de transferencia de señales entre bacterias, ¿no? Hay una comunicación bacteriana que yo puedo afectar si yo modifico la función. Entonces la idea es añadir una nueva función a lo que ya tengo y ya nadie me puede decir que Es transgénesis. Ya he evitado la palabra maldita y he logrado una nueva cosa, y como esto es algo nuevo, pues obviamente este artículo de Manuel Ferrer será muy, muy usado por la industria farmacológica que podrá vender ahora. Esto no tiene transgénesis.…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio explica el siguiente paso en la investigación sobre la degradación de plásticos utilizando Escherichia coli: buscar proteínas similares a las enzimas que ya degradan plásticos.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #12proteínas lsrb y ssua en e coliespacio periplasmático de e coliquorum sensi bacteriasenzimas degradan plásticos…doctor Manuel Ferrer pues tiene digamos esa especialidad que lo ha hecho ha posibilitado que se pueda llegar a esta conclusión y luego tenemos a Paula Vidal, que es una investigadora predoctoral que ha desarrollado este artículo como investigadora principal. Entonces, primero tienes que saber que existen enzimas que degradan plásticos. Una vez que tienes este conocimiento, intentas buscar proteínas parecidas en la E. coli. Como he dicho, se encuentran estas dos proteínas que son la LSRB y la SSUA, y nuevamente os invito a mirar el artículo que se publicó en Trends in Biotechnology porque esas proteínas no están en un lugar cualquiera; esas proteínas están en el espacio periplasmático de esta E. coli. ¿Eso qué significa? Pues que están justo en la parte exterior, y digamos que su función en parte, la LSRB es de comunicación, porque las bacterias también se comunican; es una comunicación química, como me gusta a mí decirlo mucho: no tienen ojos, no tienen boca, es la comunicación que nosotros entendemos, pero sí que es una comunicación química que tiene un nombre muy bonito que se llama Quorum Sensi, muy chulo; es muy bonito ese concepto. Pues resulta que una de esas proteínas nos sirve para nuestro cometido, por el lugar en el que está, por la estructura que tiene y además porque en la parte central de esta estructura proteica a nivel tridimensional tiene lo que se llama un ligando, por así…
Luisa Achaerandio explica que las bacterias también necesitan aminoácidos debido a su ubicación, forma y sitios de unión, y cómo la bioinformática permite resolver estructuras.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5aminoácidos en bacterias ubicaciónbioinformática resuelve estructuras bacterianassitios de unión bacterias…Entonces justamente por ser así, esta proteína y la siguiente que sirve para transportar determinados alimentos, en concreto determinados compuestos de azufre hacia la célula, ¿para qué queremos el azufre? El azufre lo necesitamos para formar aminoácidos. También las bacterias necesitan aminoácidos, precisamente por el lugar en el que están, por la forma en la que tienen y por el tipo de sitio de unión que tienen. Gracias a la bioinformática, partiendo de esa idea de que tiene que tener algo parecido, se encuentra, se resuelve la estructura y es muy importante diferenciar una cosa en bioinformática, que no es. Lo mismo modelar una estructura que predecir. Predecir una estructura proteica es a raíz de unas determinadas parámetros que tú quieras, digamos, que cumpla esa estructura final utilizando una inteligencia artificial o inteligencia artificial con un programa…
Luisa Achaerandio utiliza una metáfora para explicar cómo se están rediseñando proteínas en Escherichia coli, comparándolo con dotar a un personaje de adamantium, como en los cómics.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #6rediseño proteínas nativas escherichia colisuperpoder en escherichia colimétodos computacionales luisa achaerandioproteínas en escherichia coli adamantiumbacterias con superpoderes juan carlosdiseño bacterias mejorar no cortartecnología crispr cas guia tradicional…juego un poquito; estamos utilizando todas las posibilidades de nuestro entorno que todavía no te las he contado todas porque todavía te faltan datos para entender cómo se llega a esto, pero estamos utilizando todo lo que se sabe para ir un poquito más allá. De hecho, una de las cosas que dice una de las autoras, dice que si las proteínas nativas pueden ser rediseñadas computacionalmente para hacer algo nuevo, no necesitamos alterar el equilibrio genético de la célula con elementos externos, sino que dotamos a nuestra querida E. coli de un nuevo superpoder. es así un poquito como pensar en, lo ves, no como ser humano, pero con el adamantium. O sea, no solo puedo ser un ser humano, o en este caso una bacteria, sino tener como algo adicional, ¿no? Que efectivamente me puede alterar un poquito... Perdón, dime, dime. Estas metáforas de bacterias con superpoderes y superbacterias, no sé si escuchaste el programa con Juan Carlos en el que hacía este tipo de... Sí, de asimilar bacterias con superhéroes y tal Es que pega muchísimo, sobre todo en esta, justamente en este diseño que hacen, porque tú es como, lo que haces es mejorar, no estás cambiando, no estás cortando, no es el CRISPR -Cas, la tecnología de CRISPR-Cas con guía tradicional No es edición genética, ¿no? Efectivamente Genes que están ahí Exactamente, es una zona concreta que está ahí, que me puede servir para añadir lo que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no…
Luisa Achaerandio explica cómo una tecnología CRISPR-Cas y una guía de ARN se integran en el genético de las bacterias modificadas para degradar plástico, permitiendo a estas producir proteínas con una triada lista para la degradación.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #14crpr-cas guía arn bacteriasproteínas triada degradación plásticabacteria modifica genético plásticogen tecnología degradación bacteria…poco la temperatura, que por su porosidad va a entrar; quiero decir, es muy fácil que entre, sobre todo los que están modificados en el laboratorio y entonces básicamente al entrar eso ya en el citoplasma celular, pasa a través de su membrana, pues gracias a. Esa tecnología de CRISPR-Cas y la guía de ARN va a ese lugar concreto de esas proteínas, bueno, en este caso iría a nivel genético, digamos se integraría y ya después de que la célula pueda utilizar esa parte que ya está introducido como una adición a esa codificación genética, pues ya sí que esas proteínas tienen a la hora de crearse en la bacteria esa triada lista para poder degradar esos pequeños trocitos de plástico que les estamos poniendo a degustar a nuestra bacteria. Pues ya os digo, eso sería a grandes rasgos toda la técnica y lo que ellos han propuesto de Gen. Rewire y lo que ya para terminar simplemente, pues me gustaría decir que en este caso digamos que es una prueba de concepto. Es verdad que tú no puedes ya utilizar estas bacterias; no se trata de que tú cojas estas bacterias y ya las pongas en el medio y nos…
Francis Villatoro explica cómo se puede modificar una bacteria para que realice dos funciones: su función original para sobrevivir y una nueva función impuesta por el investigador para consumir nanoplásticos.
Habla: Francis VillatoroSignificado #1 · Palabras #1proteína bacteria nueva funciónevitar transgénesis tecnología edición genéticaalteración funcionamiento biológico bacteriamanuel ferrer propuesta transgénesisproteínas modificadas genéticamente luisaalteración funcionamiento proteínas bacteriascatálisis función bioquímica básicasitio activo proteína modificaciónproteína bacteria funciones supervivenciabacteria consume nanoplásticos bioreactorreprogramación genética escherichia coliquorum sensing afecta comunicación bacterianabiología sintética modifica funciones celularesproteína quorum sensing transferencia señalesimpacto mínimo en funcionamiento célula…una forma de más que no sabemos luego qué efectos tendrá en tu futuro de llevar esas gafas toda tu vida? ¿Cómo alterará eso? Bueno, al final, bueno, eso. Esos antitrangénicos tan radicales deben de ser un porcentaje muy bajo en los antitrangénicos mundiales. En cualquier caso, la idea de Manuel Ferrer es desarrollar una nueva tecnología de edición genética que evita la transgénesis. Entonces, lo que tú haces es decir: ¿cómo evito la transgénesis? Pues cojo una proteína que ya tenga el organismo, en este caso la bacteria, y le añado una nueva función. No puedo sustituir la función que ya tiene, porque si sustituyo la función que ya tiene, puede que esté alterando el funcionamiento biológico de la propia bacteria y no se reproduzca bien, pierda propiedades y características. En ciertas circunstancias, deje de ser y me critiquen porque la he modificado. Lo que hago es coger una proteína que, como ha Contado Luisa, pues tiene que tener una serie de propiedades especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que en este caso es consumir nanopets, consumir nanoplásticos. Entonces esta es un poco la idea de esta nueva técnica de rewire, de recableado de la función; es algo de la biología sintética el tratar de modificar funciones que tiene la propia maquinaria celular tratando de afectar lo mínimo al funcionamiento de la propia célula para evitar que con el cambio que yo he hecho pues se crezca más lentamente o crezca peor o por ejemplo este tema de curum sensing, esta es una proteína de curum sensing de transferencia de señales entre bacterias, ¿no? Hay una comunicación bacteriana que yo puedo afectar si yo modifico la función. Entonces la idea es añadir una nueva función a lo que ya tengo y ya nadie me puede decir que Es transgénesis. Ya he evitado la palabra maldita y he logrado una nueva cosa, y como esto es algo nuevo, pues obviamente este artículo de Manuel Ferrer será muy, muy usado por la industria farmacológica que podrá vender ahora. Esto no tiene transgénesis.…
Luisa Achaerandio y Francis Villatoro discuten sobre el uso controlado de bacterias modificadas genéticamente para degradar plástico, enfatizando que su liberación en entornos naturales como los océanos sería peligrosa debido a la falta de adaptación de estas bacterias.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #10reprogramación genética escherichia colidegradación plástica bacteria e colisalinidad afecta supervivencia escherichia coli…prometedor y vendría en eso, en bioreactores específicamente, por ejemplo, en lugares donde tú puedas filtrar de nanoplásticos, por ejemplo, temas de aguas, aguas residuales o en pantanos, en sitios así; en el mar es muy difícil, en el océano es muy difícil. Nadie va a lanzar este tipo de bacterias al océano; el peligro sería terrible porque no están adaptadas, de hecho, a ese medio y como se reproduzcan pueden... Claro, incluso morirían por la salinidad porque, claro, la salinidad afecta a su supervivencia, pero que sí, que es en condiciones controladas; de hecho, eso es un nivel de madurez. De la tecnología TRL4, de eso los que sabéis de biotecnología lo tenéis muchísimo más claro que yo en este sentido y que básicamente es una prueba de concepto para escalarlo si es que se puede y si es que funciona en otros organismos porque en principio una…